MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium leprae TN chromosome

Total Repeats: 34154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_002677	GAA	2	6	305373	305378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15827031
4002	NC_002677	GAT	2	6	305398	305403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15827031
4003	NC_002677	GCC	2	6	305419	305424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15827031
4004	NC_002677	CCG	2	6	305525	305530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15827031
4005	NC_002677	CGG	2	6	305541	305546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15827031
4006	NC_002677	CGG	2	6	305548	305553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15827031
4007	NC_002677	CGAT	2	8	305588	305595	25 %	25 %	25 %	25 %	15827031
4008	NC_002677	GCG	2	6	305608	305613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15827031
4009	NC_002677	TCG	2	6	305628	305633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827031
4010	NC_002677	TAAAA	2	10	305704	305713	80 %	20 %	0 %	0 %	15827031
4011	NC_002677	GTC	2	6	306039	306044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827032
4012	NC_002677	CGAAGG	2	12	306119	306130	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	15827032
4013	NC_002677	CAG	2	6	306213	306218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827032
4014	NC_002677	AAG	2	6	306255	306260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15827032
4015	NC_002677	TGAGC	2	10	306266	306275	20 %	20 %	40 %	20 %	15827032
4016	NC_002677	GGGA	2	8	306343	306350	25 %	0 %	75 %	0 %	15827032
4017	NC_002677	GCC	2	6	306360	306365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15827032
4018	NC_002677	CAG	2	6	306408	306413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827032
4019	NC_002677	GCT	2	6	306422	306427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827032
4020	NC_002677	GCT	2	6	306450	306455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827032
4021	NC_002677	GCT	2	6	306540	306545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827032
4022	NC_002677	AAC	2	6	306630	306635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15827032
4023	NC_002677	GTC	2	6	306675	306680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827032
4024	NC_002677	AGC	2	6	306736	306741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827032
4025	NC_002677	AC	3	6	306745	306750	50 %	0 %	0 %	50 %	15827032
4026	NC_002677	GAG	2	6	306798	306803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15827032
4027	NC_002677	GAA	2	6	306809	306814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15827032
4028	NC_002677	GGTGCC	2	12	306882	306893	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15827032
4029	NC_002677	CGAT	2	8	306904	306911	25 %	25 %	25 %	25 %	15827032
4030	NC_002677	ACC	2	6	306969	306974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15827032
4031	NC_002677	CGA	2	6	306977	306982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827032
4032	NC_002677	CGC	2	6	307007	307012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15827032
4033	NC_002677	GGTG	2	8	307040	307047	0 %	25 %	75 %	0 %	15827032
4034	NC_002677	CCA	2	6	307106	307111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15827032
4035	NC_002677	TGG	2	6	307138	307143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15827032
4036	NC_002677	CCG	2	6	307144	307149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15827032
4037	NC_002677	TCC	2	6	307183	307188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15827032
4038	NC_002677	CCA	2	6	307254	307259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15827032
4039	NC_002677	CGA	2	6	307274	307279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827032
4040	NC_002677	CCG	2	6	307295	307300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15827032
4041	NC_002677	GGC	2	6	307340	307345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15827032
4042	NC_002677	GAC	2	6	307440	307445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827032
4043	NC_002677	GCT	2	6	307520	307525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827032
4044	NC_002677	GGA	3	9	307532	307540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15827032
4045	NC_002677	AGG	2	6	307564	307569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15827032
4046	NC_002677	CGT	2	6	307599	307604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827032
4047	NC_002677	GTTC	2	8	307642	307649	0 %	50 %	25 %	25 %	15827032
4048	NC_002677	CGA	3	9	307718	307726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827032
4049	NC_002677	CCG	2	6	307794	307799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15827032
4050	NC_002677	GAG	2	6	307815	307820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15827032
4051	NC_002677	GCG	2	6	307844	307849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15827032
4052	NC_002677	GGT	2	6	307862	307867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15827032
4053	NC_002677	CGA	2	6	307874	307879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827032
4054	NC_002677	GGC	2	6	307936	307941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15827032
4055	NC_002677	CGGT	2	8	308029	308036	0 %	25 %	50 %	25 %	15827032
4056	NC_002677	GTG	2	6	308056	308061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15827032
4057	NC_002677	GAA	2	6	308105	308110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15827032
4058	NC_002677	CGA	2	6	308141	308146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827032
4059	NC_002677	CAT	2	6	308147	308152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15827032
4060	NC_002677	CCA	2	6	308159	308164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15827032
4061	NC_002677	TGA	2	6	308174	308179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15827032
4062	NC_002677	ATC	2	6	308181	308186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15827032
4063	NC_002677	ACAA	2	8	308256	308263	75 %	0 %	0 %	25 %	15827032
4064	NC_002677	TTG	2	6	308274	308279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15827032
4065	NC_002677	GCG	2	6	308321	308326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15827032
4066	NC_002677	GTC	2	6	308397	308402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827032
4067	NC_002677	CGTCGA	2	12	308405	308416	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15827032
4068	NC_002677	TTCACT	2	12	308454	308465	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15827032
4069	NC_002677	ACCG	2	8	309646	309653	25 %	0 %	25 %	50 %	15827033
4070	NC_002677	CGG	2	6	309738	309743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15827033
4071	NC_002677	CGC	2	6	309750	309755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15827033
4072	NC_002677	CGG	2	6	309777	309782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15827033
4073	NC_002677	AT	3	6	309859	309864	50 %	50 %	0 %	0 %	15827033
4074	NC_002677	GCC	2	6	309962	309967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15827033
4075	NC_002677	CAAC	2	8	310038	310045	50 %	0 %	0 %	50 %	15827033
4076	NC_002677	ATG	2	6	310115	310120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15827033
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4078	NC_002677	AGC	2	6	310279	310284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827033
4079	NC_002677	CCA	2	6	310305	310310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15827033
4080	NC_002677	GAA	2	6	310318	310323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15827033
4081	NC_002677	TG	3	6	310358	310363	0 %	50 %	50 %	0 %	15827033
4082	NC_002677	CA	4	8	310364	310371	50 %	0 %	0 %	50 %	15827033
4083	NC_002677	CAGG	2	8	310405	310412	25 %	0 %	50 %	25 %	15827033
4084	NC_002677	C	6	6	310434	310439	0 %	0 %	0 %	100 %	15827033
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4087	NC_002677	ACC	2	6	310545	310550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15827033
4088	NC_002677	GC	3	6	310554	310559	0 %	0 %	50 %	50 %	15827033
4089	NC_002677	GCA	2	6	310572	310577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827033
4090	NC_002677	CA	3	6	310576	310581	50 %	0 %	0 %	50 %	15827033
4091	NC_002677	CGG	2	6	310596	310601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15827033
4092	NC_002677	GCT	2	6	310620	310625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827033
4093	NC_002677	CTACTG	2	12	310674	310685	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15827033
4094	NC_002677	CGT	2	6	310725	310730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827033
4095	NC_002677	ATT	2	6	310766	310771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15827033
4096	NC_002677	GGC	3	9	310808	310816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15827033
4097	NC_002677	GA	3	6	310843	310848	50 %	0 %	50 %	0 %	15827033
4098	NC_002677	CGCAC	2	10	310895	310904	20 %	0 %	20 %	60 %	15827033
4099	NC_002677	TC	3	6	312230	312235	0 %	50 %	0 %	50 %	15827034
4100	NC_002677	TGC	2	6	312240	312245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827034
4101	NC_002677	AC	3	6	312297	312302	50 %	0 %	0 %	50 %	15827034
4102	NC_002677	GGTG	2	8	312304	312311	0 %	25 %	75 %	0 %	15827034
4103	NC_002677	GCA	2	6	312315	312320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827034
4104	NC_002677	TCC	2	6	312371	312376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15827034
4105	NC_002677	CAAG	2	8	312381	312388	50 %	0 %	25 %	25 %	15827034
4106	NC_002677	GCCG	2	8	312400	312407	0 %	0 %	50 %	50 %	15827034
4107	NC_002677	CGC	2	6	312436	312441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15827034
4108	NC_002677	CAC	2	6	312448	312453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15827034
4109	NC_002677	CGA	2	6	312535	312540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827034
4110	NC_002677	CGT	2	6	312646	312651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827034
4111	NC_002677	CGG	2	6	312666	312671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15827034
4112	NC_002677	CGC	2	6	312699	312704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15827034
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4115	NC_002677	TGA	2	6	313020	313025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15827034
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4117	NC_002677	ACATG	2	10	313140	313149	40 %	20 %	20 %	20 %	15827034
4118	NC_002677	CGT	2	6	313281	313286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827034
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4123	NC_002677	CGC	2	6	313496	313501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15827034
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4242	NC_002677	ACG	2	6	320096	320101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827040
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4246	NC_002677	GTCGAG	2	12	320241	320252	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15827040
4247	NC_002677	GTC	2	6	320253	320258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827040
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4491	NC_002677	GAT	2	6	353096	353101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15827052
4492	NC_002677	TCA	2	6	353143	353148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15827052
4493	NC_002677	GTC	2	6	353226	353231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827052
4494	NC_002677	CGG	2	6	353249	353254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15827052
4495	NC_002677	GCG	2	6	353264	353269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15827052
4496	NC_002677	ATC	2	6	353332	353337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15827052
4497	NC_002677	GTC	2	6	353346	353351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827052
4498	NC_002677	GCCA	2	8	353361	353368	25 %	0 %	25 %	50 %	15827052
4499	NC_002677	CTG	2	6	353369	353374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827052
4500	NC_002677	TCC	2	6	353416	353421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15827052

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