MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_000916	CCT	2	6	1304298	1304303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679441
23502	NC_000916	GAT	2	6	1304304	1304309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679441
23503	NC_000916	TCA	2	6	1304394	1304399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679441
23504	NC_000916	CTG	2	6	1304426	1304431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679441
23505	NC_000916	TCA	2	6	1304448	1304453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679441
23506	NC_000916	T	6	6	1304528	1304533	0 %	100 %	0 %	0 %	15679441
23507	NC_000916	TAT	2	6	1304636	1304641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679441
23508	NC_000916	TGT	2	6	1304675	1304680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679441
23509	NC_000916	GGT	2	6	1304785	1304790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679441
23510	NC_000916	AGGAA	2	10	1304795	1304804	60 %	0 %	40 %	0 %	15679441
23511	NC_000916	GTT	2	6	1304820	1304825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679441
23512	NC_000916	CTC	2	6	1304890	1304895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679441
23513	NC_000916	CCT	2	6	1304924	1304929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679441
23514	NC_000916	TCA	2	6	1305003	1305008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679441
23515	NC_000916	CCT	2	6	1305010	1305015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679441
23516	NC_000916	TCCTGT	2	12	1305024	1305035	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15679441
23517	NC_000916	AAC	2	6	1305056	1305061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679441
23518	NC_000916	CCT	2	6	1305184	1305189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679441
23519	NC_000916	CAT	2	6	1305196	1305201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679441
23520	NC_000916	GT	3	6	1305212	1305217	0 %	50 %	50 %	0 %	15679441
23521	NC_000916	GACCT	2	10	1305221	1305230	20 %	20 %	20 %	40 %	15679441
23522	NC_000916	TTG	2	6	1305289	1305294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679441
23523	NC_000916	TGC	2	6	1305365	1305370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679441
23524	NC_000916	ATT	2	6	1305495	1305500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679441
23525	NC_000916	TA	3	6	1305601	1305606	50 %	50 %	0 %	0 %	15679442
23526	NC_000916	AGG	2	6	1305640	1305645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679442
23527	NC_000916	TTG	2	6	1305664	1305669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679442
23528	NC_000916	GGT	2	6	1305809	1305814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679442
23529	NC_000916	TGG	2	6	1305883	1305888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679442
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23531	NC_000916	CCA	2	6	1305925	1305930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679442
23532	NC_000916	TCAT	2	8	1305960	1305967	25 %	50 %	0 %	25 %	15679442
23533	NC_000916	GAG	2	6	1306032	1306037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679442
23534	NC_000916	AGG	2	6	1306097	1306102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679442
23535	NC_000916	GTG	2	6	1306203	1306208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679442
23536	NC_000916	GTT	2	6	1306221	1306226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679442
23537	NC_000916	CAG	2	6	1306282	1306287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679442
23538	NC_000916	ACC	2	6	1306294	1306299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679442
23539	NC_000916	AGG	2	6	1306334	1306339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679442
23540	NC_000916	CTT	2	6	1306368	1306373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679442
23541	NC_000916	AAT	2	6	1306412	1306417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679442
23542	NC_000916	AAGG	2	8	1306439	1306446	50 %	0 %	50 %	0 %	15679442
23543	NC_000916	CT	3	6	1306488	1306493	0 %	50 %	0 %	50 %	15679442
23544	NC_000916	TGGA	2	8	1306603	1306610	25 %	25 %	50 %	0 %	15679442
23545	NC_000916	GAA	2	6	1306718	1306723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679442
23546	NC_000916	TAT	2	6	1306749	1306754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679442
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23548	NC_000916	CAT	3	9	1306789	1306797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679442
23549	NC_000916	TGCACT	2	12	1306802	1306813	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15679442
23550	NC_000916	GAAGG	2	10	1306877	1306886	40 %	0 %	60 %	0 %	15679442
23551	NC_000916	AGG	2	6	1306896	1306901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679442
23552	NC_000916	GGA	2	6	1306946	1306951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679442
23553	NC_000916	GTG	2	6	1307014	1307019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679443
23554	NC_000916	CCT	2	6	1307022	1307027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679443
23555	NC_000916	AGG	2	6	1307048	1307053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679443
23556	NC_000916	TCA	2	6	1307110	1307115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679443
23557	NC_000916	CT	3	6	1307176	1307181	0 %	50 %	0 %	50 %	15679443
23558	NC_000916	CAG	2	6	1307238	1307243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679443
23559	NC_000916	AAT	2	6	1307256	1307261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679443
23560	NC_000916	TCA	2	6	1307321	1307326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679443
23561	NC_000916	G	6	6	1307394	1307399	0 %	0 %	100 %	0 %	15679443
23562	NC_000916	CT	3	6	1307448	1307453	0 %	50 %	0 %	50 %	15679443
23563	NC_000916	CCT	2	6	1307454	1307459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679443
23564	NC_000916	TGCC	2	8	1307493	1307500	0 %	25 %	25 %	50 %	15679443
23565	NC_000916	C	7	7	1307499	1307505	0 %	0 %	0 %	100 %	15679443
23566	NC_000916	G	6	6	1307606	1307611	0 %	0 %	100 %	0 %	15679443
23567	NC_000916	CTGC	2	8	1307748	1307755	0 %	25 %	25 %	50 %	15679443
23568	NC_000916	ACA	2	6	1307776	1307781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679443
23569	NC_000916	AT	3	6	1307876	1307881	50 %	50 %	0 %	0 %	15679443
23570	NC_000916	CAA	2	6	1308195	1308200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679444
23571	NC_000916	CCT	2	6	1308307	1308312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679444
23572	NC_000916	TTC	2	6	1308325	1308330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679444
23573	NC_000916	ACC	2	6	1308332	1308337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679444
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23576	NC_000916	TCCA	2	8	1308390	1308397	25 %	25 %	0 %	50 %	15679444
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23578	NC_000916	TGGA	2	8	1308467	1308474	25 %	25 %	50 %	0 %	15679444
23579	NC_000916	CAT	2	6	1308501	1308506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679444
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23582	NC_000916	CAT	2	6	1308600	1308605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679444
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23584	NC_000916	CTG	2	6	1308644	1308649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679444
23585	NC_000916	AC	3	6	1308684	1308689	50 %	0 %	0 %	50 %	15679444
23586	NC_000916	TGG	2	6	1308696	1308701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679444
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23588	NC_000916	CTC	2	6	1308841	1308846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679444
23589	NC_000916	GGT	2	6	1308858	1308863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679444
23590	NC_000916	CGT	2	6	1308960	1308965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679444
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23592	NC_000916	TCC	2	6	1309085	1309090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679444
23593	NC_000916	CAA	2	6	1309110	1309115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679444
23594	NC_000916	CTC	2	6	1309129	1309134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679444
23595	NC_000916	TTA	2	6	1309158	1309163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679444
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23597	NC_000916	CAG	2	6	1309288	1309293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679444
23598	NC_000916	CGT	2	6	1309353	1309358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679444
23599	NC_000916	AGCC	2	8	1309359	1309366	25 %	0 %	25 %	50 %	15679444
23600	NC_000916	ATG	2	6	1309397	1309402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679444
23601	NC_000916	GT	3	6	1309451	1309456	0 %	50 %	50 %	0 %	15679444
23602	NC_000916	G	6	6	1309480	1309485	0 %	0 %	100 %	0 %	15679444
23603	NC_000916	TGGA	2	8	1309505	1309512	25 %	25 %	50 %	0 %	15679444
23604	NC_000916	AGT	2	6	1309517	1309522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679444
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23606	NC_000916	CGA	2	6	1309545	1309550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679444
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23610	NC_000916	CCGGGT	2	12	1309934	1309945	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15679445
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23614	NC_000916	TCT	2	6	1310114	1310119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679445
23615	NC_000916	AGA	2	6	1310144	1310149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679445
23616	NC_000916	AAGTAG	2	12	1310211	1310222	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15679445
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