MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem

Total Repeats: 109893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_022350	CG	3	6	611621	611626	0 %	0 %	50 %	50 %	197739294
15003	NC_022350	GGCG	2	8	611644	611651	0 %	0 %	75 %	25 %	197739294
15004	NC_022350	GGCTG	2	10	611661	611670	0 %	20 %	60 %	20 %	197739294
15005	NC_022350	GC	3	6	611680	611685	0 %	0 %	50 %	50 %	197739294
15006	NC_022350	GGT	2	6	611722	611727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197739294
15007	NC_022350	GGC	2	6	611746	611751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739294
15008	NC_022350	CCG	2	6	611811	611816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739294
15009	NC_022350	TGG	2	6	611820	611825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197739294
15010	NC_022350	GCC	2	6	611878	611883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739294
15011	NC_022350	TTCG	2	8	611921	611928	0 %	50 %	25 %	25 %	197739294
15012	NC_022350	TGA	2	6	611962	611967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197739294
15013	NC_022350	CCA	2	6	611973	611978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197739294
15014	NC_022350	TGG	2	6	612013	612018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197739294
15015	NC_022350	CCCA	2	8	612020	612027	25 %	0 %	0 %	75 %	197739294
15016	NC_022350	GCT	2	6	612169	612174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739294
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15021	NC_022350	CGC	2	6	612334	612339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739294
15022	NC_022350	GC	3	6	612346	612351	0 %	0 %	50 %	50 %	197739294
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15030	NC_022350	ACT	2	6	612578	612583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197739295
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15038	NC_022350	GCC	2	6	612998	613003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15039	NC_022350	AAG	2	6	613018	613023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15040	NC_022350	TGA	2	6	613110	613115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15121	NC_022350	CGCCGG	2	12	616340	616351	0 %	0 %	50 %	50 %	197739298
15122	NC_022350	CGG	2	6	616372	616377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739298
15123	NC_022350	ATG	2	6	616399	616404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197739298
15124	NC_022350	GCA	2	6	616503	616508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15125	NC_022350	GAA	2	6	616519	616524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15126	NC_022350	ATG	2	6	616590	616595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15127	NC_022350	GTC	2	6	616612	616617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15128	NC_022350	AAG	2	6	616686	616691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197739299
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15130	NC_022350	CGT	2	6	616775	616780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739299
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15143	NC_022350	CGG	2	6	617420	617425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739301
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15150	NC_022350	TCG	2	6	617659	617664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739301
15151	NC_022350	CGG	2	6	617684	617689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739301
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15153	NC_022350	CGA	2	6	617761	617766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739301
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15229	NC_022350	GGCA	2	8	620348	620355	25 %	0 %	50 %	25 %	197739303
15230	NC_022350	GT	3	6	620365	620370	0 %	50 %	50 %	0 %	197739303
15231	NC_022350	CG	3	6	620405	620410	0 %	0 %	50 %	50 %	197739303
15232	NC_022350	GCCA	2	8	620412	620419	25 %	0 %	25 %	50 %	197739303
15233	NC_022350	CATGC	2	10	620445	620454	20 %	20 %	20 %	40 %	197739303
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15237	NC_022350	CGC	2	6	620555	620560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739303
15238	NC_022350	GCG	2	6	620568	620573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739303
15239	NC_022350	GTG	2	6	620618	620623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197739304
15240	NC_022350	GGC	2	6	620664	620669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739304
15241	NC_022350	CGGCG	2	10	620695	620704	0 %	0 %	60 %	40 %	197739304
15242	NC_022350	GCC	3	9	620708	620716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739304
15243	NC_022350	TCG	2	6	620745	620750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739304
15244	NC_022350	ATCGC	2	10	620756	620765	20 %	20 %	20 %	40 %	197739304
15245	NC_022350	CCG	2	6	620787	620792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739304
15246	NC_022350	CGC	2	6	620800	620805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739304
15247	NC_022350	CTT	2	6	620857	620862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197739304
15248	NC_022350	GCC	2	6	620868	620873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739304
15249	NC_022350	GTG	2	6	620914	620919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197739304
15250	NC_022350	CGT	2	6	620943	620948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739304
15251	NC_022350	GAC	2	6	620983	620988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739304
15252	NC_022350	GGT	2	6	621028	621033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197739304
15253	NC_022350	CGT	2	6	621138	621143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739304
15254	NC_022350	ACG	2	6	621150	621155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739304
15255	NC_022350	GTG	2	6	621173	621178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197739304
15256	NC_022350	CGG	2	6	621189	621194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739304
15257	NC_022350	CGA	2	6	621212	621217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739305
15258	NC_022350	GCAGA	2	10	621219	621228	40 %	0 %	40 %	20 %	197739305
15259	NC_022350	GCG	2	6	621242	621247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739305
15260	NC_022350	CGC	2	6	621273	621278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739305
15261	NC_022350	TGC	2	6	621293	621298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739305
15262	NC_022350	GGC	2	6	621334	621339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739305
15263	NC_022350	CGG	2	6	621360	621365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739305
15264	NC_022350	TCT	2	6	621377	621382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197739305
15265	NC_022350	GCC	2	6	621404	621409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739305
15266	NC_022350	GC	3	6	621445	621450	0 %	0 %	50 %	50 %	197739305
15267	NC_022350	GT	3	6	621452	621457	0 %	50 %	50 %	0 %	197739305
15268	NC_022350	GAC	2	6	621463	621468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739305
15269	NC_022350	GTC	4	12	621481	621492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739305
15270	NC_022350	GT	3	6	621575	621580	0 %	50 %	50 %	0 %	197739305
15271	NC_022350	ACA	2	6	621605	621610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197739305
15272	NC_022350	TCA	2	6	621632	621637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197739305
15273	NC_022350	CCA	2	6	621713	621718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197739305
15274	NC_022350	CGG	2	6	621764	621769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739305
15275	NC_022350	GCTG	2	8	621786	621793	0 %	25 %	50 %	25 %	197739305
15276	NC_022350	GGT	2	6	621807	621812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197739305
15277	NC_022350	GAG	3	9	621826	621834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197739305
15278	NC_022350	GTCGG	2	10	621837	621846	0 %	20 %	60 %	20 %	197739305
15279	NC_022350	CTG	2	6	621900	621905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739306
15280	NC_022350	CTG	2	6	621924	621929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739306
15281	NC_022350	CTGGT	2	10	621931	621940	0 %	40 %	40 %	20 %	197739306
15282	NC_022350	TG	3	6	621957	621962	0 %	50 %	50 %	0 %	197739306
15283	NC_022350	GGC	2	6	621995	622000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739306
15284	NC_022350	CGT	2	6	622001	622006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739306
15285	NC_022350	AGC	2	6	622018	622023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739306
15286	NC_022350	GCCG	2	8	622025	622032	0 %	0 %	50 %	50 %	197739306
15287	NC_022350	CGT	2	6	622034	622039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739306
15288	NC_022350	CGG	2	6	622078	622083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739306
15289	NC_022350	ACG	2	6	622104	622109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739306
15290	NC_022350	ACC	2	6	622146	622151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197739306
15291	NC_022350	GCT	3	9	622169	622177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739306
15292	NC_022350	TCG	2	6	622201	622206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739306
15293	NC_022350	CGC	2	6	622264	622269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739306
15294	NC_022350	CTGGGG	2	12	622431	622442	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	197739306
15295	NC_022350	GTTCG	2	10	622463	622472	0 %	40 %	40 %	20 %	197739306
15296	NC_022350	GCTG	2	8	622495	622502	0 %	25 %	50 %	25 %	197739306
15297	NC_022350	CGG	2	6	622532	622537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739306
15298	NC_022350	GCT	2	6	622541	622546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739306
15299	NC_022350	CGGT	2	8	622552	622559	0 %	25 %	50 %	25 %	197739306
15300	NC_022350	ACG	2	6	622585	622590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739306
15301	NC_022350	TCGTG	2	10	622591	622600	0 %	40 %	40 %	20 %	197739306
15302	NC_022350	GC	3	6	622667	622672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15303	NC_022350	TGC	2	6	622713	622718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161426
15304	NC_022350	GCTG	2	8	622732	622739	0 %	25 %	50 %	25 %	544161426
15305	NC_022350	CTG	2	6	622754	622759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161426
15306	NC_022350	CGC	2	6	622777	622782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161426
15307	NC_022350	GAC	2	6	622790	622795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161426
15308	NC_022350	TGC	2	6	622887	622892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161426
15309	NC_022350	TCG	2	6	622905	622910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161426
15310	NC_022350	CGC	2	6	622966	622971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161426
15311	NC_022350	CACGCC	2	12	623000	623011	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	544161426
15312	NC_022350	CGC	2	6	623029	623034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161426
15313	NC_022350	GCC	2	6	623039	623044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161426
15314	NC_022350	GCA	2	6	623073	623078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161426
15315	NC_022350	CAA	2	6	623087	623092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	544161426
15316	NC_022350	CCG	2	6	623112	623117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161426
15317	NC_022350	GCT	2	6	623164	623169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161426
15318	NC_022350	CTG	2	6	623174	623179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161426
15319	NC_022350	CGTGAT	2	12	623221	623232	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	544161426
15320	NC_022350	CGG	2	6	623239	623244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161426
15321	NC_022350	GCCG	2	8	623266	623273	0 %	0 %	50 %	50 %	544161426
15322	NC_022350	CGT	2	6	623313	623318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161426
15323	NC_022350	TG	3	6	623330	623335	0 %	50 %	50 %	0 %	544161426
15324	NC_022350	CAA	2	6	623341	623346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	544161426
15325	NC_022350	CGC	2	6	623389	623394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161426
15326	NC_022350	CTG	2	6	623424	623429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161426
15327	NC_022350	GGC	2	6	623448	623453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161426
15328	NC_022350	CGG	2	6	623488	623493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161426
15329	NC_022350	CTG	2	6	623606	623611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161426
15330	NC_022350	CGG	2	6	623613	623618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161426
15331	NC_022350	CGT	2	6	623620	623625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161426
15332	NC_022350	GCCG	2	8	623638	623645	0 %	0 %	50 %	50 %	544161426
15333	NC_022350	CGA	2	6	623662	623667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161426
15334	NC_022350	CTG	2	6	623699	623704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161426
15335	NC_022350	AGC	2	6	623715	623720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161426
15336	NC_022350	CTG	2	6	623732	623737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161426
15337	NC_022350	TCG	2	6	623738	623743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161426
15338	NC_022350	CGG	2	6	623766	623771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161426
15339	NC_022350	GCGG	2	8	623811	623818	0 %	0 %	75 %	25 %	544161426
15340	NC_022350	GTT	2	6	623827	623832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	544161426
15341	NC_022350	ACC	2	6	623841	623846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	544161426
15342	NC_022350	GC	3	6	623893	623898	0 %	0 %	50 %	50 %	544161426
15343	NC_022350	CGG	2	6	623928	623933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161426
15344	NC_022350	GGT	2	6	623941	623946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161426
15345	NC_022350	GAT	2	6	624031	624036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544161426
15346	NC_022350	CTG	2	6	624044	624049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161426
15347	NC_022350	GCT	2	6	624055	624060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161426
15348	NC_022350	CGA	2	6	624096	624101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161426
15349	NC_022350	GGC	2	6	624128	624133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161426
15350	NC_022350	GTG	2	6	624325	624330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197739308
15351	NC_022350	TGG	2	6	624335	624340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197739308
15352	NC_022350	GCT	4	12	624345	624356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739308
15353	NC_022350	TCGCGG	2	12	624378	624389	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	197739308
15354	NC_022350	CGC	2	6	624395	624400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739308
15355	NC_022350	GCCG	2	8	624408	624415	0 %	0 %	50 %	50 %	197739308
15356	NC_022350	CGA	2	6	624477	624482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739308
15357	NC_022350	CGGG	2	8	624489	624496	0 %	0 %	75 %	25 %	197739308
15358	NC_022350	CTG	2	6	624532	624537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739308
15359	NC_022350	GCGT	2	8	624538	624545	0 %	25 %	50 %	25 %	197739308
15360	NC_022350	TGC	2	6	624548	624553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739308
15361	NC_022350	TCA	2	6	624599	624604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197739308
15362	NC_022350	ACCTG	2	10	624605	624614	20 %	20 %	20 %	40 %	197739308
15363	NC_022350	TGC	2	6	624644	624649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739308
15364	NC_022350	CTG	2	6	624682	624687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739308
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15369	NC_022350	TCG	2	6	625067	625072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739308
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15372	NC_022350	CGG	2	6	625112	625117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739308
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15478	NC_022350	CGG	2	6	628231	628236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161429
15479	NC_022350	CGG	2	6	628294	628299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161429
15480	NC_022350	GCGG	2	8	628301	628308	0 %	0 %	75 %	25 %	544161429
15481	NC_022350	GGC	2	6	628325	628330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161429
15482	NC_022350	CGG	2	6	628333	628338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161429
15483	NC_022350	CGG	2	6	628342	628347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161429
15484	NC_022350	CGG	2	6	628351	628356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161429
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