MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanopyrus kandleri AV19

Total Repeats: 32319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003551	GGA	2	6	816	821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20093441
2	NC_003551	CCA	2	6	828	833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20093441
3	NC_003551	TCG	2	6	843	848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20093441
4	NC_003551	GATCT	2	10	916	925	20 %	40 %	20 %	20 %	20093441
5	NC_003551	GCT	2	6	972	977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20093441
6	NC_003551	CAC	2	6	994	999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20093441
7	NC_003551	TCTCGA	2	12	1122	1133	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	20093441
8	NC_003551	GGT	2	6	1205	1210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20093441
9	NC_003551	CGCA	2	8	1214	1221	25 %	0 %	25 %	50 %	20093441
10	NC_003551	CGTTGA	2	12	1392	1403	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	20093441
11	NC_003551	CGTC	2	8	1434	1441	0 %	25 %	25 %	50 %	20093441
12	NC_003551	CGG	2	6	1473	1478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20093441
13	NC_003551	CGC	2	6	1483	1488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20093441
14	NC_003551	CCT	2	6	1553	1558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093441
15	NC_003551	TGT	2	6	1698	1703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20093441
16	NC_003551	CCG	2	6	1743	1748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20093441
17	NC_003551	TCA	2	6	1803	1808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20093441
18	NC_003551	TCC	2	6	1895	1900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093442
19	NC_003551	TCC	2	6	2013	2018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093442
20	NC_003551	TCC	2	6	2126	2131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093442
21	NC_003551	GGGC	2	8	2132	2139	0 %	0 %	75 %	25 %	20093442
22	NC_003551	CGA	2	6	2154	2159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20093442
23	NC_003551	CGG	2	6	2193	2198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20093442
24	NC_003551	GT	3	6	2201	2206	0 %	50 %	50 %	0 %	20093442
25	NC_003551	CTA	2	6	2295	2300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20093442
26	NC_003551	GCC	2	6	2301	2306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20093442
27	NC_003551	TCC	2	6	2309	2314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093442
28	NC_003551	CTC	2	6	2332	2337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093442
29	NC_003551	GGCC	2	8	2349	2356	0 %	0 %	50 %	50 %	20093442
30	NC_003551	CTC	2	6	2363	2368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093442
31	NC_003551	TCA	2	6	2379	2384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20093442
32	NC_003551	TCC	2	6	2508	2513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093443
33	NC_003551	CAC	2	6	2543	2548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20093443
34	NC_003551	GCT	2	6	2596	2601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20093443
35	NC_003551	CGTC	2	8	2653	2660	0 %	25 %	25 %	50 %	20093443
36	NC_003551	TCC	2	6	2709	2714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093443
37	NC_003551	GT	3	6	2734	2739	0 %	50 %	50 %	0 %	20093443
38	NC_003551	GGT	2	6	2849	2854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20093443
39	NC_003551	GGA	2	6	2944	2949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20093443
40	NC_003551	TCG	2	6	2980	2985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20093443
41	NC_003551	CGG	2	6	3022	3027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20093443
42	NC_003551	CTC	2	6	3065	3070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093443
43	NC_003551	TCG	2	6	3180	3185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20093443
44	NC_003551	CT	3	6	3331	3336	0 %	50 %	0 %	50 %	20093443
45	NC_003551	TGC	2	6	3512	3517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20093444
46	NC_003551	CGA	2	6	3588	3593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20093444
47	NC_003551	GGC	2	6	3615	3620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20093444
48	NC_003551	AGA	2	6	3624	3629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20093444
49	NC_003551	CGA	2	6	3639	3644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20093444
50	NC_003551	GCC	2	6	3658	3663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20093444
51	NC_003551	GCC	2	6	3670	3675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20093444
52	NC_003551	CGG	2	6	3680	3685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20093444
53	NC_003551	AGG	2	6	3704	3709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20093444
54	NC_003551	AAGAGG	2	12	3710	3721	50 %	0 %	50 %	0 %	20093444
55	NC_003551	GGAAGA	2	12	3729	3740	50 %	0 %	50 %	0 %	20093444
56	NC_003551	AGAGGA	2	12	3741	3752	50 %	0 %	50 %	0 %	20093444
57	NC_003551	GAA	3	9	3754	3762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20093444
58	NC_003551	AGA	2	6	3813	3818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20093445
59	NC_003551	CCT	3	9	3842	3850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093445
60	NC_003551	CTT	3	9	3853	3861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20093445
61	NC_003551	CT	4	8	3865	3872	0 %	50 %	0 %	50 %	20093445
62	NC_003551	CTT	2	6	3876	3881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20093445
63	NC_003551	TTC	2	6	3937	3942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20093445
64	NC_003551	TC	3	6	3949	3954	0 %	50 %	0 %	50 %	20093445
65	NC_003551	CT	3	6	3985	3990	0 %	50 %	0 %	50 %	20093445
66	NC_003551	CGC	2	6	4059	4064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20093445
67	NC_003551	CCT	2	6	4112	4117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093445
68	NC_003551	CATG	2	8	4215	4222	25 %	25 %	25 %	25 %	20093445
69	NC_003551	CGAA	2	8	4313	4320	50 %	0 %	25 %	25 %	20093445
70	NC_003551	GGT	2	6	4325	4330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20093445
71	NC_003551	CG	3	6	4456	4461	0 %	0 %	50 %	50 %	20093445
72	NC_003551	TCC	2	6	4469	4474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093445
73	NC_003551	CGT	2	6	4521	4526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20093445
74	NC_003551	GC	3	6	4551	4556	0 %	0 %	50 %	50 %	20093445
75	NC_003551	TTG	2	6	4577	4582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20093445
76	NC_003551	TACCC	2	10	4657	4666	20 %	20 %	0 %	60 %	20093445
77	NC_003551	CCT	2	6	4749	4754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093445
78	NC_003551	CGA	2	6	4797	4802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20093445
79	NC_003551	CGG	2	6	4820	4825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20093445
80	NC_003551	ATC	2	6	4832	4837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20093445
81	NC_003551	CGA	2	6	4884	4889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20093445
82	NC_003551	GATC	2	8	4959	4966	25 %	25 %	25 %	25 %	20093445
83	NC_003551	GGA	2	6	5052	5057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20093445
84	NC_003551	GCC	2	6	5077	5082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20093445
85	NC_003551	TCT	2	6	5088	5093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20093445
86	NC_003551	GGT	2	6	5195	5200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20093445
87	NC_003551	TAC	2	6	5232	5237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20093445
88	NC_003551	CG	3	6	5238	5243	0 %	0 %	50 %	50 %	20093445
89	NC_003551	CTT	2	6	5272	5277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20093445
90	NC_003551	CCG	2	6	5353	5358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20093446
91	NC_003551	CCT	2	6	5480	5485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093446
92	NC_003551	GACG	2	8	5525	5532	25 %	0 %	50 %	25 %	20093446
93	NC_003551	GAG	2	6	5562	5567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20093446
94	NC_003551	GTA	2	6	5573	5578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20093446
95	NC_003551	GTG	2	6	5613	5618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20093446
96	NC_003551	ATC	2	6	5620	5625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20093446
97	NC_003551	CCT	2	6	5633	5638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093446
98	NC_003551	TCG	2	6	5677	5682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20093446
99	NC_003551	CGC	2	6	5728	5733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20093446
100	NC_003551	TCC	2	6	5773	5778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093446
101	NC_003551	AC	3	6	5863	5868	50 %	0 %	0 %	50 %	20093446
102	NC_003551	GAT	2	6	5886	5891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20093446
103	NC_003551	AGT	2	6	5900	5905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20093446
104	NC_003551	TTC	2	6	6052	6057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20093446
105	NC_003551	GCA	2	6	6101	6106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20093446
106	NC_003551	GAA	2	6	6126	6131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20093446
107	NC_003551	CGT	2	6	6155	6160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20093446
108	NC_003551	CGT	2	6	6170	6175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20093446
109	NC_003551	GAG	2	6	6289	6294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20093446
110	NC_003551	CGA	2	6	6380	6385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20093446
111	NC_003551	CGT	2	6	6449	6454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20093446
112	NC_003551	GCCA	2	8	6487	6494	25 %	0 %	25 %	50 %	20093446
113	NC_003551	TCC	2	6	6514	6519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093446
114	NC_003551	GGT	2	6	6591	6596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20093446
115	NC_003551	GATCCG	2	12	6610	6621	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	20093446
116	NC_003551	ACC	2	6	6631	6636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20093446
117	NC_003551	GCC	2	6	6639	6644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20093446
118	NC_003551	GTT	2	6	6653	6658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20093446
119	NC_003551	CGA	2	6	6671	6676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20093446
120	NC_003551	GCC	2	6	6729	6734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20093446
121	NC_003551	TGA	2	6	6824	6829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20093446
122	NC_003551	CGC	2	6	6908	6913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20093446
123	NC_003551	GGA	2	6	6959	6964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20093446
124	NC_003551	CGC	2	6	6968	6973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20093446
125	NC_003551	TC	3	6	7033	7038	0 %	50 %	0 %	50 %	20093446
126	NC_003551	GCC	2	6	7075	7080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20093446
127	NC_003551	CGC	2	6	7130	7135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20093446
128	NC_003551	CGA	2	6	7178	7183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20093446
129	NC_003551	GTC	2	6	7185	7190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20093446
130	NC_003551	CCAC	2	8	7214	7221	25 %	0 %	0 %	75 %	20093446
131	NC_003551	CTCC	2	8	7345	7352	0 %	25 %	0 %	75 %	20093447
132	NC_003551	CCT	2	6	7398	7403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093447
133	NC_003551	CTT	2	6	7420	7425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20093447
134	NC_003551	CTTC	2	8	7443	7450	0 %	50 %	0 %	50 %	20093447
135	NC_003551	GTCGC	2	10	7479	7488	0 %	20 %	40 %	40 %	20093447
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263	NC_003551	CGT	2	6	13856	13861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20093454
264	NC_003551	GTT	2	6	13902	13907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20093454
265	NC_003551	CTC	2	6	13968	13973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093454
266	NC_003551	GGA	2	6	13976	13981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20093454
267	NC_003551	CCT	2	6	14064	14069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093454
268	NC_003551	GAAC	2	8	14113	14120	50 %	0 %	25 %	25 %	20093454
269	NC_003551	CCG	2	6	14170	14175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20093454
270	NC_003551	GAG	2	6	14199	14204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20093454
271	NC_003551	GAA	2	6	14238	14243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20093454
272	NC_003551	GTT	2	6	14379	14384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20093454
273	NC_003551	GAG	2	6	14411	14416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20093454
274	NC_003551	CGAG	2	8	14432	14439	25 %	0 %	50 %	25 %	20093454
275	NC_003551	CGG	2	6	14452	14457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20093454
276	NC_003551	TGA	2	6	14516	14521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20093454
277	NC_003551	TCG	2	6	14618	14623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20093455
278	NC_003551	CGTC	2	8	14685	14692	0 %	25 %	25 %	50 %	20093455
279	NC_003551	CAT	2	6	14722	14727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20093455
280	NC_003551	GCC	2	6	14863	14868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20093455
281	NC_003551	TGT	2	6	14900	14905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20093455
282	NC_003551	GGA	2	6	14913	14918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20093455
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287	NC_003551	TG	3	6	15109	15114	0 %	50 %	50 %	0 %	20093455
288	NC_003551	TGCGGG	2	12	15182	15193	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	20093455
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290	NC_003551	CCA	2	6	15370	15375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20093456
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294	NC_003551	CCG	2	6	15612	15617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20093456
295	NC_003551	CTC	2	6	15650	15655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093456
296	NC_003551	GAG	2	6	15788	15793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20093456
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298	NC_003551	CCT	2	6	15847	15852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093456
299	NC_003551	CCGAG	2	10	15880	15889	20 %	0 %	40 %	40 %	20093456
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301	NC_003551	GGA	2	6	16078	16083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20093456
302	NC_003551	CCT	2	6	16260	16265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093456
303	NC_003551	GGCT	2	8	16310	16317	0 %	25 %	50 %	25 %	20093457
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344	NC_003551	CGG	2	6	18148	18153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20093458
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376	NC_003551	AGTC	2	8	19607	19614	25 %	25 %	25 %	25 %	20093460
377	NC_003551	CGA	2	6	19634	19639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20093460
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380	NC_003551	ATCG	2	8	20234	20241	25 %	25 %	25 %	25 %	20093461
381	NC_003551	GCG	3	9	20243	20251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20093461
382	NC_003551	TCG	2	6	20253	20258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20093461
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385	NC_003551	CTT	2	6	20437	20442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20093461
386	NC_003551	GTC	2	6	20459	20464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20093461
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389	NC_003551	TCG	2	6	20613	20618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20093461
390	NC_003551	TCG	2	6	20641	20646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20093461
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393	NC_003551	CAG	2	6	20893	20898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20093462
394	NC_003551	CGC	2	6	20908	20913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20093462
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