MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_000916	TGA	2	6	1278191	1278196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679411
23003	NC_000916	TTCC	2	8	1278249	1278256	0 %	50 %	0 %	50 %	15679411
23004	NC_000916	GAG	2	6	1278276	1278281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679411
23005	NC_000916	AGG	2	6	1278409	1278414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679411
23006	NC_000916	ACA	2	6	1278471	1278476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679411
23007	NC_000916	CAG	2	6	1278504	1278509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679411
23008	NC_000916	TGA	2	6	1278623	1278628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679411
23009	NC_000916	CTC	2	6	1278639	1278644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679411
23010	NC_000916	ATG	2	6	1278649	1278654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679411
23011	NC_000916	AGC	2	6	1278756	1278761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679411
23012	NC_000916	CAGGGA	2	12	1278764	1278775	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	15679411
23013	NC_000916	CAG	2	6	1278801	1278806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679411
23014	NC_000916	TTG	2	6	1278808	1278813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679411
23015	NC_000916	GAG	2	6	1278822	1278827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679411
23016	NC_000916	AGG	2	6	1278847	1278852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679411
23017	NC_000916	TGA	3	9	1278860	1278868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679411
23018	NC_000916	AGG	3	9	1278901	1278909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679411
23019	NC_000916	CCT	2	6	1278932	1278937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679411
23020	NC_000916	CAG	2	6	1278943	1278948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679411
23021	NC_000916	GAGG	2	8	1278998	1279005	25 %	0 %	75 %	0 %	15679411
23022	NC_000916	ACA	2	6	1279024	1279029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679411
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23024	NC_000916	CAG	3	9	1279062	1279070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679411
23025	NC_000916	AGGA	2	8	1279104	1279111	50 %	0 %	50 %	0 %	15679411
23026	NC_000916	AGG	2	6	1279179	1279184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679411
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23029	NC_000916	GGA	2	6	1279304	1279309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679411
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23031	NC_000916	TCCTC	2	10	1279377	1279386	0 %	40 %	0 %	60 %	15679412
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23034	NC_000916	GGGA	2	8	1279462	1279469	25 %	0 %	75 %	0 %	15679412
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23038	NC_000916	ATG	2	6	1279705	1279710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679412
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23040	NC_000916	AGTG	2	8	1279783	1279790	25 %	25 %	50 %	0 %	15679412
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23062	NC_000916	TGA	2	6	1280984	1280989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679413
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23069	NC_000916	GCCT	2	8	1281343	1281350	0 %	25 %	25 %	50 %	15679414
23070	NC_000916	TCC	2	6	1281373	1281378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679414
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23072	NC_000916	TCCC	2	8	1281743	1281750	0 %	25 %	0 %	75 %	15679414
23073	NC_000916	TC	3	6	1281818	1281823	0 %	50 %	0 %	50 %	15679414
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23085	NC_000916	TAT	2	6	1282193	1282198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679414
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23096	NC_000916	TTATC	2	10	1282756	1282765	20 %	60 %	0 %	20 %	15679414
23097	NC_000916	TA	3	6	1282823	1282828	50 %	50 %	0 %	0 %	15679414
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23100	NC_000916	CCAG	2	8	1282920	1282927	25 %	0 %	25 %	50 %	15679414
23101	NC_000916	TC	3	6	1282991	1282996	0 %	50 %	0 %	50 %	15679414
23102	NC_000916	CTC	2	6	1283057	1283062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679414
23103	NC_000916	TC	3	6	1283129	1283134	0 %	50 %	0 %	50 %	15679414
23104	NC_000916	TGA	2	6	1283206	1283211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679414
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23107	NC_000916	CTG	2	6	1283228	1283233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679414
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23115	NC_000916	CAC	2	6	1284009	1284014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679416
23116	NC_000916	CCTT	2	8	1284015	1284022	0 %	50 %	0 %	50 %	15679416
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23118	NC_000916	GAG	2	6	1284043	1284048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679416
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23120	NC_000916	TTCCCT	2	12	1284172	1284183	0 %	50 %	0 %	50 %	15679416
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23228	NC_000916	TC	3	6	1289515	1289520	0 %	50 %	0 %	50 %	15679422
23229	NC_000916	TG	3	6	1289577	1289582	0 %	50 %	50 %	0 %	15679422
23230	NC_000916	GAT	2	6	1289606	1289611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679422
23231	NC_000916	CCTT	2	8	1289627	1289634	0 %	50 %	0 %	50 %	15679422
23232	NC_000916	TTTCA	2	10	1289667	1289676	20 %	60 %	0 %	20 %	15679422
23233	NC_000916	TAT	2	6	1289751	1289756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679422
23234	NC_000916	TGG	2	6	1289768	1289773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679422
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23350	NC_000916	CATGA	2	10	1295817	1295826	40 %	20 %	20 %	20 %	15679429
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23471	NC_000916	CCT	2	6	1302906	1302911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679439
23472	NC_000916	ATG	2	6	1302977	1302982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679439
23473	NC_000916	CAT	3	9	1303026	1303034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679439
23474	NC_000916	CTT	2	6	1303039	1303044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679439
23475	NC_000916	ACC	2	6	1303054	1303059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679439
23476	NC_000916	CCTGG	2	10	1303105	1303114	0 %	20 %	40 %	40 %	15679439
23477	NC_000916	ATGTCA	2	12	1303172	1303183	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15679439
23478	NC_000916	A	6	6	1303204	1303209	100 %	0 %	0 %	0 %	15679439
23479	NC_000916	CCT	2	6	1303210	1303215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679439
23480	NC_000916	TCC	2	6	1303446	1303451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679440
23481	NC_000916	TAT	2	6	1303474	1303479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679440
23482	NC_000916	CT	3	6	1303493	1303498	0 %	50 %	0 %	50 %	15679440
23483	NC_000916	GCT	2	6	1303593	1303598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679440
23484	NC_000916	GTC	2	6	1303621	1303626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679440
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23487	NC_000916	G	7	7	1303889	1303895	0 %	0 %	100 %	0 %	15679441
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23489	NC_000916	AGG	2	6	1303935	1303940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679441
23490	NC_000916	CTCCA	2	10	1304012	1304021	20 %	20 %	0 %	60 %	15679441
23491	NC_000916	CAGC	2	8	1304029	1304036	25 %	0 %	25 %	50 %	15679441
23492	NC_000916	GT	3	6	1304063	1304068	0 %	50 %	50 %	0 %	15679441
23493	NC_000916	TC	3	6	1304078	1304083	0 %	50 %	0 %	50 %	15679441
23494	NC_000916	AGA	2	6	1304089	1304094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679441
23495	NC_000916	CCA	2	6	1304110	1304115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679441
23496	NC_000916	TGT	2	6	1304128	1304133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679441
23497	NC_000916	CAC	2	6	1304147	1304152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679441
23498	NC_000916	CCG	2	6	1304205	1304210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679441
23499	NC_000916	CAA	2	6	1304224	1304229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679441
23500	NC_000916	GGC	2	6	1304264	1304269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679441

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