MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021200	CTG	2	6	113782	113787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074496
3002	NC_021200	GCG	2	6	113803	113808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074496
3003	NC_021200	GTC	2	6	113821	113826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074496
3004	NC_021200	CGGCG	2	10	113839	113848	0 %	0 %	60 %	40 %	499074496
3005	NC_021200	GCC	2	6	113926	113931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3006	NC_021200	ACCG	2	8	113932	113939	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3007	NC_021200	TGGG	2	8	113980	113987	0 %	25 %	75 %	0 %	499074497
3008	NC_021200	GCG	2	6	114005	114010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074497
3009	NC_021200	CTG	2	6	114025	114030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074497
3010	NC_021200	TCG	2	6	114035	114040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074497
3011	NC_021200	GCC	2	6	114043	114048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074497
3012	NC_021200	CG	3	6	114058	114063	0 %	0 %	50 %	50 %	499074497
3013	NC_021200	TGC	2	6	114083	114088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074497
3014	NC_021200	GGC	2	6	114119	114124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074497
3015	NC_021200	CGGCG	2	10	114186	114195	0 %	0 %	60 %	40 %	499074497
3016	NC_021200	CGG	2	6	114200	114205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074497
3017	NC_021200	GGC	2	6	114243	114248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074497
3018	NC_021200	TTCG	2	8	114315	114322	0 %	50 %	25 %	25 %	499074497
3019	NC_021200	GCT	3	9	114333	114341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074497
3020	NC_021200	TGA	2	6	114356	114361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074497
3021	NC_021200	CGC	2	6	114389	114394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074497
3022	NC_021200	TGC	2	6	114419	114424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074497
3023	NC_021200	GCG	2	6	114464	114469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074497
3024	NC_021200	CTGT	2	8	114492	114499	0 %	50 %	25 %	25 %	499074497
3025	NC_021200	ACC	2	6	114503	114508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074497
3026	NC_021200	TTC	2	6	114544	114549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074497
3027	NC_021200	CAC	2	6	114550	114555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074497
3028	NC_021200	CGC	2	6	114632	114637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074497
3029	NC_021200	CAT	2	6	114663	114668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074497
3030	NC_021200	CGA	2	6	114753	114758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074497
3031	NC_021200	TCG	2	6	114760	114765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074497
3032	NC_021200	GCT	3	9	114771	114779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074497
3033	NC_021200	TGC	2	6	114791	114796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074497
3034	NC_021200	TCG	2	6	114833	114838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074497
3035	NC_021200	TGG	2	6	114842	114847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074497
3036	NC_021200	CCG	3	9	114857	114865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074497
3037	NC_021200	TGA	2	6	114872	114877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074497
3038	NC_021200	GCA	2	6	114971	114976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074497
3039	NC_021200	CCG	2	6	114987	114992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074497
3040	NC_021200	GGT	2	6	114996	115001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074497
3041	NC_021200	CCG	2	6	115013	115018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074497
3042	NC_021200	GCG	2	6	115076	115081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074497
3043	NC_021200	CGC	2	6	115143	115148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074497
3044	NC_021200	GCT	2	6	115197	115202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074497
3045	NC_021200	GTT	2	6	115227	115232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074497
3046	NC_021200	GCC	2	6	115257	115262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074497
3047	NC_021200	CAC	2	6	115299	115304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074497
3048	NC_021200	GCCG	2	8	115305	115312	0 %	0 %	50 %	50 %	499074497
3049	NC_021200	TGG	2	6	115333	115338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074497
3050	NC_021200	CGG	2	6	115353	115358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074497
3051	NC_021200	GCC	2	6	115365	115370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074497
3052	NC_021200	GGCA	2	8	115411	115418	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3053	NC_021200	GGC	2	6	115443	115448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_021200	GC	3	6	115447	115452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3055	NC_021200	CAC	2	6	115476	115481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_021200	GT	3	6	115502	115507	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_021200	GT	3	6	115522	115527	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_021200	CGG	2	6	115533	115538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_021200	AC	3	6	115566	115571	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3060	NC_021200	GAT	2	6	115684	115689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074498
3061	NC_021200	TTG	2	6	115721	115726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074498
3062	NC_021200	CCA	2	6	115752	115757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074498
3063	NC_021200	GGT	2	6	115800	115805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074498
3064	NC_021200	TGGA	2	8	115826	115833	25 %	25 %	50 %	0 %	499074498
3065	NC_021200	TCA	2	6	115839	115844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074498
3066	NC_021200	TCG	2	6	115847	115852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074498
3067	NC_021200	TGA	2	6	115884	115889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074498
3068	NC_021200	GAT	2	6	115957	115962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074498
3069	NC_021200	AGGTTG	2	12	115988	115999	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	499074498
3070	NC_021200	CGC	3	9	116037	116045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074498
3071	NC_021200	CGT	2	6	116046	116051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074498
3072	NC_021200	CGG	2	6	116098	116103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074498
3073	NC_021200	GGC	2	6	116203	116208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074498
3074	NC_021200	ATC	2	6	116267	116272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074498
3075	NC_021200	CAG	2	6	116275	116280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074498
3076	NC_021200	TGG	2	6	116300	116305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074498
3077	NC_021200	CGG	2	6	116325	116330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074498
3078	NC_021200	GTC	2	6	116359	116364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074498
3079	NC_021200	CCT	2	6	116376	116381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074498
3080	NC_021200	GCA	2	6	116388	116393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074498
3081	NC_021200	CGA	2	6	116445	116450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074498
3082	NC_021200	GAT	2	6	116629	116634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074498
3083	NC_021200	CGT	2	6	116760	116765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074498
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3087	NC_021200	GTC	2	6	116914	116919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074498
3088	NC_021200	AGC	2	6	116951	116956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074498
3089	NC_021200	AGT	2	6	117033	117038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074498
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3091	NC_021200	CGA	2	6	117111	117116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074498
3092	NC_021200	CGA	2	6	117219	117224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074498
3093	NC_021200	CGA	2	6	117264	117269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074498
3094	NC_021200	GCC	2	6	117283	117288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074498
3095	NC_021200	CGA	4	12	117291	117302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074498
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3097	NC_021200	TCC	2	6	117353	117358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074498
3098	NC_021200	CCGCA	2	10	117383	117392	20 %	0 %	20 %	60 %	499074498
3099	NC_021200	AGC	2	6	117443	117448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_021200	CGC	2	6	117507	117512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3101	NC_021200	TGG	2	6	117517	117522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_021200	GC	3	6	117532	117537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_021200	GC	3	6	117558	117563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3104	NC_021200	TGT	2	6	117608	117613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074499
3105	NC_021200	CTT	2	6	117639	117644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074499
3106	NC_021200	TTCA	2	8	117709	117716	25 %	50 %	0 %	25 %	499074499
3107	NC_021200	CCG	2	6	117720	117725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074499
3108	NC_021200	TGT	2	6	117741	117746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074499
3109	NC_021200	GTC	2	6	117811	117816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074499
3110	NC_021200	TCG	2	6	117818	117823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074499
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3112	NC_021200	GC	3	6	117842	117847	0 %	0 %	50 %	50 %	499074499
3113	NC_021200	CGG	2	6	117861	117866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074499
3114	NC_021200	GCCC	2	8	117906	117913	0 %	0 %	25 %	75 %	499074499
3115	NC_021200	CGG	2	6	117939	117944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074499
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3118	NC_021200	GGC	2	6	118132	118137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074499
3119	NC_021200	GTG	2	6	118153	118158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074499
3120	NC_021200	TGGG	2	8	118200	118207	0 %	25 %	75 %	0 %	499074499
3121	NC_021200	CGTCA	2	10	118231	118240	20 %	20 %	20 %	40 %	499074499
3122	NC_021200	CG	4	8	118317	118324	0 %	0 %	50 %	50 %	499074499
3123	NC_021200	CGCA	2	8	118343	118350	25 %	0 %	25 %	50 %	499074499
3124	NC_021200	GCC	2	6	118374	118379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074499
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3128	NC_021200	CGA	2	6	118692	118697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074499
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3130	NC_021200	CGC	2	6	118776	118781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074499
3131	NC_021200	CGA	2	6	118789	118794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074499
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3134	NC_021200	CGC	2	6	118942	118947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074499
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3138	NC_021200	GGC	2	6	119108	119113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074500
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3239	NC_021200	ACGCC	2	10	123455	123464	20 %	0 %	20 %	60 %	499074503
3240	NC_021200	GAT	2	6	123465	123470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074503
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3242	NC_021200	AC	3	6	123516	123521	50 %	0 %	0 %	50 %	499074503
3243	NC_021200	CGG	2	6	123524	123529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074503
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3245	NC_021200	GGT	2	6	123554	123559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074503
3246	NC_021200	CGT	2	6	123566	123571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074503
3247	NC_021200	CGG	2	6	123593	123598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074503
3248	NC_021200	TCG	2	6	123659	123664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074503
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3250	NC_021200	GCC	2	6	123719	123724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3251	NC_021200	CCGGG	2	10	123790	123799	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3252	NC_021200	CGC	2	6	123967	123972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074504
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3262	NC_021200	G	6	6	124606	124611	0 %	0 %	100 %	0 %	499074505
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3365	NC_021200	TCAGC	2	10	128268	128277	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3366	NC_021200	AGG	2	6	128358	128363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3367	NC_021200	CCA	2	6	128380	128385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074507
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3491	NC_021200	CAGCCG	2	12	132736	132747	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499074510
3492	NC_021200	AGC	2	6	132813	132818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3493	NC_021200	TCACC	2	10	132848	132857	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3494	NC_021200	GCA	2	6	132921	132926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074511
3495	NC_021200	GC	3	6	132952	132957	0 %	0 %	50 %	50 %	499074511
3496	NC_021200	GCG	2	6	132973	132978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074511
3497	NC_021200	ATC	2	6	132980	132985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074511
3498	NC_021200	CTG	2	6	133003	133008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074511
3499	NC_021200	CGT	2	6	133012	133017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074511
3500	NC_021200	TCG	2	6	133082	133087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074511

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