MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_000916	TGA	2	6	831119	831124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678933
15002	NC_000916	TCA	2	6	831165	831170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678933
15003	NC_000916	CTG	2	6	831214	831219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678933
15004	NC_000916	GT	3	6	831244	831249	0 %	50 %	50 %	0 %	15678933
15005	NC_000916	CTC	2	6	831410	831415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678933
15006	NC_000916	GCA	2	6	831513	831518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678933
15007	NC_000916	AG	3	6	831628	831633	50 %	0 %	50 %	0 %	15678933
15008	NC_000916	GTA	2	6	831650	831655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678933
15009	NC_000916	GCTG	2	8	831666	831673	0 %	25 %	50 %	25 %	15678933
15010	NC_000916	GCT	2	6	831813	831818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678933
15011	NC_000916	GCATA	2	10	832000	832009	40 %	20 %	20 %	20 %	15678933
15012	NC_000916	TAG	2	6	832038	832043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678933
15013	NC_000916	CTG	2	6	832046	832051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678933
15014	NC_000916	CAA	2	6	832210	832215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678933
15015	NC_000916	GTGGA	2	10	832223	832232	20 %	20 %	60 %	0 %	15678933
15016	NC_000916	T	6	6	832250	832255	0 %	100 %	0 %	0 %	15678933
15017	NC_000916	CAG	2	6	832354	832359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678934
15018	NC_000916	TTA	2	6	832393	832398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678934
15019	NC_000916	ATC	2	6	832403	832408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678934
15020	NC_000916	CAG	2	6	832429	832434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678934
15021	NC_000916	CTC	2	6	832496	832501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678934
15022	NC_000916	ACTG	2	8	832514	832521	25 %	25 %	25 %	25 %	15678934
15023	NC_000916	GATG	2	8	832550	832557	25 %	25 %	50 %	0 %	15678934
15024	NC_000916	TTG	2	6	832618	832623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678934
15025	NC_000916	CCA	2	6	832710	832715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678934
15026	NC_000916	GA	4	8	832764	832771	50 %	0 %	50 %	0 %	15678934
15027	NC_000916	ATC	2	6	832802	832807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678934
15028	NC_000916	TCA	3	9	832896	832904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678934
15029	NC_000916	ATGAT	2	10	832928	832937	40 %	40 %	20 %	0 %	15678934
15030	NC_000916	CAG	2	6	833075	833080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678934
15031	NC_000916	CAT	2	6	833089	833094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678934
15032	NC_000916	CTG	2	6	833114	833119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678934
15033	NC_000916	TAC	2	6	833153	833158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678934
15034	NC_000916	CTGA	2	8	833179	833186	25 %	25 %	25 %	25 %	15678934
15035	NC_000916	ATA	2	6	833207	833212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678934
15036	NC_000916	TCT	2	6	833325	833330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678934
15037	NC_000916	ATCAT	2	10	833376	833385	40 %	40 %	0 %	20 %	15678934
15038	NC_000916	GT	3	6	833432	833437	0 %	50 %	50 %	0 %	15678934
15039	NC_000916	GTG	2	6	833449	833454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678934
15040	NC_000916	GCTGA	2	10	833457	833466	20 %	20 %	40 %	20 %	15678934
15041	NC_000916	GTTT	2	8	833515	833522	0 %	75 %	25 %	0 %	15678934
15042	NC_000916	ATG	2	6	833677	833682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678935
15043	NC_000916	ACT	2	6	833811	833816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678935
15044	NC_000916	GAG	2	6	833875	833880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678935
15045	NC_000916	A	7	7	833976	833982	100 %	0 %	0 %	0 %	15678935
15046	NC_000916	AT	3	6	834066	834071	50 %	50 %	0 %	0 %	15678935
15047	NC_000916	CTT	2	6	834111	834116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678935
15048	NC_000916	ATGA	2	8	834145	834152	50 %	25 %	25 %	0 %	15678935
15049	NC_000916	A	6	6	834154	834159	100 %	0 %	0 %	0 %	15678935
15050	NC_000916	TGT	2	6	834207	834212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678935
15051	NC_000916	GAA	2	6	834249	834254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678935
15052	NC_000916	AAG	2	6	834267	834272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678935
15053	NC_000916	AGA	3	9	834400	834408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678936
15054	NC_000916	AGAA	2	8	834452	834459	75 %	0 %	25 %	0 %	15678936
15055	NC_000916	TGA	2	6	834557	834562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678936
15056	NC_000916	ATT	2	6	834575	834580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678936
15057	NC_000916	GAA	2	6	834582	834587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678936
15058	NC_000916	GCCA	2	8	834654	834661	25 %	0 %	25 %	50 %	15678936
15059	NC_000916	GTT	2	6	834678	834683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678936
15060	NC_000916	TCG	2	6	834727	834732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678936
15061	NC_000916	TAA	2	6	834852	834857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678937
15062	NC_000916	A	6	6	834856	834861	100 %	0 %	0 %	0 %	15678937
15063	NC_000916	GAA	2	6	834947	834952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678937
15064	NC_000916	CAA	2	6	835014	835019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678937
15065	NC_000916	TCA	3	9	835065	835073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678937
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15069	NC_000916	AGA	2	6	835278	835283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678937
15070	NC_000916	TGA	2	6	835473	835478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678938
15071	NC_000916	T	6	6	835531	835536	0 %	100 %	0 %	0 %	15678938
15072	NC_000916	CAG	2	6	835590	835595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678938
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15074	NC_000916	TGAAA	2	10	835671	835680	60 %	20 %	20 %	0 %	15678938
15075	NC_000916	TTC	2	6	835710	835715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678938
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15081	NC_000916	GAAT	2	8	835922	835929	50 %	25 %	25 %	0 %	15678938
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15089	NC_000916	ACA	2	6	836213	836218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678938
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15092	NC_000916	TA	3	6	836278	836283	50 %	50 %	0 %	0 %	15678938
15093	NC_000916	GCT	2	6	836297	836302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678938
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15106	NC_000916	AAC	2	6	837557	837562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678939
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15111	NC_000916	AG	3	6	837830	837835	50 %	0 %	50 %	0 %	15678939
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15122	NC_000916	CATC	2	8	838503	838510	25 %	25 %	0 %	50 %	15678940
15123	NC_000916	CAT	2	6	838615	838620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678940
15124	NC_000916	TCTG	2	8	838664	838671	0 %	50 %	25 %	25 %	15678940
15125	NC_000916	TCC	2	6	838697	838702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678940
15126	NC_000916	GGT	2	6	838771	838776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678940
15127	NC_000916	ATG	2	6	838829	838834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678940
15128	NC_000916	AAGA	2	8	838840	838847	75 %	0 %	25 %	0 %	15678940
15129	NC_000916	T	6	6	838990	838995	0 %	100 %	0 %	0 %	15678941
15130	NC_000916	ATGA	2	8	839013	839020	50 %	25 %	25 %	0 %	15678941
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15134	NC_000916	AGC	2	6	839544	839549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678941
15135	NC_000916	GTT	2	6	839571	839576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678941
15136	NC_000916	TGAA	2	8	839629	839636	50 %	25 %	25 %	0 %	15678941
15137	NC_000916	GGAT	2	8	839641	839648	25 %	25 %	50 %	0 %	15678941
15138	NC_000916	A	6	6	839687	839692	100 %	0 %	0 %	0 %	15678941
15139	NC_000916	ACTC	2	8	839741	839748	25 %	25 %	0 %	50 %	15678941
15140	NC_000916	TGC	2	6	839782	839787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678942
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15142	NC_000916	GCCATG	2	12	839834	839845	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15678942
15143	NC_000916	TCT	2	6	839913	839918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678942
15144	NC_000916	T	7	7	839926	839932	0 %	100 %	0 %	0 %	15678942
15145	NC_000916	T	6	6	839956	839961	0 %	100 %	0 %	0 %	15678942
15146	NC_000916	AAGCA	2	10	840049	840058	60 %	0 %	20 %	20 %	15678942
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15148	NC_000916	CT	3	6	840308	840313	0 %	50 %	0 %	50 %	15678943
15149	NC_000916	CAA	2	6	840319	840324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678943
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15151	NC_000916	TGT	2	6	840646	840651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678944
15152	NC_000916	TCC	2	6	840666	840671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678944
15153	NC_000916	ATGT	2	8	840705	840712	25 %	50 %	25 %	0 %	15678944
15154	NC_000916	TTC	2	6	840876	840881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678944
15155	NC_000916	CTTTT	2	10	840956	840965	0 %	80 %	0 %	20 %	15678944
15156	NC_000916	T	6	6	841011	841016	0 %	100 %	0 %	0 %	15678944
15157	NC_000916	TCA	2	6	841021	841026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678944
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15159	NC_000916	T	6	6	841071	841076	0 %	100 %	0 %	0 %	15678944
15160	NC_000916	TTA	2	6	841099	841104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678944
15161	NC_000916	TCAT	2	8	841107	841114	25 %	50 %	0 %	25 %	15678944
15162	NC_000916	CCCTGC	2	12	841127	841138	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	15678944
15163	NC_000916	TCT	2	6	841243	841248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678944
15164	NC_000916	ATT	2	6	841280	841285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678945
15165	NC_000916	A	8	8	841390	841397	100 %	0 %	0 %	0 %	15678945
15166	NC_000916	CTGTG	2	10	841470	841479	0 %	40 %	40 %	20 %	15678945
15167	NC_000916	TGC	2	6	841491	841496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678945
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15170	NC_000916	TCC	2	6	841685	841690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678945
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15172	NC_000916	ACC	2	6	841720	841725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678945
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15175	NC_000916	GCT	2	6	841870	841875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678945
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15178	NC_000916	ATTT	2	8	841999	842006	25 %	75 %	0 %	0 %	15678946
15179	NC_000916	ATG	2	6	842023	842028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678946
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15181	NC_000916	GACA	2	8	842099	842106	50 %	0 %	25 %	25 %	15678946
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15184	NC_000916	T	6	6	842262	842267	0 %	100 %	0 %	0 %	15678946
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15186	NC_000916	TCA	2	6	842326	842331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678946
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15188	NC_000916	TGA	2	6	842493	842498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678946
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15195	NC_000916	TCC	2	6	842963	842968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678946
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15197	NC_000916	TGA	2	6	843180	843185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678947
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15204	NC_000916	CTG	2	6	843604	843609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678948
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15232	NC_000916	ACA	2	6	845004	845009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678948
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15236	NC_000916	GCT	2	6	845139	845144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678948
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15244	NC_000916	ATG	2	6	845604	845609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678948
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15246	NC_000916	GTG	3	9	845743	845751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678948
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15250	NC_000916	TGG	3	9	845988	845996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678948
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15352	NC_000916	GAT	2	6	852129	852134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678953
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15358	NC_000916	TGGC	2	8	852474	852481	0 %	25 %	50 %	25 %	15678954
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15362	NC_000916	AGG	2	6	852632	852637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678954
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15364	NC_000916	CCTTCA	2	12	852717	852728	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15678954
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15366	NC_000916	GTC	2	6	852779	852784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678954
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15371	NC_000916	TCTG	2	8	853137	853144	0 %	50 %	25 %	25 %	15678955
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15385	NC_000916	CGA	2	6	853859	853864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678957
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15487	NC_000916	AAC	2	6	858467	858472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678961
15488	NC_000916	TTA	2	6	858591	858596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678961
15489	NC_000916	CTC	2	6	858650	858655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678961
15490	NC_000916	TAAA	2	8	858671	858678	75 %	25 %	0 %	0 %	15678961
15491	NC_000916	T	6	6	858679	858684	0 %	100 %	0 %	0 %	15678961
15492	NC_000916	T	7	7	858691	858697	0 %	100 %	0 %	0 %	15678961
15493	NC_000916	TGC	2	6	858715	858720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678961
15494	NC_000916	T	6	6	858743	858748	0 %	100 %	0 %	0 %	15678961
15495	NC_000916	TTA	2	6	858751	858756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678961
15496	NC_000916	ATA	2	6	858761	858766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678961
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15499	NC_000916	TAAGAT	2	12	858901	858912	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15678961
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