MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_000916	TCA	2	6	1674816	1674821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679823
30003	NC_000916	GAT	2	6	1674966	1674971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679823
30004	NC_000916	GAT	2	6	1675001	1675006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679823
30005	NC_000916	AGG	2	6	1675177	1675182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679824
30006	NC_000916	TCCC	2	8	1675266	1675273	0 %	25 %	0 %	75 %	15679824
30007	NC_000916	CGG	2	6	1675361	1675366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679824
30008	NC_000916	CTG	2	6	1675376	1675381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679824
30009	NC_000916	GCA	2	6	1675390	1675395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679824
30010	NC_000916	CAA	3	9	1675454	1675462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679824
30011	NC_000916	CCTA	2	8	1675485	1675492	25 %	25 %	0 %	50 %	15679824
30012	NC_000916	ATT	2	6	1675641	1675646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679825
30013	NC_000916	CA	3	6	1675649	1675654	50 %	0 %	0 %	50 %	15679825
30014	NC_000916	TCT	2	6	1675658	1675663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679825
30015	NC_000916	GGA	2	6	1675666	1675671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679825
30016	NC_000916	GGC	3	9	1675709	1675717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679825
30017	NC_000916	GAC	2	6	1675769	1675774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679825
30018	NC_000916	TCA	2	6	1675814	1675819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679825
30019	NC_000916	CTT	2	6	1675823	1675828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679825
30020	NC_000916	CAT	2	6	1675864	1675869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679825
30021	NC_000916	CCT	2	6	1675944	1675949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679825
30022	NC_000916	GGA	2	6	1676049	1676054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679825
30023	NC_000916	TGG	2	6	1676134	1676139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679825
30024	NC_000916	GCT	2	6	1676176	1676181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679825
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30026	NC_000916	GCAG	2	8	1676273	1676280	25 %	0 %	50 %	25 %	15679825
30027	NC_000916	GATG	2	8	1676290	1676297	25 %	25 %	50 %	0 %	15679825
30028	NC_000916	CAT	2	6	1676308	1676313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679825
30029	NC_000916	GTCA	2	8	1676317	1676324	25 %	25 %	25 %	25 %	15679825
30030	NC_000916	GAG	2	6	1676333	1676338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679825
30031	NC_000916	CAT	2	6	1676353	1676358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679825
30032	NC_000916	CAGTC	2	10	1676372	1676381	20 %	20 %	20 %	40 %	15679825
30033	NC_000916	AAT	2	6	1676590	1676595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679825
30034	NC_000916	GGA	2	6	1676596	1676601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679825
30035	NC_000916	TGT	2	6	1676626	1676631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679825
30036	NC_000916	G	7	7	1676645	1676651	0 %	0 %	100 %	0 %	15679825
30037	NC_000916	TCA	2	6	1676670	1676675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679825
30038	NC_000916	A	7	7	1676723	1676729	100 %	0 %	0 %	0 %	15679826
30039	NC_000916	GAG	2	6	1676762	1676767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679826
30040	NC_000916	ATA	2	6	1676777	1676782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679826
30041	NC_000916	CATT	2	8	1676792	1676799	25 %	50 %	0 %	25 %	15679826
30042	NC_000916	GGA	2	6	1676842	1676847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679826
30043	NC_000916	GAG	2	6	1676867	1676872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679826
30044	NC_000916	GAA	2	6	1677004	1677009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679826
30045	NC_000916	TGT	2	6	1677010	1677015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679826
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30047	NC_000916	TCA	2	6	1677042	1677047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679826
30048	NC_000916	TGA	2	6	1677108	1677113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679827
30049	NC_000916	CTT	2	6	1677130	1677135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679827
30050	NC_000916	GCAT	2	8	1677180	1677187	25 %	25 %	25 %	25 %	15679827
30051	NC_000916	GCA	2	6	1677229	1677234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679827
30052	NC_000916	GAG	2	6	1677376	1677381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679827
30053	NC_000916	GAG	3	9	1677415	1677423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679827
30054	NC_000916	AGG	2	6	1677440	1677445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679827
30055	NC_000916	TGA	2	6	1677597	1677602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679827
30056	NC_000916	GAT	2	6	1677622	1677627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679827
30057	NC_000916	GAG	2	6	1677634	1677639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679827
30058	NC_000916	AGG	2	6	1677647	1677652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679827
30059	NC_000916	AGC	2	6	1677654	1677659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679827
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30061	NC_000916	A	6	6	1677781	1677786	100 %	0 %	0 %	0 %	15679827
30062	NC_000916	GAA	2	6	1677808	1677813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679827
30063	NC_000916	TGA	2	6	1677890	1677895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679827
30064	NC_000916	AAGATA	2	12	1677985	1677996	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15679827
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30085	NC_000916	AT	3	6	1679449	1679454	50 %	50 %	0 %	0 %	15679829
30086	NC_000916	GCT	2	6	1679532	1679537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679829
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30109	NC_000916	TGA	2	6	1680936	1680941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679831
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30113	NC_000916	G	6	6	1681025	1681030	0 %	0 %	100 %	0 %	15679831
30114	NC_000916	CT	3	6	1681069	1681074	0 %	50 %	0 %	50 %	15679831
30115	NC_000916	AT	3	6	1681121	1681126	50 %	50 %	0 %	0 %	15679831
30116	NC_000916	TCA	2	6	1681184	1681189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679831
30117	NC_000916	AT	3	6	1681220	1681225	50 %	50 %	0 %	0 %	15679831
30118	NC_000916	AT	4	8	1681313	1681320	50 %	50 %	0 %	0 %	15679831
30119	NC_000916	GAG	2	6	1681333	1681338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679831
30120	NC_000916	CAC	2	6	1681711	1681716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679832
30121	NC_000916	TGA	2	6	1681718	1681723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679832
30122	NC_000916	GGTCA	2	10	1681775	1681784	20 %	20 %	40 %	20 %	15679832
30123	NC_000916	ATG	2	6	1681842	1681847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679832
30124	NC_000916	GAG	2	6	1681907	1681912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679832
30125	NC_000916	TGA	2	6	1682053	1682058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679832
30126	NC_000916	AGCC	2	8	1682093	1682100	25 %	0 %	25 %	50 %	15679832
30127	NC_000916	GAG	2	6	1682112	1682117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679832
30128	NC_000916	ACCT	2	8	1682127	1682134	25 %	25 %	0 %	50 %	15679832
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30130	NC_000916	TGCC	2	8	1682181	1682188	0 %	25 %	25 %	50 %	15679832
30131	NC_000916	CA	3	6	1682193	1682198	50 %	0 %	0 %	50 %	15679832
30132	NC_000916	GGA	2	6	1682226	1682231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679832
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30134	NC_000916	TCT	2	6	1682321	1682326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679832
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30137	NC_000916	T	6	6	1682382	1682387	0 %	100 %	0 %	0 %	15679832
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30143	NC_000916	TGA	2	6	1682745	1682750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679834
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30145	NC_000916	TCA	2	6	1682807	1682812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679834
30146	NC_000916	TCC	2	6	1682818	1682823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679834
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30149	NC_000916	CCT	2	6	1682996	1683001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679834
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30165	NC_000916	GAA	2	6	1683726	1683731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679834
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30233	NC_000916	CCCT	2	8	1687533	1687540	0 %	25 %	0 %	75 %	15679838
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30470	NC_000916	GAGG	2	8	1700480	1700487	25 %	0 %	75 %	0 %	15679851
30471	NC_000916	GAT	2	6	1700492	1700497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679851
30472	NC_000916	GA	3	6	1700507	1700512	50 %	0 %	50 %	0 %	15679851
30473	NC_000916	GAT	2	6	1700664	1700669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679852
30474	NC_000916	ATC	2	6	1700670	1700675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679852
30475	NC_000916	ATG	2	6	1700743	1700748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679852
30476	NC_000916	ACCT	2	8	1700769	1700776	25 %	25 %	0 %	50 %	15679852
30477	NC_000916	GAC	2	6	1700787	1700792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679852
30478	NC_000916	CTT	2	6	1700823	1700828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679852
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30480	NC_000916	GGT	2	6	1700931	1700936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679852
30481	NC_000916	TGG	2	6	1701040	1701045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679852
30482	NC_000916	G	6	6	1701044	1701049	0 %	0 %	100 %	0 %	15679852
30483	NC_000916	CAT	2	6	1701119	1701124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679852
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30485	NC_000916	TTG	2	6	1701160	1701165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679852
30486	NC_000916	CAT	2	6	1701260	1701265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679852
30487	NC_000916	GTTTT	2	10	1701448	1701457	0 %	80 %	20 %	0 %	15679852
30488	NC_000916	GCA	2	6	1701462	1701467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679852
30489	NC_000916	TG	3	6	1701486	1701491	0 %	50 %	50 %	0 %	15679852
30490	NC_000916	ATA	2	6	1701537	1701542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679852
30491	NC_000916	TGA	4	12	1701569	1701580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679852
30492	NC_000916	ATA	2	6	1701609	1701614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679852
30493	NC_000916	GAG	2	6	1701627	1701632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679852
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30495	NC_000916	TGTT	2	8	1701707	1701714	0 %	75 %	25 %	0 %	15679853
30496	NC_000916	GGA	2	6	1701726	1701731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679853
30497	NC_000916	GGAT	2	8	1701744	1701751	25 %	25 %	50 %	0 %	15679853
30498	NC_000916	GCA	2	6	1701878	1701883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679853
30499	NC_000916	TAG	2	6	1701920	1701925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679853
30500	NC_000916	ATA	3	9	1702102	1702110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679853

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