MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_000916	GTG	2	6	1418837	1418842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679548
25502	NC_000916	TGC	2	6	1418850	1418855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679548
25503	NC_000916	GAG	2	6	1418881	1418886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679548
25504	NC_000916	TCC	2	6	1418894	1418899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679548
25505	NC_000916	GCAT	2	8	1419040	1419047	25 %	25 %	25 %	25 %	15679548
25506	NC_000916	AC	3	6	1419076	1419081	50 %	0 %	0 %	50 %	15679548
25507	NC_000916	TCAGG	2	10	1419113	1419122	20 %	20 %	40 %	20 %	15679548
25508	NC_000916	TGG	2	6	1419131	1419136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679548
25509	NC_000916	GAG	2	6	1419147	1419152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679548
25510	NC_000916	TCA	2	6	1419236	1419241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679548
25511	NC_000916	GAG	2	6	1419244	1419249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679548
25512	NC_000916	TGA	2	6	1419294	1419299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679548
25513	NC_000916	GAG	2	6	1419331	1419336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679548
25514	NC_000916	GAG	2	6	1419372	1419377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679548
25515	NC_000916	A	6	6	1419399	1419404	100 %	0 %	0 %	0 %	15679548
25516	NC_000916	CATC	2	8	1419410	1419417	25 %	25 %	0 %	50 %	15679548
25517	NC_000916	CTC	2	6	1419487	1419492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679548
25518	NC_000916	AAC	2	6	1419544	1419549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679548
25519	NC_000916	GAC	2	6	1419610	1419615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679548
25520	NC_000916	CCT	2	6	1419738	1419743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679548
25521	NC_000916	TTG	2	6	1419797	1419802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679548
25522	NC_000916	CTG	2	6	1419827	1419832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679548
25523	NC_000916	GAG	2	6	1419900	1419905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679548
25524	NC_000916	GACT	2	8	1419951	1419958	25 %	25 %	25 %	25 %	15679548
25525	NC_000916	AGA	2	6	1419983	1419988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679548
25526	NC_000916	TCA	2	6	1420015	1420020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679548
25527	NC_000916	AGC	2	6	1420041	1420046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679548
25528	NC_000916	CAT	2	6	1420055	1420060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679548
25529	NC_000916	TGG	2	6	1420092	1420097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679548
25530	NC_000916	CA	3	6	1420134	1420139	50 %	0 %	0 %	50 %	15679548
25531	NC_000916	GA	3	6	1420153	1420158	50 %	0 %	50 %	0 %	15679548
25532	NC_000916	AGGG	2	8	1420173	1420180	25 %	0 %	75 %	0 %	15679548
25533	NC_000916	ATTC	2	8	1420307	1420314	25 %	50 %	0 %	25 %	15679548
25534	NC_000916	GGA	2	6	1420323	1420328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679548
25535	NC_000916	GCA	2	6	1420351	1420356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679548
25536	NC_000916	GGC	2	6	1420375	1420380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679548
25537	NC_000916	G	6	6	1420401	1420406	0 %	0 %	100 %	0 %	15679548
25538	NC_000916	CT	3	6	1420407	1420412	0 %	50 %	0 %	50 %	15679548
25539	NC_000916	CTGAA	2	10	1420535	1420544	40 %	20 %	20 %	20 %	15679548
25540	NC_000916	TG	3	6	1420647	1420652	0 %	50 %	50 %	0 %	15679549
25541	NC_000916	AC	3	6	1420657	1420662	50 %	0 %	0 %	50 %	15679549
25542	NC_000916	AGC	2	6	1420709	1420714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679549
25543	NC_000916	AG	4	8	1420744	1420751	50 %	0 %	50 %	0 %	15679549
25544	NC_000916	TAA	2	6	1420843	1420848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679549
25545	NC_000916	CTTC	2	8	1420868	1420875	0 %	50 %	0 %	50 %	15679549
25546	NC_000916	CAT	2	6	1420919	1420924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679549
25547	NC_000916	TG	3	6	1420989	1420994	0 %	50 %	50 %	0 %	15679549
25548	NC_000916	TGC	2	6	1421058	1421063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679549
25549	NC_000916	AGG	2	6	1421113	1421118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679549
25550	NC_000916	AAC	2	6	1421133	1421138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679549
25551	NC_000916	GAA	2	6	1421182	1421187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679550
25552	NC_000916	ATC	2	6	1421437	1421442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679550
25553	NC_000916	GAT	2	6	1421458	1421463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679550
25554	NC_000916	CCATAA	2	12	1421513	1421524	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15679550
25555	NC_000916	AGGA	2	8	1421542	1421549	50 %	0 %	50 %	0 %	15679550
25556	NC_000916	TG	3	6	1421603	1421608	0 %	50 %	50 %	0 %	15679550
25557	NC_000916	GATAGA	2	12	1421631	1421642	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15679550
25558	NC_000916	CCA	2	6	1421643	1421648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679550
25559	NC_000916	CCT	2	6	1421657	1421662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679550
25560	NC_000916	CAG	2	6	1421669	1421674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679550
25561	NC_000916	CCT	2	6	1421819	1421824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679550
25562	NC_000916	TG	3	6	1421842	1421847	0 %	50 %	50 %	0 %	15679550
25563	NC_000916	CGA	2	6	1421925	1421930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679550
25564	NC_000916	TG	3	6	1421956	1421961	0 %	50 %	50 %	0 %	15679550
25565	NC_000916	GCG	2	6	1422059	1422064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679550
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25569	NC_000916	GAT	2	6	1422309	1422314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679551
25570	NC_000916	ATC	2	6	1422321	1422326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679551
25571	NC_000916	GTT	2	6	1422345	1422350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679551
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25574	NC_000916	ATG	2	6	1422551	1422556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679552
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25587	NC_000916	ATGGGG	2	12	1423410	1423421	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	15679553
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25589	NC_000916	TGT	2	6	1423752	1423757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679553
25590	NC_000916	ACC	2	6	1423792	1423797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679553
25591	NC_000916	CACT	2	8	1423831	1423838	25 %	25 %	0 %	50 %	15679553
25592	NC_000916	TCC	2	6	1423961	1423966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679553
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25600	NC_000916	AGGA	2	8	1424309	1424316	50 %	0 %	50 %	0 %	15679553
25601	NC_000916	GCA	2	6	1424326	1424331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679553
25602	NC_000916	GTT	2	6	1424356	1424361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679553
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25607	NC_000916	CAG	2	6	1424728	1424733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679554
25608	NC_000916	CAG	2	6	1424737	1424742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679554
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25611	NC_000916	CAGGA	2	10	1424905	1424914	40 %	0 %	40 %	20 %	15679554
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25615	NC_000916	CGG	2	6	1425056	1425061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679554
25616	NC_000916	ATC	3	9	1425066	1425074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679554
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25862	NC_000916	GGTT	2	8	1438554	1438561	0 %	50 %	50 %	0 %	15679566
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25975	NC_000916	CTC	2	6	1445765	1445770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679574
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