MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem

Total Repeats: 109893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_022350	ACC	2	6	530447	530452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197739218
13002	NC_022350	CGG	2	6	530486	530491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739218
13003	NC_022350	GCC	2	6	530501	530506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739218
13004	NC_022350	CGG	2	6	530528	530533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739218
13005	NC_022350	CGGGG	2	10	530567	530576	0 %	0 %	80 %	20 %	197739218
13006	NC_022350	ACG	2	6	530695	530700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739219
13007	NC_022350	TCC	2	6	530701	530706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197739219
13008	NC_022350	CCAA	2	8	530735	530742	50 %	0 %	0 %	50 %	197739219
13009	NC_022350	TGA	2	6	530774	530779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197739219
13010	NC_022350	TGCC	2	8	530783	530790	0 %	25 %	25 %	50 %	197739219
13011	NC_022350	CG	3	6	530828	530833	0 %	0 %	50 %	50 %	197739219
13012	NC_022350	GC	3	6	530942	530947	0 %	0 %	50 %	50 %	197739219
13013	NC_022350	CCCG	2	8	530990	530997	0 %	0 %	25 %	75 %	197739219
13014	NC_022350	ACC	2	6	531091	531096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197739219
13015	NC_022350	CCG	2	6	531118	531123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739219
13016	NC_022350	TGA	2	6	531128	531133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197739219
13017	NC_022350	CGT	2	6	531185	531190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739219
13018	NC_022350	CGG	2	6	531194	531199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739219
13019	NC_022350	GCG	2	6	531217	531222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739219
13020	NC_022350	GCG	2	6	531376	531381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739219
13021	NC_022350	CCG	2	6	531395	531400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739219
13022	NC_022350	GCA	2	6	531422	531427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739219
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13024	NC_022350	CGC	2	6	531512	531517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739219
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13026	NC_022350	CGG	2	6	531626	531631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739219
13027	NC_022350	GC	3	6	531694	531699	0 %	0 %	50 %	50 %	197739219
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13030	NC_022350	GC	3	6	531817	531822	0 %	0 %	50 %	50 %	197739219
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13033	NC_022350	GGC	2	6	531932	531937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739220
13034	NC_022350	GC	3	6	531962	531967	0 %	0 %	50 %	50 %	197739220
13035	NC_022350	ACC	2	6	531976	531981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197739220
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13038	NC_022350	GCCC	2	8	532028	532035	0 %	0 %	25 %	75 %	197739220
13039	NC_022350	GGC	2	6	532053	532058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739220
13040	NC_022350	GCC	2	6	532170	532175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739220
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13044	NC_022350	GGC	2	6	532275	532280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739220
13045	NC_022350	GTC	2	6	532311	532316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739220
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13050	NC_022350	CGG	2	6	532547	532552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739220
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13052	NC_022350	TGC	2	6	532588	532593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739220
13053	NC_022350	GGGC	2	8	532612	532619	0 %	0 %	75 %	25 %	197739220
13054	NC_022350	ATG	2	6	532624	532629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197739220
13055	NC_022350	GCG	2	6	532639	532644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739220
13056	NC_022350	CGG	3	9	532703	532711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739220
13057	NC_022350	ACG	2	6	532750	532755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739220
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13060	NC_022350	AGGCC	2	10	532969	532978	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13061	NC_022350	CGT	2	6	532979	532984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_022350	CCGT	2	8	533015	533022	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13063	NC_022350	GGA	2	6	533097	533102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_022350	ACG	2	6	533133	533138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739221
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13068	NC_022350	GGA	2	6	533296	533301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197739221
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13103	NC_022350	CTC	2	6	534786	534791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13122	NC_022350	GCC	2	6	535693	535698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739223
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13131	NC_022350	CTG	2	6	536202	536207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739223
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13239	NC_022350	AGTG	2	8	540872	540879	25 %	25 %	50 %	0 %	197739228
13240	NC_022350	AGC	2	6	540892	540897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739228
13241	NC_022350	GCC	2	6	540910	540915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739228
13242	NC_022350	CG	3	6	540935	540940	0 %	0 %	50 %	50 %	197739228
13243	NC_022350	TGC	2	6	540978	540983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739228
13244	NC_022350	CTGG	2	8	540993	541000	0 %	25 %	50 %	25 %	197739228
13245	NC_022350	CAC	2	6	541019	541024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	544161405
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13247	NC_022350	CCA	3	9	541075	541083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	544161405
13248	NC_022350	CAT	2	6	541109	541114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544161405
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13250	NC_022350	CGG	2	6	541185	541190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161405
13251	NC_022350	GTG	2	6	541234	541239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161405
13252	NC_022350	GTA	2	6	541250	541255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544161405
13253	NC_022350	TGA	2	6	541266	541271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544161405
13254	NC_022350	CAC	2	6	541301	541306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	544161405
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13256	NC_022350	CCG	2	6	541344	541349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161405
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13259	NC_022350	AAG	2	6	541503	541508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	544161405
13260	NC_022350	GCG	2	6	541537	541542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161405
13261	NC_022350	GTC	2	6	541568	541573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161405
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13263	NC_022350	GTG	2	6	541667	541672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161405
13264	NC_022350	GTG	2	6	541701	541706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161405
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13270	NC_022350	GCC	2	6	541981	541986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739230
13271	NC_022350	CGG	2	6	542003	542008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739230
13272	NC_022350	CTG	2	6	542030	542035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739230
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13274	NC_022350	TGG	2	6	542105	542110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197739230
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13292	NC_022350	GTC	2	6	542749	542754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739230
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13294	NC_022350	CGACAT	2	12	542764	542775	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	197739230
13295	NC_022350	CGA	2	6	542871	542876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739230
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13297	NC_022350	GCCG	2	8	542937	542944	0 %	0 %	50 %	50 %	197739230
13298	NC_022350	GGC	2	6	542989	542994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739230
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13300	NC_022350	TCG	2	6	543034	543039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739230
13301	NC_022350	TGC	2	6	543047	543052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739230
13302	NC_022350	CGGC	2	8	543070	543077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13303	NC_022350	GACG	2	8	543080	543087	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13304	NC_022350	GCT	2	6	543109	543114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739231
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13306	NC_022350	CGGG	2	8	543167	543174	0 %	0 %	75 %	25 %	197739231
13307	NC_022350	CCA	2	6	543196	543201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197739231
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13309	NC_022350	GCG	2	6	543221	543226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739231
13310	NC_022350	ATGG	2	8	543227	543234	25 %	25 %	50 %	0 %	197739231
13311	NC_022350	TGG	2	6	543285	543290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197739231
13312	NC_022350	GCC	2	6	543385	543390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739231
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13332	NC_022350	TCG	2	6	544416	544421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739231
13333	NC_022350	TCG	2	6	544430	544435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739231
13334	NC_022350	TCG	2	6	544539	544544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739231
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13337	NC_022350	TTGG	2	8	544726	544733	0 %	50 %	50 %	0 %	197739231
13338	NC_022350	GGTA	2	8	544748	544755	25 %	25 %	50 %	0 %	197739231
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13342	NC_022350	ACCC	2	8	544864	544871	25 %	0 %	0 %	75 %	197739231
13343	NC_022350	GCC	2	6	544872	544877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739231
13344	NC_022350	GAG	2	6	544891	544896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197739231
13345	NC_022350	GTA	2	6	545110	545115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197739231
13346	NC_022350	GGC	2	6	545116	545121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739231
13347	NC_022350	GAT	2	6	545164	545169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197739231
13348	NC_022350	GGT	2	6	545230	545235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197739231
13349	NC_022350	CG	3	6	545277	545282	0 %	0 %	50 %	50 %	197739231
13350	NC_022350	CAG	2	6	545311	545316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739231
13351	NC_022350	CAA	2	6	545350	545355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197739231
13352	NC_022350	ATA	2	6	545357	545362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197739231
13353	NC_022350	CGG	2	6	545470	545475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739231
13354	NC_022350	CGA	2	6	545490	545495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739231
13355	NC_022350	TGC	2	6	545496	545501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739231
13356	NC_022350	GCG	2	6	545529	545534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739231
13357	NC_022350	GGC	2	6	545569	545574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739231
13358	NC_022350	CGT	2	6	545580	545585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739231
13359	NC_022350	CGG	2	6	545601	545606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197739231
13360	NC_022350	C	6	6	545616	545621	0 %	0 %	0 %	100 %	197739231
13361	NC_022350	CTT	2	6	545647	545652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197739231
13362	NC_022350	CGT	2	6	545679	545684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739231
13363	NC_022350	GGTT	2	8	545711	545718	0 %	50 %	50 %	0 %	197739231
13364	NC_022350	TAT	2	6	545725	545730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197739231
13365	NC_022350	CCTT	2	8	545756	545763	0 %	50 %	0 %	50 %	197739231
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13372	NC_022350	CCG	2	6	546128	546133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739232
13373	NC_022350	CGT	2	6	546134	546139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739232
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13380	NC_022350	AGCCT	2	10	546517	546526	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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13385	NC_022350	CGCTGG	2	12	546748	546759	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	544161406
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13401	NC_022350	CTT	2	6	547427	547432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13402	NC_022350	ATAGTC	2	12	547478	547489	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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13404	NC_022350	GC	4	8	547594	547601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13405	NC_022350	TG	3	6	547630	547635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13406	NC_022350	ATGG	2	8	547697	547704	25 %	25 %	50 %	0 %	197739234
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13457	NC_022350	CGA	2	6	549155	549160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739234
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13469	NC_022350	ACA	2	6	549819	549824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13470	NC_022350	CGA	2	6	549946	549951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197739236
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13477	NC_022350	TCG	2	6	550084	550089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197739236
13478	NC_022350	GTT	2	6	550109	550114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197739236
13479	NC_022350	GTA	2	6	550136	550141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197739236
13480	NC_022350	CCG	2	6	550162	550167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197739236
13481	NC_022350	GGT	2	6	550190	550195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197739236
13482	NC_022350	ATC	2	6	550200	550205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197739236
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13485	NC_022350	GTCT	2	8	550385	550392	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13486	NC_022350	TGA	2	6	550415	550420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197739237
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