MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem

Total Repeats: 109893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_022350	GCC	2	6	646117	646122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739327
16003	NC_022350	TCG	2	6	646143	646148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739327
16004	NC_022350	GTA	2	6	646199	646204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197739327
16005	NC_022350	CCG	2	6	646226	646231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739327
16006	NC_022350	GTA	2	6	646274	646279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197739327
16007	NC_022350	CGA	2	6	646292	646297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739327
16008	NC_022350	CAG	2	6	646328	646333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739327
16009	NC_022350	CTC	2	6	646379	646384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197739327
16010	NC_022350	ATC	2	6	646428	646433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197739327
16011	NC_022350	CGC	2	6	646435	646440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739327
16012	NC_022350	CGC	2	6	646466	646471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739327
16013	NC_022350	GGCC	2	8	646514	646521	0 %	0 %	50 %	50 %	197739327
16014	NC_022350	TGG	2	6	646552	646557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197739327
16015	NC_022350	GGT	2	6	646598	646603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197739327
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16017	NC_022350	CGG	2	6	646648	646653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739327
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16021	NC_022350	TGC	2	6	646749	646754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739327
16022	NC_022350	CAG	2	6	646772	646777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739327
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16024	NC_022350	CGA	2	6	646792	646797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739327
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16032	NC_022350	TCG	2	6	647247	647252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739327
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16047	NC_022350	GC	3	6	648066	648071	0 %	0 %	50 %	50 %	544161432
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16120	NC_022350	GTG	2	6	650819	650824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197739331
16121	NC_022350	CCGG	2	8	650883	650890	0 %	0 %	50 %	50 %	197739331
16122	NC_022350	CCG	2	6	650922	650927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739331
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16151	NC_022350	GACC	2	8	652314	652321	25 %	0 %	25 %	50 %	197739331
16152	NC_022350	GTC	2	6	652372	652377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739331
16153	NC_022350	CGC	2	6	652393	652398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739331
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16155	NC_022350	CTG	2	6	652432	652437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739332
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16158	NC_022350	TGG	2	6	652559	652564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197739332
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16162	NC_022350	ACA	2	6	652751	652756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197739332
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16166	NC_022350	GGT	2	6	652830	652835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197739332
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16171	NC_022350	TCG	2	6	653013	653018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739333
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16183	NC_022350	CGG	2	6	653899	653904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739333
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16188	NC_022350	GCT	2	6	654073	654078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739333
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16190	NC_022350	TGACC	2	10	654215	654224	20 %	20 %	20 %	40 %	197739334
16191	NC_022350	GGC	2	6	654259	654264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739334
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16193	NC_022350	CCG	2	6	654328	654333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739334
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16196	NC_022350	TCGG	2	8	654387	654394	0 %	25 %	50 %	25 %	197739334
16197	NC_022350	GCG	2	6	654402	654407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739334
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16199	NC_022350	GAC	2	6	654465	654470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739334
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16201	NC_022350	CGGG	2	8	654559	654566	0 %	0 %	75 %	25 %	197739334
16202	NC_022350	CTA	2	6	654570	654575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197739334
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16205	NC_022350	GCGG	2	8	654659	654666	0 %	0 %	75 %	25 %	197739334
16206	NC_022350	GGT	2	6	654760	654765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197739334
16207	NC_022350	CGG	2	6	654791	654796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739334
16208	NC_022350	CAAA	2	8	654830	654837	75 %	0 %	0 %	25 %	197739334
16209	NC_022350	AGT	2	6	654906	654911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197739335
16210	NC_022350	GATC	2	8	654912	654919	25 %	25 %	25 %	25 %	197739335
16211	NC_022350	GCG	2	6	654920	654925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739335
16212	NC_022350	CG	3	6	654960	654965	0 %	0 %	50 %	50 %	197739335
16213	NC_022350	GTTGC	2	10	654970	654979	0 %	40 %	40 %	20 %	197739335
16214	NC_022350	CAAGC	2	10	655047	655056	40 %	0 %	20 %	40 %	197739335
16215	NC_022350	GTT	2	6	655099	655104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197739335
16216	NC_022350	CGT	2	6	655113	655118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739335
16217	NC_022350	GTC	2	6	655120	655125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739335
16218	NC_022350	CGA	2	6	655170	655175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739335
16219	NC_022350	CAGC	2	8	655179	655186	25 %	0 %	25 %	50 %	197739335
16220	NC_022350	CGT	2	6	655216	655221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16221	NC_022350	AGC	2	6	655253	655258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739336
16222	NC_022350	GCCG	2	8	655327	655334	0 %	0 %	50 %	50 %	197739336
16223	NC_022350	CG	3	6	655352	655357	0 %	0 %	50 %	50 %	197739336
16224	NC_022350	GAT	2	6	655372	655377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197739336
16225	NC_022350	CCG	2	6	655392	655397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739336
16226	NC_022350	CG	3	6	655396	655401	0 %	0 %	50 %	50 %	197739336
16227	NC_022350	CGC	2	6	655444	655449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739336
16228	NC_022350	AGG	2	6	655473	655478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197739336
16229	NC_022350	GCC	2	6	655487	655492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739336
16230	NC_022350	GCAC	2	8	655493	655500	25 %	0 %	25 %	50 %	197739336
16231	NC_022350	CGA	2	6	655560	655565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739336
16232	NC_022350	GCT	2	6	655646	655651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739336
16233	NC_022350	CGG	3	9	655671	655679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739336
16234	NC_022350	GTG	2	6	655700	655705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197739336
16235	NC_022350	CGC	2	6	655767	655772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739336
16236	NC_022350	GGC	2	6	655795	655800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739336
16237	NC_022350	CTCC	2	8	655842	655849	0 %	25 %	0 %	75 %	197739336
16238	NC_022350	AT	4	8	655918	655925	50 %	50 %	0 %	0 %	197739336
16239	NC_022350	AT	3	6	655937	655942	50 %	50 %	0 %	0 %	197739336
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16478	NC_022350	CGC	2	6	665558	665563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161435
16479	NC_022350	GACC	2	8	665586	665593	25 %	0 %	25 %	50 %	544161435
16480	NC_022350	GGA	2	6	665640	665645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	544161435
16481	NC_022350	CGA	2	6	665658	665663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161435
16482	NC_022350	GCA	2	6	665670	665675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161435
16483	NC_022350	TCC	2	6	665702	665707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	544161435
16484	NC_022350	CGA	2	6	665739	665744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161436
16485	NC_022350	GGTG	2	8	665749	665756	0 %	25 %	75 %	0 %	544161436
16486	NC_022350	CG	3	6	665812	665817	0 %	0 %	50 %	50 %	544161436
16487	NC_022350	AGC	2	6	665824	665829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161436
16488	NC_022350	GC	3	6	665843	665848	0 %	0 %	50 %	50 %	544161436
16489	NC_022350	CGA	2	6	665860	665865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161436
16490	NC_022350	CAT	2	6	666001	666006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544161436
16491	NC_022350	GCG	2	6	666016	666021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161436
16492	NC_022350	GGC	2	6	666082	666087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161436
16493	NC_022350	CTG	2	6	666113	666118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161436
16494	NC_022350	ACG	2	6	666120	666125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161436
16495	NC_022350	GCCG	3	12	666132	666143	0 %	0 %	50 %	50 %	544161436
16496	NC_022350	GC	3	6	666173	666178	0 %	0 %	50 %	50 %	544161436
16497	NC_022350	CGG	2	6	666186	666191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161436
16498	NC_022350	TCG	2	6	666215	666220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161436
16499	NC_022350	TGA	2	6	666288	666293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544161436
16500	NC_022350	GCC	2	6	666383	666388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161436

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