MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica D153

Total Repeats: 52171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021743	GCTAC	2	10	150659	150668	20 %	20 %	20 %	40 %	525701113
3002	NC_021743	AGAC	2	8	150730	150737	50 %	0 %	25 %	25 %	525701433
3003	NC_021743	T	6	6	150742	150747	0 %	100 %	0 %	0 %	525701433
3004	NC_021743	GAA	2	6	150780	150785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701433
3005	NC_021743	GTT	2	6	150894	150899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525701433
3006	NC_021743	TTA	2	6	151052	151057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701433
3007	NC_021743	CAA	2	6	151076	151081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525701433
3008	NC_021743	GC	3	6	151104	151109	0 %	0 %	50 %	50 %	525701433
3009	NC_021743	CCG	2	6	151197	151202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525701433
3010	NC_021743	A	7	7	151253	151259	100 %	0 %	0 %	0 %	525701433
3011	NC_021743	ACA	2	6	151365	151370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525701433
3012	NC_021743	A	6	6	151386	151391	100 %	0 %	0 %	0 %	525701433
3013	NC_021743	GGC	2	6	151397	151402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525701433
3014	NC_021743	TTC	2	6	151507	151512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525701433
3015	NC_021743	TGT	2	6	151599	151604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525701433
3016	NC_021743	CAG	2	6	151614	151619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701433
3017	NC_021743	GCC	2	6	151658	151663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525701433
3018	NC_021743	GTC	2	6	151758	151763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701433
3019	NC_021743	ACT	2	6	151795	151800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701433
3020	NC_021743	A	6	6	151837	151842	100 %	0 %	0 %	0 %	525701433
3021	NC_021743	ACTT	2	8	151869	151876	25 %	50 %	0 %	25 %	525701433
3022	NC_021743	CGAA	2	8	151971	151978	50 %	0 %	25 %	25 %	525701433
3023	NC_021743	CAA	2	6	152028	152033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525701433
3024	NC_021743	GAC	2	6	152036	152041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701433
3025	NC_021743	CAA	2	6	152181	152186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525701434
3026	NC_021743	GCAA	2	8	152213	152220	50 %	0 %	25 %	25 %	525701434
3027	NC_021743	CGA	2	6	152357	152362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701434
3028	NC_021743	AGC	2	6	152363	152368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701434
3029	NC_021743	ATC	2	6	152441	152446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701434
3030	NC_021743	CA	3	6	152488	152493	50 %	0 %	0 %	50 %	525701434
3031	NC_021743	CGA	2	6	152525	152530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701434
3032	NC_021743	GAAA	2	8	152588	152595	75 %	0 %	25 %	0 %	525701434
3033	NC_021743	TCA	2	6	152628	152633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701434
3034	NC_021743	GCGAA	2	10	152640	152649	40 %	0 %	40 %	20 %	525701434
3035	NC_021743	GGC	2	6	152669	152674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525701434
3036	NC_021743	TCG	2	6	152678	152683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701434
3037	NC_021743	AGA	2	6	152714	152719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701434
3038	NC_021743	CTA	2	6	152764	152769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701434
3039	NC_021743	TGTGGT	2	12	152876	152887	0 %	50 %	50 %	0 %	525701434
3040	NC_021743	TTG	2	6	152923	152928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525701434
3041	NC_021743	A	6	6	152966	152971	100 %	0 %	0 %	0 %	525701434
3042	NC_021743	A	6	6	152976	152981	100 %	0 %	0 %	0 %	525701434
3043	NC_021743	TTG	2	6	153077	153082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525701114
3044	NC_021743	ATG	2	6	153083	153088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701114
3045	NC_021743	TGA	2	6	153092	153097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701114
3046	NC_021743	ACG	2	6	153098	153103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701114
3047	NC_021743	ACA	2	6	153137	153142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525701114
3048	NC_021743	AACA	2	8	153223	153230	75 %	0 %	0 %	25 %	525701114
3049	NC_021743	GAA	2	6	153249	153254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701114
3050	NC_021743	CCG	2	6	153300	153305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525701114
3051	NC_021743	CTTG	2	8	153336	153343	0 %	50 %	25 %	25 %	525701114
3052	NC_021743	GCG	2	6	153514	153519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525701114
3053	NC_021743	TGA	2	6	153525	153530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701114
3054	NC_021743	GCG	2	6	153598	153603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525701114
3055	NC_021743	GAA	2	6	153673	153678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701114
3056	NC_021743	CG	3	6	153685	153690	0 %	0 %	50 %	50 %	525701114
3057	NC_021743	AAG	2	6	153865	153870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701114
3058	NC_021743	GAA	2	6	153880	153885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701114
3059	NC_021743	ACA	2	6	153995	154000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525701114
3060	NC_021743	TGA	2	6	154062	154067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701114
3061	NC_021743	AGCA	2	8	154139	154146	50 %	0 %	25 %	25 %	525701114
3062	NC_021743	TGCG	2	8	154151	154158	0 %	25 %	50 %	25 %	525701114
3063	NC_021743	CAA	2	6	154243	154248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525701114
3064	NC_021743	TCGG	2	8	154249	154256	0 %	25 %	50 %	25 %	525701114
3065	NC_021743	AAT	2	6	154264	154269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701114
3066	NC_021743	CAAT	2	8	154290	154297	50 %	25 %	0 %	25 %	525701114
3067	NC_021743	ACTC	2	8	154307	154314	25 %	25 %	0 %	50 %	525701114
3068	NC_021743	GTAAT	2	10	154338	154347	40 %	40 %	20 %	0 %	525701114
3069	NC_021743	AGT	2	6	154420	154425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701435
3070	NC_021743	GGC	3	9	154450	154458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525701435
3071	NC_021743	T	6	6	154477	154482	0 %	100 %	0 %	0 %	525701435
3072	NC_021743	CAA	2	6	154489	154494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525701435
3073	NC_021743	CGTTT	2	10	154551	154560	0 %	60 %	20 %	20 %	525701435
3074	NC_021743	GCGG	2	8	154637	154644	0 %	0 %	75 %	25 %	525701435
3075	NC_021743	CGA	2	6	154690	154695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701435
3076	NC_021743	GGC	2	6	154718	154723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525701435
3077	NC_021743	GTG	2	6	154742	154747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701435
3078	NC_021743	AAGAAC	2	12	154799	154810	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525701436
3079	NC_021743	A	6	6	154843	154848	100 %	0 %	0 %	0 %	525701436
3080	NC_021743	GCA	2	6	154861	154866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701436
3081	NC_021743	CGG	2	6	154871	154876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525701436
3082	NC_021743	GAA	2	6	154954	154959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701436
3083	NC_021743	TGG	2	6	154961	154966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701436
3084	NC_021743	CGGTT	2	10	155046	155055	0 %	40 %	40 %	20 %	525701436
3085	NC_021743	TCA	2	6	155077	155082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701436
3086	NC_021743	GTG	2	6	155098	155103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701436
3087	NC_021743	ATT	2	6	155131	155136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701436
3088	NC_021743	TGGC	2	8	155154	155161	0 %	25 %	50 %	25 %	525701436
3089	NC_021743	GCA	2	6	155206	155211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701436
3090	NC_021743	CG	3	6	155212	155217	0 %	0 %	50 %	50 %	525701436
3091	NC_021743	A	6	6	155240	155245	100 %	0 %	0 %	0 %	525701436
3092	NC_021743	AC	4	8	155336	155343	50 %	0 %	0 %	50 %	525701436
3093	NC_021743	GAAA	2	8	155370	155377	75 %	0 %	25 %	0 %	525701436
3094	NC_021743	GAA	2	6	155418	155423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701436
3095	NC_021743	CTA	2	6	155424	155429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701436
3096	NC_021743	ATCT	2	8	155511	155518	25 %	50 %	0 %	25 %	525701436
3097	NC_021743	TGA	2	6	155528	155533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701436
3098	NC_021743	GC	3	6	155659	155664	0 %	0 %	50 %	50 %	525701436
3099	NC_021743	GAT	2	6	155677	155682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701436
3100	NC_021743	CGA	2	6	155727	155732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701436
3101	NC_021743	AC	3	6	155799	155804	50 %	0 %	0 %	50 %	525701437
3102	NC_021743	GAA	2	6	155819	155824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701437
3103	NC_021743	ATCGAA	2	12	155877	155888	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525701437
3104	NC_021743	A	6	6	156060	156065	100 %	0 %	0 %	0 %	525701437
3105	NC_021743	GCA	2	6	156086	156091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701438
3106	NC_021743	AAC	2	6	156115	156120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525701438
3107	NC_021743	CT	3	6	156151	156156	0 %	50 %	0 %	50 %	525701438
3108	NC_021743	GAA	2	6	156221	156226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701438
3109	NC_021743	GC	3	6	156281	156286	0 %	0 %	50 %	50 %	525701438
3110	NC_021743	GCT	2	6	156453	156458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701438
3111	NC_021743	T	6	6	156542	156547	0 %	100 %	0 %	0 %	525701439
3112	NC_021743	GC	3	6	156591	156596	0 %	0 %	50 %	50 %	525701439
3113	NC_021743	CCGAT	2	10	156701	156710	20 %	20 %	20 %	40 %	525701439
3114	NC_021743	TGGC	2	8	156713	156720	0 %	25 %	50 %	25 %	525701439
3115	NC_021743	ATT	2	6	156730	156735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701439
3116	NC_021743	TGA	2	6	156774	156779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701439
3117	NC_021743	AGC	2	6	156840	156845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701115
3118	NC_021743	GTT	2	6	156857	156862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525701115
3119	NC_021743	GCG	2	6	156929	156934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525701115
3120	NC_021743	GAA	2	6	157093	157098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701115
3121	NC_021743	CT	3	6	157215	157220	0 %	50 %	0 %	50 %	525701440
3122	NC_021743	TGT	2	6	157233	157238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525701440
3123	NC_021743	GGA	2	6	157254	157259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525701440
3124	NC_021743	TGTTAT	2	12	157278	157289	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525701440
3125	NC_021743	CGC	2	6	157307	157312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525701440
3126	NC_021743	AGC	2	6	157327	157332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701440
3127	NC_021743	TTG	2	6	157355	157360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525701440
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3143	NC_021743	TAT	2	6	158241	158246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701442
3144	NC_021743	CT	3	6	158270	158275	0 %	50 %	0 %	50 %	525701442
3145	NC_021743	TCG	2	6	158294	158299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701442
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3147	NC_021743	TAG	2	6	158362	158367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701442
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3151	NC_021743	TAT	2	6	158547	158552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701443
3152	NC_021743	CTTGG	2	10	158602	158611	0 %	40 %	40 %	20 %	525701443
3153	NC_021743	CTT	2	6	158628	158633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525701443
3154	NC_021743	GTA	2	6	158642	158647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701443
3155	NC_021743	CCT	3	9	158728	158736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3156	NC_021743	T	7	7	158808	158814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3157	NC_021743	GA	3	6	158981	158986	50 %	0 %	50 %	0 %	525701444
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3163	NC_021743	A	6	6	159273	159278	100 %	0 %	0 %	0 %	525701444
3164	NC_021743	GCA	2	6	159381	159386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701444
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3200	NC_021743	TTAT	2	8	160739	160746	25 %	75 %	0 %	0 %	525701447
3201	NC_021743	AAG	2	6	160782	160787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3202	NC_021743	GAAA	2	8	160788	160795	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3203	NC_021743	A	7	7	160882	160888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3226	NC_021743	A	8	8	162160	162167	100 %	0 %	0 %	0 %	525701448
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3236	NC_021743	A	6	6	162614	162619	100 %	0 %	0 %	0 %	525701448
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3241	NC_021743	CTA	2	6	162781	162786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701448
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3243	NC_021743	GTA	2	6	162847	162852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701448
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3247	NC_021743	CA	3	6	162999	163004	50 %	0 %	0 %	50 %	525701448
3248	NC_021743	CGC	2	6	163065	163070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525701448
3249	NC_021743	GGC	2	6	163090	163095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525701448
3250	NC_021743	AT	3	6	163173	163178	50 %	50 %	0 %	0 %	525701448
3251	NC_021743	CAA	2	6	163209	163214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525701448
3252	NC_021743	CAAGGT	2	12	163222	163233	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525701448
3253	NC_021743	AGC	2	6	163285	163290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701448
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3261	NC_021743	CAG	2	6	163863	163868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701116
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3324	NC_021743	A	6	6	167748	167753	100 %	0 %	0 %	0 %	525701118
3325	NC_021743	GTA	3	9	167795	167803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701118
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3327	NC_021743	CA	3	6	167939	167944	50 %	0 %	0 %	50 %	525701118
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3332	NC_021743	A	7	7	168485	168491	100 %	0 %	0 %	0 %	525701118
3333	NC_021743	GCT	2	6	168518	168523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701118
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3340	NC_021743	AGTC	2	8	168754	168761	25 %	25 %	25 %	25 %	525701118
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3351	NC_021743	AGCACA	2	12	169330	169341	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525701118
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3353	NC_021743	A	8	8	169410	169417	100 %	0 %	0 %	0 %	525701118
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3358	NC_021743	CA	3	6	169765	169770	50 %	0 %	0 %	50 %	525701118
3359	NC_021743	TGG	2	6	169885	169890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701118
3360	NC_021743	CAT	2	6	169923	169928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701118
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3363	NC_021743	GAC	2	6	170272	170277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701118
3364	NC_021743	CG	3	6	170293	170298	0 %	0 %	50 %	50 %	525701118
3365	NC_021743	AAC	2	6	170305	170310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525701118
3366	NC_021743	CT	3	6	170321	170326	0 %	50 %	0 %	50 %	525701118
3367	NC_021743	CAAC	2	8	170470	170477	50 %	0 %	0 %	50 %	525701118
3368	NC_021743	TACAA	2	10	170486	170495	60 %	20 %	0 %	20 %	525701118
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3493	NC_021743	A	6	6	176655	176660	100 %	0 %	0 %	0 %	525701458
3494	NC_021743	TG	4	8	176795	176802	0 %	50 %	50 %	0 %	525701458
3495	NC_021743	TAA	2	6	176927	176932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701458
3496	NC_021743	GAA	2	6	177078	177083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701458
3497	NC_021743	ATA	2	6	177154	177159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701458
3498	NC_021743	ACGC	2	8	177170	177177	25 %	0 %	25 %	50 %	525701458
3499	NC_021743	CGAGC	2	10	177282	177291	20 %	0 %	40 %	40 %	525701458
3500	NC_021743	AGC	2	6	177335	177340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701458

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