MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_000916	T	6	6	1003161	1003166	0 %	100 %	0 %	0 %	15679097
18003	NC_000916	GAT	2	6	1003215	1003220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679097
18004	NC_000916	AAG	2	6	1003243	1003248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679097
18005	NC_000916	TGG	2	6	1003261	1003266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679097
18006	NC_000916	TCA	2	6	1003283	1003288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679097
18007	NC_000916	G	6	6	1003352	1003357	0 %	0 %	100 %	0 %	15679097
18008	NC_000916	GTG	2	6	1003376	1003381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679097
18009	NC_000916	TTC	2	6	1003389	1003394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679097
18010	NC_000916	ATC	2	6	1003416	1003421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679097
18011	NC_000916	T	6	6	1003431	1003436	0 %	100 %	0 %	0 %	15679097
18012	NC_000916	TAT	2	6	1003470	1003475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679097
18013	NC_000916	TCT	2	6	1003502	1003507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679097
18014	NC_000916	TGTT	2	8	1003535	1003542	0 %	75 %	25 %	0 %	15679097
18015	NC_000916	ATC	2	6	1003560	1003565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679097
18016	NC_000916	GC	3	6	1003569	1003574	0 %	0 %	50 %	50 %	15679097
18017	NC_000916	TAT	2	6	1003635	1003640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679097
18018	NC_000916	CAT	2	6	1003653	1003658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679097
18019	NC_000916	TA	3	6	1003764	1003769	50 %	50 %	0 %	0 %	15679098
18020	NC_000916	TC	3	6	1003883	1003888	0 %	50 %	0 %	50 %	15679098
18021	NC_000916	TATG	2	8	1003928	1003935	25 %	50 %	25 %	0 %	15679098
18022	NC_000916	CCT	2	6	1004074	1004079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679098
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18118	NC_000916	CCT	2	6	1010060	1010065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679104
18119	NC_000916	TCC	2	6	1010069	1010074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679104
18120	NC_000916	GCG	2	6	1010107	1010112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679104
18121	NC_000916	CTCC	2	8	1010127	1010134	0 %	25 %	0 %	75 %	15679104
18122	NC_000916	TCG	2	6	1010146	1010151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679104
18123	NC_000916	GTA	2	6	1010252	1010257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679104
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18126	NC_000916	CTT	2	6	1010376	1010381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679104
18127	NC_000916	T	6	6	1010380	1010385	0 %	100 %	0 %	0 %	15679104
18128	NC_000916	ATCC	2	8	1010409	1010416	25 %	25 %	0 %	50 %	15679104
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18131	NC_000916	ATC	2	6	1010738	1010743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679105
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18133	NC_000916	TGA	2	6	1010768	1010773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679105
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18142	NC_000916	G	6	6	1011382	1011387	0 %	0 %	100 %	0 %	15679105
18143	NC_000916	TGG	2	6	1011614	1011619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679105
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18147	NC_000916	G	6	6	1011908	1011913	0 %	0 %	100 %	0 %	15679105
18148	NC_000916	TGA	2	6	1011941	1011946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679106
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18150	NC_000916	TGA	2	6	1012016	1012021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679106
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18155	NC_000916	AT	3	6	1012306	1012311	50 %	50 %	0 %	0 %	15679107
18156	NC_000916	TGA	3	9	1012317	1012325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679107
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18161	NC_000916	CCT	2	6	1012533	1012538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679107
18162	NC_000916	ACAG	2	8	1012555	1012562	50 %	0 %	25 %	25 %	15679107
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18223	NC_000916	CAT	2	6	1015788	1015793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679111
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18228	NC_000916	GGC	3	9	1016069	1016077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679112
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18230	NC_000916	TGA	2	6	1016218	1016223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679112
18231	NC_000916	AGA	2	6	1016279	1016284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679112
18232	NC_000916	GAT	2	6	1016345	1016350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679112
18233	NC_000916	TGT	2	6	1016389	1016394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679112
18234	NC_000916	G	6	6	1016479	1016484	0 %	0 %	100 %	0 %	15679112
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18236	NC_000916	ATGTA	2	10	1016602	1016611	40 %	40 %	20 %	0 %	15679112
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18242	NC_000916	GGATA	2	10	1016916	1016925	40 %	20 %	40 %	0 %	15679113
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18354	NC_000916	TCC	2	6	1023865	1023870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679120
18355	NC_000916	CAT	2	6	1023924	1023929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679120
18356	NC_000916	TAT	2	6	1024010	1024015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679121
18357	NC_000916	CTT	2	6	1024017	1024022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679121
18358	NC_000916	TAT	2	6	1024034	1024039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679121
18359	NC_000916	TCA	2	6	1024101	1024106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679121
18360	NC_000916	ACC	2	6	1024107	1024112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679121
18361	NC_000916	TCC	2	6	1024173	1024178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679121
18362	NC_000916	CATA	2	8	1024331	1024338	50 %	25 %	0 %	25 %	15679121
18363	NC_000916	ATA	2	6	1024355	1024360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679121
18364	NC_000916	TGA	2	6	1024365	1024370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679121
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18367	NC_000916	AATG	2	8	1024462	1024469	50 %	25 %	25 %	0 %	15679122
18368	NC_000916	CAT	2	6	1024571	1024576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679122
18369	NC_000916	TGG	2	6	1024656	1024661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679122
18370	NC_000916	TCG	2	6	1024662	1024667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679122
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18374	NC_000916	G	6	6	1024818	1024823	0 %	0 %	100 %	0 %	15679122
18375	NC_000916	GAG	2	6	1024871	1024876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679122
18376	NC_000916	TGG	3	9	1024932	1024940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679122
18377	NC_000916	CCG	2	6	1024953	1024958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679122
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18379	NC_000916	GCC	2	6	1025030	1025035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679122
18380	NC_000916	TGA	2	6	1025113	1025118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679122
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18382	NC_000916	TGG	2	6	1025226	1025231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679122
18383	NC_000916	ATG	2	6	1025232	1025237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679122
18384	NC_000916	ATG	2	6	1025281	1025286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679122
18385	NC_000916	TGA	2	6	1025382	1025387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679123
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18470	NC_000916	CCT	2	6	1029046	1029051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679127
18471	NC_000916	GAT	2	6	1029065	1029070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679127
18472	NC_000916	CCA	2	6	1029308	1029313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679128
18473	NC_000916	TGC	2	6	1029335	1029340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679128
18474	NC_000916	CT	3	6	1029396	1029401	0 %	50 %	0 %	50 %	15679128
18475	NC_000916	CTC	2	6	1029520	1029525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679129
18476	NC_000916	CCT	2	6	1029609	1029614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679129
18477	NC_000916	ATC	2	6	1029620	1029625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679129
18478	NC_000916	TCA	2	6	1029641	1029646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679129
18479	NC_000916	TCCA	2	8	1029768	1029775	25 %	25 %	0 %	50 %	15679129
18480	NC_000916	TCC	2	6	1029929	1029934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679129
18481	NC_000916	CTC	2	6	1029940	1029945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679129
18482	NC_000916	CAT	2	6	1029979	1029984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679129
18483	NC_000916	GGC	3	9	1030024	1030032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679129
18484	NC_000916	TTGACC	2	12	1030061	1030072	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15679129
18485	NC_000916	CCT	2	6	1030122	1030127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679129
18486	NC_000916	TCT	2	6	1030128	1030133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679129
18487	NC_000916	GAC	2	6	1030186	1030191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679129
18488	NC_000916	CAA	2	6	1030230	1030235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679129
18489	NC_000916	GCATG	2	10	1030271	1030280	20 %	20 %	40 %	20 %	15679129
18490	NC_000916	ACC	2	6	1030285	1030290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679129
18491	NC_000916	TTA	2	6	1030299	1030304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679129
18492	NC_000916	TGGC	2	8	1030323	1030330	0 %	25 %	50 %	25 %	15679129
18493	NC_000916	GTT	2	6	1030508	1030513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679129
18494	NC_000916	CCAT	2	8	1030544	1030551	25 %	25 %	0 %	50 %	15679129
18495	NC_000916	TCC	2	6	1030596	1030601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679129
18496	NC_000916	AG	3	6	1030636	1030641	50 %	0 %	50 %	0 %	15679129
18497	NC_000916	G	6	6	1030664	1030669	0 %	0 %	100 %	0 %	15679129
18498	NC_000916	CCT	2	6	1030671	1030676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679129
18499	NC_000916	TCC	2	6	1030694	1030699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679129
18500	NC_000916	TTC	2	6	1030715	1030720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679129

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