MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosarcina mazei Go1 chromosome

Total Repeats: 58074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003901	GCA	2	6	534	539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226103
2	NC_003901	GAA	2	6	600	605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226103
3	NC_003901	ACTAT	2	10	778	787	40 %	40 %	0 %	20 %	21226103
4	NC_003901	GAT	2	6	792	797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226103
5	NC_003901	ATG	2	6	841	846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226103
6	NC_003901	GCA	2	6	891	896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226103
7	NC_003901	CAG	2	6	940	945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226103
8	NC_003901	GAT	2	6	948	953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226103
9	NC_003901	TCA	2	6	994	999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226103
10	NC_003901	CAG	2	6	1066	1071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226103
11	NC_003901	GCA	2	6	1109	1114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226103
12	NC_003901	TGC	2	6	1196	1201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226103
13	NC_003901	GATC	2	8	1226	1233	25 %	25 %	25 %	25 %	21226103
14	NC_003901	TTCC	2	8	1243	1250	0 %	50 %	0 %	50 %	21226103
15	NC_003901	A	6	6	1348	1353	100 %	0 %	0 %	0 %	21226103
16	NC_003901	CAGG	2	8	1430	1437	25 %	0 %	50 %	25 %	21226103
17	NC_003901	GAA	3	9	1470	1478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226103
18	NC_003901	TAA	2	6	1508	1513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226103
19	NC_003901	GGC	2	6	1569	1574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21226103
20	NC_003901	TTG	2	6	1600	1605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226103
21	NC_003901	AGGC	2	8	1662	1669	25 %	0 %	50 %	25 %	21226103
22	NC_003901	GAA	2	6	1689	1694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226103
23	NC_003901	A	6	6	1698	1703	100 %	0 %	0 %	0 %	21226103
24	NC_003901	TAC	2	6	1821	1826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226103
25	NC_003901	TAA	2	6	1853	1858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226103
26	NC_003901	TAA	2	6	1861	1866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226103
27	NC_003901	ACA	2	6	1870	1875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21226103
28	NC_003901	CTG	2	6	1879	1884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226103
29	NC_003901	AGC	2	6	1928	1933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226103
30	NC_003901	CAA	2	6	1934	1939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21226103
31	NC_003901	GCTG	2	8	1949	1956	0 %	25 %	50 %	25 %	21226103
32	NC_003901	GGGAC	2	10	1960	1969	20 %	0 %	60 %	20 %	21226103
33	NC_003901	TGGATG	2	12	2001	2012	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	21226103
34	NC_003901	ATTA	2	8	2019	2026	50 %	50 %	0 %	0 %	21226103
35	NC_003901	TA	3	6	2031	2036	50 %	50 %	0 %	0 %	21226103
36	NC_003901	GCA	2	6	2098	2103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226103
37	NC_003901	TGGAA	2	10	2107	2116	40 %	20 %	40 %	0 %	21226103
38	NC_003901	GATG	2	8	2676	2683	25 %	25 %	50 %	0 %	21226104
39	NC_003901	CAGC	2	8	2729	2736	25 %	0 %	25 %	50 %	21226104
40	NC_003901	GTA	2	6	2764	2769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226104
41	NC_003901	GGGATG	2	12	2820	2831	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	21226104
42	NC_003901	GAT	2	6	2881	2886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226104
43	NC_003901	GAT	2	6	2965	2970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226104
44	NC_003901	ACGG	2	8	2980	2987	25 %	0 %	50 %	25 %	21226104
45	NC_003901	CCAGT	2	10	3123	3132	20 %	20 %	20 %	40 %	21226104
46	NC_003901	A	6	6	3181	3186	100 %	0 %	0 %	0 %	21226104
47	NC_003901	AGCC	2	8	3198	3205	25 %	0 %	25 %	50 %	21226104
48	NC_003901	ACA	2	6	3249	3254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21226104
49	NC_003901	A	7	7	3304	3310	100 %	0 %	0 %	0 %	21226104
50	NC_003901	CTTC	2	8	3433	3440	0 %	50 %	0 %	50 %	21226104
51	NC_003901	TTCC	2	8	3459	3466	0 %	50 %	0 %	50 %	21226104
52	NC_003901	A	7	7	3487	3493	100 %	0 %	0 %	0 %	21226104
53	NC_003901	CAA	2	6	3516	3521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21226104
54	NC_003901	GAA	2	6	3682	3687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226104
55	NC_003901	AGGC	2	8	3802	3809	25 %	0 %	50 %	25 %	21226104
56	NC_003901	A	7	7	3837	3843	100 %	0 %	0 %	0 %	21226104
57	NC_003901	CAG	2	6	3927	3932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226104
58	NC_003901	GAT	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226104
59	NC_003901	TGT	2	6	4017	4022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226104
60	NC_003901	GGACAA	2	12	4247	4258	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	21226104
61	NC_003901	TAAA	2	8	4327	4334	75 %	25 %	0 %	0 %	21226105
62	NC_003901	GA	3	6	4348	4353	50 %	0 %	50 %	0 %	21226105
63	NC_003901	TAA	2	6	4365	4370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226105
64	NC_003901	T	6	6	4426	4431	0 %	100 %	0 %	0 %	21226105
65	NC_003901	GAA	2	6	4445	4450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226105
66	NC_003901	TG	3	6	4456	4461	0 %	50 %	50 %	0 %	21226105
67	NC_003901	T	6	6	4462	4467	0 %	100 %	0 %	0 %	21226105
68	NC_003901	A	6	6	4628	4633	100 %	0 %	0 %	0 %	21226106
69	NC_003901	A	8	8	4650	4657	100 %	0 %	0 %	0 %	21226106
70	NC_003901	TCT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226106
71	NC_003901	GTTT	2	8	4687	4694	0 %	75 %	25 %	0 %	21226106
72	NC_003901	TA	3	6	4744	4749	50 %	50 %	0 %	0 %	21226106
73	NC_003901	CAGT	2	8	4760	4767	25 %	25 %	25 %	25 %	21226106
74	NC_003901	GAA	2	6	4789	4794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226106
75	NC_003901	CTC	2	6	4811	4816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21226106
76	NC_003901	AAAG	2	8	4909	4916	75 %	0 %	25 %	0 %	21226106
77	NC_003901	GAAT	2	8	4997	5004	50 %	25 %	25 %	0 %	21226106
78	NC_003901	CTGG	2	8	5070	5077	0 %	25 %	50 %	25 %	21226106
79	NC_003901	GGT	2	6	5114	5119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21226106
80	NC_003901	T	7	7	5169	5175	0 %	100 %	0 %	0 %	21226106
81	NC_003901	GGA	2	6	5404	5409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226106
82	NC_003901	TTG	2	6	5417	5422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226106
83	NC_003901	GCA	2	6	5455	5460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226106
84	NC_003901	AGC	2	6	5463	5468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226106
85	NC_003901	CAG	2	6	5587	5592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226106
86	NC_003901	CTG	2	6	5637	5642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226107
87	NC_003901	AGA	2	6	5688	5693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226107
88	NC_003901	CTG	2	6	5696	5701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226107
89	NC_003901	TGC	2	6	5724	5729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226107
90	NC_003901	GTACT	2	10	5916	5925	20 %	40 %	20 %	20 %	21226107
91	NC_003901	CTGG	2	8	5983	5990	0 %	25 %	50 %	25 %	21226107
92	NC_003901	TTTC	2	8	5999	6006	0 %	75 %	0 %	25 %	21226107
93	NC_003901	CTT	2	6	6017	6022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226107
94	NC_003901	GGA	3	9	6050	6058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226107
95	NC_003901	CAGAG	2	10	6118	6127	40 %	0 %	40 %	20 %	21226107
96	NC_003901	AGC	2	6	6132	6137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226107
97	NC_003901	TGG	2	6	6188	6193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21226107
98	NC_003901	TGG	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21226107
99	NC_003901	AAT	2	6	6457	6462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226107
100	NC_003901	ATGA	2	8	6480	6487	50 %	25 %	25 %	0 %	21226107
101	NC_003901	AAT	2	6	6541	6546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226108
102	NC_003901	GAA	2	6	6550	6555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226108
103	NC_003901	TAAAAG	2	12	6578	6589	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	21226108
104	NC_003901	TC	3	6	6591	6596	0 %	50 %	0 %	50 %	21226108
105	NC_003901	CAGA	2	8	6627	6634	50 %	0 %	25 %	25 %	21226108
106	NC_003901	TGT	2	6	6693	6698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226108
107	NC_003901	CTT	2	6	6724	6729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226108
108	NC_003901	CCT	2	6	6754	6759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21226108
109	NC_003901	AGAA	2	8	6815	6822	75 %	0 %	25 %	0 %	21226108
110	NC_003901	GT	3	6	6909	6914	0 %	50 %	50 %	0 %	21226108
111	NC_003901	GGA	2	6	6915	6920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226108
112	NC_003901	TGA	2	6	6935	6940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226108
113	NC_003901	AGA	2	6	7030	7035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226108
114	NC_003901	ACCC	2	8	7089	7096	25 %	0 %	0 %	75 %	21226108
115	NC_003901	TGGAT	2	10	7098	7107	20 %	40 %	40 %	0 %	21226108
116	NC_003901	TGC	2	6	7260	7265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226108
117	NC_003901	T	6	6	7397	7402	0 %	100 %	0 %	0 %	21226108
118	NC_003901	A	6	6	7416	7421	100 %	0 %	0 %	0 %	21226108
119	NC_003901	GAAC	2	8	7422	7429	50 %	0 %	25 %	25 %	21226108
120	NC_003901	GGA	2	6	7468	7473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226108
121	NC_003901	AAT	2	6	7486	7491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226108
122	NC_003901	A	8	8	7526	7533	100 %	0 %	0 %	0 %	21226109
123	NC_003901	GTCT	2	8	7557	7564	0 %	50 %	25 %	25 %	21226109
124	NC_003901	AAG	2	6	7567	7572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226109
125	NC_003901	A	7	7	7825	7831	100 %	0 %	0 %	0 %	21226109
126	NC_003901	GGCT	2	8	7832	7839	0 %	25 %	50 %	25 %	21226109
127	NC_003901	GAG	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226109
128	NC_003901	AG	3	6	8002	8007	50 %	0 %	50 %	0 %	21226109
129	NC_003901	TGT	2	6	8068	8073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226109
130	NC_003901	CTG	2	6	8195	8200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226110
131	NC_003901	ACCCT	2	10	8212	8221	20 %	20 %	0 %	60 %	21226110
132	NC_003901	TCA	2	6	8259	8264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226110
133	NC_003901	CCTGC	2	10	8298	8307	0 %	20 %	20 %	60 %	21226110
134	NC_003901	CTG	2	6	8447	8452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226110
135	NC_003901	TATTGC	2	12	8510	8521	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	21226110
136	NC_003901	AGCA	2	8	8636	8643	50 %	0 %	25 %	25 %	21226110
137	NC_003901	CACCAG	2	12	8648	8659	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	21226110
138	NC_003901	AAT	2	6	8669	8674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226110
139	NC_003901	CAG	2	6	8680	8685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226110
140	NC_003901	TGC	2	6	8717	8722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226110
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142	NC_003901	GGC	2	6	8889	8894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21226110
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254	NC_003901	CCT	2	6	23370	23375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21226121
255	NC_003901	TGT	2	6	23487	23492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226121
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265	NC_003901	TCA	2	6	24355	24360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226122
266	NC_003901	GA	3	6	24426	24431	50 %	0 %	50 %	0 %	21226122
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268	NC_003901	CTT	2	6	24445	24450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226122
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393	NC_003901	ATGAT	2	10	34889	34898	40 %	40 %	20 %	0 %	21226132
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399	NC_003901	ATA	2	6	35141	35146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226132
400	NC_003901	GGC	2	6	35174	35179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21226132
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403	NC_003901	ATA	2	6	35249	35254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226132
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