MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica D153

Total Repeats: 52171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021743	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021743	T	6	6	17	22	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021743	GAT	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701271
4	NC_021743	ATC	2	6	196	201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701271
5	NC_021743	GAT	2	6	273	278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701271
6	NC_021743	GAA	2	6	394	399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701271
7	NC_021743	ATT	2	6	519	524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701271
8	NC_021743	TAG	2	6	580	585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701271
9	NC_021743	TTG	2	6	622	627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525701271
10	NC_021743	TG	3	6	646	651	0 %	50 %	50 %	0 %	525701271
11	NC_021743	AGC	2	6	659	664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701271
12	NC_021743	CGTT	2	8	789	796	0 %	50 %	25 %	25 %	525701271
13	NC_021743	GCA	2	6	852	857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701271
14	NC_021743	AT	3	6	1028	1033	50 %	50 %	0 %	0 %	525701272
15	NC_021743	A	6	6	1101	1106	100 %	0 %	0 %	0 %	525701272
16	NC_021743	AAT	2	6	1230	1235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701272
17	NC_021743	GTC	2	6	1242	1247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701272
18	NC_021743	ACA	2	6	1262	1267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021743	ACTGAA	2	12	1340	1351	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021743	GAT	2	6	1452	1457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701273
21	NC_021743	ATT	2	6	1462	1467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701273
22	NC_021743	TGA	2	6	1487	1492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701273
23	NC_021743	TAC	2	6	1509	1514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701273
24	NC_021743	TGA	2	6	1538	1543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701273
25	NC_021743	ACC	2	6	1578	1583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_021743	TTG	2	6	1706	1711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525701274
27	NC_021743	CTG	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701274
28	NC_021743	A	7	7	1884	1890	100 %	0 %	0 %	0 %	525701274
29	NC_021743	CGG	2	6	1902	1907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525701274
30	NC_021743	AT	3	6	1908	1913	50 %	50 %	0 %	0 %	525701274
31	NC_021743	TGA	2	6	1940	1945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701274
32	NC_021743	TGA	2	6	1956	1961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701274
33	NC_021743	GA	5	10	1960	1969	50 %	0 %	50 %	0 %	525701274
34	NC_021743	AGGA	2	8	2003	2010	50 %	0 %	50 %	0 %	525701274
35	NC_021743	TAA	2	6	2040	2045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701274
36	NC_021743	AAC	2	6	2117	2122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525701274
37	NC_021743	AAT	2	6	2332	2337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701274
38	NC_021743	GAG	2	6	2401	2406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525701274
39	NC_021743	GCG	2	6	2473	2478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525701274
40	NC_021743	AGA	2	6	2508	2513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701274
41	NC_021743	GAA	2	6	2617	2622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701274
42	NC_021743	GCT	2	6	2623	2628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701274
43	NC_021743	T	6	6	2694	2699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021743	TTA	2	6	2761	2766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701275
45	NC_021743	ATG	2	6	2779	2784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701275
46	NC_021743	TAT	2	6	2811	2816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701275
47	NC_021743	TCG	2	6	2843	2848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701275
48	NC_021743	TGA	2	6	3060	3065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701276
49	NC_021743	GAT	2	6	3099	3104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701276
50	NC_021743	TTA	2	6	3175	3180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701276
51	NC_021743	CAGG	2	8	3182	3189	25 %	0 %	50 %	25 %	525701276
52	NC_021743	T	6	6	3277	3282	0 %	100 %	0 %	0 %	525701277
53	NC_021743	A	7	7	3329	3335	100 %	0 %	0 %	0 %	525701277
54	NC_021743	ATC	2	6	3439	3444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701278
55	NC_021743	TCT	2	6	3515	3520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525701278
56	NC_021743	ATT	2	6	3653	3658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021743	TGA	2	6	3685	3690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701279
58	NC_021743	TAT	2	6	3698	3703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701279
59	NC_021743	TAA	2	6	3791	3796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701279
60	NC_021743	TAT	2	6	3825	3830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701279
61	NC_021743	ATT	2	6	3937	3942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701279
62	NC_021743	ATA	2	6	3947	3952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701279
63	NC_021743	TGAAT	2	10	3954	3963	40 %	40 %	20 %	0 %	525701279
64	NC_021743	ATA	3	9	3980	3988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701279
65	NC_021743	GAAA	2	8	3998	4005	75 %	0 %	25 %	0 %	525701279
66	NC_021743	T	7	7	4020	4026	0 %	100 %	0 %	0 %	525701279
67	NC_021743	TTTA	2	8	4029	4036	25 %	75 %	0 %	0 %	525701279
68	NC_021743	GATT	2	8	4083	4090	25 %	50 %	25 %	0 %	525701279
69	NC_021743	TAT	2	6	4103	4108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701279
70	NC_021743	TAT	2	6	4143	4148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701279
71	NC_021743	ATT	2	6	4155	4160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701279
72	NC_021743	T	6	6	4192	4197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021743	GATATA	2	12	4232	4243	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021743	AATA	2	8	4246	4253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021743	TAA	2	6	4266	4271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021743	TA	3	6	4279	4284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021743	TCAT	2	8	4295	4302	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021743	AT	4	8	4348	4355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021743	TAA	2	6	4411	4416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021743	A	6	6	4415	4420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021743	AG	3	6	4436	4441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021743	T	6	6	4442	4447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021743	A	6	6	4503	4508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021743	CTTT	2	8	4626	4633	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_021743	CAT	2	6	4643	4648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021743	A	7	7	4682	4688	100 %	0 %	0 %	0 %	525701280
87	NC_021743	ACT	2	6	4795	4800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701280
88	NC_021743	CAT	3	9	4940	4948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701280
89	NC_021743	CGG	2	6	4957	4962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525701280
90	NC_021743	TA	3	6	5018	5023	50 %	50 %	0 %	0 %	525701280
91	NC_021743	GAA	2	6	5045	5050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701280
92	NC_021743	ACC	2	6	5182	5187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525701280
93	NC_021743	AGG	2	6	5245	5250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525701280
94	NC_021743	TTC	2	6	5317	5322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525701280
95	NC_021743	TAAA	2	8	5427	5434	75 %	25 %	0 %	0 %	525701280
96	NC_021743	GGTT	2	8	5540	5547	0 %	50 %	50 %	0 %	525701280
97	NC_021743	AGGA	2	8	5553	5560	50 %	0 %	50 %	0 %	525701280
98	NC_021743	CTG	3	9	5580	5588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701280
99	NC_021743	ATA	2	6	5589	5594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701280
100	NC_021743	CTTA	2	8	5601	5608	25 %	50 %	0 %	25 %	525701280
101	NC_021743	TGA	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701280
102	NC_021743	TC	3	6	5666	5671	0 %	50 %	0 %	50 %	525701280
103	NC_021743	AGA	2	6	5680	5685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701280
104	NC_021743	TGG	2	6	5695	5700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701280
105	NC_021743	ATT	2	6	5761	5766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701280
106	NC_021743	ATT	2	6	5814	5819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701280
107	NC_021743	AGA	2	6	5854	5859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701280
108	NC_021743	ATT	2	6	5939	5944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701280
109	NC_021743	AAG	2	6	5952	5957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701280
110	NC_021743	ATC	2	6	6008	6013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701280
111	NC_021743	ATG	2	6	6018	6023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701280
112	NC_021743	CCT	2	6	6036	6041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525701280
113	NC_021743	TGA	2	6	6088	6093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701280
114	NC_021743	AAG	2	6	6141	6146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701280
115	NC_021743	CAA	2	6	6301	6306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525701280
116	NC_021743	TTG	2	6	6342	6347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525701280
117	NC_021743	ACC	2	6	6351	6356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525701280
118	NC_021743	TAA	2	6	6430	6435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701280
119	NC_021743	ATTC	2	8	6464	6471	25 %	50 %	0 %	25 %	525701280
120	NC_021743	A	6	6	6574	6579	100 %	0 %	0 %	0 %	525701280
121	NC_021743	T	6	6	6590	6595	0 %	100 %	0 %	0 %	525701280
122	NC_021743	AAT	2	6	6614	6619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701280
123	NC_021743	CTA	2	6	6681	6686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021743	T	9	9	6693	6701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021743	ACA	2	6	6740	6745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021743	ACC	2	6	6799	6804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_021743	TTG	2	6	6833	6838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525701281
128	NC_021743	AAT	2	6	6865	6870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701281
129	NC_021743	TA	3	6	6893	6898	50 %	50 %	0 %	0 %	525701281
130	NC_021743	TTAT	2	8	6952	6959	25 %	75 %	0 %	0 %	525701281
131	NC_021743	GAAA	2	8	6977	6984	75 %	0 %	25 %	0 %	525701281
132	NC_021743	AAT	2	6	7027	7032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701281
133	NC_021743	ATT	2	6	7081	7086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701281
134	NC_021743	TTA	2	6	7253	7258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701281
135	NC_021743	AAAC	2	8	7276	7283	75 %	0 %	0 %	25 %	525701281
136	NC_021743	ATTT	2	8	7310	7317	25 %	75 %	0 %	0 %	525701281
137	NC_021743	GAA	2	6	7331	7336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701281
138	NC_021743	AT	3	6	7370	7375	50 %	50 %	0 %	0 %	525701281
139	NC_021743	TCA	2	6	7408	7413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701281
140	NC_021743	CA	3	6	7415	7420	50 %	0 %	0 %	50 %	525701281
141	NC_021743	GAA	2	6	7452	7457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701281
142	NC_021743	AT	3	6	7521	7526	50 %	50 %	0 %	0 %	525701281
143	NC_021743	GA	3	6	7548	7553	50 %	0 %	50 %	0 %	525701281
144	NC_021743	A	6	6	7571	7576	100 %	0 %	0 %	0 %	525701281
145	NC_021743	ATA	2	6	7622	7627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701282
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147	NC_021743	AAT	2	6	7793	7798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701282
148	NC_021743	GAT	2	6	7886	7891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701282
149	NC_021743	GAT	2	6	7964	7969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701282
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152	NC_021743	CTCA	2	8	8095	8102	25 %	25 %	0 %	50 %	525701282
153	NC_021743	CATT	2	8	8211	8218	25 %	50 %	0 %	25 %	525701282
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158	NC_021743	A	6	6	8503	8508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021743	AGA	2	6	8562	8567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_021743	AATC	2	8	8633	8640	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
161	NC_021743	TTA	2	6	8683	8688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701283
162	NC_021743	TTA	2	6	8703	8708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701283
163	NC_021743	AGA	2	6	8717	8722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701283
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178	NC_021743	CAT	2	6	9654	9659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701283
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180	NC_021743	CTTT	2	8	9824	9831	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
181	NC_021743	TTC	2	6	9840	9845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_021743	AGT	2	6	9859	9864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_021743	CT	3	6	9891	9896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
184	NC_021743	CTAT	2	8	9918	9925	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
185	NC_021743	AAT	2	6	9954	9959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701284
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234	NC_021743	TCT	2	6	12906	12911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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236	NC_021743	A	6	6	13025	13030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
237	NC_021743	TGCC	2	8	13127	13134	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
238	NC_021743	CAA	2	6	13182	13187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
239	NC_021743	TTA	2	6	13197	13202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
240	NC_021743	T	6	6	13215	13220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_021743	A	6	6	13762	13767	100 %	0 %	0 %	0 %	525701286
254	NC_021743	ATC	2	6	13871	13876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701287
255	NC_021743	GAC	2	6	13956	13961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701287
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257	NC_021743	TGC	2	6	14036	14041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701287
258	NC_021743	AATTCT	2	12	14043	14054	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525701287
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260	NC_021743	TAT	2	6	14089	14094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701287
261	NC_021743	ATTCA	2	10	14111	14120	40 %	40 %	0 %	20 %	525701287
262	NC_021743	CTAG	2	8	14214	14221	25 %	25 %	25 %	25 %	525701287
263	NC_021743	CTGTA	2	10	14302	14311	20 %	40 %	20 %	20 %	525701287
264	NC_021743	CTG	2	6	14348	14353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701287
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267	NC_021743	TAA	2	6	14509	14514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701288
268	NC_021743	TCA	2	6	14543	14548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701288
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270	NC_021743	AAT	2	6	14684	14689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701288
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