MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_000916	TCAGGG	2	12	380838	380849	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15678471
7002	NC_000916	TGA	2	6	380968	380973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678471
7003	NC_000916	GGGC	2	8	381119	381126	0 %	0 %	75 %	25 %	15678471
7004	NC_000916	GCG	2	6	381139	381144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678471
7005	NC_000916	GAG	2	6	381228	381233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678471
7006	NC_000916	GGA	2	6	381290	381295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678471
7007	NC_000916	GAG	2	6	381329	381334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678471
7008	NC_000916	GTG	2	6	381406	381411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678471
7009	NC_000916	CAG	2	6	381443	381448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678471
7010	NC_000916	GAG	2	6	381449	381454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678471
7011	NC_000916	TGA	2	6	381479	381484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678471
7012	NC_000916	AAG	2	6	381516	381521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678471
7013	NC_000916	CTC	2	6	381522	381527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678471
7014	NC_000916	CCG	2	6	381562	381567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678471
7015	NC_000916	CAT	2	6	381611	381616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678471
7016	NC_000916	GTG	2	6	381634	381639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678471
7017	NC_000916	TCG	2	6	381652	381657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678471
7018	NC_000916	AGG	2	6	381676	381681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678471
7019	NC_000916	TGC	2	6	381683	381688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678471
7020	NC_000916	AC	4	8	381696	381703	50 %	0 %	0 %	50 %	15678471
7021	NC_000916	GAT	2	6	381772	381777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678471
7022	NC_000916	T	6	6	381916	381921	0 %	100 %	0 %	0 %	15678472
7023	NC_000916	T	7	7	381965	381971	0 %	100 %	0 %	0 %	15678472
7024	NC_000916	ATG	2	6	382003	382008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678472
7025	NC_000916	GCA	2	6	382036	382041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678472
7026	NC_000916	GCATG	2	10	382071	382080	20 %	20 %	40 %	20 %	15678472
7027	NC_000916	G	6	6	382136	382141	0 %	0 %	100 %	0 %	15678472
7028	NC_000916	CCT	2	6	382167	382172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678472
7029	NC_000916	TGG	2	6	382259	382264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678472
7030	NC_000916	CTC	2	6	382267	382272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678472
7031	NC_000916	CT	3	6	382296	382301	0 %	50 %	0 %	50 %	15678472
7032	NC_000916	GAA	2	6	382323	382328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678472
7033	NC_000916	GGA	2	6	382443	382448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678472
7034	NC_000916	GAT	2	6	382465	382470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678472
7035	NC_000916	ATA	2	6	382492	382497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678472
7036	NC_000916	GAC	2	6	382531	382536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678472
7037	NC_000916	CTC	3	9	382540	382548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678472
7038	NC_000916	GCAG	3	12	382555	382566	25 %	0 %	50 %	25 %	15678472
7039	NC_000916	AGG	3	9	382634	382642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678472
7040	NC_000916	CCT	2	6	382722	382727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678472
7041	NC_000916	GGGACC	2	12	382751	382762	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15678472
7042	NC_000916	ATGG	2	8	382786	382793	25 %	25 %	50 %	0 %	15678472
7043	NC_000916	TGA	2	6	382797	382802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678472
7044	NC_000916	AC	3	6	382803	382808	50 %	0 %	0 %	50 %	15678472
7045	NC_000916	GAA	2	6	382894	382899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678472
7046	NC_000916	TGG	2	6	382953	382958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678472
7047	NC_000916	TGG	2	6	382986	382991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678472
7048	NC_000916	CAA	2	6	382994	382999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678472
7049	NC_000916	GGT	2	6	383019	383024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678472
7050	NC_000916	ATG	2	6	383028	383033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678472
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7052	NC_000916	CAA	2	6	383117	383122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678473
7053	NC_000916	TCC	2	6	383218	383223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678473
7054	NC_000916	TCC	2	6	383319	383324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678473
7055	NC_000916	AGG	2	6	383326	383331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678473
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7058	NC_000916	ATA	2	6	383719	383724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678474
7059	NC_000916	GGA	2	6	383826	383831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678474
7060	NC_000916	AGG	2	6	383911	383916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678474
7061	NC_000916	AGG	2	6	383924	383929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678474
7062	NC_000916	GAA	2	6	383932	383937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678474
7063	NC_000916	GA	3	6	383938	383943	50 %	0 %	50 %	0 %	15678474
7064	NC_000916	AG	3	6	383973	383978	50 %	0 %	50 %	0 %	15678474
7065	NC_000916	CAT	2	6	384045	384050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678474
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7073	NC_000916	GAG	2	6	384415	384420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678474
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7098	NC_000916	GGA	2	6	385966	385971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678475
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7492	NC_000916	TCC	2	6	409355	409360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678496
7493	NC_000916	CAT	2	6	409422	409427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678496
7494	NC_000916	TCC	3	9	409487	409495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678496
7495	NC_000916	TGA	2	6	409509	409514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678496
7496	NC_000916	ACA	2	6	409583	409588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678496
7497	NC_000916	TCA	2	6	409595	409600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678496
7498	NC_000916	AGG	2	6	409607	409612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678496
7499	NC_000916	CGG	2	6	409695	409700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678496
7500	NC_000916	CGG	2	6	409737	409742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678496

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