MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_000916	TGA	2	6	1167752	1167757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679291
21003	NC_000916	GCA	2	6	1167760	1167765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679291
21004	NC_000916	GGT	2	6	1167786	1167791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679291
21005	NC_000916	TGCCG	2	10	1167804	1167813	0 %	20 %	40 %	40 %	15679291
21006	NC_000916	ATG	3	9	1167814	1167822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679291
21007	NC_000916	GCAT	2	8	1167873	1167880	25 %	25 %	25 %	25 %	15679291
21008	NC_000916	GGA	3	9	1167929	1167937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679291
21009	NC_000916	AGG	3	9	1167951	1167959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679291
21010	NC_000916	A	7	7	1167975	1167981	100 %	0 %	0 %	0 %	15679291
21011	NC_000916	ACT	2	6	1167988	1167993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679291
21012	NC_000916	TCC	2	6	1168066	1168071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679291
21013	NC_000916	TGA	2	6	1168099	1168104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679291
21014	NC_000916	TGT	2	6	1168229	1168234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679291
21015	NC_000916	GTG	2	6	1168246	1168251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679291
21016	NC_000916	AGG	2	6	1168266	1168271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679291
21017	NC_000916	GGT	2	6	1168377	1168382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679291
21018	NC_000916	CTC	2	6	1168431	1168436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679291
21019	NC_000916	GATGTT	2	12	1168485	1168496	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15679291
21020	NC_000916	CAG	2	6	1168553	1168558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679291
21021	NC_000916	CAC	3	9	1168587	1168595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679291
21022	NC_000916	TGCCCT	2	12	1168601	1168612	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15679291
21023	NC_000916	TGCATA	2	12	1168638	1168649	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15679291
21024	NC_000916	TGA	2	6	1168673	1168678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679291
21025	NC_000916	CAT	2	6	1168684	1168689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679291
21026	NC_000916	GTG	2	6	1168693	1168698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679291
21027	NC_000916	GA	3	6	1168728	1168733	50 %	0 %	50 %	0 %	15679291
21028	NC_000916	CTC	2	6	1168800	1168805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679291
21029	NC_000916	GTG	2	6	1168899	1168904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679291
21030	NC_000916	CAG	2	6	1168975	1168980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679291
21031	NC_000916	CTG	2	6	1169127	1169132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679291
21032	NC_000916	GCC	2	6	1169184	1169189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679291
21033	NC_000916	GCA	2	6	1169232	1169237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679291
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21039	NC_000916	CTTT	2	8	1169573	1169580	0 %	75 %	0 %	25 %	15679292
21040	NC_000916	GAG	2	6	1169598	1169603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679292
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21051	NC_000916	A	6	6	1170277	1170282	100 %	0 %	0 %	0 %	15679293
21052	NC_000916	CAG	2	6	1170355	1170360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679293
21053	NC_000916	ATGG	2	8	1170362	1170369	25 %	25 %	50 %	0 %	15679293
21054	NC_000916	AGG	2	6	1170411	1170416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679293
21055	NC_000916	TCC	2	6	1170459	1170464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679293
21056	NC_000916	ATC	3	9	1170509	1170517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679293
21057	NC_000916	GAG	2	6	1170518	1170523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679293
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21060	NC_000916	A	6	6	1170623	1170628	100 %	0 %	0 %	0 %	15679294
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21063	NC_000916	TGG	2	6	1170776	1170781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679294
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21065	NC_000916	AC	3	6	1170887	1170892	50 %	0 %	0 %	50 %	15679294
21066	NC_000916	TCC	2	6	1170914	1170919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679294
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21086	NC_000916	ATAACA	2	12	1172041	1172052	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15679294
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21100	NC_000916	CAG	3	9	1172384	1172392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679294
21101	NC_000916	ACT	2	6	1172564	1172569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679295
21102	NC_000916	AAG	2	6	1172602	1172607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679295
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21109	NC_000916	TCAG	2	8	1172777	1172784	25 %	25 %	25 %	25 %	15679295
21110	NC_000916	AT	3	6	1172789	1172794	50 %	50 %	0 %	0 %	15679295
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21117	NC_000916	AAC	2	6	1173114	1173119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679295
21118	NC_000916	AGT	2	6	1173147	1173152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679295
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21235	NC_000916	CAT	2	6	1180041	1180046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679303
21236	NC_000916	AT	3	6	1180135	1180140	50 %	50 %	0 %	0 %	15679303
21237	NC_000916	AGG	2	6	1180146	1180151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679303
21238	NC_000916	TGT	2	6	1180204	1180209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679303
21239	NC_000916	TGGG	2	8	1180221	1180228	0 %	25 %	75 %	0 %	15679303
21240	NC_000916	GA	3	6	1180239	1180244	50 %	0 %	50 %	0 %	15679303
21241	NC_000916	TGG	2	6	1180285	1180290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679303
21242	NC_000916	ATG	2	6	1180297	1180302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679303
21243	NC_000916	TGC	2	6	1180321	1180326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679304
21244	NC_000916	AT	3	6	1180330	1180335	50 %	50 %	0 %	0 %	15679304
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21246	NC_000916	TCCC	2	8	1180466	1180473	0 %	25 %	0 %	75 %	15679304
21247	NC_000916	AT	3	6	1180516	1180521	50 %	50 %	0 %	0 %	15679304
21248	NC_000916	TCCTCT	2	12	1180538	1180549	0 %	50 %	0 %	50 %	15679304
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21251	NC_000916	TATGA	2	10	1180579	1180588	40 %	40 %	20 %	0 %	15679304
21252	NC_000916	ATGG	2	8	1180605	1180612	25 %	25 %	50 %	0 %	15679304
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21266	NC_000916	TG	3	6	1181655	1181660	0 %	50 %	50 %	0 %	15679305
21267	NC_000916	GTGG	2	8	1181661	1181668	0 %	25 %	75 %	0 %	15679305
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21341	NC_000916	TCC	2	6	1185646	1185651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679311
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21343	NC_000916	TTGC	2	8	1185749	1185756	0 %	50 %	25 %	25 %	15679312
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21345	NC_000916	TATC	2	8	1185879	1185886	25 %	50 %	0 %	25 %	15679312
21346	NC_000916	TTATC	2	10	1185972	1185981	20 %	60 %	0 %	20 %	15679312
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21349	NC_000916	TCG	2	6	1186151	1186156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679312
21350	NC_000916	TTTGCC	2	12	1186178	1186189	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15679312
21351	NC_000916	CT	3	6	1186232	1186237	0 %	50 %	0 %	50 %	15679312
21352	NC_000916	TCA	2	6	1186241	1186246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679312
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21472	NC_000916	CAG	2	6	1192631	1192636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679322
21473	NC_000916	GGA	2	6	1192643	1192648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679322
21474	NC_000916	GGCA	2	8	1192691	1192698	25 %	0 %	50 %	25 %	15679322
21475	NC_000916	TTG	2	6	1192701	1192706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679322
21476	NC_000916	AGA	2	6	1192752	1192757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679322
21477	NC_000916	CATG	2	8	1192782	1192789	25 %	25 %	25 %	25 %	15679322
21478	NC_000916	TGA	2	6	1192816	1192821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679322
21479	NC_000916	C	6	6	1192898	1192903	0 %	0 %	0 %	100 %	15679322
21480	NC_000916	TGG	2	6	1192908	1192913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679322
21481	NC_000916	TGA	3	9	1192918	1192926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679322
21482	NC_000916	CTG	2	6	1193006	1193011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679322
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21486	NC_000916	GGA	2	6	1193227	1193232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679322
21487	NC_000916	GCCA	2	8	1193258	1193265	25 %	0 %	25 %	50 %	15679322
21488	NC_000916	CAGG	2	8	1193292	1193299	25 %	0 %	50 %	25 %	15679322
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21491	NC_000916	AGGAAG	2	12	1193456	1193467	50 %	0 %	50 %	0 %	15679322
21492	NC_000916	TGGA	2	8	1193526	1193533	25 %	25 %	50 %	0 %	15679322
21493	NC_000916	TGA	2	6	1193542	1193547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679322
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21495	NC_000916	CAT	2	6	1193575	1193580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679322
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21499	NC_000916	TGA	2	6	1193818	1193823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679322
21500	NC_000916	CAGG	2	8	1194075	1194082	25 %	0 %	50 %	25 %	15679323

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