MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_021200	GCG	2	6	799209	799214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075121
23003	NC_021200	GACCG	2	10	799225	799234	20 %	0 %	40 %	40 %	499075121
23004	NC_021200	CTG	2	6	799241	799246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075121
23005	NC_021200	GGT	2	6	799260	799265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075121
23006	NC_021200	TCG	2	6	799280	799285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075121
23007	NC_021200	GCC	2	6	799308	799313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075121
23008	NC_021200	GCC	2	6	799327	799332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075121
23009	NC_021200	AAC	2	6	799346	799351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499075121
23010	NC_021200	GCC	2	6	799372	799377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075121
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23120	NC_021200	GTC	2	6	802999	803004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075123
23121	NC_021200	ACC	2	6	803018	803023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075123
23122	NC_021200	CGG	2	6	803051	803056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075123
23123	NC_021200	CAG	2	6	803086	803091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075123
23124	NC_021200	GCC	3	9	803102	803110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075123
23125	NC_021200	GTG	2	6	803152	803157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075123
23126	NC_021200	GCCA	2	8	803159	803166	25 %	0 %	25 %	50 %	499075123
23127	NC_021200	GGTG	2	8	803172	803179	0 %	25 %	75 %	0 %	499075123
23128	NC_021200	CGCGAT	2	12	803238	803249	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	499075124
23129	NC_021200	GTC	2	6	803262	803267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075124
23130	NC_021200	TGG	2	6	803272	803277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075124
23131	NC_021200	GGC	2	6	803283	803288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075124
23132	NC_021200	GTC	2	6	803316	803321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075124
23133	NC_021200	GCC	2	6	803344	803349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075124
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23135	NC_021200	GTC	2	6	803367	803372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075124
23136	NC_021200	GAT	2	6	803400	803405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075124
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23142	NC_021200	CGA	3	9	803633	803641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075124
23143	NC_021200	CGAC	2	8	803693	803700	25 %	0 %	25 %	50 %	499075124
23144	NC_021200	CGG	2	6	803777	803782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075124
23145	NC_021200	TCG	2	6	803785	803790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075124
23146	NC_021200	CGG	2	6	803809	803814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075124
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23149	NC_021200	GGC	2	6	803918	803923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075124
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23152	NC_021200	GCCG	2	8	803991	803998	0 %	0 %	50 %	50 %	499075124
23153	NC_021200	CGG	2	6	804008	804013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075124
23154	NC_021200	AGGC	2	8	804056	804063	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23155	NC_021200	GCG	2	6	804116	804121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23156	NC_021200	GTA	2	6	804188	804193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23157	NC_021200	GAG	2	6	804258	804263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23158	NC_021200	AACG	2	8	804395	804402	50 %	0 %	25 %	25 %	499075125
23159	NC_021200	CG	3	6	804401	804406	0 %	0 %	50 %	50 %	499075125
23160	NC_021200	CGCGAG	2	12	804428	804439	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	499075125
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23198	NC_021200	GGT	2	6	805753	805758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075126
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23208	NC_021200	CTG	2	6	806125	806130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23226	NC_021200	GGGC	2	8	806672	806679	0 %	0 %	75 %	25 %	499075127
23227	NC_021200	GCTACG	2	12	806699	806710	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	499075127
23228	NC_021200	GAT	2	6	806752	806757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075127
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23230	NC_021200	TCG	2	6	806795	806800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075127
23231	NC_021200	GCC	2	6	806804	806809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075127
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23233	NC_021200	CCGG	2	8	806844	806851	0 %	0 %	50 %	50 %	499075127
23234	NC_021200	GTC	2	6	806854	806859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075127
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23237	NC_021200	CG	3	6	806892	806897	0 %	0 %	50 %	50 %	499075127
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23356	NC_021200	CGCGC	2	10	810992	811001	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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23358	NC_021200	CGCC	2	8	811071	811078	0 %	0 %	25 %	75 %	499075131
23359	NC_021200	GCG	2	6	811094	811099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075131
23360	NC_021200	CG	3	6	811122	811127	0 %	0 %	50 %	50 %	499075131
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23362	NC_021200	GTC	3	9	811141	811149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075131
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23364	NC_021200	TCG	2	6	811178	811183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075131
23365	NC_021200	GCCC	2	8	811188	811195	0 %	0 %	25 %	75 %	499075131
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23394	NC_021200	GC	3	6	812017	812022	0 %	0 %	50 %	50 %	499075131
23395	NC_021200	CGCC	2	8	812037	812044	0 %	0 %	25 %	75 %	499075131
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23398	NC_021200	GCG	2	6	812181	812186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075132
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23480	NC_021200	GCT	2	6	815014	815019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075133
23481	NC_021200	CGG	2	6	815031	815036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075133
23482	NC_021200	TGCG	2	8	815037	815044	0 %	25 %	50 %	25 %	499075133
23483	NC_021200	CGC	3	9	815140	815148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075133
23484	NC_021200	GC	3	6	815152	815157	0 %	0 %	50 %	50 %	499075133
23485	NC_021200	GCT	2	6	815176	815181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075133
23486	NC_021200	CCA	2	6	815190	815195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075133
23487	NC_021200	CGG	2	6	815200	815205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075133
23488	NC_021200	CCG	2	6	815224	815229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075133
23489	NC_021200	CG	3	6	815263	815268	0 %	0 %	50 %	50 %	499075133
23490	NC_021200	CGA	2	6	815293	815298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075133
23491	NC_021200	CTG	2	6	815324	815329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075133
23492	NC_021200	TCG	2	6	815390	815395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23493	NC_021200	TGG	2	6	815416	815421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075134
23494	NC_021200	CGC	2	6	815470	815475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075134
23495	NC_021200	TGC	2	6	815509	815514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075134
23496	NC_021200	GCC	2	6	815559	815564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075134
23497	NC_021200	GCC	2	6	815622	815627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075134
23498	NC_021200	CCG	2	6	815658	815663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075134
23499	NC_021200	GCG	2	6	815680	815685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075134
23500	NC_021200	CTG	2	6	815688	815693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075134

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