MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_000916	CTC	2	6	1360510	1360515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679501
24502	NC_000916	TATGT	2	10	1360549	1360558	20 %	60 %	20 %	0 %	15679501
24503	NC_000916	GGA	2	6	1360581	1360586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679501
24504	NC_000916	GAG	3	9	1360630	1360638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679501
24505	NC_000916	CCT	2	6	1360641	1360646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679501
24506	NC_000916	GTCT	2	8	1360660	1360667	0 %	50 %	25 %	25 %	15679501
24507	NC_000916	CAT	2	6	1360792	1360797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679501
24508	NC_000916	GCT	2	6	1360816	1360821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679502
24509	NC_000916	TCC	2	6	1360846	1360851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679502
24510	NC_000916	TCC	2	6	1360883	1360888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679502
24511	NC_000916	GT	3	6	1360936	1360941	0 %	50 %	50 %	0 %	15679502
24512	NC_000916	CCT	2	6	1360974	1360979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679502
24513	NC_000916	GTT	3	9	1361163	1361171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679502
24514	NC_000916	GCG	2	6	1361176	1361181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679502
24515	NC_000916	GGA	2	6	1361216	1361221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679502
24516	NC_000916	TG	3	6	1361273	1361278	0 %	50 %	50 %	0 %	15679502
24517	NC_000916	TC	4	8	1361290	1361297	0 %	50 %	0 %	50 %	15679502
24518	NC_000916	TCA	2	6	1361374	1361379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679502
24519	NC_000916	TCTCTG	2	12	1361432	1361443	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15679502
24520	NC_000916	ATGTAT	2	12	1361448	1361459	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15679502
24521	NC_000916	TAT	2	6	1361583	1361588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679502
24522	NC_000916	GCCT	2	8	1361670	1361677	0 %	25 %	25 %	50 %	15679502
24523	NC_000916	AGG	2	6	1361726	1361731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679502
24524	NC_000916	ATC	2	6	1361746	1361751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679502
24525	NC_000916	CAG	2	6	1361763	1361768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679502
24526	NC_000916	CCG	2	6	1362015	1362020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679502
24527	NC_000916	ATT	2	6	1362371	1362376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679503
24528	NC_000916	CAG	2	6	1362413	1362418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679503
24529	NC_000916	AGC	2	6	1362419	1362424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679503
24530	NC_000916	GGA	2	6	1362518	1362523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679503
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24532	NC_000916	GGA	2	6	1362587	1362592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679503
24533	NC_000916	GTT	2	6	1362675	1362680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679503
24534	NC_000916	CAG	2	6	1362743	1362748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679503
24535	NC_000916	ACC	2	6	1362772	1362777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679503
24536	NC_000916	CCA	2	6	1362841	1362846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679503
24537	NC_000916	ATA	2	6	1362855	1362860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679503
24538	NC_000916	GTG	2	6	1363032	1363037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679503
24539	NC_000916	AGG	2	6	1363045	1363050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679503
24540	NC_000916	TTG	2	6	1363099	1363104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679503
24541	NC_000916	ATA	2	6	1363119	1363124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679503
24542	NC_000916	ATTGA	2	10	1363136	1363145	40 %	40 %	20 %	0 %	15679504
24543	NC_000916	GAG	2	6	1363220	1363225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679504
24544	NC_000916	GAT	2	6	1363271	1363276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679504
24545	NC_000916	TAC	2	6	1363284	1363289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679504
24546	NC_000916	TG	3	6	1363316	1363321	0 %	50 %	50 %	0 %	15679504
24547	NC_000916	ATC	2	6	1363379	1363384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679504
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24549	NC_000916	AT	3	6	1363430	1363435	50 %	50 %	0 %	0 %	15679504
24550	NC_000916	CGT	2	6	1363480	1363485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679504
24551	NC_000916	AG	3	6	1363489	1363494	50 %	0 %	50 %	0 %	15679504
24552	NC_000916	CTC	2	6	1363510	1363515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679504
24553	NC_000916	GGC	2	6	1363516	1363521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679504
24554	NC_000916	ATG	2	6	1363554	1363559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679504
24555	NC_000916	AGG	2	6	1363580	1363585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679504
24556	NC_000916	AT	3	6	1363674	1363679	50 %	50 %	0 %	0 %	15679504
24557	NC_000916	CTC	2	6	1363748	1363753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679504
24558	NC_000916	TG	3	6	1363900	1363905	0 %	50 %	50 %	0 %	15679504
24559	NC_000916	TGGC	2	8	1364096	1364103	0 %	25 %	50 %	25 %	15679505
24560	NC_000916	TGA	2	6	1364261	1364266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679505
24561	NC_000916	TCC	2	6	1364267	1364272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679505
24562	NC_000916	CCT	2	6	1364288	1364293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679505
24563	NC_000916	CTG	2	6	1364363	1364368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679505
24564	NC_000916	CCATTT	2	12	1364385	1364396	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15679505
24565	NC_000916	CT	3	6	1364509	1364514	0 %	50 %	0 %	50 %	15679505
24566	NC_000916	CAT	2	6	1364516	1364521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679505
24567	NC_000916	CAC	2	6	1364561	1364566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679505
24568	NC_000916	CAG	2	6	1364588	1364593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679505
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24570	NC_000916	CCT	2	6	1364729	1364734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679505
24571	NC_000916	CAT	2	6	1364805	1364810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679505
24572	NC_000916	CT	3	6	1364890	1364895	0 %	50 %	0 %	50 %	15679505
24573	NC_000916	TCC	2	6	1364918	1364923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679505
24574	NC_000916	CTCC	2	8	1364946	1364953	0 %	25 %	0 %	75 %	15679505
24575	NC_000916	CTG	2	6	1364975	1364980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679505
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24583	NC_000916	AG	3	6	1365192	1365197	50 %	0 %	50 %	0 %	15679505
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24595	NC_000916	CATCT	2	10	1365633	1365642	20 %	40 %	0 %	40 %	15679505
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24602	NC_000916	GAAG	2	8	1366017	1366024	50 %	0 %	50 %	0 %	15679505
24603	NC_000916	TTA	2	6	1366157	1366162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679505
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24605	NC_000916	ACC	2	6	1366173	1366178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679505
24606	NC_000916	TCA	2	6	1366201	1366206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679505
24607	NC_000916	TGG	2	6	1366223	1366228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679505
24608	NC_000916	GAG	2	6	1366293	1366298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679505
24609	NC_000916	AGG	2	6	1366333	1366338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679505
24610	NC_000916	CCTT	2	8	1366394	1366401	0 %	50 %	0 %	50 %	15679505
24611	NC_000916	CTG	2	6	1366447	1366452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679505
24612	NC_000916	TCC	2	6	1366507	1366512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679505
24613	NC_000916	CTG	2	6	1366531	1366536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679505
24614	NC_000916	TCCT	2	8	1366630	1366637	0 %	50 %	0 %	50 %	15679505
24615	NC_000916	TCC	2	6	1366643	1366648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679505
24616	NC_000916	TCC	2	6	1366757	1366762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679505
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24618	NC_000916	GGGGTA	2	12	1366788	1366799	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	15679505
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24853	NC_000916	ATC	2	6	1381267	1381272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679517
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24970	NC_000916	CCAT	2	8	1388172	1388179	25 %	25 %	0 %	50 %	15679524
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24973	NC_000916	GTC	2	6	1388300	1388305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679524
24974	NC_000916	GCA	2	6	1388354	1388359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679524
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