MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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20120	NC_000916	CTGG	2	8	1119477	1119484	0 %	25 %	50 %	25 %	15679227
20121	NC_000916	GTCT	2	8	1119487	1119494	0 %	50 %	25 %	25 %	15679227
20122	NC_000916	CTTC	2	8	1119578	1119585	0 %	50 %	0 %	50 %	15679227
20123	NC_000916	GCG	2	6	1119607	1119612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679227
20124	NC_000916	GAG	3	9	1119675	1119683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679227
20125	NC_000916	GAT	2	6	1119685	1119690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679227
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20127	NC_000916	ATG	2	6	1119727	1119732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679227
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20129	NC_000916	CAT	2	6	1119986	1119991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679228
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20132	NC_000916	TAT	2	6	1120036	1120041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679228
20133	NC_000916	ATT	2	6	1120042	1120047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679228
20134	NC_000916	TCC	2	6	1120082	1120087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679228
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20142	NC_000916	CTT	2	6	1120488	1120493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679228
20143	NC_000916	CCT	2	6	1120494	1120499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679228
20144	NC_000916	CTGT	2	8	1120862	1120869	0 %	50 %	25 %	25 %	15679229
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20146	NC_000916	GAT	2	6	1121054	1121059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679229
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20149	NC_000916	CCT	2	6	1121297	1121302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679230
20150	NC_000916	TGTGG	2	10	1121354	1121363	0 %	40 %	60 %	0 %	15679230
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20152	NC_000916	CTGA	2	8	1121389	1121396	25 %	25 %	25 %	25 %	15679230
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20165	NC_000916	AAT	2	6	1122026	1122031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679231
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20169	NC_000916	CTCC	2	8	1122423	1122430	0 %	25 %	0 %	75 %	15679231
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20233	NC_000916	GT	3	6	1125216	1125221	0 %	50 %	50 %	0 %	15679234
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20235	NC_000916	CTT	2	6	1125313	1125318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679234
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20356	NC_000916	TCC	2	6	1130239	1130244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679241
20357	NC_000916	GCA	2	6	1130260	1130265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679241
20358	NC_000916	C	6	6	1130317	1130322	0 %	0 %	0 %	100 %	15679241
20359	NC_000916	CAC	3	9	1130495	1130503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679241
20360	NC_000916	TCC	2	6	1130529	1130534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679241
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20362	NC_000916	TGA	2	6	1130648	1130653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679242
20363	NC_000916	ATCAT	2	10	1130697	1130706	40 %	40 %	0 %	20 %	15679242
20364	NC_000916	CAC	2	6	1130823	1130828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679242
20365	NC_000916	ATG	2	6	1130830	1130835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679242
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20368	NC_000916	GGA	2	6	1130906	1130911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679242
20369	NC_000916	CTC	2	6	1130937	1130942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679242
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20371	NC_000916	ACC	2	6	1131085	1131090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679242
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20379	NC_000916	CTG	2	6	1131442	1131447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679242
20380	NC_000916	AGGG	2	8	1131498	1131505	25 %	0 %	75 %	0 %	15679242
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20383	NC_000916	ATGA	2	8	1131594	1131601	50 %	25 %	25 %	0 %	15679242
20384	NC_000916	TG	3	6	1131658	1131663	0 %	50 %	50 %	0 %	15679243
20385	NC_000916	GTG	2	6	1131703	1131708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679243
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20389	NC_000916	TGT	2	6	1131948	1131953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679243
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20421	NC_000916	CCTC	2	8	1133349	1133356	0 %	25 %	0 %	75 %	15679244
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20444	NC_000916	CAC	2	6	1134410	1134415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679246
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20465	NC_000916	AT	3	6	1135796	1135801	50 %	50 %	0 %	0 %	15679248
20466	NC_000916	CCT	2	6	1135804	1135809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679248
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20470	NC_000916	GAG	2	6	1135892	1135897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679248
20471	NC_000916	CTA	2	6	1135912	1135917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679248
20472	NC_000916	AGA	2	6	1135975	1135980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679248
20473	NC_000916	GGT	2	6	1136016	1136021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679248
20474	NC_000916	CTG	2	6	1136030	1136035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679248
20475	NC_000916	TGCA	2	8	1136042	1136049	25 %	25 %	25 %	25 %	15679248
20476	NC_000916	TTTC	2	8	1136055	1136062	0 %	75 %	0 %	25 %	15679248
20477	NC_000916	ATG	2	6	1136131	1136136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679248
20478	NC_000916	CAGA	2	8	1136165	1136172	50 %	0 %	25 %	25 %	15679249
20479	NC_000916	CTGT	2	8	1136191	1136198	0 %	50 %	25 %	25 %	15679249
20480	NC_000916	GCACT	2	10	1136217	1136226	20 %	20 %	20 %	40 %	15679249
20481	NC_000916	TGG	2	6	1136251	1136256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679249
20482	NC_000916	ATGC	2	8	1136260	1136267	25 %	25 %	25 %	25 %	15679249
20483	NC_000916	GTG	2	6	1136366	1136371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679249
20484	NC_000916	TGA	2	6	1136387	1136392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679249
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20488	NC_000916	CCCT	2	8	1136749	1136756	0 %	25 %	0 %	75 %	15679249
20489	NC_000916	TCATC	2	10	1136771	1136780	20 %	40 %	0 %	40 %	15679249
20490	NC_000916	TAT	2	6	1136808	1136813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679249
20491	NC_000916	AGA	2	6	1136882	1136887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679249
20492	NC_000916	GAT	2	6	1136973	1136978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679249
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20494	NC_000916	GCT	2	6	1137223	1137228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679249
20495	NC_000916	TAT	2	6	1137261	1137266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679249
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20497	NC_000916	TCCA	2	8	1137276	1137283	25 %	25 %	0 %	50 %	15679249
20498	NC_000916	CAG	2	6	1137316	1137321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679250
20499	NC_000916	GCC	2	6	1137332	1137337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679250
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