MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium bovis AF2122/97 chromosome

Total Repeats: 99350

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002945	AC	3	6	24027	24032	50 %	0 %	0 %	50 %	31791197
502	NC_002945	GAT	2	6	24073	24078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31791197
503	NC_002945	CGT	2	6	24117	24122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791197
504	NC_002945	CGG	2	6	24147	24152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791197
505	NC_002945	GCC	2	6	24160	24165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791197
506	NC_002945	GCTG	2	8	24194	24201	0 %	25 %	50 %	25 %	31791197
507	NC_002945	CGTAGT	2	12	24228	24239	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	31791197
508	NC_002945	CGGC	2	8	24242	24249	0 %	0 %	50 %	50 %	31791197
509	NC_002945	GAG	2	6	24273	24278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31791197
510	NC_002945	GCC	3	9	24325	24333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791197
511	NC_002945	GCCG	2	8	24342	24349	0 %	0 %	50 %	50 %	31791197
512	NC_002945	CGGG	2	8	24417	24424	0 %	0 %	75 %	25 %	31791197
513	NC_002945	CTC	2	6	24454	24459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31791197
514	NC_002945	CCG	2	6	24494	24499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791197
515	NC_002945	GCC	2	6	24511	24516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791197
516	NC_002945	GCC	2	6	24535	24540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791197
517	NC_002945	GCCGG	2	10	24587	24596	0 %	0 %	60 %	40 %	31791197
518	NC_002945	AGG	2	6	24604	24609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31791197
519	NC_002945	GCG	2	6	24624	24629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791197
520	NC_002945	C	6	6	24635	24640	0 %	0 %	0 %	100 %	31791197
521	NC_002945	CCTGGT	2	12	24666	24677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791197
522	NC_002945	GCC	2	6	24802	24807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791197
523	NC_002945	C	6	6	24823	24828	0 %	0 %	0 %	100 %	31791197
524	NC_002945	CCA	2	6	24860	24865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31791197
525	NC_002945	GTC	2	6	24895	24900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791197
526	NC_002945	TCG	2	6	24908	24913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791197
527	NC_002945	GCCCCT	2	12	24918	24929	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	31791197
528	NC_002945	CGG	2	6	25024	25029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791197
529	NC_002945	CGA	2	6	25090	25095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791197
530	NC_002945	GAC	2	6	25108	25113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791197
531	NC_002945	ATG	2	6	25235	25240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31791197
532	NC_002945	GCC	2	6	25292	25297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791197
533	NC_002945	GCA	2	6	25305	25310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791197
534	NC_002945	GC	3	6	25901	25906	0 %	0 %	50 %	50 %	31791198
535	NC_002945	CGC	2	6	25924	25929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791198
536	NC_002945	TTG	2	6	25930	25935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791198
537	NC_002945	CGG	2	6	25956	25961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791198
538	NC_002945	CGG	2	6	25998	26003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791198
539	NC_002945	CTT	2	6	26061	26066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31791198
540	NC_002945	GT	3	6	26135	26140	0 %	50 %	50 %	0 %	31791198
541	NC_002945	GTG	2	6	26180	26185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791198
542	NC_002945	GTC	2	6	26194	26199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791198
543	NC_002945	GCC	2	6	26207	26212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791198
544	NC_002945	AGC	2	6	26213	26218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791198
545	NC_002945	CGG	2	6	26286	26291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791198
546	NC_002945	CGG	2	6	26307	26312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791198
547	NC_002945	CGG	2	6	26340	26345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791198
548	NC_002945	CG	3	6	26369	26374	0 %	0 %	50 %	50 %	31791198
549	NC_002945	CGA	2	6	26385	26390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791198
550	NC_002945	CCA	2	6	26457	26462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31791198
551	NC_002945	GCTC	2	8	26486	26493	0 %	25 %	25 %	50 %	31791198
552	NC_002945	CGG	2	6	26535	26540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791198
553	NC_002945	AGC	2	6	26621	26626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791198
554	NC_002945	TGA	2	6	26652	26657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31791198
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556	NC_002945	CCAA	2	8	26703	26710	50 %	0 %	0 %	50 %	31791198
557	NC_002945	GCC	2	6	26725	26730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791198
558	NC_002945	CAGC	2	8	26769	26776	25 %	0 %	25 %	50 %	31791198
559	NC_002945	CCG	2	6	26780	26785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791198
560	NC_002945	CAC	2	6	26857	26862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31791198
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562	NC_002945	CAG	2	6	27094	27099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791199
563	NC_002945	CGC	2	6	27135	27140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791199
564	NC_002945	GCA	2	6	27153	27158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791199
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567	NC_002945	GCT	2	6	27273	27278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791199
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569	NC_002945	CGT	2	6	27366	27371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791199
570	NC_002945	CGGC	2	8	27589	27596	0 %	0 %	50 %	50 %	31791200
571	NC_002945	GGC	2	6	27647	27652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791200
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573	NC_002945	GCC	2	6	27752	27757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791200
574	NC_002945	CGC	2	6	27782	27787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791200
575	NC_002945	CGC	2	6	27818	27823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791200
576	NC_002945	CCG	2	6	27848	27853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791200
577	NC_002945	GTC	2	6	27864	27869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791200
578	NC_002945	CGA	2	6	27958	27963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791200
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580	NC_002945	GCC	2	6	28029	28034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791200
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582	NC_002945	CG	3	6	28114	28119	0 %	0 %	50 %	50 %	31791200
583	NC_002945	GC	3	6	28120	28125	0 %	0 %	50 %	50 %	31791200
584	NC_002945	GTC	2	6	28181	28186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791200
585	NC_002945	TCGGCG	2	12	28216	28227	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	31791200
586	NC_002945	CGA	2	6	28229	28234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791200
587	NC_002945	GC	3	6	28273	28278	0 %	0 %	50 %	50 %	31791200
588	NC_002945	TCG	2	6	28297	28302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791200
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593	NC_002945	CTG	2	6	28445	28450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791201
594	NC_002945	GGC	2	6	28519	28524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791201
595	NC_002945	CTG	2	6	28533	28538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791201
596	NC_002945	TCA	2	6	28566	28571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31791201
597	NC_002945	CGG	2	6	28601	28606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791201
598	NC_002945	CGA	2	6	28624	28629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791201
599	NC_002945	GCTC	2	8	28631	28638	0 %	25 %	25 %	50 %	31791201
600	NC_002945	ACC	2	6	28643	28648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31791201
601	NC_002945	CGT	2	6	28691	28696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791201
602	NC_002945	GC	4	8	28708	28715	0 %	0 %	50 %	50 %	31791201
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606	NC_002945	TGCG	2	8	28770	28777	0 %	25 %	50 %	25 %	31791201
607	NC_002945	CGC	2	6	28867	28872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791201
608	NC_002945	CAC	2	6	28983	28988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31791201
609	NC_002945	CCGG	2	8	29034	29041	0 %	0 %	50 %	50 %	31791201
610	NC_002945	CAA	2	6	29088	29093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31791201
611	NC_002945	GTC	2	6	29098	29103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791201
612	NC_002945	CAA	2	6	29148	29153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31791201
613	NC_002945	GGCAA	2	10	29281	29290	40 %	0 %	40 %	20 %	31791202
614	NC_002945	ACG	2	6	29292	29297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791202
615	NC_002945	GC	3	6	29340	29345	0 %	0 %	50 %	50 %	31791202
616	NC_002945	CGTC	2	8	29365	29372	0 %	25 %	25 %	50 %	31791202
617	NC_002945	CG	3	6	29402	29407	0 %	0 %	50 %	50 %	31791202
618	NC_002945	GGATCA	2	12	29413	29424	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	31791202
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621	NC_002945	GCC	3	9	29507	29515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791202
622	NC_002945	CACG	2	8	29725	29732	25 %	0 %	25 %	50 %	31791203
623	NC_002945	ACCG	2	8	29806	29813	25 %	0 %	25 %	50 %	31791203
624	NC_002945	GGT	2	6	29824	29829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791203
625	NC_002945	CGC	2	6	29935	29940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791203
626	NC_002945	AGC	2	6	29962	29967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791203
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