MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 48690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021738	TGA	2	6	29	34	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021738	TGA	2	6	45	50	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021738	AGTTG	2	10	71	80	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021738	GAA	2	6	96	101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021738	CAC	2	6	110	115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_021738	AAT	2	6	277	282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021738	CCA	2	6	482	487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_021738	CTT	2	6	488	493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021738	AT	3	6	523	528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021738	CAG	2	6	548	553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021738	CAA	2	6	593	598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021738	T	6	6	618	623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021738	ATAA	2	8	649	656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021738	ATC	2	6	735	740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655724
15	NC_021738	T	7	7	750	756	0 %	100 %	0 %	0 %	525655724
16	NC_021738	GCT	2	6	866	871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655724
17	NC_021738	TAA	2	6	930	935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655724
18	NC_021738	A	6	6	972	977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021738	TTG	2	6	979	984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021738	ATA	2	6	998	1003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021738	AGA	2	6	1060	1065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021738	GCGG	2	8	1088	1095	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021738	TCG	2	6	1102	1107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021738	AATG	2	8	1108	1115	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021738	CA	3	6	1161	1166	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021738	CAC	2	6	1182	1187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_021738	CAG	2	6	1235	1240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021738	ATAA	2	8	1411	1418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021738	ATG	2	6	1439	1444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021738	AAG	2	6	1490	1495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021738	TTGC	2	8	1531	1538	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021738	TTC	2	6	1540	1545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021738	A	6	6	1553	1558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021738	A	6	6	1647	1652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021738	ACC	2	6	1687	1692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_021738	CCA	2	6	1758	1763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_021738	A	6	6	1780	1785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021738	TG	3	6	1836	1841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021738	AATT	2	8	1895	1902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021738	GA	4	8	2056	2063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021738	TTGG	2	8	2067	2074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021738	TAA	2	6	2079	2084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021738	TTA	2	6	2105	2110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021738	TGT	2	6	2228	2233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
45	NC_021738	T	6	6	2233	2238	0 %	100 %	0 %	0 %	525655725
46	NC_021738	GTTG	2	8	2337	2344	0 %	50 %	50 %	0 %	525655725
47	NC_021738	TTA	2	6	2351	2356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655725
48	NC_021738	CTC	2	6	2508	2513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525655725
49	NC_021738	GTA	2	6	2542	2547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655725
50	NC_021738	TTG	2	6	2559	2564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
51	NC_021738	CGG	2	6	2627	2632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655725
52	NC_021738	T	6	6	2666	2671	0 %	100 %	0 %	0 %	525655725
53	NC_021738	TTG	2	6	2710	2715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
54	NC_021738	TAG	2	6	2746	2751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655725
55	NC_021738	TATC	2	8	2832	2839	25 %	50 %	0 %	25 %	525655725
56	NC_021738	GGTT	2	8	2865	2872	0 %	50 %	50 %	0 %	525655725
57	NC_021738	TGT	2	6	2873	2878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
58	NC_021738	GCT	2	6	2929	2934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655725
59	NC_021738	TTTG	2	8	2955	2962	0 %	75 %	25 %	0 %	525655725
60	NC_021738	GCAGA	2	10	2994	3003	40 %	0 %	40 %	20 %	525655725
61	NC_021738	AAT	2	6	3067	3072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655725
62	NC_021738	TCA	2	6	3075	3080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655725
63	NC_021738	TTGC	2	8	3099	3106	0 %	50 %	25 %	25 %	525655725
64	NC_021738	TTA	2	6	3126	3131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655725
65	NC_021738	CTT	2	6	3168	3173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655725
66	NC_021738	TTGT	2	8	3222	3229	0 %	75 %	25 %	0 %	525655725
67	NC_021738	GTTT	2	8	3230	3237	0 %	75 %	25 %	0 %	525655725
68	NC_021738	ATTTT	2	10	3239	3248	20 %	80 %	0 %	0 %	525655725
69	NC_021738	AAT	2	6	3250	3255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655725
70	NC_021738	CTGC	2	8	3273	3280	0 %	25 %	25 %	50 %	525655725
71	NC_021738	CGA	2	6	3299	3304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655725
72	NC_021738	GTC	2	6	3345	3350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655725
73	NC_021738	TTTC	2	8	3450	3457	0 %	75 %	0 %	25 %	525655725
74	NC_021738	T	6	6	3491	3496	0 %	100 %	0 %	0 %	525655725
75	NC_021738	TAAA	2	8	3558	3565	75 %	25 %	0 %	0 %	525655725
76	NC_021738	ATT	2	6	3622	3627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655725
77	NC_021738	CTT	2	6	3654	3659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655725
78	NC_021738	T	6	6	3668	3673	0 %	100 %	0 %	0 %	525655725
79	NC_021738	TAG	2	6	3679	3684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655725
80	NC_021738	GAT	2	6	3771	3776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655725
81	NC_021738	GAT	2	6	3841	3846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655725
82	NC_021738	TTG	2	6	3851	3856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
83	NC_021738	GTT	2	6	3989	3994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
84	NC_021738	TTTGC	2	10	4022	4031	0 %	60 %	20 %	20 %	525655725
85	NC_021738	GTT	2	6	4082	4087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
86	NC_021738	TAA	2	6	4185	4190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655725
87	NC_021738	TTTA	2	8	4276	4283	25 %	75 %	0 %	0 %	525655725
88	NC_021738	CAT	2	6	4338	4343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655725
89	NC_021738	CAA	2	6	4390	4395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655725
90	NC_021738	ACC	2	6	4399	4404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655725
91	NC_021738	TCC	2	6	4435	4440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525655725
92	NC_021738	TTGC	2	8	4611	4618	0 %	50 %	25 %	25 %	525655725
93	NC_021738	GAAA	2	8	4631	4638	75 %	0 %	25 %	0 %	525655725
94	NC_021738	ATA	2	6	4672	4677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655725
95	NC_021738	CTG	2	6	4752	4757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655725
96	NC_021738	TAT	2	6	4819	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655725
97	NC_021738	TAC	2	6	4974	4979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655725
98	NC_021738	TTC	2	6	5034	5039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655725
99	NC_021738	TTCC	2	8	5130	5137	0 %	50 %	0 %	50 %	525655725
100	NC_021738	T	6	6	5168	5173	0 %	100 %	0 %	0 %	525655725
101	NC_021738	T	6	6	5188	5193	0 %	100 %	0 %	0 %	525655725
102	NC_021738	CGA	2	6	5202	5207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655725
103	NC_021738	TGCACC	2	12	5275	5286	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525655725
104	NC_021738	CTA	2	6	5390	5395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655725
105	NC_021738	ATT	2	6	5425	5430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655725
106	NC_021738	AG	3	6	5441	5446	50 %	0 %	50 %	0 %	525655725
107	NC_021738	AATTG	2	10	5469	5478	40 %	40 %	20 %	0 %	525655725
108	NC_021738	TAT	2	6	5493	5498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655725
109	NC_021738	T	6	6	5527	5532	0 %	100 %	0 %	0 %	525655725
110	NC_021738	TCATA	2	10	5631	5640	40 %	40 %	0 %	20 %	525655725
111	NC_021738	AAT	2	6	5721	5726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655725
112	NC_021738	GTT	2	6	5807	5812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
113	NC_021738	TTA	2	6	5813	5818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655725
114	NC_021738	CTTT	2	8	5819	5826	0 %	75 %	0 %	25 %	525655725
115	NC_021738	GAA	2	6	5859	5864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655725
116	NC_021738	TTC	2	6	5878	5883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655725
117	NC_021738	GGCA	2	8	5926	5933	25 %	0 %	50 %	25 %	525655725
118	NC_021738	ATTT	2	8	5949	5956	25 %	75 %	0 %	0 %	525655725
119	NC_021738	GAG	2	6	5961	5966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525655725
120	NC_021738	CCT	2	6	5987	5992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525655725
121	NC_021738	CAA	2	6	6018	6023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655725
122	NC_021738	GCA	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655725
123	NC_021738	TAT	2	6	6093	6098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655725
124	NC_021738	ACTA	2	8	6106	6113	50 %	25 %	0 %	25 %	525655725
125	NC_021738	TTG	2	6	6212	6217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
126	NC_021738	CAT	2	6	6297	6302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655725
127	NC_021738	ACA	2	6	6308	6313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655725
128	NC_021738	CAG	2	6	6321	6326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655725
129	NC_021738	AAG	2	6	6351	6356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655725
130	NC_021738	TAA	2	6	6415	6420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021738	A	6	6	6419	6424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021738	TA	3	6	6479	6484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021738	AGT	2	6	6494	6499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021738	ATT	2	6	6511	6516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021738	TCA	2	6	6521	6526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021738	GGTTC	2	10	6756	6765	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_021738	TGA	2	6	6832	6837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021738	ATG	2	6	6884	6889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021738	AAG	2	6	7069	7074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021738	ATA	2	6	7225	7230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021738	TG	3	6	7272	7277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021738	CAA	2	6	7305	7310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_021738	AGCA	2	8	7358	7365	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021738	AGA	2	6	7401	7406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021738	AATC	2	8	7472	7479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_021738	AAC	2	6	7512	7517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655726
147	NC_021738	TTA	2	6	7542	7547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655726
148	NC_021738	AGA	2	6	7556	7561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655726
149	NC_021738	CAA	2	6	7626	7631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655726
150	NC_021738	GGT	2	6	7644	7649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655726
151	NC_021738	A	6	6	7691	7696	100 %	0 %	0 %	0 %	525655726
152	NC_021738	TGA	2	6	7703	7708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655726
153	NC_021738	TGT	2	6	7724	7729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655726
154	NC_021738	CAG	2	6	7807	7812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655726
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157	NC_021738	AAGA	2	8	7941	7948	75 %	0 %	25 %	0 %	525655726
158	NC_021738	AC	3	6	7980	7985	50 %	0 %	0 %	50 %	525655726
159	NC_021738	CAA	2	6	8052	8057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655726
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161	NC_021738	TTTA	2	8	8248	8255	25 %	75 %	0 %	0 %	525655726
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164	NC_021738	GACA	2	8	8544	8551	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
165	NC_021738	TCT	2	6	8590	8595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_021738	TA	3	6	8624	8629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_021738	A	6	6	8693	8698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_021738	TGCC	2	8	8795	8802	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
169	NC_021738	CAA	2	6	8850	8855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_021738	TTA	2	6	8865	8870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_021738	T	6	6	8883	8888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_021738	GAT	2	6	8903	8908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_021738	CTT	2	6	9011	9016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655727
176	NC_021738	TCA	2	6	9025	9030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655727
177	NC_021738	TTG	2	6	9045	9050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655727
178	NC_021738	A	6	6	9063	9068	100 %	0 %	0 %	0 %	525655727
179	NC_021738	CTGT	2	8	9112	9119	0 %	50 %	25 %	25 %	525655727
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185	NC_021738	ATC	2	6	9540	9545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655727
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404	NC_021738	TTCAC	2	10	20606	20615	20 %	40 %	0 %	40 %	525655735
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406	NC_021738	CCG	2	6	20825	20830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655735
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