MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica D174

Total Repeats: 52571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52501	NC_021739	GCT	2	6	2698550	2698555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52502	NC_021739	TAAAT	2	10	2698580	2698589	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52503	NC_021739	CCA	2	6	2698653	2698658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52504	NC_021739	TCT	2	6	2698688	2698693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52505	NC_021739	GCTT	2	8	2698706	2698713	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52506	NC_021739	CT	3	6	2698748	2698753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52507	NC_021739	CTG	2	6	2698758	2698763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52508	NC_021739	TCC	2	6	2698777	2698782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52509	NC_021739	GT	3	6	2698785	2698790	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52510	NC_021739	GTT	2	6	2699012	2699017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52511	NC_021739	TCC	2	6	2699116	2699121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52512	NC_021739	AAT	2	6	2699149	2699154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52513	NC_021739	A	6	6	2699223	2699228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52514	NC_021739	TTA	2	6	2699235	2699240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52515	NC_021739	CAAT	2	8	2699305	2699312	50 %	25 %	0 %	25 %	525665061
52516	NC_021739	ACA	2	6	2699343	2699348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525665061
52517	NC_021739	C	6	6	2699421	2699426	0 %	0 %	0 %	100 %	525665061
52518	NC_021739	CTT	2	6	2699498	2699503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525665061
52519	NC_021739	TGG	2	6	2699514	2699519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525665061
52520	NC_021739	ACC	2	6	2699532	2699537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525665061
52521	NC_021739	T	6	6	2699538	2699543	0 %	100 %	0 %	0 %	525665061
52522	NC_021739	AAAT	2	8	2699554	2699561	75 %	25 %	0 %	0 %	525665061
52523	NC_021739	CT	3	6	2699597	2699602	0 %	50 %	0 %	50 %	525665061
52524	NC_021739	TAG	2	6	2699818	2699823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525665061
52525	NC_021739	TAA	2	6	2699835	2699840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525665061
52526	NC_021739	GA	3	6	2699949	2699954	50 %	0 %	50 %	0 %	525665061
52527	NC_021739	AAT	2	6	2700017	2700022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525665061
52528	NC_021739	CGA	2	6	2700089	2700094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525665061
52529	NC_021739	TTG	2	6	2700113	2700118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525665061
52530	NC_021739	GCA	2	6	2700130	2700135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525665061
52531	NC_021739	ATG	2	6	2700152	2700157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525665061
52532	NC_021739	GTT	2	6	2700181	2700186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525665061
52533	NC_021739	AG	3	6	2700204	2700209	50 %	0 %	50 %	0 %	525665061
52534	NC_021739	A	7	7	2700218	2700224	100 %	0 %	0 %	0 %	525665061
52535	NC_021739	GTT	2	6	2700250	2700255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525665062
52536	NC_021739	ATT	2	6	2700332	2700337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525665062
52537	NC_021739	A	6	6	2700338	2700343	100 %	0 %	0 %	0 %	525665062
52538	NC_021739	T	6	6	2700356	2700361	0 %	100 %	0 %	0 %	525665062
52539	NC_021739	CTT	2	6	2700415	2700420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525665062
52540	NC_021739	CTG	2	6	2700433	2700438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525665062
52541	NC_021739	ATA	2	6	2700533	2700538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525665062
52542	NC_021739	TGT	2	6	2700581	2700586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525665062
52543	NC_021739	ACT	2	6	2700630	2700635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525665062
52544	NC_021739	TCA	2	6	2700673	2700678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52545	NC_021739	CT	3	6	2700679	2700684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52546	NC_021739	AATA	2	8	2700690	2700697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52547	NC_021739	A	6	6	2700748	2700753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52548	NC_021739	T	7	7	2700760	2700766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52549	NC_021739	A	6	6	2700771	2700776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52550	NC_021739	GCG	2	6	2700864	2700869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52551	NC_021739	ACCT	2	8	2700962	2700969	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52552	NC_021739	TATT	2	8	2701019	2701026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52553	NC_021739	CAA	2	6	2701057	2701062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525665063
52554	NC_021739	GGATG	2	10	2701069	2701078	20 %	20 %	60 %	0 %	525665063
52555	NC_021739	T	6	6	2701118	2701123	0 %	100 %	0 %	0 %	525665063
52556	NC_021739	TTTCG	2	10	2701152	2701161	0 %	60 %	20 %	20 %	525665063
52557	NC_021739	ATCA	2	8	2701207	2701214	50 %	25 %	0 %	25 %	525665063
52558	NC_021739	GAA	2	6	2701225	2701230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525665063
52559	NC_021739	AGCA	2	8	2701271	2701278	50 %	0 %	25 %	25 %	525665063
52560	NC_021739	ATT	2	6	2701345	2701350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525665063
52561	NC_021739	CT	3	6	2701390	2701395	0 %	50 %	0 %	50 %	525665063
52562	NC_021739	ATGT	2	8	2701472	2701479	25 %	50 %	25 %	0 %	525665064
52563	NC_021739	AATG	2	8	2701530	2701537	50 %	25 %	25 %	0 %	525665064
52564	NC_021739	CAA	2	6	2701635	2701640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525665064
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52567	NC_021739	CAT	2	6	2701925	2701930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525665065
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52570	NC_021739	GAG	2	6	2702133	2702138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52571	NC_021739	CCTT	2	8	2702155	2702162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.