MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica D174

Total Repeats: 52571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_021739	CTA	2	6	539733	539738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525663038
10502	NC_021739	CTG	2	6	539780	539785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10503	NC_021739	TAT	2	6	539840	539845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662460
10504	NC_021739	TTGC	2	8	539856	539863	0 %	50 %	25 %	25 %	525662460
10505	NC_021739	CATT	2	8	539877	539884	25 %	50 %	0 %	25 %	525662460
10506	NC_021739	CAA	2	6	539975	539980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662460
10507	NC_021739	GGA	2	6	540005	540010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525662460
10508	NC_021739	GTC	2	6	540057	540062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662460
10509	NC_021739	ATC	2	6	540194	540199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662460
10510	NC_021739	T	6	6	540326	540331	0 %	100 %	0 %	0 %	525662460
10511	NC_021739	A	6	6	540391	540396	100 %	0 %	0 %	0 %	525662460
10512	NC_021739	A	6	6	540502	540507	100 %	0 %	0 %	0 %	525662460
10513	NC_021739	T	6	6	540536	540541	0 %	100 %	0 %	0 %	525662460
10514	NC_021739	CAA	2	6	540549	540554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662460
10515	NC_021739	CT	3	6	540650	540655	0 %	50 %	0 %	50 %	525662460
10516	NC_021739	T	6	6	540664	540669	0 %	100 %	0 %	0 %	525662460
10517	NC_021739	AAG	2	6	540701	540706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662460
10518	NC_021739	T	6	6	540784	540789	0 %	100 %	0 %	0 %	525662460
10519	NC_021739	GTA	2	6	540969	540974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662460
10520	NC_021739	A	6	6	541028	541033	100 %	0 %	0 %	0 %	525662461
10521	NC_021739	GTT	2	6	541061	541066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525662461
10522	NC_021739	GAT	2	6	541208	541213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662461
10523	NC_021739	AGAA	2	8	541301	541308	75 %	0 %	25 %	0 %	525662461
10524	NC_021739	A	6	6	541328	541333	100 %	0 %	0 %	0 %	525662461
10525	NC_021739	TGG	2	6	541381	541386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525662461
10526	NC_021739	ATT	2	6	541400	541405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662461
10527	NC_021739	AT	3	6	541411	541416	50 %	50 %	0 %	0 %	525662461
10528	NC_021739	CAA	3	9	541421	541429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662461
10529	NC_021739	TTAG	2	8	541438	541445	25 %	50 %	25 %	0 %	525662461
10530	NC_021739	CGAC	2	8	541606	541613	25 %	0 %	25 %	50 %	525663039
10531	NC_021739	CAT	2	6	541614	541619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525663039
10532	NC_021739	TCAA	2	8	541657	541664	50 %	25 %	0 %	25 %	525663039
10533	NC_021739	TAG	2	6	541676	541681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525663039
10534	NC_021739	TAA	2	6	541817	541822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525663039
10535	NC_021739	CAA	2	6	541857	541862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525663039
10536	NC_021739	ATC	2	6	541926	541931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525663039
10537	NC_021739	AAT	2	6	542019	542024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525663039
10538	NC_021739	T	7	7	542058	542064	0 %	100 %	0 %	0 %	525663039
10539	NC_021739	TTCATC	2	12	542067	542078	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525663039
10540	NC_021739	TAA	2	6	542079	542084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525663039
10541	NC_021739	TC	3	6	542089	542094	0 %	50 %	0 %	50 %	525663039
10542	NC_021739	TAC	2	6	542141	542146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10543	NC_021739	AAG	2	6	542204	542209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_021739	TCA	2	6	542288	542293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525663040
10545	NC_021739	CTT	2	6	542481	542486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525663040
10546	NC_021739	T	6	6	542547	542552	0 %	100 %	0 %	0 %	525663040
10547	NC_021739	CGT	2	6	542580	542585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525663040
10548	NC_021739	TGAT	2	8	542654	542661	25 %	50 %	25 %	0 %	525663040
10549	NC_021739	ATC	2	6	542680	542685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525663040
10550	NC_021739	TGAACC	2	12	542690	542701	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525663040
10551	NC_021739	TGG	2	6	542737	542742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525663040
10552	NC_021739	TTC	2	6	542755	542760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525663040
10553	NC_021739	CTG	2	6	542823	542828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525663040
10554	NC_021739	AAG	2	6	542904	542909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525663040
10555	NC_021739	AGGT	2	8	542926	542933	25 %	25 %	50 %	0 %	525663040
10556	NC_021739	TCAG	2	8	542957	542964	25 %	25 %	25 %	25 %	525663040
10557	NC_021739	CA	3	6	542985	542990	50 %	0 %	0 %	50 %	525663040
10558	NC_021739	GTG	2	6	542996	543001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525663040
10559	NC_021739	CGG	2	6	543056	543061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525663040
10560	NC_021739	TTTGC	2	10	543100	543109	0 %	60 %	20 %	20 %	525663040
10561	NC_021739	GTA	2	6	543146	543151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525663040
10562	NC_021739	TGA	2	6	543233	543238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525663040
10563	NC_021739	TCA	2	6	543296	543301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525663040
10564	NC_021739	TAA	2	6	543322	543327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525663040
10565	NC_021739	AAT	2	6	543358	543363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525663040
10566	NC_021739	CGA	2	6	543372	543377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525663040
10567	NC_021739	TAT	2	6	543378	543383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525663040
10568	NC_021739	GAA	2	6	543401	543406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525663040
10569	NC_021739	CAAA	2	8	543414	543421	75 %	0 %	0 %	25 %	525663040
10570	NC_021739	GCA	2	6	543593	543598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525663040
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10572	NC_021739	ATAA	2	8	543631	543638	75 %	25 %	0 %	0 %	525663040
10573	NC_021739	ACC	2	6	543700	543705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525663040
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10576	NC_021739	AAGAA	2	10	544014	544023	80 %	0 %	20 %	0 %	525663040
10577	NC_021739	CGG	2	6	544048	544053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525663040
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10579	NC_021739	GTG	2	6	544204	544209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525663040
10580	NC_021739	CAT	2	6	544228	544233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525663040
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10582	NC_021739	GCA	2	6	544394	544399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525663040
10583	NC_021739	CGG	2	6	544404	544409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525663040
10584	NC_021739	CAAG	2	8	544410	544417	50 %	0 %	25 %	25 %	525663040
10585	NC_021739	ATT	2	6	544423	544428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525663040
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10587	NC_021739	TCCT	2	8	544534	544541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10588	NC_021739	TAC	2	6	544553	544558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10589	NC_021739	TA	3	6	544577	544582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10590	NC_021739	ATA	2	6	544589	544594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10591	NC_021739	T	6	6	544664	544669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_021739	CAG	2	6	544693	544698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10593	NC_021739	A	6	6	544708	544713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_021739	TAT	2	6	544772	544777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10595	NC_021739	TTA	2	6	544795	544800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525663041
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10597	NC_021739	GAA	2	6	544875	544880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525663041
10598	NC_021739	TG	3	6	544907	544912	0 %	50 %	50 %	0 %	525663041
10599	NC_021739	AGCA	2	8	544967	544974	50 %	0 %	25 %	25 %	525663041
10600	NC_021739	A	6	6	544974	544979	100 %	0 %	0 %	0 %	525663041
10601	NC_021739	TTTA	2	8	545047	545054	25 %	75 %	0 %	0 %	525663041
10602	NC_021739	TGA	3	9	545114	545122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525663041
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10604	NC_021739	GAT	2	6	545141	545146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525663041
10605	NC_021739	ATT	2	6	545198	545203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525663041
10606	NC_021739	TGTT	2	8	545311	545318	0 %	75 %	25 %	0 %	525663041
10607	NC_021739	GGCA	2	8	545333	545340	25 %	0 %	50 %	25 %	525663041
10608	NC_021739	A	6	6	545345	545350	100 %	0 %	0 %	0 %	525663041
10609	NC_021739	TAT	2	6	545405	545410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525663041
10610	NC_021739	AAG	2	6	545497	545502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525663041
10611	NC_021739	TG	3	6	545556	545561	0 %	50 %	50 %	0 %	525663041
10612	NC_021739	TTA	2	6	545652	545657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525663041
10613	NC_021739	TAA	2	6	545705	545710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525663041
10614	NC_021739	AC	3	6	545742	545747	50 %	0 %	0 %	50 %	525663041
10615	NC_021739	TAA	2	6	545849	545854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525663041
10616	NC_021739	ATG	2	6	545856	545861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525663041
10617	NC_021739	CAA	2	6	545870	545875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525663041
10618	NC_021739	TAT	2	6	545894	545899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525663041
10619	NC_021739	GT	3	6	545917	545922	0 %	50 %	50 %	0 %	525663041
10620	NC_021739	GAT	2	6	545970	545975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525663041
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10622	NC_021739	TGA	2	6	546098	546103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525663041
10623	NC_021739	GTG	2	6	546132	546137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525663041
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10991	NC_021739	TGTT	2	8	566692	566699	0 %	75 %	25 %	0 %	525663054
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