MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28004	NC_021200	CGT	2	6	969356	969361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075278
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28353	NC_021200	GCAA	2	8	980471	980478	50 %	0 %	25 %	25 %	499075290
28354	NC_021200	TGA	2	6	980490	980495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075290
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28357	NC_021200	CGA	2	6	980524	980529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075290
28358	NC_021200	GTG	2	6	980569	980574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075290
28359	NC_021200	TGGAT	2	10	980616	980625	20 %	40 %	40 %	0 %	499075290
28360	NC_021200	GTT	2	6	980680	980685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499075290
28361	NC_021200	CAC	2	6	980713	980718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075290
28362	NC_021200	CCG	2	6	980724	980729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075290
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28386	NC_021200	ACC	2	6	981545	981550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075291
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28402	NC_021200	CGA	2	6	981920	981925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075292
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28405	NC_021200	GGC	2	6	981986	981991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075292
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28410	NC_021200	GC	3	6	982148	982153	0 %	0 %	50 %	50 %	499075292
28411	NC_021200	GTGC	2	8	982159	982166	0 %	25 %	50 %	25 %	499075292
28412	NC_021200	GACGTC	2	12	982170	982181	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	499075292
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28420	NC_021200	CGAGGC	2	12	982406	982417	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	499075292
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28423	NC_021200	GCT	2	6	982499	982504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075292
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28432	NC_021200	GCA	2	6	982797	982802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075293
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28457	NC_021200	CGG	2	6	983658	983663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075293
28458	NC_021200	CAACA	2	10	983782	983791	60 %	0 %	0 %	40 %	499075293
28459	NC_021200	GCG	2	6	983801	983806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075293
28460	NC_021200	CGT	2	6	983811	983816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075293
28461	NC_021200	GC	3	6	983829	983834	0 %	0 %	50 %	50 %	499075293
28462	NC_021200	GC	3	6	983845	983850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28463	NC_021200	GCG	2	6	983946	983951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075294
28464	NC_021200	CG	3	6	983971	983976	0 %	0 %	50 %	50 %	499075294
28465	NC_021200	GCC	2	6	984011	984016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075294
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28468	NC_021200	GCG	4	12	984099	984110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075294
28469	NC_021200	GAT	2	6	984121	984126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075294
28470	NC_021200	GCCTGG	2	12	984189	984200	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	499075294
28471	NC_021200	CCA	2	6	984207	984212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075294
28472	NC_021200	GCTG	2	8	984246	984253	0 %	25 %	50 %	25 %	499075294
28473	NC_021200	TGA	2	6	984261	984266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075294
28474	NC_021200	GCG	2	6	984281	984286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075294
28475	NC_021200	CGG	2	6	984325	984330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075294
28476	NC_021200	AGA	2	6	984390	984395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499075294
28477	NC_021200	TCA	2	6	984399	984404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075294
28478	NC_021200	TGG	2	6	984429	984434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075294
28479	NC_021200	CGA	2	6	984448	984453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075294
28480	NC_021200	AAG	2	6	984545	984550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499075294
28481	NC_021200	ATG	2	6	984557	984562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075294
28482	NC_021200	TTC	2	6	984584	984589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499075294
28483	NC_021200	CGC	2	6	984679	984684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075294
28484	NC_021200	GGATCG	2	12	984690	984701	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	499075294
28485	NC_021200	GAT	2	6	984703	984708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075294
28486	NC_021200	CAT	2	6	984718	984723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075294
28487	NC_021200	CGA	2	6	984724	984729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075294
28488	NC_021200	GCGG	2	8	984880	984887	0 %	0 %	75 %	25 %	499075294
28489	NC_021200	TCG	2	6	984932	984937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075294
28490	NC_021200	GGC	2	6	984940	984945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075294
28491	NC_021200	CGG	2	6	984979	984984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075294
28492	NC_021200	AGC	2	6	985014	985019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075294
28493	NC_021200	TGA	2	6	985041	985046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075294
28494	NC_021200	GCA	2	6	985056	985061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075294
28495	NC_021200	CTG	2	6	985094	985099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075294
28496	NC_021200	GTCG	2	8	985109	985116	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28497	NC_021200	GCGCG	2	10	985139	985148	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28498	NC_021200	A	6	6	985151	985156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28499	NC_021200	CGG	3	9	985157	985165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28500	NC_021200	CGG	2	6	985186	985191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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