MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_000916	CAT	3	9	1194136	1194144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679323
21502	NC_000916	GCCA	2	8	1194165	1194172	25 %	0 %	25 %	50 %	15679323
21503	NC_000916	GAT	2	6	1194211	1194216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679323
21504	NC_000916	TGT	2	6	1194229	1194234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679323
21505	NC_000916	TTG	2	6	1194267	1194272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679323
21506	NC_000916	TGG	2	6	1194473	1194478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679324
21507	NC_000916	AGG	2	6	1194508	1194513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679324
21508	NC_000916	TGA	2	6	1194600	1194605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679324
21509	NC_000916	GAA	2	6	1194695	1194700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679325
21510	NC_000916	AAG	2	6	1194761	1194766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679325
21511	NC_000916	CCT	2	6	1194805	1194810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679325
21512	NC_000916	GAG	2	6	1194851	1194856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679325
21513	NC_000916	AGG	2	6	1194902	1194907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679325
21514	NC_000916	CGT	2	6	1194955	1194960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679325
21515	NC_000916	GAG	2	6	1194962	1194967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679325
21516	NC_000916	ATA	2	6	1194968	1194973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679325
21517	NC_000916	TTC	2	6	1195001	1195006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679325
21518	NC_000916	CTT	2	6	1195049	1195054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679325
21519	NC_000916	GAG	2	6	1195100	1195105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679325
21520	NC_000916	AGG	2	6	1195178	1195183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679325
21521	NC_000916	ACA	2	6	1195233	1195238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679325
21522	NC_000916	AGA	2	6	1195257	1195262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679325
21523	NC_000916	CAA	2	6	1195624	1195629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679326
21524	NC_000916	TCC	2	6	1195658	1195663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679326
21525	NC_000916	TTC	2	6	1195838	1195843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679326
21526	NC_000916	GAA	3	9	1195945	1195953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679326
21527	NC_000916	CCA	2	6	1196030	1196035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679326
21528	NC_000916	TC	3	6	1196107	1196112	0 %	50 %	0 %	50 %	15679326
21529	NC_000916	TTC	2	6	1196116	1196121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679326
21530	NC_000916	ATA	2	6	1196203	1196208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679327
21531	NC_000916	AGA	2	6	1196230	1196235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679327
21532	NC_000916	CTG	2	6	1196302	1196307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679327
21533	NC_000916	TCG	2	6	1196309	1196314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679327
21534	NC_000916	ACC	2	6	1196338	1196343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679327
21535	NC_000916	ATGT	2	8	1196350	1196357	25 %	50 %	25 %	0 %	15679327
21536	NC_000916	AGAA	2	8	1196454	1196461	75 %	0 %	25 %	0 %	15679327
21537	NC_000916	CGC	2	6	1196463	1196468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679327
21538	NC_000916	ATG	2	6	1196476	1196481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679327
21539	NC_000916	TAA	2	6	1196635	1196640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679328
21540	NC_000916	AGGA	2	8	1196649	1196656	50 %	0 %	50 %	0 %	15679328
21541	NC_000916	AGG	2	6	1196671	1196676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679328
21542	NC_000916	AG	3	6	1196684	1196689	50 %	0 %	50 %	0 %	15679328
21543	NC_000916	ATA	2	6	1196712	1196717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679328
21544	NC_000916	CCCT	2	8	1196742	1196749	0 %	25 %	0 %	75 %	15679328
21545	NC_000916	TGA	2	6	1196813	1196818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679328
21546	NC_000916	AAAATG	2	12	1196828	1196839	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15679328
21547	NC_000916	CAG	2	6	1196889	1196894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679329
21548	NC_000916	TCC	2	6	1196904	1196909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679329
21549	NC_000916	AGGG	2	8	1196930	1196937	25 %	0 %	75 %	0 %	15679329
21550	NC_000916	ACAGGA	2	12	1196960	1196971	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15679329
21551	NC_000916	TTG	2	6	1196973	1196978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679329
21552	NC_000916	CGC	2	6	1197028	1197033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679329
21553	NC_000916	AC	3	6	1197144	1197149	50 %	0 %	0 %	50 %	15679329
21554	NC_000916	GAT	2	6	1197170	1197175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679329
21555	NC_000916	TGA	2	6	1197247	1197252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679329
21556	NC_000916	G	6	6	1197275	1197280	0 %	0 %	100 %	0 %	15679329
21557	NC_000916	TCC	2	6	1197299	1197304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679329
21558	NC_000916	AGA	2	6	1197318	1197323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679329
21559	NC_000916	CTT	2	6	1197382	1197387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679329
21560	NC_000916	GAG	2	6	1197389	1197394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679329
21561	NC_000916	TAA	2	6	1197419	1197424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679329
21562	NC_000916	TA	3	6	1197635	1197640	50 %	50 %	0 %	0 %	15679330
21563	NC_000916	CTC	3	9	1197656	1197664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679330
21564	NC_000916	GAT	2	6	1197725	1197730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679330
21565	NC_000916	TCC	2	6	1197780	1197785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679330
21566	NC_000916	GCA	2	6	1197812	1197817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679330
21567	NC_000916	TCC	2	6	1197828	1197833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679330
21568	NC_000916	AAC	2	6	1197883	1197888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679330
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21570	NC_000916	CCT	2	6	1197913	1197918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679330
21571	NC_000916	CAG	2	6	1197925	1197930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679330
21572	NC_000916	TAA	2	6	1198032	1198037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679330
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21575	NC_000916	AACA	2	8	1198185	1198192	75 %	0 %	0 %	25 %	15679330
21576	NC_000916	AAT	2	6	1198193	1198198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679330
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21578	NC_000916	ATAA	2	8	1198238	1198245	75 %	25 %	0 %	0 %	15679330
21579	NC_000916	ACC	2	6	1198256	1198261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679330
21580	NC_000916	GCAG	2	8	1198270	1198277	25 %	0 %	50 %	25 %	15679330
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21583	NC_000916	A	6	6	1198322	1198327	100 %	0 %	0 %	0 %	15679330
21584	NC_000916	TGGT	2	8	1198381	1198388	0 %	50 %	50 %	0 %	15679330
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21587	NC_000916	GAA	2	6	1198566	1198571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679330
21588	NC_000916	ATT	2	6	1198712	1198717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679331
21589	NC_000916	GAA	2	6	1198740	1198745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679331
21590	NC_000916	GGA	2	6	1198800	1198805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679331
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21600	NC_000916	AACA	2	8	1199203	1199210	75 %	0 %	0 %	25 %	15679332
21601	NC_000916	AAT	2	6	1199211	1199216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679332
21602	NC_000916	TCA	2	6	1199244	1199249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679332
21603	NC_000916	ATAA	2	8	1199256	1199263	75 %	25 %	0 %	0 %	15679332
21604	NC_000916	CTG	2	6	1199281	1199286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679332
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21606	NC_000916	CTGA	2	8	1199307	1199314	25 %	25 %	25 %	25 %	15679332
21607	NC_000916	GAA	2	6	1199324	1199329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679332
21608	NC_000916	TGG	2	6	1199424	1199429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679332
21609	NC_000916	CTA	2	6	1199435	1199440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679332
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21613	NC_000916	T	6	6	1200221	1200226	0 %	100 %	0 %	0 %	15679333
21614	NC_000916	CCT	2	6	1201045	1201050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679334
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21616	NC_000916	CAT	2	6	1201280	1201285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679334
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21854	NC_000916	CCT	2	6	1215064	1215069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679348
21855	NC_000916	GAA	2	6	1215107	1215112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679348
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21972	NC_000916	GAA	3	9	1222127	1222135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679358
21973	NC_000916	TAA	2	6	1222165	1222170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679358
21974	NC_000916	ATG	2	6	1222210	1222215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679358
21975	NC_000916	TGCC	2	8	1222338	1222345	0 %	25 %	25 %	50 %	15679358
21976	NC_000916	GCT	2	6	1222400	1222405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679358
21977	NC_000916	CTGC	2	8	1222430	1222437	0 %	25 %	25 %	50 %	15679358
21978	NC_000916	GAA	2	6	1222494	1222499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679358
21979	NC_000916	ATG	2	6	1222500	1222505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679358
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21981	NC_000916	GGAA	2	8	1222666	1222673	50 %	0 %	50 %	0 %	15679359
21982	NC_000916	AAGG	2	8	1222726	1222733	50 %	0 %	50 %	0 %	15679359
21983	NC_000916	GTT	2	6	1222811	1222816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679359
21984	NC_000916	AATC	2	8	1222854	1222861	50 %	25 %	0 %	25 %	15679359
21985	NC_000916	TGA	2	6	1222938	1222943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679360
21986	NC_000916	ATG	2	6	1222985	1222990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679360
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21990	NC_000916	CAGG	2	8	1223084	1223091	25 %	0 %	50 %	25 %	15679360
21991	NC_000916	AGC	2	6	1223100	1223105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679360
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21993	NC_000916	TGCT	2	8	1223155	1223162	0 %	50 %	25 %	25 %	15679360
21994	NC_000916	ATG	2	6	1223289	1223294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679360
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21998	NC_000916	CATGA	2	10	1223640	1223649	40 %	20 %	20 %	20 %	15679360
21999	NC_000916	CCTCTC	2	12	1223675	1223686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679360
22000	NC_000916	TTG	2	6	1223701	1223706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679360

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