MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_000916	CCT	2	6	296949	296954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678383
5502	NC_000916	ATG	2	6	296977	296982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678383
5503	NC_000916	GTA	2	6	296993	296998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678383
5504	NC_000916	TCATTT	2	12	297336	297347	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15678384
5505	NC_000916	GA	3	6	297418	297423	50 %	0 %	50 %	0 %	15678384
5506	NC_000916	CAC	2	6	297433	297438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678384
5507	NC_000916	AC	3	6	297437	297442	50 %	0 %	0 %	50 %	15678384
5508	NC_000916	CCG	2	6	297454	297459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678384
5509	NC_000916	TTC	2	6	297490	297495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678384
5510	NC_000916	TC	3	6	297494	297499	0 %	50 %	0 %	50 %	15678384
5511	NC_000916	TCT	2	6	297547	297552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678384
5512	NC_000916	TCACCG	2	12	297559	297570	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15678384
5513	NC_000916	CATC	2	8	297583	297590	25 %	25 %	0 %	50 %	15678384
5514	NC_000916	ATC	2	6	297620	297625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678384
5515	NC_000916	TCA	2	6	297634	297639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678384
5516	NC_000916	CAT	2	6	297647	297652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678384
5517	NC_000916	TCC	2	6	297799	297804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678384
5518	NC_000916	CCT	2	6	297806	297811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678384
5519	NC_000916	CACATC	2	12	297812	297823	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15678384
5520	NC_000916	GAG	2	6	297843	297848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678384
5521	NC_000916	GCT	2	6	297899	297904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678384
5522	NC_000916	CAT	2	6	297911	297916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678384
5523	NC_000916	CCTC	2	8	298012	298019	0 %	25 %	0 %	75 %	15678384
5524	NC_000916	ATA	2	6	298023	298028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678384
5525	NC_000916	GTT	2	6	298029	298034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678384
5526	NC_000916	CCT	2	6	298094	298099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678384
5527	NC_000916	TTC	2	6	298113	298118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678384
5528	NC_000916	TGT	2	6	298124	298129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678384
5529	NC_000916	AGG	2	6	298165	298170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678384
5530	NC_000916	A	6	6	298200	298205	100 %	0 %	0 %	0 %	15678384
5531	NC_000916	CAT	2	6	298231	298236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678384
5532	NC_000916	GGTG	2	8	298271	298278	0 %	25 %	75 %	0 %	15678384
5533	NC_000916	GATG	2	8	298294	298301	25 %	25 %	50 %	0 %	15678384
5534	NC_000916	TCAC	2	8	298344	298351	25 %	25 %	0 %	50 %	15678384
5535	NC_000916	AGTG	2	8	298397	298404	25 %	25 %	50 %	0 %	15678384
5536	NC_000916	CTT	2	6	298416	298421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678384
5537	NC_000916	CCT	2	6	298469	298474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678384
5538	NC_000916	TCC	2	6	298555	298560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678384
5539	NC_000916	GA	3	6	298629	298634	50 %	0 %	50 %	0 %	15678384
5540	NC_000916	CTC	2	6	298722	298727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678384
5541	NC_000916	GCA	2	6	298780	298785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678384
5542	NC_000916	GAT	2	6	298833	298838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678384
5543	NC_000916	ATCAG	2	10	298931	298940	40 %	20 %	20 %	20 %	15678384
5544	NC_000916	GTA	2	6	299194	299199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678385
5545	NC_000916	GCT	2	6	299360	299365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678385
5546	NC_000916	AGG	2	6	299393	299398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678385
5547	NC_000916	TCCTG	2	10	299419	299428	0 %	40 %	20 %	40 %	15678385
5548	NC_000916	GTA	2	6	299464	299469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678385
5549	NC_000916	TGT	2	6	299484	299489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678385
5550	NC_000916	TGCT	2	8	299550	299557	0 %	50 %	25 %	25 %	15678385
5551	NC_000916	TCC	2	6	299669	299674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678385
5552	NC_000916	AGG	2	6	299705	299710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678385
5553	NC_000916	GAT	2	6	299738	299743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678385
5554	NC_000916	TGA	2	6	299767	299772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678385
5555	NC_000916	CAG	2	6	299905	299910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678385
5556	NC_000916	CGG	2	6	299922	299927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678385
5557	NC_000916	CTG	2	6	299999	300004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678385
5558	NC_000916	ATC	2	6	300017	300022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678385
5559	NC_000916	CAG	2	6	300042	300047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678385
5560	NC_000916	TGT	2	6	300055	300060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678385
5561	NC_000916	CCCA	2	8	300073	300080	25 %	0 %	0 %	75 %	15678385
5562	NC_000916	CTC	2	6	300129	300134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678385
5563	NC_000916	TCC	2	6	300287	300292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678385
5564	NC_000916	TAG	3	9	300365	300373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678385
5565	NC_000916	TCC	2	6	300450	300455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678385
5566	NC_000916	ACC	2	6	300535	300540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678385
5567	NC_000916	TGT	2	6	300612	300617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678385
5568	NC_000916	AGG	2	6	300702	300707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678385
5569	NC_000916	CTT	2	6	300778	300783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678385
5570	NC_000916	CTT	2	6	300802	300807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678385
5571	NC_000916	TGG	2	6	300858	300863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678385
5572	NC_000916	TGAGG	2	10	300979	300988	20 %	20 %	60 %	0 %	15678385
5573	NC_000916	TCA	2	6	301004	301009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678385
5574	NC_000916	GCT	2	6	301020	301025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678385
5575	NC_000916	CTGTT	2	10	301117	301126	0 %	60 %	20 %	20 %	15678385
5576	NC_000916	TGTGTT	2	12	301139	301150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678385
5577	NC_000916	TCTGC	2	10	301155	301164	0 %	40 %	20 %	40 %	15678385
5578	NC_000916	TGT	2	6	301171	301176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678385
5579	NC_000916	GTT	2	6	301184	301189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678385
5580	NC_000916	TGC	2	6	301221	301226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678385
5581	NC_000916	ATGA	2	8	301265	301272	50 %	25 %	25 %	0 %	15678385
5582	NC_000916	TA	4	8	301371	301378	50 %	50 %	0 %	0 %	15678385
5583	NC_000916	CTC	2	6	301631	301636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678386
5584	NC_000916	TCC	2	6	301681	301686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678386
5585	NC_000916	ACC	2	6	301710	301715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678386
5586	NC_000916	TAT	2	6	301772	301777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678386
5587	NC_000916	ATGG	2	8	301808	301815	25 %	25 %	50 %	0 %	15678386
5588	NC_000916	ATCACC	2	12	301848	301859	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15678386
5589	NC_000916	TAG	2	6	301914	301919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678386
5590	NC_000916	CCT	2	6	302015	302020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678386
5591	NC_000916	GGT	2	6	302050	302055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678386
5592	NC_000916	CCT	2	6	302075	302080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678386
5593	NC_000916	CG	3	6	302117	302122	0 %	0 %	50 %	50 %	15678386
5594	NC_000916	CT	3	6	302130	302135	0 %	50 %	0 %	50 %	15678386
5595	NC_000916	AG	3	6	302252	302257	50 %	0 %	50 %	0 %	15678386
5596	NC_000916	ACC	2	6	302355	302360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678386
5597	NC_000916	GAA	2	6	302414	302419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678386
5598	NC_000916	CAG	2	6	302429	302434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678386
5599	NC_000916	GAA	3	9	302450	302458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678386
5600	NC_000916	CCT	2	6	302470	302475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678386
5601	NC_000916	CCA	2	6	302536	302541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678386
5602	NC_000916	GAG	2	6	302618	302623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678386
5603	NC_000916	AGCAC	2	10	302706	302715	40 %	0 %	20 %	40 %	15678386
5604	NC_000916	GAG	2	6	302723	302728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678386
5605	NC_000916	CACC	2	8	302752	302759	25 %	0 %	0 %	75 %	15678386
5606	NC_000916	AAGG	2	8	302768	302775	50 %	0 %	50 %	0 %	15678386
5607	NC_000916	GGA	2	6	302872	302877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678386
5608	NC_000916	CTG	2	6	302898	302903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678386
5609	NC_000916	CAC	2	6	302972	302977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678386
5610	NC_000916	TTC	2	6	303022	303027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678386
5611	NC_000916	AAG	2	6	303074	303079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678386
5612	NC_000916	TGA	2	6	303119	303124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678386
5613	NC_000916	GTT	2	6	303525	303530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678387
5614	NC_000916	TTG	2	6	303557	303562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678387
5615	NC_000916	GAG	2	6	303591	303596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678387
5616	NC_000916	AGG	2	6	303694	303699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678387
5617	NC_000916	TG	4	8	303700	303707	0 %	50 %	50 %	0 %	15678387
5618	NC_000916	CA	3	6	303711	303716	50 %	0 %	0 %	50 %	15678387
5619	NC_000916	CCTGT	2	10	303721	303730	0 %	40 %	20 %	40 %	15678387
5620	NC_000916	TAT	2	6	303761	303766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678387
5621	NC_000916	GCTG	2	8	303894	303901	0 %	25 %	50 %	25 %	15678387
5622	NC_000916	CGAGG	2	10	303903	303912	20 %	0 %	60 %	20 %	15678387
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5624	NC_000916	GGA	2	6	303966	303971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678387
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5626	NC_000916	TGC	2	6	304013	304018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678387
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5640	NC_000916	GTA	2	6	304728	304733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678387
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5645	NC_000916	CATG	2	8	305043	305050	25 %	25 %	25 %	25 %	15678387
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5741	NC_000916	GCA	2	6	310134	310139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678391
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5744	NC_000916	TCG	2	6	310206	310211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678391
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5992	NC_000916	GGAG	2	8	323806	323813	25 %	0 %	75 %	0 %	15678406
5993	NC_000916	CAT	2	6	323849	323854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678406
5994	NC_000916	GA	3	6	323856	323861	50 %	0 %	50 %	0 %	15678406
5995	NC_000916	CTC	2	6	323988	323993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678406
5996	NC_000916	CCT	2	6	324052	324057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678406
5997	NC_000916	TAA	2	6	324070	324075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678406
5998	NC_000916	TCC	2	6	324079	324084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678406
5999	NC_000916	GTA	2	6	324162	324167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678406
6000	NC_000916	CTGG	2	8	324186	324193	0 %	25 %	50 %	25 %	15678406

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