MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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25120	NC_000916	GGA	2	6	1396599	1396604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679532
25121	NC_000916	CAA	2	6	1396626	1396631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679532
25122	NC_000916	TCT	2	6	1396656	1396661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679532
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25124	NC_000916	GGT	2	6	1396845	1396850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679532
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25135	NC_000916	TCC	2	6	1397186	1397191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679532
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25148	NC_000916	TC	3	6	1397830	1397835	0 %	50 %	0 %	50 %	15679532
25149	NC_000916	GCC	2	6	1397850	1397855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679532
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25352	NC_000916	TTTCA	2	10	1409548	1409557	20 %	60 %	0 %	20 %	15679539
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25354	NC_000916	CAT	2	6	1409826	1409831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679540
25355	NC_000916	CTA	2	6	1409917	1409922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679540
25356	NC_000916	ATG	2	6	1409926	1409931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679540
25357	NC_000916	CAT	2	6	1410067	1410072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679540
25358	NC_000916	ATG	2	6	1410081	1410086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679540
25359	NC_000916	ACC	3	9	1410111	1410119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679540
25360	NC_000916	TGC	2	6	1410163	1410168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679540
25361	NC_000916	TGG	2	6	1410186	1410191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679540
25362	NC_000916	GCTG	2	8	1410232	1410239	0 %	25 %	50 %	25 %	15679540
25363	NC_000916	TTA	2	6	1410277	1410282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679540
25364	NC_000916	TGCAC	2	10	1410348	1410357	20 %	20 %	20 %	40 %	15679540
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25366	NC_000916	CCA	2	6	1410487	1410492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679540
25367	NC_000916	CCA	2	6	1410607	1410612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679540
25368	NC_000916	GCT	2	6	1410627	1410632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679540
25369	NC_000916	TAT	2	6	1410701	1410706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679540
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25373	NC_000916	AGC	2	6	1411152	1411157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679541
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25375	NC_000916	CAA	2	6	1411330	1411335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679541
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25382	NC_000916	GGC	2	6	1411499	1411504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679541
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25391	NC_000916	TA	3	6	1412073	1412078	50 %	50 %	0 %	0 %	15679542
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25402	NC_000916	GCA	2	6	1412932	1412937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679543
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25427	NC_000916	AGA	2	6	1414284	1414289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679545
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25473	NC_000916	ATC	2	6	1417335	1417340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679547
25474	NC_000916	CT	3	6	1417362	1417367	0 %	50 %	0 %	50 %	15679547
25475	NC_000916	CT	3	6	1417371	1417376	0 %	50 %	0 %	50 %	15679547
25476	NC_000916	TGAAC	2	10	1417380	1417389	40 %	20 %	20 %	20 %	15679547
25477	NC_000916	T	6	6	1417395	1417400	0 %	100 %	0 %	0 %	15679547
25478	NC_000916	CTC	2	6	1417429	1417434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679547
25479	NC_000916	T	6	6	1417435	1417440	0 %	100 %	0 %	0 %	15679547
25480	NC_000916	TCC	2	6	1417465	1417470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679547
25481	NC_000916	CAA	2	6	1417484	1417489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679547
25482	NC_000916	TCA	2	6	1417576	1417581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679547
25483	NC_000916	AGG	2	6	1417630	1417635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679547
25484	NC_000916	AAG	2	6	1417636	1417641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679547
25485	NC_000916	CCT	2	6	1417680	1417685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679547
25486	NC_000916	GGTATG	2	12	1417722	1417733	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15679547
25487	NC_000916	GGT	2	6	1417794	1417799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679547
25488	NC_000916	GGC	2	6	1417995	1418000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679548
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25490	NC_000916	TGG	2	6	1418078	1418083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679548
25491	NC_000916	AG	3	6	1418157	1418162	50 %	0 %	50 %	0 %	15679548
25492	NC_000916	ATAA	2	8	1418164	1418171	75 %	25 %	0 %	0 %	15679548
25493	NC_000916	GGA	2	6	1418177	1418182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679548
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25495	NC_000916	CAG	2	6	1418211	1418216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679548
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25497	NC_000916	TG	3	6	1418518	1418523	0 %	50 %	50 %	0 %	15679548
25498	NC_000916	GCTG	2	8	1418605	1418612	0 %	25 %	50 %	25 %	15679548
25499	NC_000916	G	6	6	1418633	1418638	0 %	0 %	100 %	0 %	15679548
25500	NC_000916	GTT	2	6	1418644	1418649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679548

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