MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_000916	A	6	6	607329	607334	100 %	0 %	0 %	0 %	15678703
11002	NC_000916	AGG	2	6	607432	607437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678703
11003	NC_000916	ATAC	2	8	607452	607459	50 %	25 %	0 %	25 %	15678703
11004	NC_000916	GAG	2	6	607489	607494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678703
11005	NC_000916	TAC	2	6	607495	607500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678703
11006	NC_000916	GGT	2	6	607540	607545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678703
11007	NC_000916	GGA	2	6	607658	607663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678703
11008	NC_000916	TTG	2	6	607682	607687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678703
11009	NC_000916	GAAG	2	8	607698	607705	50 %	0 %	50 %	0 %	15678703
11010	NC_000916	CA	4	8	607738	607745	50 %	0 %	0 %	50 %	15678703
11011	NC_000916	GGT	2	6	607756	607761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678703
11012	NC_000916	ATT	2	6	608224	608229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678704
11013	NC_000916	AAGG	2	8	608243	608250	50 %	0 %	50 %	0 %	15678704
11014	NC_000916	TCA	2	6	608283	608288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678704
11015	NC_000916	TCA	2	6	608316	608321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678704
11016	NC_000916	CCA	2	6	608368	608373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678704
11017	NC_000916	GGA	2	6	608446	608451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678704
11018	NC_000916	TTC	2	6	608574	608579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678705
11019	NC_000916	TTC	2	6	608588	608593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678705
11020	NC_000916	TC	3	6	608597	608602	0 %	50 %	0 %	50 %	15678705
11021	NC_000916	TCT	2	6	608608	608613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678705
11022	NC_000916	TGA	2	6	608677	608682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678705
11023	NC_000916	TA	3	6	608701	608706	50 %	50 %	0 %	0 %	15678705
11024	NC_000916	TTC	2	6	608735	608740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678705
11025	NC_000916	TGCCTG	2	12	608798	608809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678705
11026	NC_000916	CTG	3	9	608807	608815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678705
11027	NC_000916	GCT	2	6	608818	608823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678705
11028	NC_000916	GCC	2	6	608957	608962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678706
11029	NC_000916	CAT	2	6	609009	609014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678706
11030	NC_000916	CATGGA	2	12	609022	609033	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15678706
11031	NC_000916	GTCC	2	8	609103	609110	0 %	25 %	25 %	50 %	15678706
11032	NC_000916	ACTC	2	8	609147	609154	25 %	25 %	0 %	50 %	15678706
11033	NC_000916	TCA	2	6	609240	609245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678707
11034	NC_000916	T	6	6	609368	609373	0 %	100 %	0 %	0 %	15678707
11035	NC_000916	CTCCC	2	10	609410	609419	0 %	20 %	0 %	80 %	15678707
11036	NC_000916	TGT	2	6	609602	609607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678707
11037	NC_000916	GAG	2	6	609608	609613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678707
11038	NC_000916	CCT	2	6	609653	609658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679904
11039	NC_000916	CTT	2	6	609705	609710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679904
11040	NC_000916	GCT	2	6	609784	609789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678708
11041	NC_000916	TCT	2	6	609928	609933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678708
11042	NC_000916	CTTT	2	8	610001	610008	0 %	75 %	0 %	25 %	15678708
11043	NC_000916	CAT	2	6	610152	610157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678709
11044	NC_000916	CAC	2	6	610176	610181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678709
11045	NC_000916	CTC	2	6	610207	610212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678709
11046	NC_000916	TCC	3	9	610247	610255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678709
11047	NC_000916	GAGG	2	8	610258	610265	25 %	0 %	75 %	0 %	15678709
11048	NC_000916	TCT	2	6	610341	610346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678709
11049	NC_000916	CAG	2	6	610402	610407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678709
11050	NC_000916	CAT	2	6	610449	610454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678709
11051	NC_000916	ATG	2	6	610460	610465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678709
11052	NC_000916	TGC	2	6	610494	610499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678709
11053	NC_000916	ATG	2	6	610505	610510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678709
11054	NC_000916	ATC	2	6	610529	610534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678709
11055	NC_000916	TCA	2	6	610586	610591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678709
11056	NC_000916	GT	3	6	610665	610670	0 %	50 %	50 %	0 %	15678709
11057	NC_000916	TTA	2	6	610823	610828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678709
11058	NC_000916	TAT	2	6	610867	610872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678709
11059	NC_000916	CCT	2	6	610906	610911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678710
11060	NC_000916	TCC	3	9	611064	611072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678710
11061	NC_000916	AG	3	6	611075	611080	50 %	0 %	50 %	0 %	15678710
11062	NC_000916	ACC	2	6	611088	611093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678710
11063	NC_000916	CTG	2	6	611110	611115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678710
11064	NC_000916	CAA	2	6	611122	611127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678710
11065	NC_000916	CCTC	2	8	611199	611206	0 %	25 %	0 %	75 %	15678710
11066	NC_000916	CTC	2	6	611339	611344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678710
11067	NC_000916	CCA	2	6	611440	611445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678710
11068	NC_000916	TCA	2	6	611529	611534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678710
11069	NC_000916	TCC	2	6	611547	611552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678710
11070	NC_000916	TG	3	6	611583	611588	0 %	50 %	50 %	0 %	15678710
11071	NC_000916	ATT	2	6	611611	611616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678711
11072	NC_000916	CAT	2	6	611649	611654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678711
11073	NC_000916	CAG	3	9	611661	611669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678711
11074	NC_000916	CTT	2	6	611682	611687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678711
11075	NC_000916	TCA	2	6	611723	611728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678711
11076	NC_000916	AAT	2	6	611778	611783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678711
11077	NC_000916	CTC	2	6	611842	611847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678711
11078	NC_000916	GAG	2	6	611884	611889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678711
11079	NC_000916	CGGT	2	8	611900	611907	0 %	25 %	50 %	25 %	15678711
11080	NC_000916	ACC	2	6	611945	611950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678711
11081	NC_000916	ACA	2	6	611993	611998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678711
11082	NC_000916	TCT	2	6	612030	612035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678711
11083	NC_000916	CTT	2	6	612160	612165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678711
11084	NC_000916	TCA	2	6	612170	612175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678711
11085	NC_000916	CAC	2	6	612337	612342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678711
11086	NC_000916	C	6	6	612345	612350	0 %	0 %	0 %	100 %	15678711
11087	NC_000916	TCT	2	6	612390	612395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678711
11088	NC_000916	ACCTG	2	10	612491	612500	20 %	20 %	20 %	40 %	15678711
11089	NC_000916	AAC	2	6	612502	612507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678711
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11091	NC_000916	TTA	2	6	612582	612587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678712
11092	NC_000916	CGT	2	6	612684	612689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678712
11093	NC_000916	TCA	2	6	612842	612847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678712
11094	NC_000916	TCC	2	6	612881	612886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678712
11095	NC_000916	TGA	2	6	612960	612965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678712
11096	NC_000916	ATC	2	6	612986	612991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678712
11097	NC_000916	TCTGC	2	10	612999	613008	0 %	40 %	20 %	40 %	15678712
11098	NC_000916	CTT	2	6	613028	613033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678712
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11100	NC_000916	CCT	2	6	613131	613136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678712
11101	NC_000916	TCC	2	6	613151	613156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678712
11102	NC_000916	TC	3	6	613222	613227	0 %	50 %	0 %	50 %	15678712
11103	NC_000916	T	6	6	613275	613280	0 %	100 %	0 %	0 %	15678712
11104	NC_000916	CTC	2	6	613282	613287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678713
11105	NC_000916	TCC	2	6	613289	613294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678713
11106	NC_000916	TCCT	2	8	613298	613305	0 %	50 %	0 %	50 %	15678713
11107	NC_000916	CTC	2	6	613315	613320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678713
11108	NC_000916	TCA	3	9	613337	613345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678713
11109	NC_000916	GTT	2	6	613406	613411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678713
11110	NC_000916	GTC	2	6	613474	613479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678713
11111	NC_000916	CTT	2	6	613486	613491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678713
11112	NC_000916	TCC	2	6	613499	613504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678713
11113	NC_000916	CGC	2	6	613507	613512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678713
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11115	NC_000916	TCT	2	6	613677	613682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678713
11116	NC_000916	GCCTT	2	10	613743	613752	0 %	40 %	20 %	40 %	15678713
11117	NC_000916	ATT	2	6	613757	613762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678713
11118	NC_000916	CCA	2	6	613776	613781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678713
11119	NC_000916	ATCT	2	8	613810	613817	25 %	50 %	0 %	25 %	15678713
11120	NC_000916	TCT	2	6	613824	613829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678713
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11122	NC_000916	CAA	2	6	613875	613880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678713
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11124	NC_000916	TCTT	2	8	614101	614108	0 %	75 %	0 %	25 %	15678714
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11240	NC_000916	AG	3	6	620767	620772	50 %	0 %	50 %	0 %	15678723
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11245	NC_000916	AAG	2	6	621134	621139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678724
11246	NC_000916	CAGGT	2	10	621282	621291	20 %	20 %	40 %	20 %	15678724
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11248	NC_000916	CAT	2	6	621427	621432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678724
11249	NC_000916	GTA	2	6	621458	621463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678724
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11489	NC_000916	TACT	2	8	633824	633831	25 %	50 %	0 %	25 %	15678737
11490	NC_000916	CCG	2	6	633977	633982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678737
11491	NC_000916	GCC	2	6	634026	634031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678737
11492	NC_000916	A	6	6	634252	634257	100 %	0 %	0 %	0 %	15678738
11493	NC_000916	GAT	2	6	634292	634297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678738
11494	NC_000916	CCA	2	6	634358	634363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678738
11495	NC_000916	ATG	2	6	634482	634487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678738
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11497	NC_000916	GAGG	2	8	634513	634520	25 %	0 %	75 %	0 %	15678738
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11499	NC_000916	TCA	2	6	634756	634761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678739
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