MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_000916	CTC	2	6	578025	578030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678679
10503	NC_000916	GGA	2	6	578110	578115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678679
10504	NC_000916	CCAT	2	8	578116	578123	25 %	25 %	0 %	50 %	15678679
10505	NC_000916	GGA	2	6	578183	578188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678679
10506	NC_000916	TCAT	2	8	578307	578314	25 %	50 %	0 %	25 %	15678679
10507	NC_000916	ATC	2	6	578315	578320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678679
10508	NC_000916	AGG	2	6	578328	578333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678679
10509	NC_000916	AG	4	8	578352	578359	50 %	0 %	50 %	0 %	15678679
10510	NC_000916	GCA	2	6	578383	578388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678679
10511	NC_000916	ACC	2	6	578433	578438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678679
10512	NC_000916	CAG	2	6	578477	578482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678679
10513	NC_000916	AGG	2	6	578655	578660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678679
10514	NC_000916	GCC	2	6	578712	578717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678679
10515	NC_000916	TCA	2	6	578772	578777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678679
10516	NC_000916	CTG	2	6	578779	578784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678679
10517	NC_000916	GCC	2	6	578805	578810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678679
10518	NC_000916	TAAT	2	8	578918	578925	50 %	50 %	0 %	0 %	15678679
10519	NC_000916	CTG	2	6	579352	579357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678680
10520	NC_000916	TCAG	2	8	579427	579434	25 %	25 %	25 %	25 %	15678680
10521	NC_000916	AGG	2	6	579597	579602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678680
10522	NC_000916	GTT	2	6	579666	579671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678680
10523	NC_000916	TTATTT	2	12	579730	579741	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15678680
10524	NC_000916	ACG	2	6	579754	579759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678680
10525	NC_000916	AGT	2	6	579842	579847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678680
10526	NC_000916	GA	3	6	579856	579861	50 %	0 %	50 %	0 %	15678680
10527	NC_000916	TCT	2	6	579912	579917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678680
10528	NC_000916	ATG	2	6	579928	579933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678680
10529	NC_000916	ACC	2	6	580026	580031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678680
10530	NC_000916	CCA	2	6	580065	580070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678680
10531	NC_000916	CTG	2	6	580088	580093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678680
10532	NC_000916	TGA	2	6	580184	580189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678680
10533	NC_000916	CAGA	2	8	580206	580213	50 %	0 %	25 %	25 %	15678680
10534	NC_000916	ATGA	2	8	580264	580271	50 %	25 %	25 %	0 %	15678680
10535	NC_000916	ATC	2	6	580284	580289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678680
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10537	NC_000916	AGA	3	9	580304	580312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678680
10538	NC_000916	AGGA	2	8	580323	580330	50 %	0 %	50 %	0 %	15678680
10539	NC_000916	TGA	2	6	580356	580361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678680
10540	NC_000916	GCT	2	6	580474	580479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678680
10541	NC_000916	TAAT	2	8	580570	580577	50 %	50 %	0 %	0 %	15678680
10542	NC_000916	TA	3	6	580597	580602	50 %	50 %	0 %	0 %	15678680
10543	NC_000916	A	6	6	580608	580613	100 %	0 %	0 %	0 %	15678680
10544	NC_000916	AT	3	6	580661	580666	50 %	50 %	0 %	0 %	15678680
10545	NC_000916	TTA	2	6	580709	580714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678680
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10547	NC_000916	AAT	2	6	581078	581083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678681
10548	NC_000916	AGA	2	6	581278	581283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678681
10549	NC_000916	GA	3	6	581282	581287	50 %	0 %	50 %	0 %	15678681
10550	NC_000916	TGGG	2	8	581310	581317	0 %	25 %	75 %	0 %	15678681
10551	NC_000916	TCC	2	6	581341	581346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678681
10552	NC_000916	GAAA	2	8	581359	581366	75 %	0 %	25 %	0 %	15678681
10553	NC_000916	GGA	2	6	581376	581381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678681
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10555	NC_000916	ATT	2	6	581401	581406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678681
10556	NC_000916	GTA	2	6	581437	581442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678681
10557	NC_000916	CAT	2	6	581456	581461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678681
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10559	NC_000916	CAG	2	6	581597	581602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678681
10560	NC_000916	CAG	2	6	581639	581644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678681
10561	NC_000916	TGA	2	6	581687	581692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678681
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10563	NC_000916	TCA	2	6	581725	581730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678681
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10565	NC_000916	ATT	2	6	581839	581844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678682
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10569	NC_000916	CCT	2	6	582052	582057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678682
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10587	NC_000916	TCTCA	2	10	583014	583023	20 %	40 %	0 %	40 %	15678682
10588	NC_000916	TAT	2	6	583077	583082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678682
10589	NC_000916	ACA	2	6	583091	583096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678682
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10593	NC_000916	GGT	2	6	583229	583234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678683
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10595	NC_000916	CTG	2	6	583536	583541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678683
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10597	NC_000916	ATGA	2	8	583668	583675	50 %	25 %	25 %	0 %	15678683
10598	NC_000916	CCA	2	6	583713	583718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678683
10599	NC_000916	GA	3	6	583792	583797	50 %	0 %	50 %	0 %	15678683
10600	NC_000916	TCAGAT	2	12	583800	583811	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15678683
10601	NC_000916	TCC	2	6	583857	583862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678683
10602	NC_000916	CCT	2	6	583921	583926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678683
10603	NC_000916	AGG	2	6	583990	583995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678683
10604	NC_000916	GCCC	2	8	584000	584007	0 %	0 %	25 %	75 %	15678683
10605	NC_000916	TGC	2	6	584129	584134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678683
10606	NC_000916	GCC	3	9	584202	584210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678683
10607	NC_000916	TTC	2	6	584346	584351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678683
10608	NC_000916	TCC	3	9	584355	584363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678683
10609	NC_000916	C	6	6	584362	584367	0 %	0 %	0 %	100 %	15678683
10610	NC_000916	GTT	2	6	584453	584458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678683
10611	NC_000916	AG	3	6	584471	584476	50 %	0 %	50 %	0 %	15678683
10612	NC_000916	TCT	2	6	584504	584509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678683
10613	NC_000916	CTC	2	6	584546	584551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678683
10614	NC_000916	TCA	2	6	584571	584576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678683
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10617	NC_000916	CAC	2	6	584833	584838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678683
10618	NC_000916	TCC	2	6	584913	584918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678683
10619	NC_000916	CCCT	2	8	584976	584983	0 %	25 %	0 %	75 %	15678683
10620	NC_000916	G	6	6	585037	585042	0 %	0 %	100 %	0 %	15678683
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10622	NC_000916	G	6	6	585109	585114	0 %	0 %	100 %	0 %	15678683
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10985	NC_000916	GTT	2	6	606396	606401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678702
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10991	NC_000916	ACC	2	6	606768	606773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678702
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10993	NC_000916	AGT	2	6	606832	606837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678702
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