MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CDC1551 chromosome

Total Repeats: 99677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_002755	GCC	2	6	228277	228282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839573
5002	NC_002755	CGG	2	6	228310	228315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839573
5003	NC_002755	GCG	2	6	228321	228326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839573
5004	NC_002755	GAG	2	6	228333	228338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15839573
5005	NC_002755	GC	3	6	228381	228386	0 %	0 %	50 %	50 %	15839573
5006	NC_002755	CGG	2	6	228401	228406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839573
5007	NC_002755	CAACGC	2	12	228408	228419	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	15839573
5008	NC_002755	GTT	2	6	228455	228460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839573
5009	NC_002755	GAC	2	6	228468	228473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5010	NC_002755	AGG	2	6	228514	228519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15839573
5011	NC_002755	TGC	2	6	228520	228525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5012	NC_002755	CGC	2	6	228564	228569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839573
5013	NC_002755	CGA	2	6	228641	228646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5014	NC_002755	GT	3	6	228735	228740	0 %	50 %	50 %	0 %	15839573
5015	NC_002755	GCA	2	6	228773	228778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5016	NC_002755	CACC	2	8	228810	228817	25 %	0 %	0 %	75 %	15839573
5017	NC_002755	CGC	2	6	228834	228839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839573
5018	NC_002755	CTG	2	6	228840	228845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5019	NC_002755	CTG	2	6	228876	228881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5020	NC_002755	TGG	2	6	228883	228888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839573
5021	NC_002755	CTG	2	6	228909	228914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5022	NC_002755	CGC	2	6	228954	228959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839573
5023	NC_002755	TGG	2	6	228978	228983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839573
5024	NC_002755	CGT	2	6	229091	229096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5025	NC_002755	GCCTGG	2	12	229114	229125	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15839573
5026	NC_002755	GAC	2	6	229137	229142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5027	NC_002755	CCG	2	6	229171	229176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839573
5028	NC_002755	GTG	2	6	229233	229238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839573
5029	NC_002755	TGG	2	6	229255	229260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839573
5030	NC_002755	GCT	2	6	229262	229267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5031	NC_002755	CAC	2	6	229301	229306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839573
5032	NC_002755	CGG	2	6	229365	229370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839573
5033	NC_002755	CGG	2	6	229417	229422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839573
5034	NC_002755	GAC	2	6	229488	229493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5035	NC_002755	GCT	2	6	229523	229528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5036	NC_002755	TAC	2	6	229536	229541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15839573
5037	NC_002755	ACC	2	6	229572	229577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839573
5038	NC_002755	TCGG	2	8	229623	229630	0 %	25 %	50 %	25 %	15839573
5039	NC_002755	TGT	2	6	229663	229668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839573
5040	NC_002755	CGA	2	6	229700	229705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5041	NC_002755	GCG	2	6	229716	229721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839573
5042	NC_002755	GGC	2	6	229724	229729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839573
5043	NC_002755	GCT	2	6	229745	229750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5044	NC_002755	CGT	2	6	229765	229770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5045	NC_002755	CGG	2	6	229774	229779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839573
5046	NC_002755	GTG	2	6	229801	229806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839573
5047	NC_002755	CCGG	2	8	229884	229891	0 %	0 %	50 %	50 %	15839573
5048	NC_002755	GGT	2	6	229898	229903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839573
5049	NC_002755	TCG	2	6	229906	229911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5050	NC_002755	TGG	2	6	229948	229953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839573
5051	NC_002755	ACGG	2	8	230101	230108	25 %	0 %	50 %	25 %	15839573
5052	NC_002755	GAT	2	6	230165	230170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15839573
5053	NC_002755	CCG	2	6	230227	230232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839573
5054	NC_002755	CTG	3	9	230286	230294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5055	NC_002755	GTG	2	6	230334	230339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839573
5056	NC_002755	CACCCT	2	12	230348	230359	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	15839573
5057	NC_002755	GAC	2	6	230372	230377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5058	NC_002755	GCT	2	6	230481	230486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5059	NC_002755	GGC	2	6	230510	230515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839573
5060	NC_002755	AACT	2	8	230733	230740	50 %	25 %	0 %	25 %	15839574
5061	NC_002755	TGT	2	6	230873	230878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839575
5062	NC_002755	GGAA	2	8	230908	230915	50 %	0 %	50 %	0 %	15839575
5063	NC_002755	CAC	2	6	230916	230921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839575
5064	NC_002755	G	6	6	230923	230928	0 %	0 %	100 %	0 %	15839575
5065	NC_002755	GAG	2	6	230974	230979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15839575
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5067	NC_002755	GGT	2	6	231036	231041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839575
5068	NC_002755	GCGA	2	8	231043	231050	25 %	0 %	50 %	25 %	15839575
5069	NC_002755	GC	3	6	231108	231113	0 %	0 %	50 %	50 %	15839575
5070	NC_002755	CCA	2	6	231155	231160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839575
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5073	NC_002755	GAT	2	6	231273	231278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15839575
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5080	NC_002755	GCC	2	6	231448	231453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839575
5081	NC_002755	TGC	2	6	231479	231484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839575
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5083	NC_002755	CGCA	2	8	231598	231605	25 %	0 %	25 %	50 %	15839575
5084	NC_002755	TGCGC	2	10	231618	231627	0 %	20 %	40 %	40 %	15839575
5085	NC_002755	TGAT	2	8	231640	231647	25 %	50 %	25 %	0 %	15839575
5086	NC_002755	TGG	2	6	231777	231782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839576
5087	NC_002755	TGC	2	6	231840	231845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839576
5088	NC_002755	GCG	2	6	231852	231857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839576
5089	NC_002755	ACT	2	6	231879	231884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15839576
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5091	NC_002755	G	6	6	231967	231972	0 %	0 %	100 %	0 %	15839576
5092	NC_002755	GCT	2	6	231979	231984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839576
5093	NC_002755	CAG	2	6	232010	232015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839576
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5095	NC_002755	GGCG	2	8	232069	232076	0 %	0 %	75 %	25 %	15839576
5096	NC_002755	CG	3	6	232111	232116	0 %	0 %	50 %	50 %	15839576
5097	NC_002755	GCG	2	6	232121	232126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839576
5098	NC_002755	CCG	2	6	232181	232186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839576
5099	NC_002755	GCG	2	6	232255	232260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839576
5100	NC_002755	CGC	2	6	232269	232274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839576
5101	NC_002755	CTG	3	9	232304	232312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839576
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5103	NC_002755	TCG	2	6	232397	232402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839577
5104	NC_002755	CGA	2	6	232410	232415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839577
5105	NC_002755	CAA	2	6	232476	232481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15839577
5106	NC_002755	AAC	2	6	232507	232512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15839577
5107	NC_002755	GCC	2	6	232538	232543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839577
5108	NC_002755	GAG	2	6	232561	232566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15839577
5109	NC_002755	CGG	2	6	232629	232634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839577
5110	NC_002755	TCT	2	6	232643	232648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15839577
5111	NC_002755	CGG	4	12	232653	232664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839577
5112	NC_002755	TCG	2	6	232679	232684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839577
5113	NC_002755	GCG	2	6	232694	232699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839577
5114	NC_002755	CGG	2	6	232788	232793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839577
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5116	NC_002755	TCG	2	6	232835	232840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839577
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5118	NC_002755	GAT	2	6	232920	232925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15839577
5119	NC_002755	GATC	2	8	232929	232936	25 %	25 %	25 %	25 %	15839577
5120	NC_002755	CGT	2	6	232938	232943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839577
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5122	NC_002755	GC	3	6	233094	233099	0 %	0 %	50 %	50 %	15839577
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5237	NC_002755	GGC	2	6	237827	237832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839580
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5240	NC_002755	CGCT	2	8	237995	238002	0 %	25 %	25 %	50 %	15839580
5241	NC_002755	CGG	2	6	238009	238014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839580
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5245	NC_002755	CTT	2	6	238297	238302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15839581
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5249	NC_002755	GTT	2	6	238462	238467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839581
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5359	NC_002755	AGCA	2	8	243168	243175	50 %	0 %	25 %	25 %	15839584
5360	NC_002755	CGA	2	6	243182	243187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839584
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5362	NC_002755	CG	3	6	243224	243229	0 %	0 %	50 %	50 %	15839584
5363	NC_002755	G	6	6	243246	243251	0 %	0 %	100 %	0 %	15839584
5364	NC_002755	GCGG	2	8	243300	243307	0 %	0 %	75 %	25 %	15839584
5365	NC_002755	CGT	2	6	243311	243316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839584
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5489	NC_002755	GCA	2	6	248592	248597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839588
5490	NC_002755	AGC	2	6	248666	248671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839588
5491	NC_002755	AGCC	2	8	248674	248681	25 %	0 %	25 %	50 %	15839588
5492	NC_002755	TCGCCA	2	12	248730	248741	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15839588
5493	NC_002755	ACC	2	6	248777	248782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839588
5494	NC_002755	CG	3	6	248826	248831	0 %	0 %	50 %	50 %	15839588
5495	NC_002755	AGG	2	6	248849	248854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15839588
5496	NC_002755	CCG	2	6	248911	248916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839588
5497	NC_002755	GT	3	6	248958	248963	0 %	50 %	50 %	0 %	15839588
5498	NC_002755	GCAT	2	8	248990	248997	25 %	25 %	25 %	25 %	15839588
5499	NC_002755	TGG	2	6	249005	249010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839588
5500	NC_002755	TCG	2	6	249172	249177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839589

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