MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30003	NC_021200	CAT	2	6	1035019	1035024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075344
30004	NC_021200	GCC	2	6	1035038	1035043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075344
30005	NC_021200	CGC	2	6	1035052	1035057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075344
30006	NC_021200	CAC	2	6	1035061	1035066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075344
30007	NC_021200	TCG	2	6	1035075	1035080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075344
30008	NC_021200	GTG	2	6	1035125	1035130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075344
30009	NC_021200	GCC	2	6	1035149	1035154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075344
30010	NC_021200	GCC	2	6	1035191	1035196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075344
30011	NC_021200	TCG	2	6	1035249	1035254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075344
30012	NC_021200	GCT	2	6	1035313	1035318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075344
30013	NC_021200	CGGC	2	8	1035382	1035389	0 %	0 %	50 %	50 %	499075344
30014	NC_021200	CGC	2	6	1035400	1035405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075344
30015	NC_021200	CGA	2	6	1035406	1035411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075344
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30017	NC_021200	TCA	2	6	1035444	1035449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075344
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30019	NC_021200	CGC	2	6	1035500	1035505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075344
30020	NC_021200	CGGC	3	12	1035528	1035539	0 %	0 %	50 %	50 %	499075344
30021	NC_021200	CG	3	6	1035543	1035548	0 %	0 %	50 %	50 %	499075344
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30024	NC_021200	GGCC	2	8	1035583	1035590	0 %	0 %	50 %	50 %	499075344
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30052	NC_021200	GCC	2	6	1036269	1036274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075346
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30063	NC_021200	GCC	2	6	1036532	1036537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075346
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30235	NC_021200	CCGG	2	8	1040966	1040973	0 %	0 %	50 %	50 %	499075350
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30351	NC_021200	GC	3	6	1045155	1045160	0 %	0 %	50 %	50 %	499075352
30352	NC_021200	CGG	2	6	1045164	1045169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075352
30353	NC_021200	CGG	2	6	1045173	1045178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075352
30354	NC_021200	ACCC	2	8	1045203	1045210	25 %	0 %	0 %	75 %	499075352
30355	NC_021200	CGG	2	6	1045215	1045220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075352
30356	NC_021200	CGG	2	6	1045245	1045250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075352
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30369	NC_021200	GCT	2	6	1045644	1045649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075352
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30372	NC_021200	CTG	2	6	1045765	1045770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075352
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30384	NC_021200	CGA	2	6	1046058	1046063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075352
30385	NC_021200	CGC	2	6	1046088	1046093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075352
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30401	NC_021200	GGCC	2	8	1046487	1046494	0 %	0 %	50 %	50 %	499075352
30402	NC_021200	GGC	2	6	1046501	1046506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075352
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30417	NC_021200	CGT	3	9	1047114	1047122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075353
30418	NC_021200	CGC	2	6	1047126	1047131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075353
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30420	NC_021200	TGG	2	6	1047200	1047205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075353
30421	NC_021200	GAG	2	6	1047212	1047217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499075353
30422	NC_021200	CGG	2	6	1047259	1047264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075353
30423	NC_021200	GAG	2	6	1047284	1047289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499075353
30424	NC_021200	GCCG	2	8	1047348	1047355	0 %	0 %	50 %	50 %	499075353
30425	NC_021200	TCCGG	2	10	1047356	1047365	0 %	20 %	40 %	40 %	499075353
30426	NC_021200	TGA	2	6	1047367	1047372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075353
30427	NC_021200	GTC	2	6	1047385	1047390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075353
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30430	NC_021200	CA	3	6	1047515	1047520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30431	NC_021200	CGA	2	6	1047573	1047578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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30433	NC_021200	AC	3	6	1047668	1047673	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30434	NC_021200	GGA	2	6	1047693	1047698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30435	NC_021200	GCCG	2	8	1047811	1047818	0 %	0 %	50 %	50 %	499075354
30436	NC_021200	GCG	2	6	1047840	1047845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075354
30437	NC_021200	CGG	2	6	1047891	1047896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075354
30438	NC_021200	GAC	2	6	1047914	1047919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075354
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30441	NC_021200	GCCG	2	8	1048103	1048110	0 %	0 %	50 %	50 %	499075354
30442	NC_021200	GTC	2	6	1048325	1048330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30443	NC_021200	CGA	2	6	1048407	1048412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075355
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30447	NC_021200	CAC	2	6	1048464	1048469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075355
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30450	NC_021200	CCG	2	6	1048551	1048556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075355
30451	NC_021200	GAC	2	6	1048579	1048584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075355
30452	NC_021200	CTG	2	6	1048597	1048602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075355
30453	NC_021200	CAG	2	6	1048606	1048611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075355
30454	NC_021200	GGA	2	6	1048614	1048619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499075355
30455	NC_021200	GC	3	6	1048626	1048631	0 %	0 %	50 %	50 %	499075355
30456	NC_021200	CGA	2	6	1048698	1048703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075355
30457	NC_021200	CCG	2	6	1048748	1048753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075355
30458	NC_021200	GAC	2	6	1048814	1048819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075355
30459	NC_021200	GGC	2	6	1048880	1048885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075356
30460	NC_021200	GCT	2	6	1048895	1048900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075356
30461	NC_021200	CCGG	2	8	1048912	1048919	0 %	0 %	50 %	50 %	499075356
30462	NC_021200	CCA	2	6	1048936	1048941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075356
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30465	NC_021200	CGG	2	6	1049153	1049158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075356
30466	NC_021200	CCA	2	6	1049179	1049184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075356
30467	NC_021200	AGG	2	6	1049212	1049217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499075356
30468	NC_021200	CG	3	6	1049228	1049233	0 %	0 %	50 %	50 %	499075356
30469	NC_021200	CGA	2	6	1049252	1049257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075356
30470	NC_021200	CGC	2	6	1049312	1049317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075356
30471	NC_021200	TGC	2	6	1049320	1049325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075356
30472	NC_021200	GAG	2	6	1049338	1049343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499075356
30473	NC_021200	CGC	2	6	1049348	1049353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30474	NC_021200	ACC	2	6	1049389	1049394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075357
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30476	NC_021200	CGC	2	6	1049502	1049507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075357
30477	NC_021200	GGC	2	6	1049544	1049549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075357
30478	NC_021200	CGG	2	6	1049573	1049578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075357
30479	NC_021200	CGGT	2	8	1049581	1049588	0 %	25 %	50 %	25 %	499075357
30480	NC_021200	GTC	2	6	1049613	1049618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075357
30481	NC_021200	GTCGG	2	10	1049629	1049638	0 %	20 %	60 %	20 %	499075357
30482	NC_021200	CTC	2	6	1049649	1049654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499075357
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30485	NC_021200	CGT	2	6	1049726	1049731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075357
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30490	NC_021200	CGGC	2	8	1049962	1049969	0 %	0 %	50 %	50 %	499075357
30491	NC_021200	CCA	2	6	1049972	1049977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075357
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30493	NC_021200	CGGCCG	2	12	1050066	1050077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30494	NC_021200	TCG	2	6	1050102	1050107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075358
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30497	NC_021200	GCA	2	6	1050181	1050186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075358
30498	NC_021200	CCT	2	6	1050199	1050204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499075358
30499	NC_021200	GCG	2	6	1050213	1050218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075358
30500	NC_021200	CGA	2	6	1050244	1050249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075358

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