MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_000916	TCA	2	6	634909	634914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678739
11502	NC_000916	GTG	2	6	634915	634920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678739
11503	NC_000916	GCA	2	6	634948	634953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678740
11504	NC_000916	ATC	3	9	635010	635018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678740
11505	NC_000916	CAT	3	9	635021	635029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678740
11506	NC_000916	AGGT	2	8	635059	635066	25 %	25 %	50 %	0 %	15678740
11507	NC_000916	TCCC	2	8	635197	635204	0 %	25 %	0 %	75 %	15678740
11508	NC_000916	TCC	2	6	635276	635281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678740
11509	NC_000916	ATA	2	6	635772	635777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678741
11510	NC_000916	TGT	2	6	635906	635911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678741
11511	NC_000916	TGA	2	6	635927	635932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678741
11512	NC_000916	GTG	2	6	635983	635988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678741
11513	NC_000916	TCA	2	6	636213	636218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678741
11514	NC_000916	ATC	2	6	636270	636275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678741
11515	NC_000916	AAAT	2	8	636442	636449	75 %	25 %	0 %	0 %	15678741
11516	NC_000916	CTG	2	6	636453	636458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678741
11517	NC_000916	CAT	2	6	636485	636490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678741
11518	NC_000916	GTT	2	6	636522	636527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678741
11519	NC_000916	G	6	6	636565	636570	0 %	0 %	100 %	0 %	15678741
11520	NC_000916	ACAT	2	8	636594	636601	50 %	25 %	0 %	25 %	15678741
11521	NC_000916	TCA	2	6	636666	636671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678741
11522	NC_000916	TGA	2	6	636758	636763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678741
11523	NC_000916	TGG	2	6	636890	636895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678741
11524	NC_000916	ATC	2	6	637100	637105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678741
11525	NC_000916	TAG	2	6	637116	637121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678741
11526	NC_000916	CTG	2	6	637170	637175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678741
11527	NC_000916	GTT	2	6	637197	637202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678741
11528	NC_000916	TTCCA	2	10	637334	637343	20 %	40 %	0 %	40 %	15678741
11529	NC_000916	TGC	2	6	637370	637375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678741
11530	NC_000916	ATC	2	6	637376	637381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678741
11531	NC_000916	TAA	2	6	637451	637456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678741
11532	NC_000916	CTT	2	6	637485	637490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678741
11533	NC_000916	GCT	2	6	637503	637508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678741
11534	NC_000916	GAA	2	6	637517	637522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678741
11535	NC_000916	TAG	2	6	637607	637612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678741
11536	NC_000916	CAGCC	2	10	637685	637694	20 %	0 %	20 %	60 %	15678741
11537	NC_000916	TGA	2	6	637741	637746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678741
11538	NC_000916	AGG	2	6	637830	637835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678741
11539	NC_000916	TGT	2	6	637853	637858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678741
11540	NC_000916	CTC	2	6	637859	637864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678741
11541	NC_000916	TCC	2	6	637920	637925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678741
11542	NC_000916	TCT	2	6	637995	638000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678741
11543	NC_000916	TTG	2	6	638031	638036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678741
11544	NC_000916	TG	3	6	638067	638072	0 %	50 %	50 %	0 %	15678741
11545	NC_000916	ATT	2	6	638075	638080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678741
11546	NC_000916	TTG	2	6	638122	638127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678741
11547	NC_000916	CAT	2	6	638140	638145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678741
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11549	NC_000916	AAG	2	6	638167	638172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678741
11550	NC_000916	CCA	2	6	638178	638183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678741
11551	NC_000916	TGG	2	6	638204	638209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678741
11552	NC_000916	CTG	2	6	638230	638235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678741
11553	NC_000916	CTC	2	6	638241	638246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678741
11554	NC_000916	TCCA	2	8	638270	638277	25 %	25 %	0 %	50 %	15678741
11555	NC_000916	TA	3	6	638279	638284	50 %	50 %	0 %	0 %	15678741
11556	NC_000916	ATA	3	9	638282	638290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678741
11557	NC_000916	CCA	3	9	638455	638463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678741
11558	NC_000916	G	6	6	638597	638602	0 %	0 %	100 %	0 %	15678741
11559	NC_000916	AT	3	6	638859	638864	50 %	50 %	0 %	0 %	15678741
11560	NC_000916	TATCA	2	10	639017	639026	40 %	40 %	0 %	20 %	15678741
11561	NC_000916	TTG	2	6	639034	639039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678741
11562	NC_000916	TAG	2	6	639162	639167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678741
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11564	NC_000916	TAT	2	6	639257	639262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678741
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11572	NC_000916	CGC	2	6	639853	639858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678741
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11605	NC_000916	GTA	2	6	641556	641561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678742
11606	NC_000916	CAT	2	6	641614	641619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678742
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11610	NC_000916	CT	3	6	641730	641735	0 %	50 %	0 %	50 %	15678742
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11866	NC_000916	ACC	2	6	654556	654561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678750
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11868	NC_000916	CCT	2	6	654651	654656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678750
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11930	NC_000916	TCT	2	6	657852	657857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678752
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11938	NC_000916	GTA	2	6	658380	658385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678753
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11950	NC_000916	GA	3	6	658950	658955	50 %	0 %	50 %	0 %	15678754
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11983	NC_000916	T	6	6	661015	661020	0 %	100 %	0 %	0 %	15678755
11984	NC_000916	TTG	2	6	661181	661186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678756
11985	NC_000916	ATC	2	6	661258	661263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678756
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11987	NC_000916	GGA	2	6	661404	661409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678756
11988	NC_000916	CTC	2	6	661507	661512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678756
11989	NC_000916	GAT	2	6	661543	661548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678756
11990	NC_000916	CCG	2	6	661790	661795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678757
11991	NC_000916	G	6	6	661856	661861	0 %	0 %	100 %	0 %	15678757
11992	NC_000916	TCC	3	9	661898	661906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678757
11993	NC_000916	GCC	2	6	661919	661924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678757
11994	NC_000916	GAT	2	6	661958	661963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678757
11995	NC_000916	T	7	7	662058	662064	0 %	100 %	0 %	0 %	15678757
11996	NC_000916	ATT	2	6	662084	662089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678757
11997	NC_000916	TGAA	2	8	662112	662119	50 %	25 %	25 %	0 %	15678758
11998	NC_000916	GCT	2	6	662128	662133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678758
11999	NC_000916	GAG	2	6	662146	662151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678758
12000	NC_000916	ATG	2	6	662156	662161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678758

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