MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_021200	GCC	2	6	851834	851839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24503	NC_021200	GCCA	2	8	851867	851874	25 %	0 %	25 %	50 %	499075166
24504	NC_021200	CGT	2	6	851890	851895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075166
24505	NC_021200	CGG	2	6	851899	851904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075166
24506	NC_021200	GCA	2	6	851907	851912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075166
24507	NC_021200	CGGC	2	8	851937	851944	0 %	0 %	50 %	50 %	499075166
24508	NC_021200	CGG	2	6	851969	851974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075166
24509	NC_021200	GTC	2	6	851981	851986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075166
24510	NC_021200	CGG	2	6	852108	852113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075166
24511	NC_021200	C	6	6	852146	852151	0 %	0 %	0 %	100 %	499075166
24512	NC_021200	GTG	2	6	852182	852187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075166
24513	NC_021200	TGC	2	6	852195	852200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075166
24514	NC_021200	GCT	2	6	852235	852240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075166
24515	NC_021200	AAG	2	6	852314	852319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499075166
24516	NC_021200	CGC	2	6	852325	852330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075166
24517	NC_021200	TGC	2	6	852360	852365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075166
24518	NC_021200	CCCG	2	8	852431	852438	0 %	0 %	25 %	75 %	499075166
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24520	NC_021200	CGC	2	6	852490	852495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075166
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24522	NC_021200	TCG	2	6	852531	852536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075166
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24524	NC_021200	GCCG	2	8	852548	852555	0 %	0 %	50 %	50 %	499075166
24525	NC_021200	CGA	2	6	852682	852687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075166
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24529	NC_021200	CTG	2	6	852917	852922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075166
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24543	NC_021200	GGC	2	6	853357	853362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075167
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24551	NC_021200	CCGC	2	8	853530	853537	0 %	0 %	25 %	75 %	499075167
24552	NC_021200	CCT	2	6	853541	853546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24553	NC_021200	TGTC	2	8	853547	853554	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24554	NC_021200	GCCC	2	8	853592	853599	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24555	NC_021200	TGG	3	9	853614	853622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24556	NC_021200	TGG	2	6	853679	853684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075168
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24558	NC_021200	CGA	2	6	853725	853730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075168
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24581	NC_021200	CGGCC	2	10	854505	854514	0 %	0 %	40 %	60 %	499075168
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24586	NC_021200	TGAA	2	8	854640	854647	50 %	25 %	25 %	0 %	499075169
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24608	NC_021200	GCG	2	6	855443	855448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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24614	NC_021200	ATCG	2	8	855722	855729	25 %	25 %	25 %	25 %	499075170
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24979	NC_021200	GC	3	6	868161	868166	0 %	0 %	50 %	50 %	499075181
24980	NC_021200	CGG	2	6	868236	868241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075181
24981	NC_021200	TGG	2	6	868250	868255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075181
24982	NC_021200	CCA	2	6	868256	868261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075181
24983	NC_021200	GC	4	8	868281	868288	0 %	0 %	50 %	50 %	499075181
24984	NC_021200	GCG	2	6	868318	868323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24985	NC_021200	CGG	2	6	868451	868456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075182
24986	NC_021200	CGG	2	6	868481	868486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075182
24987	NC_021200	TCG	2	6	868495	868500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075182
24988	NC_021200	TCT	2	6	868522	868527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499075182
24989	NC_021200	CAC	2	6	868542	868547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075182
24990	NC_021200	AAG	2	6	868548	868553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499075182
24991	NC_021200	CCGGCG	2	12	868564	868575	0 %	0 %	50 %	50 %	499075182
24992	NC_021200	GCA	3	9	868618	868626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075182
24993	NC_021200	CGT	2	6	868637	868642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075182
24994	NC_021200	ACT	2	6	868744	868749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075182
24995	NC_021200	TCG	2	6	868791	868796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075182
24996	NC_021200	CGA	2	6	868826	868831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075182
24997	NC_021200	CCG	2	6	868847	868852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075182
24998	NC_021200	GTT	2	6	868865	868870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499075182
24999	NC_021200	CCAGC	2	10	868883	868892	20 %	0 %	20 %	60 %	499075182
25000	NC_021200	CG	3	6	868919	868924	0 %	0 %	50 %	50 %	499075182

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