MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_000916	ATA	2	6	745522	745527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678842
13502	NC_000916	CTG	2	6	745674	745679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678842
13503	NC_000916	GTA	2	6	745708	745713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678842
13504	NC_000916	GCA	2	6	745727	745732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678842
13505	NC_000916	CTT	2	6	745902	745907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678842
13506	NC_000916	CATC	2	8	745923	745930	25 %	25 %	0 %	50 %	15678842
13507	NC_000916	T	8	8	745944	745951	0 %	100 %	0 %	0 %	15678842
13508	NC_000916	TTTTGG	2	12	746017	746028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678842
13509	NC_000916	GTAG	2	8	746160	746167	25 %	25 %	50 %	0 %	15678843
13510	NC_000916	AAT	2	6	746168	746173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678843
13511	NC_000916	A	6	6	746174	746179	100 %	0 %	0 %	0 %	15678843
13512	NC_000916	TGA	2	6	746201	746206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678843
13513	NC_000916	GAA	2	6	746235	746240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678843
13514	NC_000916	GAA	2	6	746247	746252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678843
13515	NC_000916	CAA	2	6	746518	746523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678844
13516	NC_000916	GAAG	2	8	746534	746541	50 %	0 %	50 %	0 %	15678844
13517	NC_000916	AAG	2	6	746589	746594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678844
13518	NC_000916	ACC	2	6	746611	746616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678844
13519	NC_000916	ACC	2	6	746671	746676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678844
13520	NC_000916	GAG	2	6	746706	746711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678844
13521	NC_000916	GAG	2	6	746775	746780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678844
13522	NC_000916	GCCGAA	2	12	746781	746792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678844
13523	NC_000916	ACT	2	6	746902	746907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678844
13524	NC_000916	AGAT	2	8	746995	747002	50 %	25 %	25 %	0 %	15678844
13525	NC_000916	GCT	2	6	747201	747206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678845
13526	NC_000916	CAT	2	6	747239	747244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678845
13527	NC_000916	ATGC	2	8	747317	747324	25 %	25 %	25 %	25 %	15678845
13528	NC_000916	CAG	2	6	747371	747376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678845
13529	NC_000916	ATCT	2	8	747399	747406	25 %	50 %	0 %	25 %	15678845
13530	NC_000916	TTC	2	6	747493	747498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678845
13531	NC_000916	GAG	2	6	747615	747620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678845
13532	NC_000916	GTT	2	6	747639	747644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678845
13533	NC_000916	TGG	2	6	747655	747660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678845
13534	NC_000916	GAG	2	6	747669	747674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678845
13535	NC_000916	AGG	2	6	747751	747756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678845
13536	NC_000916	TTCCC	2	10	747759	747768	0 %	40 %	0 %	60 %	15678845
13537	NC_000916	TTG	2	6	747784	747789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678845
13538	NC_000916	CT	3	6	747862	747867	0 %	50 %	0 %	50 %	15678845
13539	NC_000916	CAT	2	6	747902	747907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678845
13540	NC_000916	TCC	2	6	748001	748006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678845
13541	NC_000916	AGG	2	6	748021	748026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678845
13542	NC_000916	GTAT	2	8	748028	748035	25 %	50 %	25 %	0 %	15678845
13543	NC_000916	TC	3	6	748145	748150	0 %	50 %	0 %	50 %	15678845
13544	NC_000916	TCC	2	6	748187	748192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678845
13545	NC_000916	GAG	2	6	748242	748247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678845
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13547	NC_000916	CAG	2	6	748292	748297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678845
13548	NC_000916	GAG	2	6	748308	748313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678845
13549	NC_000916	GCC	2	6	748345	748350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678845
13550	NC_000916	AT	3	6	748363	748368	50 %	50 %	0 %	0 %	15678845
13551	NC_000916	TTA	2	6	748406	748411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678845
13552	NC_000916	CTTTCA	2	12	748447	748458	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15678845
13553	NC_000916	TTTC	2	8	748480	748487	0 %	75 %	0 %	25 %	15678845
13554	NC_000916	ATG	2	6	748606	748611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678845
13555	NC_000916	AAT	2	6	748626	748631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678845
13556	NC_000916	TCC	2	6	748660	748665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678845
13557	NC_000916	CAT	2	6	748692	748697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678845
13558	NC_000916	GCT	2	6	748702	748707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678845
13559	NC_000916	TCT	2	6	748721	748726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678845
13560	NC_000916	TCCCAT	2	12	748754	748765	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15678845
13561	NC_000916	TTA	2	6	748772	748777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678845
13562	NC_000916	CT	3	6	748822	748827	0 %	50 %	0 %	50 %	15678845
13563	NC_000916	CCT	2	6	748835	748840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678845
13564	NC_000916	CAGA	2	8	748898	748905	50 %	0 %	25 %	25 %	15678845
13565	NC_000916	CAT	2	6	748913	748918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678845
13566	NC_000916	GGTG	2	8	749042	749049	0 %	25 %	75 %	0 %	15678845
13567	NC_000916	TGG	2	6	749087	749092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678845
13568	NC_000916	CTG	2	6	749093	749098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678845
13569	NC_000916	ATG	2	6	749114	749119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678845
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13572	NC_000916	AAC	2	6	750036	750041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678846
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13574	NC_000916	TTCC	2	8	750079	750086	0 %	50 %	0 %	50 %	15678846
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13586	NC_000916	CAA	2	6	750509	750514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678846
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13589	NC_000916	GGC	2	6	750639	750644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678846
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13594	NC_000916	ATG	2	6	750802	750807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678846
13595	NC_000916	TGACC	2	10	750822	750831	20 %	20 %	20 %	40 %	15678846
13596	NC_000916	ACCTTC	2	12	750838	750849	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15678846
13597	NC_000916	GGC	2	6	750894	750899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678846
13598	NC_000916	GCG	2	6	750911	750916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678846
13599	NC_000916	ATG	2	6	750944	750949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678846
13600	NC_000916	CAGC	2	8	750997	751004	25 %	0 %	25 %	50 %	15678846
13601	NC_000916	TCT	2	6	751040	751045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678846
13602	NC_000916	CAT	2	6	751115	751120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678846
13603	NC_000916	CTC	2	6	751143	751148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678846
13604	NC_000916	GGA	2	6	751151	751156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678846
13605	NC_000916	TA	3	6	751209	751214	50 %	50 %	0 %	0 %	15678846
13606	NC_000916	CCAT	2	8	751225	751232	25 %	25 %	0 %	50 %	15678846
13607	NC_000916	TTCAG	2	10	751281	751290	20 %	40 %	20 %	20 %	15678847
13608	NC_000916	TCCA	2	8	751298	751305	25 %	25 %	0 %	50 %	15678847
13609	NC_000916	CCG	2	6	751336	751341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678847
13610	NC_000916	GTC	2	6	751359	751364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678847
13611	NC_000916	GCT	2	6	751448	751453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678847
13612	NC_000916	CTG	2	6	751501	751506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678847
13613	NC_000916	TCA	2	6	751516	751521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678847
13614	NC_000916	GTTAT	2	10	751555	751564	20 %	60 %	20 %	0 %	15678847
13615	NC_000916	T	6	6	751584	751589	0 %	100 %	0 %	0 %	15678847
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13618	NC_000916	TC	3	6	751926	751931	0 %	50 %	0 %	50 %	15678847
13619	NC_000916	CAT	2	6	751935	751940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678847
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13622	NC_000916	TGT	2	6	752043	752048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678848
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13863	NC_000916	TAT	2	6	764573	764578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678861
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13987	NC_000916	GAAT	2	8	771551	771558	50 %	25 %	25 %	0 %	15678869
13988	NC_000916	GAC	2	6	771651	771656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678869
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13990	NC_000916	GGTTAA	2	12	771806	771817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678869
13991	NC_000916	AGC	2	6	771831	771836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678869
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