MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_000916	GAG	2	6	548875	548880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678642
10002	NC_000916	CTT	2	6	548924	548929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678642
10003	NC_000916	GCA	2	6	548978	548983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678642
10004	NC_000916	CGA	2	6	549028	549033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678642
10005	NC_000916	GAGG	2	8	549040	549047	25 %	0 %	75 %	0 %	15678642
10006	NC_000916	CAC	2	6	549062	549067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678642
10007	NC_000916	CATG	2	8	549538	549545	25 %	25 %	25 %	25 %	15678643
10008	NC_000916	TCC	3	9	549579	549587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678643
10009	NC_000916	CTC	2	6	549610	549615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678643
10010	NC_000916	CCT	3	9	549633	549641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678643
10011	NC_000916	CACC	2	8	549669	549676	25 %	0 %	0 %	75 %	15678643
10012	NC_000916	TCA	2	6	549710	549715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678643
10013	NC_000916	GTA	2	6	549796	549801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678643
10014	NC_000916	CAA	2	6	549831	549836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678643
10015	NC_000916	GTCA	2	8	549883	549890	25 %	25 %	25 %	25 %	15678643
10016	NC_000916	TCC	2	6	549905	549910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678643
10017	NC_000916	TCA	2	6	549936	549941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678643
10018	NC_000916	GGCCG	2	10	549955	549964	0 %	0 %	60 %	40 %	15678643
10019	NC_000916	TCT	2	6	549987	549992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678643
10020	NC_000916	GGA	2	6	550006	550011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678643
10021	NC_000916	CT	3	6	550034	550039	0 %	50 %	0 %	50 %	15678643
10022	NC_000916	CTGTC	2	10	550065	550074	0 %	40 %	20 %	40 %	15678643
10023	NC_000916	GGA	2	6	550110	550115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678643
10024	NC_000916	GAA	2	6	550171	550176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678643
10025	NC_000916	ATT	2	6	550262	550267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678643
10026	NC_000916	TCC	3	9	550327	550335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678643
10027	NC_000916	TCT	2	6	550535	550540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678644
10028	NC_000916	TTA	2	6	550544	550549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678644
10029	NC_000916	TGC	3	9	550600	550608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678644
10030	NC_000916	CCT	2	6	550613	550618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678644
10031	NC_000916	CCTT	2	8	550649	550656	0 %	50 %	0 %	50 %	15678644
10032	NC_000916	CGA	2	6	550820	550825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678644
10033	NC_000916	CTC	2	6	550870	550875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678644
10034	NC_000916	GGTT	2	8	550907	550914	0 %	50 %	50 %	0 %	15678644
10035	NC_000916	GAC	2	6	550941	550946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678644
10036	NC_000916	CTT	2	6	550977	550982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678644
10037	NC_000916	GAG	2	6	551010	551015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678644
10038	NC_000916	TCC	2	6	551026	551031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678644
10039	NC_000916	GTC	2	6	551046	551051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678644
10040	NC_000916	GAG	2	6	551055	551060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678644
10041	NC_000916	CTC	2	6	551063	551068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678644
10042	NC_000916	TAT	2	6	551079	551084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678644
10043	NC_000916	TTG	2	6	551107	551112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678644
10044	NC_000916	TCT	2	6	551197	551202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678644
10045	NC_000916	ACC	2	6	551284	551289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678644
10046	NC_000916	CCT	2	6	551368	551373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678644
10047	NC_000916	TCT	2	6	551393	551398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678644
10048	NC_000916	CCT	2	6	551444	551449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678644
10049	NC_000916	AGGC	2	8	551662	551669	25 %	0 %	50 %	25 %	15678644
10050	NC_000916	T	6	6	551758	551763	0 %	100 %	0 %	0 %	15678644
10051	NC_000916	TCA	2	6	551788	551793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678644
10052	NC_000916	AGC	2	6	551812	551817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678644
10053	NC_000916	TCA	2	6	551839	551844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678644
10054	NC_000916	GTA	2	6	551847	551852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678644
10055	NC_000916	GGT	2	6	552105	552110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678645
10056	NC_000916	AAAG	2	8	552122	552129	75 %	0 %	25 %	0 %	15678645
10057	NC_000916	AG	3	6	552220	552225	50 %	0 %	50 %	0 %	15678645
10058	NC_000916	TCC	2	6	552254	552259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678645
10059	NC_000916	TC	3	6	552263	552268	0 %	50 %	0 %	50 %	15678645
10060	NC_000916	AAG	2	6	552470	552475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678646
10061	NC_000916	CTT	2	6	552525	552530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678646
10062	NC_000916	TGC	2	6	552614	552619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678646
10063	NC_000916	GAG	2	6	552657	552662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678646
10064	NC_000916	CCA	2	6	552699	552704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678646
10065	NC_000916	CATC	2	8	552738	552745	25 %	25 %	0 %	50 %	15678646
10066	NC_000916	GAG	2	6	552790	552795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678646
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10069	NC_000916	CAT	2	6	552850	552855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678646
10070	NC_000916	ACA	2	6	552864	552869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678646
10071	NC_000916	TACA	2	8	552900	552907	50 %	25 %	0 %	25 %	15678646
10072	NC_000916	TACA	2	8	552945	552952	50 %	25 %	0 %	25 %	15678646
10073	NC_000916	CCT	2	6	553287	553292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678647
10074	NC_000916	ATCA	2	8	553356	553363	50 %	25 %	0 %	25 %	15678647
10075	NC_000916	CTG	2	6	553369	553374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678647
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10080	NC_000916	ATC	2	6	553579	553584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678647
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10082	NC_000916	AT	3	6	553598	553603	50 %	50 %	0 %	0 %	15678647
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10086	NC_000916	TGAA	2	8	553697	553704	50 %	25 %	25 %	0 %	15678647
10087	NC_000916	AGG	2	6	553712	553717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678647
10088	NC_000916	A	7	7	553742	553748	100 %	0 %	0 %	0 %	15678647
10089	NC_000916	GTG	2	6	553826	553831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678647
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10092	NC_000916	CTC	2	6	553924	553929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678647
10093	NC_000916	ATG	2	6	553931	553936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678647
10094	NC_000916	AGG	3	9	553948	553956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678647
10095	NC_000916	AGG	2	6	554032	554037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678647
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10100	NC_000916	TGAG	2	8	554324	554331	25 %	25 %	50 %	0 %	15678647
10101	NC_000916	ATA	2	6	554371	554376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678647
10102	NC_000916	TGA	2	6	554385	554390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678647
10103	NC_000916	AGG	2	6	554413	554418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678647
10104	NC_000916	AG	3	6	554441	554446	50 %	0 %	50 %	0 %	15678647
10105	NC_000916	GGAA	2	8	554458	554465	50 %	0 %	50 %	0 %	15678647
10106	NC_000916	AAG	2	6	554517	554522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678647
10107	NC_000916	CAGA	2	8	554608	554615	50 %	0 %	25 %	25 %	15678647
10108	NC_000916	CTC	2	6	554644	554649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678647
10109	NC_000916	ACC	2	6	554663	554668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678647
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10111	NC_000916	ATA	2	6	554689	554694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678647
10112	NC_000916	CTG	2	6	554701	554706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678647
10113	NC_000916	GA	4	8	554754	554761	50 %	0 %	50 %	0 %	15678647
10114	NC_000916	CAA	2	6	554813	554818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678647
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10116	NC_000916	ATAAC	2	10	555011	555020	60 %	20 %	0 %	20 %	15678647
10117	NC_000916	GAT	2	6	555067	555072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678647
10118	NC_000916	CCAG	2	8	555300	555307	25 %	0 %	25 %	50 %	15678648
10119	NC_000916	GAT	2	6	555319	555324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678648
10120	NC_000916	AAG	2	6	555325	555330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678648
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10122	NC_000916	GTT	2	6	555536	555541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678648
10123	NC_000916	ATG	2	6	555576	555581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678648
10124	NC_000916	TGC	2	6	555621	555626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678648
10125	NC_000916	TGG	2	6	555631	555636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678648
10126	NC_000916	TGA	2	6	555655	555660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678648
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10142	NC_000916	GAAA	2	8	556557	556564	75 %	0 %	25 %	0 %	15678649
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10145	NC_000916	GGA	2	6	556798	556803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678650
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10150	NC_000916	CTG	2	6	557172	557177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678650
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10153	NC_000916	CTG	2	6	557366	557371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678650
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10239	NC_000916	ACC	2	6	563101	563106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678660
10240	NC_000916	AG	3	6	563132	563137	50 %	0 %	50 %	0 %	15678660
10241	NC_000916	GCA	2	6	563178	563183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678660
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10243	NC_000916	GAT	2	6	563319	563324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678660
10244	NC_000916	A	7	7	563444	563450	100 %	0 %	0 %	0 %	15678660
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10253	NC_000916	CTGGG	2	10	563805	563814	0 %	20 %	60 %	20 %	15678660
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10365	NC_000916	TCC	2	6	570309	570314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678670
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