MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5079

Total Repeats: 109843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_021251	GCC	2	6	553022	553027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506924868
13502	NC_021251	AGT	2	6	553033	553038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506924868
13503	NC_021251	GTG	2	6	553090	553095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506924868
13504	NC_021251	CCA	2	6	553142	553147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506924868
13505	NC_021251	CG	3	6	553192	553197	0 %	0 %	50 %	50 %	506924868
13506	NC_021251	GTT	2	6	553222	553227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	506924869
13507	NC_021251	TGC	2	6	553249	553254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506924869
13508	NC_021251	TCG	2	6	553260	553265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506924869
13509	NC_021251	GCCC	2	8	553275	553282	0 %	0 %	25 %	75 %	506924869
13510	NC_021251	CAGCC	2	10	553425	553434	20 %	0 %	20 %	60 %	506924869
13511	NC_021251	GGC	2	6	553469	553474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506924869
13512	NC_021251	CCAC	2	8	553495	553502	25 %	0 %	0 %	75 %	506924869
13513	NC_021251	GCC	2	6	553595	553600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506924869
13514	NC_021251	GGA	2	6	553604	553609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506924869
13515	NC_021251	CGT	2	6	553771	553776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506924869
13516	NC_021251	CGT	2	6	553795	553800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506924869
13517	NC_021251	GCA	2	6	553816	553821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506924869
13518	NC_021251	CGG	2	6	553945	553950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506924869
13519	NC_021251	CTG	2	6	553964	553969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506924869
13520	NC_021251	CTG	2	6	553986	553991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506924869
13521	NC_021251	GCA	2	6	554026	554031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506924869
13522	NC_021251	TTG	2	6	554055	554060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	506924869
13523	NC_021251	CGG	2	6	554088	554093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506924869
13524	NC_021251	GTG	2	6	554117	554122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506924869
13525	NC_021251	AGT	2	6	554194	554199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506924869
13526	NC_021251	CTC	2	6	554258	554263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506924869
13527	NC_021251	CGG	2	6	554269	554274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506924869
13528	NC_021251	GGT	2	6	554285	554290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506924869
13529	NC_021251	ACC	2	6	554316	554321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506924869
13530	NC_021251	GTC	2	6	554435	554440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506924869
13531	NC_021251	GCA	3	9	554488	554496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506924869
13532	NC_021251	CGT	2	6	554518	554523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506924869
13533	NC_021251	TGC	2	6	554695	554700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13534	NC_021251	GAG	2	6	554770	554775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_021251	A	6	6	554805	554810	100 %	0 %	0 %	0 %	506924870
13536	NC_021251	TGCCCG	2	12	554815	554826	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	506924870
13537	NC_021251	CG	3	6	554883	554888	0 %	0 %	50 %	50 %	506924870
13538	NC_021251	CGGCTG	2	12	554892	554903	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	506924870
13539	NC_021251	GAG	2	6	554964	554969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506924870
13540	NC_021251	ACCC	2	8	554970	554977	25 %	0 %	0 %	75 %	506924870
13541	NC_021251	TGG	2	6	555001	555006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506924870
13542	NC_021251	TGC	2	6	555037	555042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506924870
13543	NC_021251	GGT	2	6	555076	555081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506924870
13544	NC_021251	GGC	2	6	555114	555119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506924870
13545	NC_021251	CGA	2	6	555185	555190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506924870
13546	NC_021251	GAT	2	6	555267	555272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506924870
13547	NC_021251	AAC	2	6	555333	555338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	506924870
13548	NC_021251	GCT	2	6	555386	555391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506924870
13549	NC_021251	ATC	2	6	555456	555461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506924870
13550	NC_021251	CGA	2	6	555548	555553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506924870
13551	NC_021251	GAC	2	6	555807	555812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13552	NC_021251	TGTC	2	8	555863	555870	0 %	50 %	25 %	25 %	506924871
13553	NC_021251	CAG	2	6	555901	555906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506924871
13554	NC_021251	CCG	2	6	555953	555958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506924871
13555	NC_021251	CGT	2	6	555963	555968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506924871
13556	NC_021251	GAG	2	6	555991	555996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506924871
13557	NC_021251	CGC	2	6	556009	556014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506924871
13558	NC_021251	AGC	2	6	556034	556039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506924871
13559	NC_021251	GC	3	6	556070	556075	0 %	0 %	50 %	50 %	506924871
13560	NC_021251	CAG	2	6	556096	556101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506924871
13561	NC_021251	GC	3	6	556104	556109	0 %	0 %	50 %	50 %	506924871
13562	NC_021251	GGT	2	6	556218	556223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506924871
13563	NC_021251	CCG	2	6	556224	556229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506924871
13564	NC_021251	CAA	2	6	556233	556238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	506924871
13565	NC_021251	GC	3	6	556248	556253	0 %	0 %	50 %	50 %	506924871
13566	NC_021251	CTGG	2	8	556296	556303	0 %	25 %	50 %	25 %	506924871
13567	NC_021251	GGC	2	6	556336	556341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506924871
13568	NC_021251	GC	3	6	556340	556345	0 %	0 %	50 %	50 %	506924871
13569	NC_021251	CGC	2	6	556377	556382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506924871
13570	NC_021251	GGA	2	6	556404	556409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506924871
13571	NC_021251	GAA	2	6	556425	556430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506924871
13572	NC_021251	GGC	2	6	556444	556449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506924871
13573	NC_021251	CAG	2	6	556468	556473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506924871
13574	NC_021251	GCTCG	2	10	556495	556504	0 %	20 %	40 %	40 %	506924871
13575	NC_021251	GGT	2	6	556530	556535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506924871
13576	NC_021251	GGC	2	6	556557	556562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506924871
13577	NC_021251	CGA	2	6	556584	556589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506924871
13578	NC_021251	TCA	2	6	556604	556609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506924871
13579	NC_021251	TGGA	2	8	556708	556715	25 %	25 %	50 %	0 %	506924871
13580	NC_021251	GCC	2	6	556738	556743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506924871
13581	NC_021251	CGA	2	6	556833	556838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506924871
13582	NC_021251	CCA	2	6	556841	556846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506924871
13583	NC_021251	TCA	2	6	556895	556900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506924871
13584	NC_021251	ACT	2	6	556925	556930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506924871
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13586	NC_021251	GAA	2	6	557011	557016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506924871
13587	NC_021251	CCA	2	6	557078	557083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506924871
13588	NC_021251	TCG	2	6	557098	557103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506924871
13589	NC_021251	ACC	2	6	557104	557109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506924871
13590	NC_021251	GCG	2	6	557179	557184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13591	NC_021251	GAG	2	6	557219	557224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13592	NC_021251	GCGAT	2	10	557234	557243	20 %	20 %	40 %	20 %	506924872
13593	NC_021251	GCCG	2	8	557334	557341	0 %	0 %	50 %	50 %	506924872
13594	NC_021251	CGAGCG	2	12	557415	557426	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	506924872
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13598	NC_021251	CCA	2	6	557624	557629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506924872
13599	NC_021251	AGC	2	6	557630	557635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506924872
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13601	NC_021251	TGC	2	6	557678	557683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506924872
13602	NC_021251	CGA	2	6	557715	557720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506924872
13603	NC_021251	GCC	3	9	557722	557730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506924872
13604	NC_021251	GC	3	6	557731	557736	0 %	0 %	50 %	50 %	506924872
13605	NC_021251	GGA	2	6	557739	557744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506924872
13606	NC_021251	GTT	2	6	557893	557898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	506924872
13607	NC_021251	GAA	2	6	557986	557991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506924872
13608	NC_021251	TGC	2	6	558026	558031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506924872
13609	NC_021251	GAAA	2	8	558056	558063	75 %	0 %	25 %	0 %	506924872
13610	NC_021251	GTA	2	6	558183	558188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13611	NC_021251	CGGC	2	8	558215	558222	0 %	0 %	50 %	50 %	506924873
13612	NC_021251	ACG	2	6	558266	558271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506924873
13613	NC_021251	CGA	2	6	558276	558281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506924873
13614	NC_021251	GAA	2	6	558355	558360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506924873
13615	NC_021251	GCT	2	6	558420	558425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506924873
13616	NC_021251	GTG	2	6	558446	558451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506924873
13617	NC_021251	TGC	3	9	558710	558718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506924873
13618	NC_021251	GAA	2	6	558808	558813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506924873
13619	NC_021251	GGC	2	6	558867	558872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506924873
13620	NC_021251	TGC	2	6	558899	558904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506924873
13621	NC_021251	AGC	2	6	558905	558910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506924873
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13627	NC_021251	CCGG	2	8	559150	559157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13628	NC_021251	GC	3	6	559168	559173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13632	NC_021251	CTT	2	6	559518	559523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506924874
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13645	NC_021251	GTC	2	6	559984	559989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506924874
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13648	NC_021251	GGC	2	6	560145	560150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13649	NC_021251	GC	3	6	560206	560211	0 %	0 %	50 %	50 %	506924875
13650	NC_021251	CAG	2	6	560241	560246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506924875
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13654	NC_021251	GTAG	2	8	560437	560444	25 %	25 %	50 %	0 %	506924875
13655	NC_021251	CAT	2	6	560453	560458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506924875
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13692	NC_021251	TCACGG	2	12	561732	561743	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	506924877
13693	NC_021251	TAC	2	6	561796	561801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13694	NC_021251	CTG	2	6	561817	561822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13695	NC_021251	CG	5	10	561833	561842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13696	NC_021251	GTC	2	6	561859	561864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13707	NC_021251	ATC	2	6	562265	562270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506924878
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13725	NC_021251	GC	3	6	562880	562885	0 %	0 %	50 %	50 %	506924878
13726	NC_021251	CGG	2	6	562908	562913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506924878
13727	NC_021251	GAC	2	6	562952	562957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506924878
13728	NC_021251	GCGG	2	8	563062	563069	0 %	0 %	75 %	25 %	506924878
13729	NC_021251	ATC	2	6	563111	563116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506924878
13730	NC_021251	AGCC	2	8	563149	563156	25 %	0 %	25 %	50 %	506924878
13731	NC_021251	TGT	2	6	563259	563264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	506924878
13732	NC_021251	AGCA	2	8	563294	563301	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13733	NC_021251	TGG	2	6	563315	563320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13734	NC_021251	GTC	2	6	563358	563363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506924879
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13737	NC_021251	CCA	2	6	563390	563395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506924879
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13740	NC_021251	GC	3	6	563601	563606	0 %	0 %	50 %	50 %	506924879
13741	NC_021251	CAT	2	6	563649	563654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506924879
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13845	NC_021251	GC	4	8	568181	568188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13846	NC_021251	CGA	2	6	568218	568223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13848	NC_021251	GC	4	8	568237	568244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13849	NC_021251	CGA	2	6	568274	568279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13851	NC_021251	GC	4	8	568293	568300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13852	NC_021251	GTT	2	6	568329	568334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	506924887
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13862	NC_021251	TCA	2	6	568980	568985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506924888
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13891	NC_021251	GGC	2	6	570001	570006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13892	NC_021251	GC	3	6	570010	570015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13893	NC_021251	C	6	6	570103	570108	0 %	0 %	0 %	100 %	506924889
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13935	NC_021251	CATC	2	8	571825	571832	25 %	25 %	0 %	50 %	506924890
13936	NC_021251	ATCGGC	2	12	571846	571857	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	506924890
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13945	NC_021251	ACG	2	6	572196	572201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13948	NC_021251	CAG	2	6	572267	572272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13949	NC_021251	GAA	2	6	572308	572313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13952	NC_021251	CGGT	2	8	572470	572477	0 %	25 %	50 %	25 %	506924891
13953	NC_021251	CTG	2	6	572541	572546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506924891
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13970	NC_021251	GCT	2	6	573356	573361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506924891
13971	NC_021251	CGA	2	6	573380	573385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506924891
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13973	NC_021251	GGC	2	6	573443	573448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506924891
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13975	NC_021251	GGCA	2	8	573524	573531	25 %	0 %	50 %	25 %	506924891
13976	NC_021251	GCG	2	6	573575	573580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506924891
13977	NC_021251	GC	3	6	573586	573591	0 %	0 %	50 %	50 %	506924891
13978	NC_021251	CG	3	6	573655	573660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13979	NC_021251	GTCCG	2	10	573732	573741	0 %	20 %	40 %	40 %	506924892
13980	NC_021251	CG	3	6	573762	573767	0 %	0 %	50 %	50 %	506924892
13981	NC_021251	GCA	2	6	573800	573805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506924892
13982	NC_021251	GAC	2	6	573806	573811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506924892
13983	NC_021251	GCT	2	6	573826	573831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506924892
13984	NC_021251	CGG	2	6	573877	573882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506924892
13985	NC_021251	TGC	2	6	573897	573902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506924892
13986	NC_021251	GGT	2	6	573979	573984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506924892
13987	NC_021251	GTG	2	6	574016	574021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506924892
13988	NC_021251	CCCA	2	8	574058	574065	25 %	0 %	0 %	75 %	506924892
13989	NC_021251	CGC	2	6	574078	574083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506924892
13990	NC_021251	TGC	2	6	574089	574094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506924892
13991	NC_021251	GC	3	6	574093	574098	0 %	0 %	50 %	50 %	506924892
13992	NC_021251	TAC	2	6	574121	574126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506924892
13993	NC_021251	ACT	2	6	574143	574148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506924892
13994	NC_021251	GGCT	2	8	574166	574173	0 %	25 %	50 %	25 %	506924892
13995	NC_021251	GC	3	6	574175	574180	0 %	0 %	50 %	50 %	506924892
13996	NC_021251	CA	3	6	574212	574217	50 %	0 %	0 %	50 %	506924892
13997	NC_021251	GCC	2	6	574223	574228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506924892
13998	NC_021251	GAA	2	6	574231	574236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506924892
13999	NC_021251	CGACGG	2	12	574249	574260	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	506924892
14000	NC_021251	GCC	2	6	574267	574272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506924892

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