MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26501	NC_021200	TCA	2	6	918636	918641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075228
26502	NC_021200	CGT	2	6	918697	918702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075228
26503	NC_021200	GCC	2	6	918712	918717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26504	NC_021200	GAG	2	6	918764	918769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499075229
26505	NC_021200	CGA	2	6	918772	918777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075229
26506	NC_021200	CGC	2	6	918815	918820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075229
26507	NC_021200	GCT	2	6	918844	918849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075229
26508	NC_021200	CTG	2	6	918899	918904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075229
26509	NC_021200	GCC	3	9	918923	918931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075229
26510	NC_021200	GGC	2	6	918932	918937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075229
26511	NC_021200	CAC	2	6	918946	918951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075229
26512	NC_021200	CGC	2	6	918959	918964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075229
26513	NC_021200	CGG	2	6	918969	918974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075229
26514	NC_021200	GCG	2	6	919000	919005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075229
26515	NC_021200	CTG	2	6	919010	919015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075229
26516	NC_021200	CGG	2	6	919026	919031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075229
26517	NC_021200	CGCAC	2	10	919053	919062	20 %	0 %	20 %	60 %	499075229
26518	NC_021200	TGC	2	6	919074	919079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075229
26519	NC_021200	TCG	2	6	919164	919169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075229
26520	NC_021200	CGA	2	6	919222	919227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075229
26521	NC_021200	GGGCAA	2	12	919261	919272	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	499075229
26522	NC_021200	AGC	2	6	919275	919280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075229
26523	NC_021200	GCCG	2	8	919300	919307	0 %	0 %	50 %	50 %	499075229
26524	NC_021200	TGGC	2	8	919325	919332	0 %	25 %	50 %	25 %	499075229
26525	NC_021200	GCCC	2	8	919342	919349	0 %	0 %	25 %	75 %	499075229
26526	NC_021200	CCGGC	2	10	919365	919374	0 %	0 %	40 %	60 %	499075229
26527	NC_021200	GCT	3	9	919375	919383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075229
26528	NC_021200	GCC	2	6	919395	919400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075229
26529	NC_021200	GTG	2	6	919427	919432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075229
26530	NC_021200	CGG	2	6	919446	919451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075229
26531	NC_021200	GCG	2	6	919455	919460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075229
26532	NC_021200	CCAC	2	8	919500	919507	25 %	0 %	0 %	75 %	499075229
26533	NC_021200	GGC	2	6	919517	919522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075229
26534	NC_021200	GGT	2	6	919534	919539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075229
26535	NC_021200	CTG	2	6	919547	919552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075229
26536	NC_021200	CCA	2	6	919569	919574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075229
26537	NC_021200	GC	3	6	919609	919614	0 %	0 %	50 %	50 %	499075229
26538	NC_021200	GC	3	6	919649	919654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26539	NC_021200	GCG	2	6	919673	919678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26540	NC_021200	CGA	2	6	919685	919690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26541	NC_021200	CCGCG	2	10	919692	919701	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26542	NC_021200	GC	3	6	919735	919740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26543	NC_021200	GC	3	6	919830	919835	0 %	0 %	50 %	50 %	499075230
26544	NC_021200	GCAG	2	8	919842	919849	25 %	0 %	50 %	25 %	499075230
26545	NC_021200	CAC	2	6	919939	919944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075230
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26547	NC_021200	ACC	2	6	919997	920002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075230
26548	NC_021200	GCC	2	6	920004	920009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075230
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26550	NC_021200	CGCC	2	8	920043	920050	0 %	0 %	25 %	75 %	499075230
26551	NC_021200	CGG	2	6	920067	920072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075230
26552	NC_021200	CGC	2	6	920088	920093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075230
26553	NC_021200	CAC	2	6	920137	920142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075230
26554	NC_021200	CGG	3	9	920146	920154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075230
26555	NC_021200	GCCG	2	8	920182	920189	0 %	0 %	50 %	50 %	499075230
26556	NC_021200	CCG	3	9	920187	920195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075230
26557	NC_021200	CGA	2	6	920214	920219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075230
26558	NC_021200	GCC	2	6	920231	920236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075230
26559	NC_021200	CGCA	2	8	920240	920247	25 %	0 %	25 %	50 %	499075230
26560	NC_021200	CGG	3	9	920263	920271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26561	NC_021200	CGC	2	6	920272	920277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26562	NC_021200	CGG	4	12	920284	920295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26563	NC_021200	CTG	2	6	920311	920316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26564	NC_021200	CTG	2	6	920329	920334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26565	NC_021200	CG	3	6	920361	920366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26566	NC_021200	GAG	2	6	920393	920398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26567	NC_021200	CGC	2	6	920452	920457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26568	NC_021200	AGC	2	6	920538	920543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075231
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26570	NC_021200	CAT	2	6	920635	920640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075231
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26573	NC_021200	TCG	2	6	920724	920729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075231
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26602	NC_021200	GAG	2	6	921990	921995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499075232
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26611	NC_021200	CG	3	6	922232	922237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26612	NC_021200	CGA	2	6	922276	922281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075233
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26618	NC_021200	CCCG	2	8	922456	922463	0 %	0 %	25 %	75 %	499075233
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26621	NC_021200	CGT	2	6	922560	922565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075233
26622	NC_021200	GCG	2	6	922661	922666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075233
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26738	NC_021200	TGCGG	2	10	926722	926731	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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26863	NC_021200	CCT	2	6	931069	931074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499075244
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26981	NC_021200	GCA	2	6	934559	934564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075248
26982	NC_021200	GTC	2	6	934624	934629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075248
26983	NC_021200	GCC	2	6	934636	934641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075248
26984	NC_021200	GCT	2	6	934662	934667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075248
26985	NC_021200	CGTCGC	2	12	934698	934709	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	499075248
26986	NC_021200	CGA	2	6	934710	934715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075248
26987	NC_021200	CGC	2	6	934719	934724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075248
26988	NC_021200	CGG	2	6	934726	934731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075248
26989	NC_021200	GGC	2	6	934761	934766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075248
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26991	NC_021200	CGT	2	6	934797	934802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075248
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27000	NC_021200	GGCG	2	8	935091	935098	0 %	0 %	75 %	25 %	499075248

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