MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem

Total Repeats: 109893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5122	NC_022350	GCCG	2	8	213033	213040	0 %	0 %	50 %	50 %	197738160
5123	NC_022350	CGG	2	6	213083	213088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738160
5124	NC_022350	GCA	2	6	213113	213118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738160
5125	NC_022350	GTC	2	6	213183	213188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738160
5126	NC_022350	GTT	2	6	213189	213194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197738160
5127	NC_022350	GTG	2	6	213210	213215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197738160
5128	NC_022350	CGT	2	6	213276	213281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738160
5129	NC_022350	GGT	2	6	213382	213387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197738162
5130	NC_022350	CCA	2	6	213399	213404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197738162
5131	NC_022350	CGG	2	6	213420	213425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738162
5132	NC_022350	CGG	2	6	213489	213494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738162
5133	NC_022350	CGG	2	6	213607	213612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738162
5134	NC_022350	CGG	2	6	213630	213635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738162
5135	NC_022350	CGG	2	6	213738	213743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738162
5136	NC_022350	GCA	2	6	213783	213788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738162
5137	NC_022350	GCA	2	6	213849	213854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738162
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5140	NC_022350	GCC	2	6	213905	213910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738162
5141	NC_022350	CGA	2	6	213942	213947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738162
5142	NC_022350	CAG	2	6	213960	213965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738162
5143	NC_022350	GTC	2	6	213967	213972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738162
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5145	NC_022350	CCA	2	6	214017	214022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197738162
5146	NC_022350	CGGA	2	8	214029	214036	25 %	0 %	50 %	25 %	197738162
5147	NC_022350	GCC	2	6	214047	214052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738162
5148	NC_022350	CGGC	2	8	214069	214076	0 %	0 %	50 %	50 %	197738162
5149	NC_022350	CAGG	2	8	214099	214106	25 %	0 %	50 %	25 %	197738162
5150	NC_022350	TGG	2	6	214110	214115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197738162
5151	NC_022350	GCA	2	6	214182	214187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738162
5152	NC_022350	CGT	2	6	214212	214217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738162
5153	NC_022350	TCG	2	6	214301	214306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738162
5154	NC_022350	AGC	2	6	214384	214389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738162
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5161	NC_022350	ACC	2	6	214596	214601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197738161
5162	NC_022350	GA	3	6	214639	214644	50 %	0 %	50 %	0 %	197738161
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5169	NC_022350	GGT	2	6	214933	214938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197738161
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5172	NC_022350	CCGG	2	8	214982	214989	0 %	0 %	50 %	50 %	197738161
5173	NC_022350	CG	3	6	214997	215002	0 %	0 %	50 %	50 %	197738161
5174	NC_022350	CTG	2	6	215003	215008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738161
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5176	NC_022350	TGC	2	6	215064	215069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738161
5177	NC_022350	TG	3	6	215123	215128	0 %	50 %	50 %	0 %	197738161
5178	NC_022350	CGA	2	6	215209	215214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738161
5179	NC_022350	GCCGA	2	10	215246	215255	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5180	NC_022350	CTG	2	6	215323	215328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738163
5181	NC_022350	CGG	2	6	215399	215404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738163
5182	NC_022350	CATC	2	8	215405	215412	25 %	25 %	0 %	50 %	197738163
5183	NC_022350	CACCAT	2	12	215475	215486	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	197738163
5184	NC_022350	GCG	2	6	215491	215496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738163
5185	NC_022350	CGG	2	6	215543	215548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738163
5186	NC_022350	ACG	2	6	215552	215557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738163
5187	NC_022350	TGG	2	6	215648	215653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197738163
5188	NC_022350	CCTCG	2	10	215682	215691	0 %	20 %	20 %	60 %	197738163
5189	NC_022350	CGA	2	6	215711	215716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738163
5190	NC_022350	CCA	2	6	215804	215809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197738163
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5192	NC_022350	CGT	2	6	215881	215886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738163
5193	NC_022350	GC	3	6	215896	215901	0 %	0 %	50 %	50 %	197738163
5194	NC_022350	AGCC	2	8	215913	215920	25 %	0 %	25 %	50 %	197738163
5195	NC_022350	TCG	2	6	215938	215943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738163
5196	NC_022350	GC	3	6	215952	215957	0 %	0 %	50 %	50 %	197738163
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5198	NC_022350	TTC	2	6	216147	216152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197738164
5199	NC_022350	TCGGT	3	15	216182	216196	0 %	40 %	40 %	20 %	197738164
5200	NC_022350	GAC	2	6	216219	216224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738164
5201	NC_022350	CGG	2	6	216238	216243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738164
5202	NC_022350	GC	3	6	216285	216290	0 %	0 %	50 %	50 %	197738164
5203	NC_022350	GGC	2	6	216293	216298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738164
5204	NC_022350	GGC	2	6	216324	216329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738164
5205	NC_022350	CCG	2	6	216361	216366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738164
5206	NC_022350	CAT	2	6	216408	216413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197738164
5207	NC_022350	CGT	2	6	216512	216517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738164
5208	NC_022350	AGG	2	6	216526	216531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197738164
5209	NC_022350	CGA	3	9	216592	216600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738165
5210	NC_022350	TG	3	6	216684	216689	0 %	50 %	50 %	0 %	197738165
5211	NC_022350	TTG	2	6	216731	216736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197738165
5212	NC_022350	CCG	2	6	216804	216809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738165
5213	NC_022350	GC	3	6	216878	216883	0 %	0 %	50 %	50 %	197738165
5214	NC_022350	CAAT	2	8	216915	216922	50 %	25 %	0 %	25 %	197738165
5215	NC_022350	GC	3	6	216926	216931	0 %	0 %	50 %	50 %	197738165
5216	NC_022350	GTT	2	6	216976	216981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197738165
5217	NC_022350	ATC	2	6	217007	217012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197738165
5218	NC_022350	CAG	3	9	217019	217027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738165
5219	NC_022350	CGA	3	9	217038	217046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738165
5220	NC_022350	CTGG	2	8	217084	217091	0 %	25 %	50 %	25 %	197738165
5221	NC_022350	TTG	2	6	217130	217135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197738165
5222	NC_022350	GGC	2	6	217180	217185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738165
5223	NC_022350	ACA	2	6	217188	217193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197738165
5224	NC_022350	ACG	2	6	217236	217241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738165
5225	NC_022350	GC	3	6	217311	217316	0 %	0 %	50 %	50 %	197738165
5226	NC_022350	GGCC	2	8	217318	217325	0 %	0 %	50 %	50 %	197738165
5227	NC_022350	GTGCG	2	10	217336	217345	0 %	20 %	60 %	20 %	197738165
5228	NC_022350	ACCG	2	8	217382	217389	25 %	0 %	25 %	50 %	197738165
5229	NC_022350	GCC	2	6	217397	217402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738165
5230	NC_022350	CGG	2	6	217448	217453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738165
5231	NC_022350	GCGCCG	2	12	217499	217510	0 %	0 %	50 %	50 %	197738165
5232	NC_022350	TGC	3	9	217563	217571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738165
5233	NC_022350	GCT	2	6	217582	217587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738165
5234	NC_022350	CGCT	2	8	217590	217597	0 %	25 %	25 %	50 %	197738165
5235	NC_022350	CGG	2	6	217627	217632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738165
5236	NC_022350	G	6	6	217687	217692	0 %	0 %	100 %	0 %	197738165
5237	NC_022350	CTG	2	6	217754	217759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738165
5238	NC_022350	TGAG	2	8	217773	217780	25 %	25 %	50 %	0 %	197738165
5239	NC_022350	AGTTCG	2	12	217806	217817	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	197738165
5240	NC_022350	CGG	2	6	217833	217838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738165
5241	NC_022350	GCTG	2	8	217846	217853	0 %	25 %	50 %	25 %	197738165
5242	NC_022350	CGC	2	6	217954	217959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738165
5243	NC_022350	CAT	2	6	218044	218049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197738165
5244	NC_022350	TGG	2	6	218331	218336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197738165
5245	NC_022350	GGC	2	6	218342	218347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738165
5246	NC_022350	CGGTTG	2	12	218444	218455	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	197738165
5247	NC_022350	CGG	2	6	218495	218500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738165
5248	NC_022350	ACG	2	6	218538	218543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738165
5249	NC_022350	CGGTGG	2	12	218583	218594	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	197738165
5250	NC_022350	CGG	2	6	218601	218606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738165
5251	NC_022350	GGCC	2	8	218638	218645	0 %	0 %	50 %	50 %	197738165
5252	NC_022350	GGCC	2	8	218665	218672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5253	NC_022350	TCG	2	6	218727	218732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5254	NC_022350	ACAGCC	2	12	218798	218809	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5255	NC_022350	GGT	2	6	218898	218903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5256	NC_022350	AT	3	6	218935	218940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5257	NC_022350	CTG	2	6	218987	218992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5258	NC_022350	GC	3	6	218993	218998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5259	NC_022350	CGGT	2	8	219001	219008	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5260	NC_022350	CAACC	2	10	219038	219047	40 %	0 %	0 %	60 %	544161353
5261	NC_022350	CGA	2	6	219088	219093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161353
5262	NC_022350	GGC	2	6	219115	219120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161353
5263	NC_022350	CAG	2	6	219161	219166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161353
5264	NC_022350	CTG	2	6	219182	219187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161353
5265	NC_022350	GC	3	6	219203	219208	0 %	0 %	50 %	50 %	544161353
5266	NC_022350	TGGC	2	8	219251	219258	0 %	25 %	50 %	25 %	544161353
5267	NC_022350	GGT	2	6	219283	219288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161353
5268	NC_022350	AGCG	2	8	219339	219346	25 %	0 %	50 %	25 %	544161353
5269	NC_022350	GGT	2	6	219367	219372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161353
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5272	NC_022350	CGGCG	2	10	219491	219500	0 %	0 %	60 %	40 %	544161353
5273	NC_022350	GTG	2	6	219509	219514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161353
5274	NC_022350	GGC	2	6	219530	219535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161353
5275	NC_022350	CGA	2	6	219553	219558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161353
5276	NC_022350	GGC	2	6	219571	219576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161353
5277	NC_022350	ATG	2	6	219593	219598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544161353
5278	NC_022350	GATG	2	8	219748	219755	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5279	NC_022350	TGC	2	6	219779	219784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5280	NC_022350	TCA	2	6	219819	219824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197738167
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5282	NC_022350	CGC	2	6	219872	219877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738167
5283	NC_022350	CGA	2	6	219883	219888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738167
5284	NC_022350	CTG	2	6	219915	219920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738167
5285	NC_022350	TCG	2	6	219952	219957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738167
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5336	NC_022350	ATG	2	6	222125	222130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5348	NC_022350	CAC	2	6	222508	222513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5350	NC_022350	ACG	2	6	222637	222642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738170
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5353	NC_022350	GCCGC	2	10	222855	222864	0 %	0 %	40 %	60 %	197738170
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5363	NC_022350	CGGCG	2	10	223152	223161	0 %	0 %	60 %	40 %	197738170
5364	NC_022350	GCC	2	6	223177	223182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738170
5365	NC_022350	TGC	2	6	223205	223210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738170
5366	NC_022350	GC	3	6	223209	223214	0 %	0 %	50 %	50 %	197738170
5367	NC_022350	CAC	2	6	223249	223254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197738170
5368	NC_022350	GAT	2	6	223290	223295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197738170
5369	NC_022350	CCTACA	2	12	223319	223330	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	197738170
5370	NC_022350	GTG	2	6	223333	223338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197738170
5371	NC_022350	ATC	2	6	223339	223344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197738170
5372	NC_022350	CGT	2	6	223350	223355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738170
5373	NC_022350	CTGGC	2	10	223375	223384	0 %	20 %	40 %	40 %	197738170
5374	NC_022350	CGC	2	6	223389	223394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738170
5375	NC_022350	TGG	2	6	223427	223432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197738170
5376	NC_022350	TCG	2	6	223469	223474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738170
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5378	NC_022350	CTG	2	6	223552	223557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738170
5379	NC_022350	TGC	2	6	223610	223615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738170
5380	NC_022350	CGG	2	6	223619	223624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738170
5381	NC_022350	GCG	3	9	223634	223642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738170
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5384	NC_022350	GCT	2	6	223719	223724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738170
5385	NC_022350	GAT	2	6	223743	223748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197738170
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5388	NC_022350	CAG	2	6	223851	223856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5389	NC_022350	GAA	2	6	223897	223902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197738171
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5393	NC_022350	ACCCG	2	10	224127	224136	20 %	0 %	20 %	60 %	197738171
5394	NC_022350	GCC	2	6	224145	224150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738171
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5400	NC_022350	GCC	2	6	224286	224291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738171
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5403	NC_022350	CGGC	2	8	224507	224514	0 %	0 %	50 %	50 %	197738171
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5424	NC_022350	GC	3	6	225246	225251	0 %	0 %	50 %	50 %	197738172
5425	NC_022350	CGG	2	6	225293	225298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738172
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5428	NC_022350	GCT	2	6	225392	225397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738172
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5430	NC_022350	CTG	2	6	225440	225445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738172
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5432	NC_022350	GAA	2	6	225561	225566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197738172
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5436	NC_022350	TTC	2	6	225727	225732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197738172
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5483	NC_022350	GTC	2	6	227784	227789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738173
5484	NC_022350	GCG	2	6	227793	227798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738173
5485	NC_022350	GTC	2	6	227814	227819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738173
5486	NC_022350	AGG	2	6	227833	227838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197738173
5487	NC_022350	CG	3	6	227871	227876	0 %	0 %	50 %	50 %	197738173
5488	NC_022350	TGC	2	6	227882	227887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738173
5489	NC_022350	GCT	2	6	227927	227932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738173
5490	NC_022350	CGG	2	6	227975	227980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738173
5491	NC_022350	ATGG	2	8	227981	227988	25 %	25 %	50 %	0 %	197738173
5492	NC_022350	GCA	2	6	227998	228003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738173
5493	NC_022350	TTG	2	6	228019	228024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197738173
5494	NC_022350	GCCT	2	8	228033	228040	0 %	25 %	25 %	50 %	197738173
5495	NC_022350	CGGC	2	8	228054	228061	0 %	0 %	50 %	50 %	197738173
5496	NC_022350	CAG	2	6	228093	228098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738173
5497	NC_022350	GC	4	8	228099	228106	0 %	0 %	50 %	50 %	197738173
5498	NC_022350	GCCG	2	8	228139	228146	0 %	0 %	50 %	50 %	197738173
5499	NC_022350	CCGGG	2	10	228266	228275	0 %	0 %	60 %	40 %	197738173
5500	NC_022350	GGT	2	6	228287	228292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197738173

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