MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_021200	GTA	2	6	834216	834221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075151
24003	NC_021200	CGGG	2	8	834248	834255	0 %	0 %	75 %	25 %	499075151
24004	NC_021200	CGTGG	2	10	834310	834319	0 %	20 %	60 %	20 %	499075151
24005	NC_021200	CGCC	2	8	834330	834337	0 %	0 %	25 %	75 %	499075151
24006	NC_021200	GCC	2	6	834348	834353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075151
24007	NC_021200	CGC	2	6	834365	834370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075151
24008	NC_021200	GGC	2	6	834402	834407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075151
24009	NC_021200	CG	4	8	834414	834421	0 %	0 %	50 %	50 %	499075151
24010	NC_021200	ACG	2	6	834430	834435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075151
24011	NC_021200	ACC	2	6	834463	834468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075151
24012	NC_021200	CCG	2	6	834503	834508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075151
24013	NC_021200	CGGC	2	8	834538	834545	0 %	0 %	50 %	50 %	499075151
24014	NC_021200	GGC	2	6	834582	834587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075151
24015	NC_021200	GCCG	2	8	834611	834618	0 %	0 %	50 %	50 %	499075151
24016	NC_021200	GCG	2	6	834619	834624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075151
24017	NC_021200	GCC	2	6	834660	834665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075151
24018	NC_021200	TCG	2	6	834715	834720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075151
24019	NC_021200	GCA	2	6	834815	834820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075151
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24021	NC_021200	CGC	2	6	834893	834898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075151
24022	NC_021200	GC	4	8	834902	834909	0 %	0 %	50 %	50 %	499075151
24023	NC_021200	GCC	2	6	834945	834950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075151
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24025	NC_021200	GCCG	2	8	835005	835012	0 %	0 %	50 %	50 %	499075151
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24028	NC_021200	GGCG	2	8	835098	835105	0 %	0 %	75 %	25 %	499075151
24029	NC_021200	CAG	3	9	835179	835187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075151
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24032	NC_021200	CCG	2	6	835230	835235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075151
24033	NC_021200	CGC	2	6	835293	835298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075151
24034	NC_021200	GGC	2	6	835301	835306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075151
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24040	NC_021200	GGCC	2	8	835514	835521	0 %	0 %	50 %	50 %	499075151
24041	NC_021200	CGA	2	6	835565	835570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075151
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24044	NC_021200	GCT	2	6	835750	835755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075152
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24050	NC_021200	TGG	2	6	835881	835886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075152
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24052	NC_021200	GCT	3	9	835936	835944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075152
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24055	NC_021200	CGG	2	6	835965	835970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075152
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24068	NC_021200	GGT	3	9	836431	836439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075152
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24090	NC_021200	CGA	2	6	837096	837101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075152
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24092	NC_021200	GCCG	2	8	837127	837134	0 %	0 %	50 %	50 %	499075152
24093	NC_021200	CGGCG	2	10	837151	837160	0 %	0 %	60 %	40 %	499075152
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24102	NC_021200	GC	4	8	837419	837426	0 %	0 %	50 %	50 %	499075153
24103	NC_021200	GCG	2	6	837472	837477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075153
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24107	NC_021200	AGC	2	6	837564	837569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075153
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24110	NC_021200	GTCA	2	8	837687	837694	25 %	25 %	25 %	25 %	499075153
24111	NC_021200	GGT	2	6	837719	837724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075153
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24120	NC_021200	GCT	3	9	838124	838132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075153
24121	NC_021200	CGC	3	9	838151	838159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075153
24122	NC_021200	GAAC	2	8	838205	838212	50 %	0 %	25 %	25 %	499075153
24123	NC_021200	CCA	2	6	838219	838224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075153
24124	NC_021200	GCC	2	6	838245	838250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075153
24125	NC_021200	GCA	2	6	838275	838280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075154
24126	NC_021200	CGC	2	6	838303	838308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075154
24127	NC_021200	AAC	2	6	838316	838321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499075154
24128	NC_021200	ACA	2	6	838326	838331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499075154
24129	NC_021200	AAC	2	6	838373	838378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499075154
24130	NC_021200	CGG	2	6	838386	838391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075154
24131	NC_021200	CAT	2	6	838396	838401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075154
24132	NC_021200	GTG	2	6	838409	838414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075154
24133	NC_021200	CCA	2	6	838515	838520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075154
24134	NC_021200	GGCC	2	8	838524	838531	0 %	0 %	50 %	50 %	499075154
24135	NC_021200	CAG	3	9	838567	838575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075154
24136	NC_021200	CCG	2	6	838584	838589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075154
24137	NC_021200	CGAGC	2	10	838621	838630	20 %	0 %	40 %	40 %	499075154
24138	NC_021200	GC	3	6	838665	838670	0 %	0 %	50 %	50 %	499075154
24139	NC_021200	AGC	2	6	838673	838678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075154
24140	NC_021200	CGG	2	6	838701	838706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075154
24141	NC_021200	CGTCAC	2	12	838753	838764	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	499075154
24142	NC_021200	CAT	3	9	838774	838782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075154
24143	NC_021200	CGCTGG	2	12	838851	838862	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	499075154
24144	NC_021200	GCG	2	6	838875	838880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075154
24145	NC_021200	CGA	2	6	838884	838889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075154
24146	NC_021200	G	6	6	839054	839059	0 %	0 %	100 %	0 %	499075154
24147	NC_021200	GCC	2	6	839080	839085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075154
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24149	NC_021200	GCC	2	6	839113	839118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075154
24150	NC_021200	CGC	2	6	839131	839136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075154
24151	NC_021200	CGA	2	6	839158	839163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075154
24152	NC_021200	GGC	2	6	839173	839178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075154
24153	NC_021200	GGT	2	6	839200	839205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075154
24154	NC_021200	CAC	2	6	839209	839214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075154
24155	NC_021200	CCACG	2	10	839245	839254	20 %	0 %	20 %	60 %	499075154
24156	NC_021200	ACC	2	6	839261	839266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075154
24157	NC_021200	CAG	2	6	839290	839295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075154
24158	NC_021200	TCG	2	6	839303	839308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075154
24159	NC_021200	CG	4	8	839319	839326	0 %	0 %	50 %	50 %	499075154
24160	NC_021200	TGA	2	6	839361	839366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075154
24161	NC_021200	AGGA	2	8	839369	839376	50 %	0 %	50 %	0 %	499075154
24162	NC_021200	CAG	2	6	839389	839394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075154
24163	NC_021200	GGTC	2	8	839451	839458	0 %	25 %	50 %	25 %	499075154
24164	NC_021200	CCG	2	6	839480	839485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24165	NC_021200	CGC	2	6	839560	839565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24166	NC_021200	GAT	2	6	839671	839676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075155
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24168	NC_021200	GCT	2	6	839752	839757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075155
24169	NC_021200	GGT	2	6	839779	839784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075155
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24171	NC_021200	GCCG	2	8	839845	839852	0 %	0 %	50 %	50 %	499075155
24172	NC_021200	CAT	2	6	839884	839889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075155
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24175	NC_021200	GCC	2	6	839990	839995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075155
24176	NC_021200	GCC	2	6	839999	840004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075155
24177	NC_021200	ACG	2	6	840033	840038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075155
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24179	NC_021200	CAA	2	6	840053	840058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499075155
24180	NC_021200	GCT	2	6	840211	840216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075155
24181	NC_021200	TCG	2	6	840237	840242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075155
24182	NC_021200	TGA	2	6	840258	840263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075155
24183	NC_021200	CTG	2	6	840266	840271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075155
24184	NC_021200	CGG	2	6	840300	840305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075155
24185	NC_021200	CGCC	2	8	840495	840502	0 %	0 %	25 %	75 %	499075156
24186	NC_021200	CGG	2	6	840507	840512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075156
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24188	NC_021200	GCT	2	6	840576	840581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075156
24189	NC_021200	CGCTG	2	10	840587	840596	0 %	20 %	40 %	40 %	499075156
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24192	NC_021200	GTG	2	6	840685	840690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075156
24193	NC_021200	GGCG	2	8	840705	840712	0 %	0 %	75 %	25 %	499075156
24194	NC_021200	GGA	2	6	840738	840743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499075156
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24197	NC_021200	GCC	2	6	840848	840853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075156
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24199	NC_021200	CGA	2	6	840879	840884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075156
24200	NC_021200	GAC	2	6	840898	840903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075156
24201	NC_021200	GCA	2	6	840914	840919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075156
24202	NC_021200	CGC	2	6	840927	840932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075156
24203	NC_021200	CGA	2	6	841002	841007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075156
24204	NC_021200	TGA	2	6	841013	841018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075156
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24207	NC_021200	CTG	2	6	841048	841053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075156
24208	NC_021200	ACCGCG	2	12	841205	841216	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499075156
24209	NC_021200	GCT	2	6	841233	841238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075156
24210	NC_021200	GCT	2	6	841251	841256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075156
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24226	NC_021200	GC	3	6	841836	841841	0 %	0 %	50 %	50 %	499075156
24227	NC_021200	CGA	2	6	841877	841882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24228	NC_021200	CAC	2	6	841884	841889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24229	NC_021200	GAA	2	6	841946	841951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24230	NC_021200	GGC	3	9	841957	841965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24231	NC_021200	CCG	2	6	842106	842111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24232	NC_021200	CGT	2	6	842187	842192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24233	NC_021200	CGC	2	6	842207	842212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24234	NC_021200	CGG	2	6	842220	842225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24235	NC_021200	CGGT	2	8	842276	842283	0 %	25 %	50 %	25 %	499075157
24236	NC_021200	CCG	2	6	842292	842297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075157
24237	NC_021200	CCAC	2	8	842309	842316	25 %	0 %	0 %	75 %	499075157
24238	NC_021200	GGC	2	6	842324	842329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075157
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24480	NC_021200	CGGC	2	8	850808	850815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24481	NC_021200	TCG	2	6	850868	850873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075165
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24483	NC_021200	CGT	2	6	850976	850981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075165
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