MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_000916	TGA	2	6	716798	716803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678811
13003	NC_000916	TCT	2	6	716846	716851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678811
13004	NC_000916	GA	3	6	716944	716949	50 %	0 %	50 %	0 %	15678811
13005	NC_000916	GCG	2	6	717043	717048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678811
13006	NC_000916	AGG	2	6	717120	717125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678811
13007	NC_000916	AAG	2	6	717200	717205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678811
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13009	NC_000916	CAT	2	6	717257	717262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678811
13010	NC_000916	GAG	2	6	717264	717269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678811
13011	NC_000916	GAT	2	6	717552	717557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678812
13012	NC_000916	ATG	2	6	717568	717573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678812
13013	NC_000916	ATGA	2	8	717658	717665	50 %	25 %	25 %	0 %	15678812
13014	NC_000916	AG	3	6	717738	717743	50 %	0 %	50 %	0 %	15678812
13015	NC_000916	TGA	2	6	717788	717793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678812
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13017	NC_000916	GAG	2	6	717897	717902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678812
13018	NC_000916	ACC	2	6	717937	717942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678812
13019	NC_000916	TTC	2	6	717958	717963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678812
13020	NC_000916	TTA	2	6	717980	717985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678812
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13022	NC_000916	CAG	2	6	718065	718070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678812
13023	NC_000916	CAT	2	6	718125	718130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678812
13024	NC_000916	GAG	2	6	718200	718205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678812
13025	NC_000916	ATC	2	6	718252	718257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678812
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13029	NC_000916	ATG	2	6	718435	718440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678812
13030	NC_000916	CAA	2	6	718460	718465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678812
13031	NC_000916	AGAA	2	8	718482	718489	75 %	0 %	25 %	0 %	15678812
13032	NC_000916	AGG	2	6	718549	718554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678812
13033	NC_000916	TAG	2	6	718555	718560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678812
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13035	NC_000916	TGC	2	6	718776	718781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678812
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13039	NC_000916	TCT	2	6	719223	719228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678813
13040	NC_000916	GAG	2	6	719268	719273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678813
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13044	NC_000916	GGA	2	6	719480	719485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678813
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13057	NC_000916	TGA	2	6	720560	720565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678814
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13101	NC_000916	GCT	2	6	723286	723291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678816
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13105	NC_000916	CTT	2	6	723635	723640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678816
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13107	NC_000916	ATC	2	6	723762	723767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678816
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13112	NC_000916	GTC	2	6	724148	724153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678816
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13120	NC_000916	CGT	2	6	724378	724383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678816
13121	NC_000916	ACA	2	6	724389	724394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678816
13122	NC_000916	CAA	2	6	724411	724416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678816
13123	NC_000916	GTT	2	6	724446	724451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678816
13124	NC_000916	GCT	2	6	724549	724554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678816
13125	NC_000916	CGC	2	6	724992	724997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678817
13126	NC_000916	CCT	2	6	725132	725137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678817
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13129	NC_000916	TCA	2	6	725293	725298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678817
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13132	NC_000916	GCA	2	6	725488	725493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678817
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13136	NC_000916	GTAA	2	8	725844	725851	50 %	25 %	25 %	0 %	15678817
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13140	NC_000916	C	6	6	726120	726125	0 %	0 %	0 %	100 %	15678818
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13143	NC_000916	TCA	2	6	726237	726242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678818
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13145	NC_000916	TGG	2	6	726324	726329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678818
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13151	NC_000916	CTCA	2	8	726623	726630	25 %	25 %	0 %	50 %	15678819
13152	NC_000916	TGG	2	6	726739	726744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678819
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13233	NC_000916	TA	3	6	731616	731621	50 %	50 %	0 %	0 %	15678824
13234	NC_000916	CAGC	2	8	731699	731706	25 %	0 %	25 %	50 %	15678824
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13237	NC_000916	ACAACG	2	12	731785	731796	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15678824
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13242	NC_000916	CTC	2	6	732031	732036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678825
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13249	NC_000916	CCT	2	6	732310	732315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678826
13250	NC_000916	ATCT	2	8	732386	732393	25 %	50 %	0 %	25 %	15678826
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13486	NC_000916	ATA	3	9	744736	744744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678841
13487	NC_000916	CTT	2	6	744902	744907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678842
13488	NC_000916	TCCT	2	8	744915	744922	0 %	50 %	0 %	50 %	15678842
13489	NC_000916	TTA	2	6	744939	744944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678842
13490	NC_000916	TTC	2	6	744946	744951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678842
13491	NC_000916	CGG	2	6	744981	744986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678842
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13493	NC_000916	GTC	2	6	745144	745149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678842
13494	NC_000916	AGGGG	2	10	745212	745221	20 %	0 %	80 %	0 %	15678842
13495	NC_000916	TCT	2	6	745245	745250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678842
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