MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29118	NC_021200	GC	3	6	1006078	1006083	0 %	0 %	50 %	50 %	499075314
29119	NC_021200	GCG	2	6	1006093	1006098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075314
29120	NC_021200	G	6	6	1006098	1006103	0 %	0 %	100 %	0 %	499075314
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29232	NC_021200	GGGC	2	8	1009710	1009717	0 %	0 %	75 %	25 %	499075315
29233	NC_021200	GAT	2	6	1009722	1009727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075315
29234	NC_021200	CCCG	2	8	1009752	1009759	0 %	0 %	25 %	75 %	499075315
29235	NC_021200	GGT	2	6	1009797	1009802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075315
29236	NC_021200	CGA	2	6	1009818	1009823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075315
29237	NC_021200	GCC	2	6	1009871	1009876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075315
29238	NC_021200	TCG	2	6	1009973	1009978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075315
29239	NC_021200	GTCGG	2	10	1009981	1009990	0 %	20 %	60 %	20 %	499075315
29240	NC_021200	CGG	2	6	1010091	1010096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075315
29241	NC_021200	GCC	2	6	1010113	1010118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075315
29242	NC_021200	TGG	2	6	1010198	1010203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075315
29243	NC_021200	GC	3	6	1010261	1010266	0 %	0 %	50 %	50 %	499075315
29244	NC_021200	ATC	2	6	1010290	1010295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075315
29245	NC_021200	ATGGCC	2	12	1010323	1010334	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	499075315
29246	NC_021200	GTTC	2	8	1010339	1010346	0 %	50 %	25 %	25 %	499075315
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29260	NC_021200	GCC	3	9	1010743	1010751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075316
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29262	NC_021200	ACC	2	6	1010806	1010811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075316
29263	NC_021200	GTC	2	6	1010815	1010820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075316
29264	NC_021200	CGGC	2	8	1010844	1010851	0 %	0 %	50 %	50 %	499075316
29265	NC_021200	CGA	2	6	1010865	1010870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075316
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29267	NC_021200	GCG	3	9	1010894	1010902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075316
29268	NC_021200	ACC	2	6	1010976	1010981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29269	NC_021200	GCA	2	6	1011018	1011023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29270	NC_021200	AACG	2	8	1011024	1011031	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29271	NC_021200	CAC	2	6	1011039	1011044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29272	NC_021200	CAT	2	6	1011095	1011100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075317
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29329	NC_021200	GC	4	8	1012700	1012707	0 %	0 %	50 %	50 %	499075318
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29332	NC_021200	CGA	2	6	1012757	1012762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075318
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29335	NC_021200	CGT	2	6	1012826	1012831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075318
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29337	NC_021200	CGG	2	6	1012858	1012863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075318
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29343	NC_021200	CCG	2	6	1012993	1012998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075318
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29345	NC_021200	CGA	2	6	1013053	1013058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075318
29346	NC_021200	CGGCG	2	10	1013069	1013078	0 %	0 %	60 %	40 %	499075318
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29348	NC_021200	GCT	2	6	1013090	1013095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075318
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29463	NC_021200	GCCG	2	8	1016885	1016892	0 %	0 %	50 %	50 %	499075323
29464	NC_021200	GCT	2	6	1016923	1016928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075323
29465	NC_021200	TCT	2	6	1016949	1016954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499075323
29466	NC_021200	GCCG	2	8	1017010	1017017	0 %	0 %	50 %	50 %	499075323
29467	NC_021200	CTA	2	6	1017034	1017039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075323
29468	NC_021200	GCT	2	6	1017049	1017054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075323
29469	NC_021200	GGC	2	6	1017070	1017075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075323
29470	NC_021200	CGC	2	6	1017163	1017168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075323
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29472	NC_021200	GGGC	2	8	1017214	1017221	0 %	0 %	75 %	25 %	499075323
29473	NC_021200	TCTGGC	2	12	1017244	1017255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075323
29474	NC_021200	TGCG	2	8	1017258	1017265	0 %	25 %	50 %	25 %	499075323
29475	NC_021200	GC	3	6	1017287	1017292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29476	NC_021200	TCG	2	6	1017294	1017299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29477	NC_021200	CGGG	2	8	1017301	1017308	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29478	NC_021200	CTC	3	9	1017323	1017331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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29480	NC_021200	GCG	3	9	1017339	1017347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29481	NC_021200	TCG	2	6	1017352	1017357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29482	NC_021200	CGC	2	6	1017391	1017396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075324
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29484	NC_021200	CGGG	2	8	1017494	1017501	0 %	0 %	75 %	25 %	499075324
29485	NC_021200	AACCC	2	10	1017523	1017532	40 %	0 %	0 %	60 %	499075324
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29491	NC_021200	GCA	2	6	1017761	1017766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075324
29492	NC_021200	GGCCGC	2	12	1017773	1017784	0 %	0 %	50 %	50 %	499075324
29493	NC_021200	GCT	2	6	1017812	1017817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075324
29494	NC_021200	GCG	2	6	1017863	1017868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075324
29495	NC_021200	GC	3	6	1017876	1017881	0 %	0 %	50 %	50 %	499075324
29496	NC_021200	GCC	2	6	1017885	1017890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075324
29497	NC_021200	CG	3	6	1017891	1017896	0 %	0 %	50 %	50 %	499075324
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29499	NC_021200	TCG	2	6	1017925	1017930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075324
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