MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium kansasii ATCC 12478 plasmid pMK12478

Total Repeats: 3686

< Previous12345678Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_022654	TCG	2	6	77081	77086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559783
2002	NC_022654	CAG	2	6	77091	77096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559783
2003	NC_022654	GC	3	6	77201	77206	0 %	0 %	50 %	50 %	556559783
2004	NC_022654	CGC	2	6	77244	77249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559783
2005	NC_022654	CTG	2	6	77262	77267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559783
2006	NC_022654	CG	3	6	77280	77285	0 %	0 %	50 %	50 %	556559783
2007	NC_022654	ACC	2	6	77287	77292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556559783
2008	NC_022654	CCCG	2	8	77361	77368	0 %	0 %	25 %	75 %	556559783
2009	NC_022654	CCGG	2	8	77374	77381	0 %	0 %	50 %	50 %	556559783
2010	NC_022654	AAC	2	6	77383	77388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556559783
2011	NC_022654	CGC	2	6	77430	77435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559783
2012	NC_022654	CGC	2	6	77596	77601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559784
2013	NC_022654	GC	3	6	77600	77605	0 %	0 %	50 %	50 %	556559784
2014	NC_022654	CCGCA	2	10	77674	77683	20 %	0 %	20 %	60 %	556559784
2015	NC_022654	ACT	2	6	77731	77736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556559784
2016	NC_022654	GAC	2	6	77738	77743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559784
2017	NC_022654	ATC	2	6	77815	77820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556559785
2018	NC_022654	TCG	2	6	77834	77839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559785
2019	NC_022654	GCC	2	6	77881	77886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559785
2020	NC_022654	CGC	2	6	77889	77894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559785
2021	NC_022654	CG	3	6	77970	77975	0 %	0 %	50 %	50 %	556559785
2022	NC_022654	CGC	2	6	78045	78050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559785
2023	NC_022654	GCC	2	6	78080	78085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559785
2024	NC_022654	CGC	2	6	78090	78095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559785
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2030	NC_022654	CCGGTC	2	12	78601	78612	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	556559786
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2034	NC_022654	CCTT	2	8	78743	78750	0 %	50 %	0 %	50 %	556559786
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2041	NC_022654	GCGG	2	8	79271	79278	0 %	0 %	75 %	25 %	556559786
2042	NC_022654	CGGT	2	8	79309	79316	0 %	25 %	50 %	25 %	556559786
2043	NC_022654	GGT	2	6	79386	79391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556559786
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2047	NC_022654	CG	3	6	79490	79495	0 %	0 %	50 %	50 %	556559786
2048	NC_022654	TCGATC	2	12	79501	79512	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	556559786
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2050	NC_022654	CCGG	2	8	79579	79586	0 %	0 %	50 %	50 %	556559786
2051	NC_022654	GCC	2	6	79671	79676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559786
2052	NC_022654	TCG	2	6	79741	79746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559786
2053	NC_022654	GCC	2	6	79774	79779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559786
2054	NC_022654	TCA	2	6	79835	79840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556559786
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2056	NC_022654	AGTG	2	8	79940	79947	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2057	NC_022654	TCT	2	6	79968	79973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2058	NC_022654	GGT	2	6	80039	80044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556559787
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2062	NC_022654	GGT	3	9	80136	80144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556559787
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2122	NC_022654	GCG	2	6	82622	82627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556559789
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2128	NC_022654	GTC	2	6	82892	82897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559789
2129	NC_022654	CAA	2	6	82898	82903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556559789
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2131	NC_022654	TCGG	2	8	82944	82951	0 %	25 %	50 %	25 %	556559789
2132	NC_022654	GCA	2	6	82980	82985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559789
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2138	NC_022654	TCA	2	6	83203	83208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556559789
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2140	NC_022654	TGC	2	6	83305	83310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559790
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2162	NC_022654	CCT	2	6	84296	84301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556559790
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2166	NC_022654	GCC	2	6	84413	84418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559790
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2201	NC_022654	CA	3	6	85607	85612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2202	NC_022654	CGC	2	6	85687	85692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2203	NC_022654	CGT	2	6	85693	85698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2205	NC_022654	GCA	2	6	85803	85808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2209	NC_022654	CGA	2	6	86090	86095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2211	NC_022654	CTG	2	6	86133	86138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2212	NC_022654	CGG	3	9	86140	86148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2213	NC_022654	GGC	2	6	86183	86188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2214	NC_022654	TGA	2	6	86224	86229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2215	NC_022654	CGT	2	6	86256	86261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559791
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2222	NC_022654	CATC	2	8	86498	86505	25 %	25 %	0 %	50 %	556559791
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2231	NC_022654	CTT	2	6	87095	87100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556559792
2232	NC_022654	CG	3	6	87103	87108	0 %	0 %	50 %	50 %	556559792
2233	NC_022654	CGC	2	6	87129	87134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559792
2234	NC_022654	TCGC	2	8	87219	87226	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2235	NC_022654	TGT	2	6	87393	87398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2236	NC_022654	GTG	2	6	87404	87409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2237	NC_022654	GCT	2	6	87415	87420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2238	NC_022654	GGA	2	6	87438	87443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556559793
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2240	NC_022654	CGA	2	6	87501	87506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559793
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2242	NC_022654	GGT	2	6	87620	87625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556559793
2243	NC_022654	GAC	2	6	87658	87663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559793
2244	NC_022654	CAGC	2	8	87712	87719	25 %	0 %	25 %	50 %	556559793
2245	NC_022654	TGCGG	2	10	87808	87817	0 %	20 %	60 %	20 %	556559793
2246	NC_022654	TCG	2	6	87821	87826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559793
2247	NC_022654	ATC	2	6	87836	87841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556559793
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2249	NC_022654	CCG	2	6	87848	87853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559793
2250	NC_022654	GC	3	6	87914	87919	0 %	0 %	50 %	50 %	556559793
2251	NC_022654	GCTC	2	8	87958	87965	0 %	25 %	25 %	50 %	556559793
2252	NC_022654	CGA	2	6	88007	88012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559793
2253	NC_022654	CG	3	6	88036	88041	0 %	0 %	50 %	50 %	556559793
2254	NC_022654	GC	3	6	88045	88050	0 %	0 %	50 %	50 %	556559793
2255	NC_022654	CCA	2	6	88069	88074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556559793
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2313	NC_022654	CT	3	6	90251	90256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2354	NC_022654	AGG	2	6	92205	92210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2362	NC_022654	GCG	2	6	92616	92621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556559858
2363	NC_022654	TCA	2	6	92639	92644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556559858
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2371	NC_022654	GC	3	6	92974	92979	0 %	0 %	50 %	50 %	556559800
2372	NC_022654	ATG	2	6	93102	93107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2373	NC_022654	ACC	2	6	93157	93162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2374	NC_022654	GCC	2	6	93210	93215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2375	NC_022654	AAC	2	6	93216	93221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2376	NC_022654	CAC	2	6	93228	93233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2377	NC_022654	GC	4	8	93241	93248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2378	NC_022654	CACC	2	8	93316	93323	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2379	NC_022654	CA	3	6	93378	93383	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2380	NC_022654	CA	3	6	93439	93444	50 %	0 %	0 %	50 %	556559801
2381	NC_022654	GCCG	2	8	93472	93479	0 %	0 %	50 %	50 %	556559801
2382	NC_022654	GCA	2	6	93499	93504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559801
2383	NC_022654	GCA	2	6	93514	93519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559801
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2500	NC_022654	G	6	6	98262	98267	0 %	0 %	100 %	0 %	556559805

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