MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_000916	CCT	2	6	914140	914145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679019
16503	NC_000916	ATA	2	6	914165	914170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679019
16504	NC_000916	AGA	2	6	914174	914179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679019
16505	NC_000916	ACTG	2	8	914215	914222	25 %	25 %	25 %	25 %	15679019
16506	NC_000916	GAA	2	6	914225	914230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679019
16507	NC_000916	GAG	2	6	914324	914329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679019
16508	NC_000916	TTG	2	6	914352	914357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679019
16509	NC_000916	ATG	2	6	914360	914365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679019
16510	NC_000916	AAG	2	6	914374	914379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679019
16511	NC_000916	GCT	2	6	914384	914389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679019
16512	NC_000916	GTT	2	6	914426	914431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679019
16513	NC_000916	CAGG	2	8	914511	914518	25 %	0 %	50 %	25 %	15679019
16514	NC_000916	TGA	2	6	914524	914529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679019
16515	NC_000916	GAG	2	6	914540	914545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679019
16516	NC_000916	CAGGG	2	10	914624	914633	20 %	0 %	60 %	20 %	15679019
16517	NC_000916	AAG	2	6	914684	914689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679019
16518	NC_000916	GCC	2	6	914690	914695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679019
16519	NC_000916	TCC	2	6	914738	914743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679019
16520	NC_000916	TCC	2	6	914751	914756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679019
16521	NC_000916	GAT	2	6	914759	914764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679019
16522	NC_000916	AGG	2	6	914793	914798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679019
16523	NC_000916	ATA	2	6	914814	914819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679019
16524	NC_000916	CAA	2	6	914847	914852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679019
16525	NC_000916	TCA	2	6	914889	914894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679019
16526	NC_000916	ATA	2	6	914939	914944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679019
16527	NC_000916	ATGG	2	8	914945	914952	25 %	25 %	50 %	0 %	15679019
16528	NC_000916	ACC	2	6	914953	914958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679019
16529	NC_000916	CCT	2	6	915043	915048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679019
16530	NC_000916	GCC	2	6	915077	915082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15679019
16531	NC_000916	TACATG	2	12	915098	915109	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15679019
16532	NC_000916	ATC	2	6	915112	915117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679019
16533	NC_000916	TCG	2	6	915162	915167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679019
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16535	NC_000916	TGG	2	6	915345	915350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679019
16536	NC_000916	TAAAG	2	10	915403	915412	60 %	20 %	20 %	0 %	15679019
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16538	NC_000916	GAACA	2	10	915445	915454	60 %	0 %	20 %	20 %	15679020
16539	NC_000916	GAA	2	6	915466	915471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679020
16540	NC_000916	AG	3	6	915523	915528	50 %	0 %	50 %	0 %	15679020
16541	NC_000916	A	6	6	915529	915534	100 %	0 %	0 %	0 %	15679020
16542	NC_000916	TGTC	2	8	915535	915542	0 %	50 %	25 %	25 %	15679020
16543	NC_000916	AGG	2	6	915570	915575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679020
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16545	NC_000916	CCAC	2	8	915751	915758	25 %	0 %	0 %	75 %	15679020
16546	NC_000916	TTCA	2	8	915872	915879	25 %	50 %	0 %	25 %	15679020
16547	NC_000916	CATC	2	8	916018	916025	25 %	25 %	0 %	50 %	15679020
16548	NC_000916	ATC	2	6	916062	916067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679020
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16551	NC_000916	GA	3	6	916221	916226	50 %	0 %	50 %	0 %	15679020
16552	NC_000916	TAC	2	6	916381	916386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679021
16553	NC_000916	CAACTT	2	12	916403	916414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679021
16554	NC_000916	TGA	2	6	916427	916432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679021
16555	NC_000916	GCT	2	6	916480	916485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679021
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16557	NC_000916	TGA	2	6	916563	916568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679021
16558	NC_000916	ACA	2	6	916702	916707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679021
16559	NC_000916	ATC	2	6	916713	916718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679021
16560	NC_000916	ACC	2	6	916720	916725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679021
16561	NC_000916	ACC	2	6	916771	916776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679021
16562	NC_000916	C	6	6	916830	916835	0 %	0 %	0 %	100 %	15679021
16563	NC_000916	TTA	2	6	916841	916846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679021
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16567	NC_000916	GCT	2	6	917098	917103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679021
16568	NC_000916	GAG	2	6	917136	917141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679021
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16588	NC_000916	CCA	2	6	918597	918602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679023
16589	NC_000916	AAT	2	6	918629	918634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679023
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16592	NC_000916	ATA	2	6	918801	918806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679023
16593	NC_000916	TGAA	2	8	919057	919064	50 %	25 %	25 %	0 %	15679024
16594	NC_000916	GGA	2	6	919223	919228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679024
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16602	NC_000916	TTC	2	6	919882	919887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679025
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16604	NC_000916	TCT	2	6	920099	920104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679025
16605	NC_000916	TCCAG	2	10	920138	920147	20 %	20 %	20 %	40 %	15679025
16606	NC_000916	CAG	2	6	920152	920157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679025
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16608	NC_000916	GATG	2	8	920274	920281	25 %	25 %	50 %	0 %	15679025
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16611	NC_000916	ACTC	2	8	920375	920382	25 %	25 %	0 %	50 %	15679025
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16615	NC_000916	CCCA	2	8	920528	920535	25 %	0 %	0 %	75 %	15679025
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16619	NC_000916	CAA	2	6	920676	920681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679025
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