MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica D153

Total Repeats: 52171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021743	GCG	2	6	252598	252603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525701526
5002	NC_021743	CTT	2	6	252672	252677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525701526
5003	NC_021743	AT	3	6	252678	252683	50 %	50 %	0 %	0 %	525701526
5004	NC_021743	GCGT	2	8	252732	252739	0 %	25 %	50 %	25 %	525701526
5005	NC_021743	CCG	2	6	252803	252808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525701526
5006	NC_021743	TCA	2	6	252811	252816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701526
5007	NC_021743	TGC	2	6	252840	252845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701526
5008	NC_021743	CT	4	8	252855	252862	0 %	50 %	0 %	50 %	525701526
5009	NC_021743	GGA	2	6	252877	252882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525701526
5010	NC_021743	GAAA	2	8	252909	252916	75 %	0 %	25 %	0 %	525701526
5011	NC_021743	TCGT	2	8	253301	253308	0 %	50 %	25 %	25 %	525701526
5012	NC_021743	A	6	6	253376	253381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_021743	ATTT	2	8	253449	253456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_021743	ATA	2	6	253505	253510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_021743	TGA	2	6	253664	253669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_021743	ATC	2	6	253714	253719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_021743	TGC	2	6	253733	253738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_021743	ATA	2	6	253959	253964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_021743	T	6	6	254011	254016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_021743	CTT	2	6	254094	254099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_021743	TGT	2	6	254176	254181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_021743	TCCAA	2	10	254209	254218	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5023	NC_021743	TTG	2	6	254224	254229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_021743	CAAT	2	8	254277	254284	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5025	NC_021743	GCT	2	6	254406	254411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_021743	A	6	6	254448	254453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_021743	CTT	2	6	254478	254483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_021743	TGA	2	6	254499	254504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_021743	TAAA	2	8	254529	254536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_021743	TCT	2	6	254582	254587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_021743	TCA	2	6	254588	254593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_021743	TCA	2	6	254603	254608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_021743	CTC	2	6	254720	254725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5034	NC_021743	TTG	2	6	254751	254756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_021743	ATC	2	6	254794	254799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_021743	TCT	2	6	254800	254805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_021743	ACA	2	6	254834	254839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_021743	AG	3	6	254925	254930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_021743	TCA	2	6	254953	254958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_021743	CAA	2	6	254985	254990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_021743	GTTT	2	8	255019	255026	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_021743	AGT	2	6	255054	255059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_021743	GTA	2	6	255092	255097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_021743	TAG	2	6	255179	255184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_021743	TTA	2	6	255202	255207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_021743	T	6	6	255310	255315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_021743	AAC	2	6	255427	255432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_021743	CCA	2	6	255442	255447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_021743	T	6	6	255613	255618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_021743	T	7	7	255626	255632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_021743	CTA	2	6	255636	255641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_021743	CAT	2	6	255656	255661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701527
5053	NC_021743	TTTTC	2	10	255683	255692	0 %	80 %	0 %	20 %	525701527
5054	NC_021743	TA	3	6	255845	255850	50 %	50 %	0 %	0 %	525701527
5055	NC_021743	TAG	2	6	255856	255861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701527
5056	NC_021743	T	7	7	255904	255910	0 %	100 %	0 %	0 %	525701527
5057	NC_021743	GGC	2	6	255945	255950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525701527
5058	NC_021743	CCA	2	6	256033	256038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525701527
5059	NC_021743	T	6	6	256089	256094	0 %	100 %	0 %	0 %	525701527
5060	NC_021743	ACA	2	6	256105	256110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525701527
5061	NC_021743	ACG	2	6	256149	256154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701527
5062	NC_021743	CTG	2	6	256172	256177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_021743	TCT	2	6	256285	256290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525701528
5064	NC_021743	TCC	2	6	256297	256302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525701528
5065	NC_021743	AAT	2	6	256306	256311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701528
5066	NC_021743	TTG	2	6	256340	256345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525701528
5067	NC_021743	T	7	7	256382	256388	0 %	100 %	0 %	0 %	525701528
5068	NC_021743	T	6	6	256459	256464	0 %	100 %	0 %	0 %	525701528
5069	NC_021743	TCA	2	6	256471	256476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701528
5070	NC_021743	T	6	6	256481	256486	0 %	100 %	0 %	0 %	525701528
5071	NC_021743	AAT	2	6	256542	256547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701528
5072	NC_021743	T	7	7	256577	256583	0 %	100 %	0 %	0 %	525701528
5073	NC_021743	A	6	6	256586	256591	100 %	0 %	0 %	0 %	525701528
5074	NC_021743	TA	3	6	256601	256606	50 %	50 %	0 %	0 %	525701528
5075	NC_021743	T	6	6	256620	256625	0 %	100 %	0 %	0 %	525701528
5076	NC_021743	GAG	2	6	256640	256645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525701528
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5079	NC_021743	T	6	6	256753	256758	0 %	100 %	0 %	0 %	525701528
5080	NC_021743	AAAT	2	8	256767	256774	75 %	25 %	0 %	0 %	525701528
5081	NC_021743	A	6	6	256801	256806	100 %	0 %	0 %	0 %	525701528
5082	NC_021743	CTTTT	2	10	256816	256825	0 %	80 %	0 %	20 %	525701528
5083	NC_021743	GAAAT	2	10	256840	256849	60 %	20 %	20 %	0 %	525701528
5084	NC_021743	TCA	2	6	256867	256872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701528
5085	NC_021743	ATC	2	6	256902	256907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701528
5086	NC_021743	CAT	2	6	256971	256976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701528
5087	NC_021743	ATC	2	6	257004	257009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701528
5088	NC_021743	GGA	2	6	257041	257046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525701528
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5090	NC_021743	CAG	2	6	257156	257161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701528
5091	NC_021743	AGCTG	2	10	257163	257172	20 %	20 %	40 %	20 %	525701528
5092	NC_021743	GTT	2	6	257247	257252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_021743	T	6	6	257257	257262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_021743	CTT	3	9	257268	257276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_021743	AAAAGT	2	12	257314	257325	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_021743	ATT	2	6	257328	257333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_021743	A	7	7	257347	257353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_021743	A	6	6	257367	257372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_021743	TG	3	6	257449	257454	0 %	50 %	50 %	0 %	525701529
5100	NC_021743	TCA	2	6	257563	257568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701529
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5103	NC_021743	ATG	2	6	257825	257830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701529
5104	NC_021743	TTC	2	6	257889	257894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525701529
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5106	NC_021743	TTC	2	6	257916	257921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525701529
5107	NC_021743	TCCA	2	8	257926	257933	25 %	25 %	0 %	50 %	525701529
5108	NC_021743	TCA	2	6	257953	257958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701529
5109	NC_021743	TTC	2	6	258045	258050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525701529
5110	NC_021743	T	6	6	258063	258068	0 %	100 %	0 %	0 %	525701529
5111	NC_021743	AAAG	2	8	258088	258095	75 %	0 %	25 %	0 %	525701529
5112	NC_021743	TGC	2	6	258153	258158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701529
5113	NC_021743	CTT	2	6	258224	258229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525701529
5114	NC_021743	T	6	6	258271	258276	0 %	100 %	0 %	0 %	525701529
5115	NC_021743	ACC	2	6	258295	258300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525701529
5116	NC_021743	TCA	2	6	258320	258325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701529
5117	NC_021743	AAT	2	6	258329	258334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701529
5118	NC_021743	TGG	2	6	258368	258373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701529
5119	NC_021743	GCA	2	6	258380	258385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701529
5120	NC_021743	CATT	2	8	258421	258428	25 %	50 %	0 %	25 %	525701529
5121	NC_021743	ATA	2	6	258433	258438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701529
5122	NC_021743	TGG	3	9	258481	258489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701529
5123	NC_021743	TG	3	6	258544	258549	0 %	50 %	50 %	0 %	525701529
5124	NC_021743	CGC	2	6	258710	258715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525701529
5125	NC_021743	ACC	3	9	258744	258752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525701529
5126	NC_021743	T	6	6	258885	258890	0 %	100 %	0 %	0 %	525701529
5127	NC_021743	TTC	2	6	258897	258902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525701529
5128	NC_021743	CAC	2	6	258908	258913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525701529
5129	NC_021743	TTC	2	6	258972	258977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525701529
5130	NC_021743	GGT	2	6	258993	258998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701529
5131	NC_021743	T	6	6	259002	259007	0 %	100 %	0 %	0 %	525701529
5132	NC_021743	CT	3	6	259165	259170	0 %	50 %	0 %	50 %	525701529
5133	NC_021743	T	6	6	259176	259181	0 %	100 %	0 %	0 %	525701529
5134	NC_021743	TTG	2	6	259197	259202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525701529
5135	NC_021743	GCGTA	2	10	259224	259233	20 %	20 %	40 %	20 %	525701529
5136	NC_021743	CAC	2	6	259257	259262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525701529
5137	NC_021743	AGC	2	6	259350	259355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701529
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5140	NC_021743	ACC	2	6	259467	259472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525701529
5141	NC_021743	TTTCA	2	10	259509	259518	20 %	60 %	0 %	20 %	525701529
5142	NC_021743	TCA	2	6	259564	259569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701529
5143	NC_021743	AGT	2	6	259581	259586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701529
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5147	NC_021743	TAC	2	6	259770	259775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701529
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5150	NC_021743	GTA	2	6	259831	259836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701529
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5152	NC_021743	T	6	6	259879	259884	0 %	100 %	0 %	0 %	525701529
5153	NC_021743	CGA	2	6	259894	259899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701529
5154	NC_021743	T	6	6	259920	259925	0 %	100 %	0 %	0 %	525701529
5155	NC_021743	ATA	2	6	259927	259932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701529
5156	NC_021743	AAGTT	2	10	259944	259953	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5157	NC_021743	A	6	6	260047	260052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5158	NC_021743	GTA	2	6	260062	260067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5159	NC_021743	CAG	2	6	260102	260107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5160	NC_021743	CTGC	2	8	260157	260164	0 %	25 %	25 %	50 %	525701530
5161	NC_021743	GATA	2	8	260188	260195	50 %	25 %	25 %	0 %	525701530
5162	NC_021743	CGCA	2	8	260201	260208	25 %	0 %	25 %	50 %	525701530
5163	NC_021743	CAT	2	6	260209	260214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701530
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5167	NC_021743	CTTTG	2	10	260458	260467	0 %	60 %	20 %	20 %	525701530
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5178	NC_021743	TTTC	2	8	260899	260906	0 %	75 %	0 %	25 %	525701530
5179	NC_021743	CTT	2	6	260956	260961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525701530
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5181	NC_021743	CA	3	6	261149	261154	50 %	0 %	0 %	50 %	525701530
5182	NC_021743	TGG	2	6	261169	261174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701530
5183	NC_021743	TG	3	6	261189	261194	0 %	50 %	50 %	0 %	525701530
5184	NC_021743	GCA	2	6	261207	261212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701530
5185	NC_021743	ATA	2	6	261222	261227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701530
5186	NC_021743	T	7	7	261244	261250	0 %	100 %	0 %	0 %	525701530
5187	NC_021743	AAT	2	6	261367	261372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5188	NC_021743	CGG	2	6	261425	261430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525701531
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5191	NC_021743	GATA	2	8	261518	261525	50 %	25 %	25 %	0 %	525701531
5192	NC_021743	GTG	2	6	261643	261648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701531
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5194	NC_021743	AAT	2	6	261863	261868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701531
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5201	NC_021743	AAAT	2	8	262367	262374	75 %	25 %	0 %	0 %	525701531
5202	NC_021743	GAA	2	6	262387	262392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701531
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5211	NC_021743	GTT	2	6	262660	262665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525701531
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5213	NC_021743	TGG	2	6	262950	262955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701531
5214	NC_021743	ATT	2	6	263339	263344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5215	NC_021743	TAT	2	6	263472	263477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701532
5216	NC_021743	TGA	2	6	263496	263501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701532
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5218	NC_021743	GCC	2	6	263613	263618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525701532
5219	NC_021743	TGA	2	6	263646	263651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701532
5220	NC_021743	A	6	6	263693	263698	100 %	0 %	0 %	0 %	525701532
5221	NC_021743	GGT	2	6	263710	263715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701532
5222	NC_021743	ACC	2	6	263794	263799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525701532
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5230	NC_021743	GGT	2	6	264481	264486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701532
5231	NC_021743	ACC	2	6	264493	264498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5232	NC_021743	T	6	6	264506	264511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5233	NC_021743	AAAG	2	8	264550	264557	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5234	NC_021743	TTG	2	6	264587	264592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5235	NC_021743	CGG	2	6	264679	264684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5236	NC_021743	ATT	2	6	264705	264710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5237	NC_021743	TTTA	2	8	264728	264735	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5238	NC_021743	CTTT	2	8	264899	264906	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5239	NC_021743	CTTT	2	8	264912	264919	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5240	NC_021743	AAAG	2	8	264928	264935	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5241	NC_021743	AAG	2	6	264940	264945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_021743	ACAA	2	8	264982	264989	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5243	NC_021743	GAAT	2	8	265093	265100	50 %	25 %	25 %	0 %	525701533
5244	NC_021743	CAC	2	6	265134	265139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525701533
5245	NC_021743	GGC	2	6	265181	265186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525701533
5246	NC_021743	TGC	2	6	265352	265357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701533
5247	NC_021743	ATT	2	6	265401	265406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701533
5248	NC_021743	T	7	7	265472	265478	0 %	100 %	0 %	0 %	525701534
5249	NC_021743	A	6	6	265576	265581	100 %	0 %	0 %	0 %	525701534
5250	NC_021743	CTG	2	6	265609	265614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701534
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5252	NC_021743	AAG	2	6	265731	265736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701535
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5254	NC_021743	GTTT	2	8	265851	265858	0 %	75 %	25 %	0 %	525701535
5255	NC_021743	A	6	6	265883	265888	100 %	0 %	0 %	0 %	525701535
5256	NC_021743	TGA	2	6	265978	265983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701535
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5261	NC_021743	A	6	6	266162	266167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5262	NC_021743	AAT	2	6	266172	266177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5314	NC_021743	AT	3	6	270041	270046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5315	NC_021743	T	6	6	270076	270081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5316	NC_021743	ATT	2	6	270121	270126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5364	NC_021743	TTTGC	2	10	273058	273067	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5365	NC_021743	GAA	3	9	273157	273165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5366	NC_021743	GCTC	2	8	273202	273209	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5367	NC_021743	GAA	2	6	273223	273228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5368	NC_021743	GCC	2	6	273263	273268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5370	NC_021743	GAA	2	6	273362	273367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5371	NC_021743	AGA	2	6	273387	273392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5372	NC_021743	TAAAA	2	10	273425	273434	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5373	NC_021743	AGTT	2	8	273470	273477	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5374	NC_021743	TTA	2	6	273512	273517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701542
5375	NC_021743	GAT	3	9	273521	273529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701542
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