MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_021200	CCA	2	6	730931	730936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075055
21003	NC_021200	CGC	2	6	731022	731027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075056
21004	NC_021200	GCC	2	6	731071	731076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075056
21005	NC_021200	CGC	2	6	731091	731096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075056
21006	NC_021200	GCC	2	6	731107	731112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075056
21007	NC_021200	GGC	2	6	731137	731142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075056
21008	NC_021200	GGC	2	6	731152	731157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075056
21009	NC_021200	GCA	2	6	731168	731173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075056
21010	NC_021200	CGGC	2	8	731207	731214	0 %	0 %	50 %	50 %	499075056
21011	NC_021200	CCG	2	6	731234	731239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075056
21012	NC_021200	GTC	2	6	731248	731253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075056
21013	NC_021200	CAG	2	6	731254	731259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075056
21014	NC_021200	CAG	2	6	731269	731274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075056
21015	NC_021200	ACGGGT	2	12	731313	731324	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	499075056
21016	NC_021200	GAA	2	6	731338	731343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499075056
21017	NC_021200	GCC	3	9	731359	731367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075056
21018	NC_021200	AGT	2	6	731370	731375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075056
21019	NC_021200	GGT	2	6	731449	731454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075056
21020	NC_021200	CGA	2	6	731491	731496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075056
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21042	NC_021200	TCCC	2	8	732416	732423	0 %	25 %	0 %	75 %	499075056
21043	NC_021200	GCG	2	6	732450	732455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21044	NC_021200	CAC	2	6	732536	732541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075057
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21050	NC_021200	ACC	2	6	732789	732794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075057
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21052	NC_021200	CGCA	2	8	732845	732852	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21053	NC_021200	TG	3	6	732863	732868	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21054	NC_021200	ACAGG	2	10	732870	732879	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21055	NC_021200	CAG	2	6	732931	732936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075058
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21478	NC_021200	GCTGG	2	10	746561	746570	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
21479	NC_021200	CGA	2	6	746585	746590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21480	NC_021200	CGG	2	6	746597	746602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21481	NC_021200	TGGTCG	2	12	746626	746637	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21482	NC_021200	GAG	2	6	746640	746645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21483	NC_021200	CG	3	6	746652	746657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21484	NC_021200	GCCCG	2	10	746663	746672	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21485	NC_021200	CGG	2	6	746695	746700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21486	NC_021200	CAGAA	2	10	746722	746731	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21487	NC_021200	GGC	2	6	746813	746818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21488	NC_021200	CGC	2	6	746873	746878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21489	NC_021200	CGA	2	6	746882	746887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21490	NC_021200	CGACC	2	10	746945	746954	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
21491	NC_021200	CGGG	2	8	746963	746970	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21492	NC_021200	GC	3	6	747016	747021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21493	NC_021200	GGCCCG	2	12	747035	747046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21494	NC_021200	CTG	2	6	747051	747056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21495	NC_021200	GCC	2	6	747057	747062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21496	NC_021200	CAG	2	6	747123	747128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21497	NC_021200	TGG	2	6	747184	747189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21498	NC_021200	CGC	2	6	747206	747211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21499	NC_021200	CGC	2	6	747221	747226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21500	NC_021200	CG	3	6	747228	747233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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