MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanomassiliicoccus sp. Mx1-Issoire

Total Repeats: 39890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021353	T	7	7	38	44	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021353	TCTT	2	8	94	101	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021353	TTCT	2	8	103	110	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021353	CTT	2	6	111	116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021353	TAT	2	6	124	129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021353	AATAT	2	10	130	139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021353	TAG	2	6	142	147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021353	T	8	8	181	188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021353	CTT	2	6	199	204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021353	ATTTTT	2	12	218	229	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021353	T	7	7	225	231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021353	GTT	2	6	241	246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021353	GTA	2	6	318	323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021353	CTA	2	6	367	372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021353	CT	3	6	399	404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021353	CTT	2	6	407	412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021353	GCA	2	6	453	458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021353	CTT	2	6	497	502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021353	TCA	2	6	515	520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021353	TTC	2	6	521	526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021353	GAA	2	6	549	554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021353	ACA	2	6	585	590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	511058889
23	NC_021353	TGA	2	6	676	681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058889
24	NC_021353	AGAT	2	8	702	709	50 %	25 %	25 %	0 %	511058889
25	NC_021353	GAG	2	6	741	746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	511058889
26	NC_021353	ATC	2	6	923	928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511058889
27	NC_021353	CTGG	2	8	957	964	0 %	25 %	50 %	25 %	511058889
28	NC_021353	ACA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	511058889
29	NC_021353	AG	3	6	992	997	50 %	0 %	50 %	0 %	511058889
30	NC_021353	ATC	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511058889
31	NC_021353	GAT	2	6	1070	1075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058889
32	NC_021353	ATG	2	6	1101	1106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058889
33	NC_021353	GCA	2	6	1185	1190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058889
34	NC_021353	CCG	2	6	1304	1309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	511058889
35	NC_021353	AGAA	2	8	1390	1397	75 %	0 %	25 %	0 %	511058889
36	NC_021353	GAC	2	6	1403	1408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058889
37	NC_021353	TGA	2	6	1509	1514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058889
38	NC_021353	ATA	2	6	1517	1522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	511058889
39	NC_021353	GAA	2	6	1529	1534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058889
40	NC_021353	TC	3	6	1587	1592	0 %	50 %	0 %	50 %	511058889
41	NC_021353	ATG	2	6	1655	1660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058889
42	NC_021353	GGC	2	6	1697	1702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	511058889
43	NC_021353	A	7	7	1745	1751	100 %	0 %	0 %	0 %	511058889
44	NC_021353	GAA	2	6	1757	1762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058889
45	NC_021353	TTC	2	6	1770	1775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511058889
46	NC_021353	A	6	6	1798	1803	100 %	0 %	0 %	0 %	511058889
47	NC_021353	AAC	2	6	1807	1812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	511058889
48	NC_021353	CTTTTT	2	12	1825	1836	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	511058890
49	NC_021353	CTG	2	6	1928	1933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511058890
50	NC_021353	TTC	2	6	2011	2016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511058890
51	NC_021353	T	6	6	2117	2122	0 %	100 %	0 %	0 %	511058890
52	NC_021353	ATTT	2	8	2125	2132	25 %	75 %	0 %	0 %	511058890
53	NC_021353	T	6	6	2162	2167	0 %	100 %	0 %	0 %	511058890
54	NC_021353	GCC	2	6	2203	2208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	511058890
55	NC_021353	TCA	2	6	2273	2278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511058890
56	NC_021353	TAT	2	6	2305	2310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	511058890
57	NC_021353	TGT	2	6	2398	2403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	511058890
58	NC_021353	TGC	2	6	2483	2488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511058890
59	NC_021353	ACT	2	6	2507	2512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511058890
60	NC_021353	GGC	2	6	2516	2521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	511058890
61	NC_021353	TAA	2	6	2562	2567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	511058890
62	NC_021353	TTA	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	511058890
63	NC_021353	A	6	6	2645	2650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021353	TAA	2	6	2689	2694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021353	GATA	2	8	2695	2702	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021353	ATG	2	6	2745	2750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058891
67	NC_021353	CCA	2	6	2781	2786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	511058891
68	NC_021353	A	6	6	2832	2837	100 %	0 %	0 %	0 %	511058891
69	NC_021353	TAC	2	6	2845	2850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511058891
70	NC_021353	GTTAG	2	10	2903	2912	20 %	40 %	40 %	0 %	511058891
71	NC_021353	GGC	2	6	2986	2991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	511058891
72	NC_021353	TG	3	6	3044	3049	0 %	50 %	50 %	0 %	511058891
73	NC_021353	AAG	2	6	3084	3089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058891
74	NC_021353	GAT	2	6	3101	3106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058891
75	NC_021353	GAG	2	6	3157	3162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	511058891
76	NC_021353	TTC	2	6	3225	3230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021353	CAA	2	6	3239	3244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021353	T	6	6	3308	3313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021353	AAT	2	6	3318	3323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021353	TA	3	6	3346	3351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021353	GA	4	8	3382	3389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021353	AGAA	2	8	3475	3482	75 %	0 %	25 %	0 %	511058892
83	NC_021353	CTT	2	6	3483	3488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511058892
84	NC_021353	CAG	2	6	3522	3527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058892
85	NC_021353	AAG	2	6	3598	3603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058892
86	NC_021353	ACG	2	6	3622	3627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058892
87	NC_021353	GCA	3	9	3630	3638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058892
88	NC_021353	AGCTGT	2	12	3644	3655	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	511058892
89	NC_021353	AGA	2	6	3658	3663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058892
90	NC_021353	ATG	2	6	3678	3683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058892
91	NC_021353	CAA	2	6	3690	3695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	511058892
92	NC_021353	TGC	2	6	3713	3718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511058892
93	NC_021353	TCT	2	6	3783	3788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511058893
94	NC_021353	AGGA	2	8	3836	3843	50 %	0 %	50 %	0 %	511058893
95	NC_021353	GC	3	6	3936	3941	0 %	0 %	50 %	50 %	511058893
96	NC_021353	CAA	2	6	3989	3994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	511058893
97	NC_021353	TCG	2	6	4025	4030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511058893
98	NC_021353	CAGAC	2	10	4048	4057	40 %	0 %	20 %	40 %	511058893
99	NC_021353	TTG	2	6	4084	4089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	511058893
100	NC_021353	A	6	6	4099	4104	100 %	0 %	0 %	0 %	511058893
101	NC_021353	TCA	2	6	4138	4143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511058893
102	NC_021353	GAAT	2	8	4206	4213	50 %	25 %	25 %	0 %	511058893
103	NC_021353	AGA	2	6	4272	4277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058893
104	NC_021353	AGA	2	6	4398	4403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058893
105	NC_021353	TGA	2	6	4461	4466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058893
106	NC_021353	TCG	3	9	4478	4486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511058893
107	NC_021353	TAT	2	6	4622	4627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	511058893
108	NC_021353	AGA	2	6	4644	4649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058893
109	NC_021353	ATG	2	6	4670	4675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058893
110	NC_021353	AGTAGA	2	12	4686	4697	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	511058893
111	NC_021353	GAA	2	6	4699	4704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058893
112	NC_021353	TTC	2	6	4750	4755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511058893
113	NC_021353	CTC	2	6	4772	4777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	511058893
114	NC_021353	TCT	2	6	4884	4889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511058893
115	NC_021353	AAG	2	6	4896	4901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058893
116	NC_021353	GAA	2	6	4912	4917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058893
117	NC_021353	TGC	2	6	5013	5018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511058893
118	NC_021353	GGTA	2	8	5160	5167	25 %	25 %	50 %	0 %	511058893
119	NC_021353	TTA	2	6	5179	5184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	511058893
120	NC_021353	TAA	2	6	5189	5194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	511058893
121	NC_021353	ACA	2	6	5204	5209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	511058893
122	NC_021353	AGC	2	6	5232	5237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058893
123	NC_021353	TTG	2	6	5300	5305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	511058893
124	NC_021353	ATC	2	6	5425	5430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511058893
125	NC_021353	AAT	2	6	5619	5624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	511058893
126	NC_021353	AAT	2	6	5715	5720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	511058893
127	NC_021353	AC	3	6	5727	5732	50 %	0 %	0 %	50 %	511058893
128	NC_021353	GGA	2	6	5742	5747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	511058893
129	NC_021353	AG	3	6	5975	5980	50 %	0 %	50 %	0 %	511058894
130	NC_021353	CGA	2	6	6010	6015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058895
131	NC_021353	AAG	2	6	6036	6041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058895
132	NC_021353	CAA	2	6	6214	6219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	511058895
133	NC_021353	GGC	2	6	6293	6298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	511058895
134	NC_021353	AAG	2	6	6305	6310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058895
135	NC_021353	TCG	2	6	6312	6317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511058895
136	NC_021353	GA	3	6	6366	6371	50 %	0 %	50 %	0 %	511058895
137	NC_021353	GAAA	2	8	6517	6524	75 %	0 %	25 %	0 %	511058895
138	NC_021353	TTACGC	2	12	6597	6608	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	511058896
139	NC_021353	A	7	7	6628	6634	100 %	0 %	0 %	0 %	511058896
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162	NC_021353	GTA	2	6	7848	7853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058897
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248	NC_021353	ATT	2	6	11773	11778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_021353	ATT	2	6	11852	11857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_021353	AT	3	6	11897	11902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_021353	GTA	2	6	11925	11930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_021353	ATA	2	6	12060	12065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	511058901
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264	NC_021353	GA	3	6	12367	12372	50 %	0 %	50 %	0 %	511058901
265	NC_021353	TCAT	2	8	12393	12400	25 %	50 %	0 %	25 %	511058901
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267	NC_021353	TCT	2	6	12435	12440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511058901
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398	NC_021353	GAAT	2	8	17787	17794	50 %	25 %	25 %	0 %	511058906
399	NC_021353	ATA	2	6	17885	17890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	511058906
400	NC_021353	AATG	2	8	17941	17948	50 %	25 %	25 %	0 %	511058906
401	NC_021353	AT	3	6	17960	17965	50 %	50 %	0 %	0 %	511058906
402	NC_021353	CAG	2	6	17986	17991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058906
403	NC_021353	ACA	2	6	17997	18002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	511058906
404	NC_021353	ATC	2	6	18005	18010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511058906
405	NC_021353	AATG	2	8	18061	18068	50 %	25 %	25 %	0 %	511058906
406	NC_021353	ATC	2	6	18206	18211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511058906
407	NC_021353	T	7	7	18297	18303	0 %	100 %	0 %	0 %	511058906
408	NC_021353	TGA	2	6	18351	18356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058906
409	NC_021353	ACT	2	6	18407	18412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511058906
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411	NC_021353	CTG	2	6	18525	18530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511058906
412	NC_021353	TGCT	2	8	18590	18597	0 %	50 %	25 %	25 %	511058906
413	NC_021353	T	6	6	18640	18645	0 %	100 %	0 %	0 %	511058906
414	NC_021353	AATC	2	8	18702	18709	50 %	25 %	0 %	25 %	511058906
415	NC_021353	CGA	2	6	18726	18731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058906
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419	NC_021353	CTT	2	6	18879	18884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511058906
420	NC_021353	AT	3	6	18907	18912	50 %	50 %	0 %	0 %	511058906
421	NC_021353	CCTT	2	8	18955	18962	0 %	50 %	0 %	50 %	511058906
422	NC_021353	CTTT	2	8	18963	18970	0 %	75 %	0 %	25 %	511058906
423	NC_021353	GTT	2	6	19021	19026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	511058906
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425	NC_021353	CTAAT	2	10	19068	19077	40 %	40 %	0 %	20 %	511058906
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428	NC_021353	CGC	2	6	19324	19329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	511058907
429	NC_021353	GAC	2	6	19450	19455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058908
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431	NC_021353	TCT	2	6	19524	19529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511058908
432	NC_021353	ATT	2	6	19612	19617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_021353	TAA	2	6	19651	19656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_021353	GTTTAC	2	12	19695	19706	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
435	NC_021353	T	6	6	19713	19718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_021353	CATT	2	8	19723	19730	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
437	NC_021353	GAAA	2	8	19815	19822	75 %	0 %	25 %	0 %	511058909
438	NC_021353	TAC	2	6	19833	19838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511058909
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442	NC_021353	GGC	2	6	20109	20114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	511058909
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451	NC_021353	GGC	2	6	20659	20664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	511058910
452	NC_021353	ATG	2	6	20670	20675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058910
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454	NC_021353	CTG	2	6	21063	21068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_021353	TTCAA	2	10	21096	21105	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
456	NC_021353	TC	3	6	21120	21125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
457	NC_021353	TAA	2	6	21241	21246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_021353	ATGAT	2	10	21268	21277	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
459	NC_021353	TAG	2	6	21289	21294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
460	NC_021353	AGAA	2	8	21333	21340	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
461	NC_021353	AT	3	6	21450	21455	50 %	50 %	0 %	0 %	511058911
462	NC_021353	AGA	2	6	21464	21469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058911
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480	NC_021353	TGAT	2	8	22447	22454	25 %	50 %	25 %	0 %	511058911
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482	NC_021353	ATT	2	6	22540	22545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_021353	TCA	2	6	22554	22559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
484	NC_021353	ATT	2	6	22582	22587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_021353	TTTC	2	8	22795	22802	0 %	75 %	0 %	25 %	511058912
486	NC_021353	T	7	7	22826	22832	0 %	100 %	0 %	0 %	511058912
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497	NC_021353	CAGC	2	8	23215	23222	25 %	0 %	25 %	50 %	511058912
498	NC_021353	TTC	2	6	23274	23279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511058912
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