MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_000916	CAT	2	6	802745	802750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678903
14502	NC_000916	CA	3	6	802760	802765	50 %	0 %	0 %	50 %	15678903
14503	NC_000916	CTC	2	6	802781	802786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678903
14504	NC_000916	TTC	2	6	802806	802811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678903
14505	NC_000916	GGA	2	6	802853	802858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678903
14506	NC_000916	TGG	2	6	802864	802869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678903
14507	NC_000916	CCT	2	6	802916	802921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678903
14508	NC_000916	CAC	2	6	802994	802999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678903
14509	NC_000916	CAA	2	6	803026	803031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678903
14510	NC_000916	CAT	2	6	803095	803100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678903
14511	NC_000916	TTC	2	6	803117	803122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678903
14512	NC_000916	TGC	2	6	803146	803151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678903
14513	NC_000916	ATCT	2	8	803178	803185	25 %	50 %	0 %	25 %	15678903
14514	NC_000916	CCT	2	6	803192	803197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678903
14515	NC_000916	ATA	2	6	803259	803264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678903
14516	NC_000916	ATA	2	6	803382	803387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678903
14517	NC_000916	GAA	2	6	803513	803518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678903
14518	NC_000916	ATC	2	6	803529	803534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678903
14519	NC_000916	TCA	2	6	803544	803549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678903
14520	NC_000916	TTC	2	6	803613	803618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678903
14521	NC_000916	CTT	2	6	803630	803635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678903
14522	NC_000916	TTC	2	6	803640	803645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678903
14523	NC_000916	GAT	2	6	803745	803750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678904
14524	NC_000916	GAT	2	6	803781	803786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678904
14525	NC_000916	GA	3	6	803804	803809	50 %	0 %	50 %	0 %	15678904
14526	NC_000916	GTT	2	6	803823	803828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678904
14527	NC_000916	GCTGCC	2	12	803865	803876	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	15678904
14528	NC_000916	CTG	2	6	803886	803891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678904
14529	NC_000916	GAG	2	6	803946	803951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678904
14530	NC_000916	GAT	2	6	803987	803992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678904
14531	NC_000916	GAG	2	6	804005	804010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678904
14532	NC_000916	GGTG	2	8	804125	804132	0 %	25 %	75 %	0 %	15678904
14533	NC_000916	AGG	2	6	804253	804258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678904
14534	NC_000916	AGG	2	6	804360	804365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678904
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14536	NC_000916	ACG	2	6	804565	804570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678904
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14538	NC_000916	TGG	2	6	804667	804672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678904
14539	NC_000916	AGGCCG	2	12	804805	804816	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15678904
14540	NC_000916	CTT	2	6	804866	804871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678904
14541	NC_000916	AGTC	2	8	804981	804988	25 %	25 %	25 %	25 %	15678904
14542	NC_000916	CTC	2	6	805008	805013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678904
14543	NC_000916	AGGG	2	8	805053	805060	25 %	0 %	75 %	0 %	15678904
14544	NC_000916	TTC	2	6	805104	805109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678904
14545	NC_000916	GA	3	6	805299	805304	50 %	0 %	50 %	0 %	15678904
14546	NC_000916	ATG	2	6	805348	805353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678904
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14551	NC_000916	GAG	2	6	805699	805704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678905
14552	NC_000916	GCT	2	6	805727	805732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678905
14553	NC_000916	CCT	2	6	805923	805928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678905
14554	NC_000916	TGCA	2	8	805989	805996	25 %	25 %	25 %	25 %	15678905
14555	NC_000916	TGC	2	6	806008	806013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678905
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14557	NC_000916	TGA	2	6	806040	806045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678905
14558	NC_000916	TGA	2	6	806116	806121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678905
14559	NC_000916	AT	3	6	806248	806253	50 %	50 %	0 %	0 %	15678905
14560	NC_000916	TTG	2	6	806277	806282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678905
14561	NC_000916	T	6	6	806544	806549	0 %	100 %	0 %	0 %	15678906
14562	NC_000916	TC	3	6	806576	806581	0 %	50 %	0 %	50 %	15678906
14563	NC_000916	GCT	2	6	806717	806722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678906
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14573	NC_000916	GAA	2	6	807188	807193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678907
14574	NC_000916	CTGT	2	8	807213	807220	0 %	50 %	25 %	25 %	15678907
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14588	NC_000916	TC	3	6	807889	807894	0 %	50 %	0 %	50 %	15678907
14589	NC_000916	GCT	2	6	807911	807916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678907
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14593	NC_000916	CAA	2	6	808060	808065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678908
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14602	NC_000916	GTT	2	6	808433	808438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678908
14603	NC_000916	CCT	2	6	808556	808561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678908
14604	NC_000916	CAAT	2	8	808599	808606	50 %	25 %	0 %	25 %	15678909
14605	NC_000916	TCA	2	6	808654	808659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678909
14606	NC_000916	TGGA	2	8	808666	808673	25 %	25 %	50 %	0 %	15678909
14607	NC_000916	ACC	2	6	808674	808679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678909
14608	NC_000916	CT	3	6	808684	808689	0 %	50 %	0 %	50 %	15678909
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14987	NC_000916	TCTTT	3	15	829803	829817	0 %	80 %	0 %	20 %	15678932
14988	NC_000916	CTC	2	6	829899	829904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678932
14989	NC_000916	TACCT	2	10	830023	830032	20 %	40 %	0 %	40 %	15678932
14990	NC_000916	TCA	2	6	830122	830127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678932
14991	NC_000916	TCA	2	6	830218	830223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678932
14992	NC_000916	CCA	2	6	830227	830232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678932
14993	NC_000916	GAG	2	6	830273	830278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678932
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14995	NC_000916	CCA	2	6	830328	830333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678932
14996	NC_000916	ATC	3	9	830339	830347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678932
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