MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CDC1551 chromosome

Total Repeats: 99677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002755	GCC	2	6	24161	24166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839394
502	NC_002755	GCTG	2	8	24195	24202	0 %	25 %	50 %	25 %	15839394
503	NC_002755	CGTAGT	2	12	24229	24240	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15839394
504	NC_002755	CGGC	2	8	24243	24250	0 %	0 %	50 %	50 %	15839394
505	NC_002755	GAG	2	6	24274	24279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15839394
506	NC_002755	GCC	3	9	24326	24334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839394
507	NC_002755	GCCG	2	8	24343	24350	0 %	0 %	50 %	50 %	15839394
508	NC_002755	CGGG	2	8	24418	24425	0 %	0 %	75 %	25 %	15839394
509	NC_002755	CTC	2	6	24455	24460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15839394
510	NC_002755	CCG	2	6	24495	24500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839394
511	NC_002755	GCC	2	6	24512	24517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839394
512	NC_002755	GCC	2	6	24536	24541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839394
513	NC_002755	GCCGG	2	10	24588	24597	0 %	0 %	60 %	40 %	15839394
514	NC_002755	AGG	2	6	24605	24610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15839394
515	NC_002755	GCG	2	6	24625	24630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839394
516	NC_002755	C	6	6	24636	24641	0 %	0 %	0 %	100 %	15839394
517	NC_002755	CCTGGT	2	12	24667	24678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839394
518	NC_002755	GCC	2	6	24803	24808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839394
519	NC_002755	C	6	6	24824	24829	0 %	0 %	0 %	100 %	15839394
520	NC_002755	CCA	2	6	24861	24866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839394
521	NC_002755	GTC	2	6	24896	24901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839394
522	NC_002755	TCG	2	6	24909	24914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839394
523	NC_002755	GCCCCT	2	12	24919	24930	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	15839394
524	NC_002755	CGG	2	6	25025	25030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839394
525	NC_002755	CGA	2	6	25091	25096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839394
526	NC_002755	GAC	2	6	25109	25114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839394
527	NC_002755	ATG	2	6	25236	25241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15839394
528	NC_002755	GCC	2	6	25293	25298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839394
529	NC_002755	GCA	2	6	25306	25311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839394
530	NC_002755	GC	3	6	25902	25907	0 %	0 %	50 %	50 %	15839395
531	NC_002755	CGC	2	6	25925	25930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839395
532	NC_002755	TTG	2	6	25931	25936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839395
533	NC_002755	CGG	2	6	25957	25962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839395
534	NC_002755	CGG	2	6	25999	26004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839395
535	NC_002755	GCA	2	6	26031	26036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839395
536	NC_002755	CTT	2	6	26062	26067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15839395
537	NC_002755	GT	3	6	26136	26141	0 %	50 %	50 %	0 %	15839395
538	NC_002755	GTG	2	6	26181	26186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839395
539	NC_002755	GTC	2	6	26195	26200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839395
540	NC_002755	GCC	2	6	26208	26213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839395
541	NC_002755	AGC	2	6	26214	26219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839395
542	NC_002755	CGG	2	6	26287	26292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839395
543	NC_002755	CGG	2	6	26308	26313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839395
544	NC_002755	CGG	2	6	26341	26346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839395
545	NC_002755	CG	3	6	26370	26375	0 %	0 %	50 %	50 %	15839395
546	NC_002755	CGA	2	6	26386	26391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839395
547	NC_002755	CCA	2	6	26458	26463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839395
548	NC_002755	GCTC	2	8	26487	26494	0 %	25 %	25 %	50 %	15839395
549	NC_002755	CGG	2	6	26536	26541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839395
550	NC_002755	AGC	2	6	26622	26627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839395
551	NC_002755	TGA	2	6	26653	26658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15839395
552	NC_002755	GCG	2	6	26682	26687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839395
553	NC_002755	CCAA	2	8	26704	26711	50 %	0 %	0 %	50 %	15839395
554	NC_002755	GCC	2	6	26726	26731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839395
555	NC_002755	CAGC	2	8	26770	26777	25 %	0 %	25 %	50 %	15839395
556	NC_002755	CCG	2	6	26781	26786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839395
557	NC_002755	CAC	2	6	26858	26863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839395
558	NC_002755	CAC	2	6	27047	27052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839396
559	NC_002755	CAG	2	6	27095	27100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839396
560	NC_002755	CGC	2	6	27136	27141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839396
561	NC_002755	GCA	2	6	27154	27159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839396
562	NC_002755	CGT	2	6	27160	27165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839396
563	NC_002755	GCC	2	6	27200	27205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839396
564	NC_002755	GCT	2	6	27274	27279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839396
565	NC_002755	CGGC	2	8	27590	27597	0 %	0 %	50 %	50 %	15839397
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568	NC_002755	GCC	2	6	27753	27758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839397
569	NC_002755	CGC	2	6	27783	27788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839397
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573	NC_002755	CGA	2	6	27959	27964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839397
574	NC_002755	TC	3	6	27990	27995	0 %	50 %	0 %	50 %	15839397
575	NC_002755	GCC	2	6	28030	28035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839397
576	NC_002755	CCGG	2	8	28076	28083	0 %	0 %	50 %	50 %	15839397
577	NC_002755	CG	3	6	28115	28120	0 %	0 %	50 %	50 %	15839397
578	NC_002755	GC	3	6	28121	28126	0 %	0 %	50 %	50 %	15839397
579	NC_002755	GTC	2	6	28182	28187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839397
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581	NC_002755	CGA	2	6	28230	28235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839397
582	NC_002755	GC	3	6	28274	28279	0 %	0 %	50 %	50 %	15839397
583	NC_002755	TCG	2	6	28298	28303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839397
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589	NC_002755	GGC	2	6	28520	28525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839398
590	NC_002755	CTG	2	6	28534	28539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839398
591	NC_002755	TCA	2	6	28567	28572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15839398
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593	NC_002755	CGA	2	6	28625	28630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839398
594	NC_002755	GCTC	2	8	28632	28639	0 %	25 %	25 %	50 %	15839398
595	NC_002755	ACC	2	6	28644	28649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839398
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597	NC_002755	GC	4	8	28709	28716	0 %	0 %	50 %	50 %	15839398
598	NC_002755	CGA	2	6	28740	28745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839398
599	NC_002755	ACG	2	6	28751	28756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839398
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601	NC_002755	TGCG	2	8	28771	28778	0 %	25 %	50 %	25 %	15839398
602	NC_002755	CGC	2	6	28868	28873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839398
603	NC_002755	CAC	2	6	28985	28990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839398
604	NC_002755	CCGG	2	8	29036	29043	0 %	0 %	50 %	50 %	15839398
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607	NC_002755	CAA	2	6	29150	29155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15839398
608	NC_002755	GGCAA	2	10	29283	29292	40 %	0 %	40 %	20 %	15839399
609	NC_002755	ACG	2	6	29294	29299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839399
610	NC_002755	GC	3	6	29342	29347	0 %	0 %	50 %	50 %	15839399
611	NC_002755	CGTC	2	8	29367	29374	0 %	25 %	25 %	50 %	15839399
612	NC_002755	CG	3	6	29404	29409	0 %	0 %	50 %	50 %	15839399
613	NC_002755	GGATCA	2	12	29415	29426	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15839399
614	NC_002755	AGC	2	6	29482	29487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839399
615	NC_002755	CACG	2	8	29726	29733	25 %	0 %	25 %	50 %	15839400
616	NC_002755	ACCG	2	8	29807	29814	25 %	0 %	25 %	50 %	15839400
617	NC_002755	GGT	2	6	29825	29830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839400
618	NC_002755	CGC	2	6	29936	29941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839400
619	NC_002755	AGC	2	6	29963	29968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839400
620	NC_002755	GTC	2	6	30012	30017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839400
621	NC_002755	CGATC	2	10	30108	30117	20 %	20 %	20 %	40 %	15839400
622	NC_002755	CCGG	2	8	30126	30133	0 %	0 %	50 %	50 %	15839400
623	NC_002755	CG	3	6	30134	30139	0 %	0 %	50 %	50 %	15839400
624	NC_002755	GGT	2	6	30185	30190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839400
625	NC_002755	GCC	2	6	30234	30239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839400
626	NC_002755	GTCG	2	8	30302	30309	0 %	25 %	50 %	25 %	15839400
627	NC_002755	GCG	2	6	30316	30321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839400
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629	NC_002755	CCT	2	6	30380	30385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15839400
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758	NC_002755	GCA	2	6	37238	37243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839412
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