MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_000916	ACA	2	6	859005	859010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678961
15503	NC_000916	CAT	2	6	859015	859020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678961
15504	NC_000916	TCA	2	6	859199	859204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678962
15505	NC_000916	TCC	2	6	859217	859222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678962
15506	NC_000916	CTC	3	9	859273	859281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678962
15507	NC_000916	TCA	2	6	859331	859336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678962
15508	NC_000916	CAT	2	6	859359	859364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678962
15509	NC_000916	CTC	2	6	859456	859461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678962
15510	NC_000916	TGA	2	6	859470	859475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678962
15511	NC_000916	CCT	2	6	859489	859494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678962
15512	NC_000916	ATCCTT	2	12	859501	859512	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15678962
15513	NC_000916	ATT	3	9	859520	859528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678962
15514	NC_000916	AAT	2	6	859553	859558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678962
15515	NC_000916	GTC	2	6	859591	859596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678962
15516	NC_000916	TCC	2	6	859671	859676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678962
15517	NC_000916	TC	3	6	859756	859761	0 %	50 %	0 %	50 %	15678962
15518	NC_000916	CTT	2	6	859777	859782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678962
15519	NC_000916	TGG	2	6	859816	859821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678962
15520	NC_000916	GT	3	6	859884	859889	0 %	50 %	50 %	0 %	15678962
15521	NC_000916	TGG	2	6	859904	859909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678962
15522	NC_000916	ATGT	2	8	859921	859928	25 %	50 %	25 %	0 %	15678962
15523	NC_000916	CCT	2	6	859968	859973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678962
15524	NC_000916	GT	3	6	860130	860135	0 %	50 %	50 %	0 %	15678962
15525	NC_000916	CCTTGG	2	12	860148	860159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678962
15526	NC_000916	TCT	2	6	860229	860234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678962
15527	NC_000916	TG	3	6	860285	860290	0 %	50 %	50 %	0 %	15678962
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15529	NC_000916	TCCT	2	8	860393	860400	0 %	50 %	0 %	50 %	15678962
15530	NC_000916	TGT	2	6	860403	860408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678962
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15532	NC_000916	GCCTC	2	10	860466	860475	0 %	20 %	20 %	60 %	15678962
15533	NC_000916	CTC	3	9	860473	860481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678962
15534	NC_000916	CAT	2	6	860530	860535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678962
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15536	NC_000916	CTG	2	6	860610	860615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678962
15537	NC_000916	CT	3	6	860630	860635	0 %	50 %	0 %	50 %	15678962
15538	NC_000916	CTT	2	6	860717	860722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678962
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15541	NC_000916	CTT	2	6	860761	860766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678962
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15543	NC_000916	AGG	2	6	860879	860884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678962
15544	NC_000916	TTC	2	6	860893	860898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678962
15545	NC_000916	CCTG	2	8	860947	860954	0 %	25 %	25 %	50 %	15678962
15546	NC_000916	TCA	3	9	861096	861104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678963
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15550	NC_000916	TAC	2	6	861255	861260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678963
15551	NC_000916	TCT	2	6	861262	861267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678963
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15553	NC_000916	CTT	2	6	861359	861364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678963
15554	NC_000916	TCA	2	6	861549	861554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678963
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15589	NC_000916	CTG	2	6	863632	863637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678964
15590	NC_000916	CTGG	2	8	863640	863647	0 %	25 %	50 %	25 %	15678964
15591	NC_000916	GGA	2	6	864039	864044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678965
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15600	NC_000916	TCA	2	6	864407	864412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678965
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15602	NC_000916	TCC	3	9	864530	864538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678965
15603	NC_000916	GCAG	2	8	864614	864621	25 %	0 %	50 %	25 %	15678965
15604	NC_000916	ATC	2	6	864622	864627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678965
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15607	NC_000916	GGGT	2	8	864959	864966	0 %	25 %	75 %	0 %	15678965
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15611	NC_000916	C	6	6	865134	865139	0 %	0 %	0 %	100 %	15678965
15612	NC_000916	AAG	3	9	865264	865272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678966
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15617	NC_000916	AGCCTC	2	12	865881	865892	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15678967
15618	NC_000916	TCAG	2	8	865905	865912	25 %	25 %	25 %	25 %	15678967
15619	NC_000916	TCC	2	6	865989	865994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678967
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15621	NC_000916	CTC	2	6	866003	866008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678967
15622	NC_000916	TCC	2	6	866017	866022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678967
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15625	NC_000916	GATATC	2	12	866154	866165	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15678968
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15986	NC_000916	AAG	2	6	886073	886078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678988
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15988	NC_000916	AAC	2	6	886370	886375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678989
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